MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 91891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_007613	CAGA	2	8	510424	510431	50 %	0 %	25 %	25 %	82543074
10502	NC_007613	GCA	2	6	510521	510526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543074
10503	NC_007613	GCGT	2	8	510628	510635	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10504	NC_007613	TCAAT	2	10	510667	510676	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10505	NC_007613	TTG	2	6	510680	510685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_007613	AGC	2	6	510744	510749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_007613	TTG	3	9	510774	510782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_007613	TGT	2	6	510897	510902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543075
10509	NC_007613	CAG	2	6	510965	510970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543075
10510	NC_007613	AAT	2	6	511000	511005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543075
10511	NC_007613	TGT	2	6	511050	511055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543075
10512	NC_007613	CT	3	6	511098	511103	0 %	50 %	0 %	50 %	82543075
10513	NC_007613	TC	3	6	511167	511172	0 %	50 %	0 %	50 %	82543075
10514	NC_007613	TCT	2	6	511178	511183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543075
10515	NC_007613	AG	3	6	511186	511191	50 %	0 %	50 %	0 %	82543075
10516	NC_007613	GAACA	2	10	511234	511243	60 %	0 %	20 %	20 %	82543075
10517	NC_007613	GAT	2	6	511282	511287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543075
10518	NC_007613	ACTG	2	8	511302	511309	25 %	25 %	25 %	25 %	82543075
10519	NC_007613	AGGA	2	8	511390	511397	50 %	0 %	50 %	0 %	82543075
10520	NC_007613	CCGA	2	8	511406	511413	25 %	0 %	25 %	50 %	82543075
10521	NC_007613	TCGT	2	8	511434	511441	0 %	50 %	25 %	25 %	82543075
10522	NC_007613	CTTC	2	8	511454	511461	0 %	50 %	0 %	50 %	82543075
10523	NC_007613	GC	3	6	511470	511475	0 %	0 %	50 %	50 %	82543075
10524	NC_007613	CTGA	2	8	511495	511502	25 %	25 %	25 %	25 %	82543075
10525	NC_007613	GACT	2	8	511601	511608	25 %	25 %	25 %	25 %	82543075
10526	NC_007613	G	6	6	511618	511623	0 %	0 %	100 %	0 %	82543075
10527	NC_007613	GAC	2	6	511742	511747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10528	NC_007613	ATT	2	6	511774	511779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_007613	ATA	2	6	511818	511823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_007613	A	6	6	511827	511832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_007613	AAT	2	6	511837	511842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_007613	GGAAC	2	10	511856	511865	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10533	NC_007613	TAT	2	6	512000	512005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_007613	AT	3	6	512057	512062	50 %	50 %	0 %	0 %	161984972
10535	NC_007613	TAG	2	6	512080	512085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161984972
10536	NC_007613	ATT	2	6	512119	512124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161984972
10537	NC_007613	GTC	2	6	512126	512131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161984972
10538	NC_007613	AAC	2	6	512247	512252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161984972
10539	NC_007613	TTTTC	2	10	512283	512292	0 %	80 %	0 %	20 %	161984972
10540	NC_007613	CAC	2	6	512359	512364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161984972
10541	NC_007613	CAAG	2	8	512373	512380	50 %	0 %	25 %	25 %	161984972
10542	NC_007613	ACAT	2	8	512429	512436	50 %	25 %	0 %	25 %	161984972
10543	NC_007613	TGT	2	6	512441	512446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161984972
10544	NC_007613	CCTG	2	8	512531	512538	0 %	25 %	25 %	50 %	161984972
10545	NC_007613	CCAG	2	8	512568	512575	25 %	0 %	25 %	50 %	161984972
10546	NC_007613	TCA	2	6	512579	512584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161984972
10547	NC_007613	ATC	2	6	512593	512598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161984972
10548	NC_007613	GAG	2	6	512741	512746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_007613	TTC	2	6	512825	512830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543077
10550	NC_007613	TGATAG	2	12	512866	512877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543077
10551	NC_007613	TGC	2	6	512899	512904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543077
10552	NC_007613	ACC	2	6	512958	512963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543077
10553	NC_007613	GTAA	2	8	513002	513009	50 %	25 %	25 %	0 %	82543077
10554	NC_007613	CGTAA	2	10	513064	513073	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10555	NC_007613	T	7	7	513105	513111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_007613	AACCA	2	10	513165	513174	60 %	0 %	0 %	40 %	82543078
10557	NC_007613	TTAAT	2	10	513186	513195	40 %	60 %	0 %	0 %	82543078
10558	NC_007613	GAA	2	6	513214	513219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543078
10559	NC_007613	CGA	2	6	513300	513305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543078
10560	NC_007613	GCG	2	6	513321	513326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543078
10561	NC_007613	CTG	2	6	513338	513343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543078
10562	NC_007613	AAACC	2	10	513442	513451	60 %	0 %	0 %	40 %	82543078
10563	NC_007613	GAA	2	6	513499	513504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543078
10564	NC_007613	T	6	6	513526	513531	0 %	100 %	0 %	0 %	82543078
10565	NC_007613	CAA	2	6	513612	513617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543078
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10569	NC_007613	CG	3	6	513800	513805	0 %	0 %	50 %	50 %	82543078
10570	NC_007613	TCA	2	6	513888	513893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543078
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10572	NC_007613	GAA	2	6	514028	514033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543078
10573	NC_007613	CGT	2	6	514065	514070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543078
10574	NC_007613	TCA	2	6	514140	514145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543078
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10576	NC_007613	GCA	2	6	514295	514300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543078
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10579	NC_007613	A	7	7	514405	514411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10580	NC_007613	CTA	2	6	514417	514422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10581	NC_007613	GGCA	2	8	514439	514446	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10582	NC_007613	GGT	2	6	514523	514528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543079
10583	NC_007613	TGC	2	6	514566	514571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543079
10584	NC_007613	GGC	2	6	514754	514759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543079
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10587	NC_007613	GAA	2	6	514951	514956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543079
10588	NC_007613	GCAG	2	8	515016	515023	25 %	0 %	50 %	25 %	82543079
10589	NC_007613	AAT	2	6	515093	515098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543079
10590	NC_007613	GTT	2	6	515120	515125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543079
10591	NC_007613	CG	3	6	515150	515155	0 %	0 %	50 %	50 %	82543079
10592	NC_007613	CAC	2	6	515207	515212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543079
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10594	NC_007613	CAT	2	6	515341	515346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543079
10595	NC_007613	GCC	2	6	515352	515357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543079
10596	NC_007613	CAT	2	6	515536	515541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543079
10597	NC_007613	ACA	2	6	515627	515632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543080
10598	NC_007613	TCC	2	6	515697	515702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82543080
10599	NC_007613	TACCA	2	10	515751	515760	40 %	20 %	0 %	40 %	82543080
10600	NC_007613	AAT	2	6	515782	515787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543080
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10603	NC_007613	GGC	2	6	515838	515843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543080
10604	NC_007613	CAG	2	6	515865	515870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543080
10605	NC_007613	AG	3	6	515876	515881	50 %	0 %	50 %	0 %	82543080
10606	NC_007613	CAGAAT	2	12	515886	515897	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	82543080
10607	NC_007613	CAGC	2	8	515988	515995	25 %	0 %	25 %	50 %	82543080
10608	NC_007613	CCG	2	6	516010	516015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543080
10609	NC_007613	AAT	2	6	516039	516044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543080
10610	NC_007613	CAT	2	6	516087	516092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543080
10611	NC_007613	CGCTGG	2	12	516097	516108	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	82543080
10612	NC_007613	GAA	2	6	516123	516128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543080
10613	NC_007613	CGC	2	6	516147	516152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543080
10614	NC_007613	ACT	2	6	516160	516165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543080
10615	NC_007613	AG	3	6	516195	516200	50 %	0 %	50 %	0 %	82543080
10616	NC_007613	CCA	2	6	516263	516268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543080
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10618	NC_007613	ACG	2	6	516317	516322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543080
10619	NC_007613	GC	3	6	516348	516353	0 %	0 %	50 %	50 %	82543080
10620	NC_007613	CCAG	2	8	516416	516423	25 %	0 %	25 %	50 %	82543080
10621	NC_007613	CCA	2	6	516464	516469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543080
10622	NC_007613	ATA	2	6	516475	516480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543080
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10624	NC_007613	GGA	2	6	516523	516528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82543080
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10995	NC_007613	ATC	2	6	534032	534037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543095
10996	NC_007613	TCG	2	6	534062	534067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543095
10997	NC_007613	CG	3	6	534097	534102	0 %	0 %	50 %	50 %	82543095
10998	NC_007613	GCT	3	9	534117	534125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543095
10999	NC_007613	CCG	2	6	534128	534133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543095
11000	NC_007613	AAT	2	6	534262	534267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543095

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