MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 91891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007613	T	6	6	48519	48524	0 %	100 %	0 %	0 %	82542663
1002	NC_007613	TGC	2	6	48538	48543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542663
1003	NC_007613	TAA	2	6	48604	48609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82542663
1004	NC_007613	GGTGAT	2	12	48650	48661	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	82542663
1005	NC_007613	TGT	2	6	48727	48732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542663
1006	NC_007613	CGC	2	6	48733	48738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542663
1007	NC_007613	TGAT	2	8	48747	48754	25 %	50 %	25 %	0 %	82542663
1008	NC_007613	ATA	2	6	48759	48764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82542663
1009	NC_007613	CAG	2	6	48869	48874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542663
1010	NC_007613	GAC	2	6	49147	49152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542663
1011	NC_007613	GCT	2	6	49159	49164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542663
1012	NC_007613	TGGC	2	8	49206	49213	0 %	25 %	50 %	25 %	82542663
1013	NC_007613	CAG	2	6	49253	49258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542663
1014	NC_007613	TCT	2	6	49275	49280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542663
1015	NC_007613	GGC	2	6	49292	49297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542663
1016	NC_007613	CG	3	6	49465	49470	0 %	0 %	50 %	50 %	82542663
1017	NC_007613	CCA	2	6	49481	49486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542663
1018	NC_007613	TCGCTG	2	12	49755	49766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542663
1019	NC_007613	TGC	2	6	49769	49774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542663
1020	NC_007613	ATC	2	6	49806	49811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542663
1021	NC_007613	CAG	2	6	49856	49861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542663
1022	NC_007613	CAG	2	6	49943	49948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542663
1023	NC_007613	CAG	3	9	50000	50008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542663
1024	NC_007613	GTT	2	6	50032	50037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542663
1025	NC_007613	ACC	2	6	50100	50105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542663
1026	NC_007613	ACG	2	6	50153	50158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542663
1027	NC_007613	TCA	3	9	50238	50246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542663
1028	NC_007613	GCA	2	6	50275	50280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542663
1029	NC_007613	CAG	2	6	50335	50340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542663
1030	NC_007613	AG	3	6	50345	50350	50 %	0 %	50 %	0 %	82542663
1031	NC_007613	ATC	2	6	50367	50372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542663
1032	NC_007613	CAGC	2	8	50407	50414	25 %	0 %	25 %	50 %	82542663
1033	NC_007613	CG	3	6	50419	50424	0 %	0 %	50 %	50 %	82542663
1034	NC_007613	GGC	3	9	50431	50439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542663
1035	NC_007613	CAT	2	6	50443	50448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542663
1036	NC_007613	CG	4	8	50538	50545	0 %	0 %	50 %	50 %	82542663
1037	NC_007613	TCT	2	6	50706	50711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542663
1038	NC_007613	CTT	2	6	50716	50721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542663
1039	NC_007613	TGCG	2	8	50800	50807	0 %	25 %	50 %	25 %	82542663
1040	NC_007613	AAAGT	2	10	50836	50845	60 %	20 %	20 %	0 %	82542663
1041	NC_007613	ACC	2	6	50972	50977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_007613	GTG	2	6	50999	51004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_007613	T	7	7	51090	51096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_007613	GTG	2	6	51212	51217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542664
1045	NC_007613	TGG	2	6	51248	51253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542664
1046	NC_007613	TTC	2	6	51315	51320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542664
1047	NC_007613	GCG	2	6	51334	51339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542664
1048	NC_007613	GGC	2	6	51349	51354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542664
1049	NC_007613	CTG	2	6	51501	51506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542664
1050	NC_007613	CTG	2	6	51510	51515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542664
1051	NC_007613	GCG	2	6	51521	51526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542664
1052	NC_007613	CCT	2	6	51581	51586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82542664
1053	NC_007613	GTT	2	6	51698	51703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542664
1054	NC_007613	CCA	2	6	51720	51725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542664
1055	NC_007613	TGC	2	6	51736	51741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542664
1056	NC_007613	CGC	2	6	51762	51767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542664
1057	NC_007613	TTC	3	9	51768	51776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542664
1058	NC_007613	CGT	2	6	51830	51835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542664
1059	NC_007613	TCAA	2	8	51847	51854	50 %	25 %	0 %	25 %	82542664
1060	NC_007613	TGA	2	6	51877	51882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542664
1061	NC_007613	CGA	2	6	51897	51902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542664
1062	NC_007613	GAA	2	6	51918	51923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542664
1063	NC_007613	GGT	2	6	51933	51938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542664
1064	NC_007613	ATG	2	6	51964	51969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542664
1065	NC_007613	GGCA	2	8	52051	52058	25 %	0 %	50 %	25 %	82542664
1066	NC_007613	CCA	2	6	52133	52138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542664
1067	NC_007613	ATCA	2	8	52149	52156	50 %	25 %	0 %	25 %	82542664
1068	NC_007613	GAT	2	6	52167	52172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542664
1069	NC_007613	CCAGCA	2	12	52196	52207	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	82542664
1070	NC_007613	GCC	2	6	52245	52250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542664
1071	NC_007613	GCG	2	6	52262	52267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542664
1072	NC_007613	GCC	2	6	52336	52341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542664
1073	NC_007613	CCG	2	6	52348	52353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542664
1074	NC_007613	CGG	2	6	52492	52497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542664
1075	NC_007613	A	6	6	52653	52658	100 %	0 %	0 %	0 %	82542664
1076	NC_007613	TAT	2	6	52700	52705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542664
1077	NC_007613	GCA	2	6	52751	52756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542664
1078	NC_007613	CAC	2	6	52773	52778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542664
1079	NC_007613	GAT	2	6	52788	52793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542664
1080	NC_007613	GCGG	2	8	52844	52851	0 %	0 %	75 %	25 %	82542664
1081	NC_007613	GAG	2	6	52882	52887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82542664
1082	NC_007613	GGT	2	6	52971	52976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542664
1083	NC_007613	GCG	2	6	53003	53008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542664
1084	NC_007613	GGTGA	2	10	53083	53092	20 %	20 %	60 %	0 %	82542664
1085	NC_007613	GGCG	2	8	53119	53126	0 %	0 %	75 %	25 %	82542664
1086	NC_007613	TCA	2	6	53180	53185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542664
1087	NC_007613	CGG	2	6	53309	53314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542664
1088	NC_007613	GCCA	2	8	53374	53381	25 %	0 %	25 %	50 %	82542664
1089	NC_007613	CCTG	2	8	53437	53444	0 %	25 %	25 %	50 %	82542664
1090	NC_007613	A	6	6	53465	53470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_007613	CAG	2	6	53576	53581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542665
1092	NC_007613	TGC	2	6	53586	53591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542665
1093	NC_007613	GCG	2	6	53605	53610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542665
1094	NC_007613	GTGG	2	8	53867	53874	0 %	25 %	75 %	0 %	82542665
1095	NC_007613	TGG	2	6	53914	53919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542665
1096	NC_007613	GCC	2	6	53945	53950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542665
1097	NC_007613	AGC	2	6	53973	53978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542665
1098	NC_007613	GGA	2	6	53996	54001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82542665
1099	NC_007613	CGC	2	6	54109	54114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542665
1100	NC_007613	TCT	2	6	54210	54215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542665
1101	NC_007613	CGA	2	6	54424	54429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542666
1102	NC_007613	ATCA	2	8	54492	54499	50 %	25 %	0 %	25 %	82542666
1103	NC_007613	GC	3	6	54578	54583	0 %	0 %	50 %	50 %	82542666
1104	NC_007613	CAG	2	6	54705	54710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542666
1105	NC_007613	ATCA	2	8	54729	54736	50 %	25 %	0 %	25 %	82542666
1106	NC_007613	ACC	2	6	54798	54803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542666
1107	NC_007613	TCT	2	6	54838	54843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542666
1108	NC_007613	TCC	2	6	54922	54927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82542666
1109	NC_007613	AGG	2	6	54932	54937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82542666
1110	NC_007613	GCC	2	6	54939	54944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542666
1111	NC_007613	ATG	2	6	54970	54975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542666
1112	NC_007613	GCG	2	6	54985	54990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542666
1113	NC_007613	CTG	2	6	55026	55031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542666
1114	NC_007613	GGT	3	9	55089	55097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542666
1115	NC_007613	CGC	2	6	55152	55157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542666
1116	NC_007613	TG	3	6	55192	55197	0 %	50 %	50 %	0 %	82542666
1117	NC_007613	AGC	2	6	55214	55219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542666
1118	NC_007613	CAC	2	6	55269	55274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542666
1119	NC_007613	CG	3	6	55507	55512	0 %	0 %	50 %	50 %	82542666
1120	NC_007613	GGTTCA	2	12	55550	55561	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	82542666
1121	NC_007613	GCA	2	6	55619	55624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542666
1122	NC_007613	TTG	2	6	55630	55635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542666
1123	NC_007613	CAC	2	6	55689	55694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542666
1124	NC_007613	TCG	2	6	55711	55716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542666
1125	NC_007613	TCGCG	2	10	55721	55730	0 %	20 %	40 %	40 %	82542666
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1127	NC_007613	AAC	2	6	55818	55823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542666
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