MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 91891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007613	TGT	2	6	24111	24116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542642
502	NC_007613	TGGT	2	8	24183	24190	0 %	50 %	50 %	0 %	82542642
503	NC_007613	CGC	2	6	24317	24322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542642
504	NC_007613	TGA	2	6	24329	24334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542642
505	NC_007613	TGC	2	6	24423	24428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542642
506	NC_007613	TCG	2	6	24438	24443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542642
507	NC_007613	CG	3	6	24456	24461	0 %	0 %	50 %	50 %	82542642
508	NC_007613	CTG	2	6	24466	24471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542642
509	NC_007613	TGG	2	6	24524	24529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542642
510	NC_007613	CAT	2	6	24669	24674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542642
511	NC_007613	CGT	2	6	24715	24720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542642
512	NC_007613	TGA	2	6	24795	24800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542642
513	NC_007613	AGCGA	2	10	24883	24892	40 %	0 %	40 %	20 %	82542642
514	NC_007613	GTGG	2	8	24976	24983	0 %	25 %	75 %	0 %	82542642
515	NC_007613	GGC	2	6	25026	25031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542642
516	NC_007613	ACG	2	6	25103	25108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542642
517	NC_007613	CTG	2	6	25112	25117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542642
518	NC_007613	CAG	2	6	25123	25128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542642
519	NC_007613	GCT	2	6	25190	25195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542642
520	NC_007613	CGGTGA	2	12	25269	25280	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	82542642
521	NC_007613	TGA	2	6	25297	25302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542642
522	NC_007613	GCTG	2	8	25330	25337	0 %	25 %	50 %	25 %	82542643
523	NC_007613	TGG	2	6	25342	25347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542643
524	NC_007613	GCA	2	6	25372	25377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542643
525	NC_007613	TCC	2	6	25387	25392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82542643
526	NC_007613	GCG	2	6	25464	25469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542643
527	NC_007613	GCG	2	6	25489	25494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542643
528	NC_007613	TGA	2	6	25552	25557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542643
529	NC_007613	ATT	2	6	25608	25613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542643
530	NC_007613	GGC	2	6	25614	25619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542643
531	NC_007613	GC	3	6	25618	25623	0 %	0 %	50 %	50 %	82542643
532	NC_007613	T	6	6	25763	25768	0 %	100 %	0 %	0 %	82542643
533	NC_007613	A	6	6	25782	25787	100 %	0 %	0 %	0 %	82542643
534	NC_007613	AAT	2	6	25789	25794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82542643
535	NC_007613	CGC	2	6	25819	25824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_007613	CGA	2	6	25918	25923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542644
537	NC_007613	CAC	2	6	25927	25932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542644
538	NC_007613	CAA	2	6	25948	25953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542644
539	NC_007613	ACC	2	6	26042	26047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542644
540	NC_007613	GCG	2	6	26066	26071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542644
541	NC_007613	CCG	2	6	26110	26115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542644
542	NC_007613	ATGG	2	8	26171	26178	25 %	25 %	50 %	0 %	82542644
543	NC_007613	TTG	2	6	26374	26379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542645
544	NC_007613	AT	3	6	26409	26414	50 %	50 %	0 %	0 %	82542645
545	NC_007613	GAA	2	6	26652	26657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542645
546	NC_007613	CAGTA	2	10	26709	26718	40 %	20 %	20 %	20 %	82542645
547	NC_007613	TG	3	6	26759	26764	0 %	50 %	50 %	0 %	82542645
548	NC_007613	TGG	2	6	26965	26970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542645
549	NC_007613	CTC	2	6	26984	26989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82542645
550	NC_007613	CG	3	6	27033	27038	0 %	0 %	50 %	50 %	82542645
551	NC_007613	TTGA	2	8	27042	27049	25 %	50 %	25 %	0 %	82542645
552	NC_007613	TGG	2	6	27145	27150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542645
553	NC_007613	GCA	2	6	27158	27163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542645
554	NC_007613	GGT	2	6	27171	27176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542645
555	NC_007613	GAA	2	6	27201	27206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542645
556	NC_007613	AGC	2	6	27270	27275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_007613	T	6	6	27312	27317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_007613	GCC	2	6	27386	27391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542646
559	NC_007613	TGA	2	6	27423	27428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542646
560	NC_007613	ACC	2	6	27461	27466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542646
561	NC_007613	CTG	2	6	27482	27487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542646
562	NC_007613	TGGC	2	8	27585	27592	0 %	25 %	50 %	25 %	82542646
563	NC_007613	TTG	2	6	27600	27605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542646
564	NC_007613	TGG	2	6	27687	27692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542646
565	NC_007613	TCG	2	6	27757	27762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542646
566	NC_007613	CTG	2	6	27783	27788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542646
567	NC_007613	CTGG	2	8	28045	28052	0 %	25 %	50 %	25 %	82542646
568	NC_007613	ACG	2	6	28124	28129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542646
569	NC_007613	CAG	2	6	28205	28210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542646
570	NC_007613	CGT	2	6	28236	28241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542646
571	NC_007613	TCAT	2	8	28269	28276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
572	NC_007613	TCCC	2	8	28299	28306	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
573	NC_007613	TGGC	2	8	28340	28347	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
574	NC_007613	ATG	2	6	28414	28419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542647
575	NC_007613	G	6	6	28449	28454	0 %	0 %	100 %	0 %	82542647
576	NC_007613	GCC	2	6	28462	28467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542647
577	NC_007613	GGC	2	6	28478	28483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542647
578	NC_007613	GCG	2	6	28512	28517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542647
579	NC_007613	TCT	2	6	28533	28538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542647
580	NC_007613	GCTG	2	8	28562	28569	0 %	25 %	50 %	25 %	82542647
581	NC_007613	GAT	2	6	28620	28625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542647
582	NC_007613	GCC	2	6	28761	28766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542647
583	NC_007613	GCC	2	6	28785	28790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542647
584	NC_007613	GCT	2	6	28823	28828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542647
585	NC_007613	AGC	2	6	28835	28840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542647
586	NC_007613	ATT	2	6	28872	28877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542647
587	NC_007613	CAT	2	6	28884	28889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542647
588	NC_007613	CGTG	2	8	29039	29046	0 %	25 %	50 %	25 %	82542647
589	NC_007613	ATTTA	2	10	29266	29275	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_007613	TCT	2	6	29364	29369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_007613	TGT	2	6	29375	29380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_007613	TCT	2	6	29440	29445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_007613	CATG	2	8	29508	29515	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
594	NC_007613	ATA	2	6	29525	29530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_007613	A	6	6	29532	29537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_007613	GCC	2	6	29580	29585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_007613	TCG	2	6	29599	29604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_007613	TCA	2	6	29630	29635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_007613	AGTG	2	8	29658	29665	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_007613	CGG	2	6	29759	29764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542648
601	NC_007613	TCCT	2	8	29820	29827	0 %	50 %	0 %	50 %	82542648
602	NC_007613	CTTA	2	8	29848	29855	25 %	50 %	0 %	25 %	82542648
603	NC_007613	GAA	2	6	29893	29898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542648
604	NC_007613	TCT	2	6	29899	29904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542648
605	NC_007613	CT	3	6	29977	29982	0 %	50 %	0 %	50 %	82542648
606	NC_007613	GCG	2	6	30103	30108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542648
607	NC_007613	CG	3	6	30127	30132	0 %	0 %	50 %	50 %	82542648
608	NC_007613	ACC	2	6	30172	30177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542648
609	NC_007613	CGG	2	6	30219	30224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542648
610	NC_007613	A	6	6	30238	30243	100 %	0 %	0 %	0 %	82542648
611	NC_007613	CGT	2	6	30264	30269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542648
612	NC_007613	TGG	2	6	30311	30316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542648
613	NC_007613	TCA	2	6	30498	30503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542648
614	NC_007613	GCT	2	6	30504	30509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542648
615	NC_007613	CAC	2	6	30553	30558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542648
616	NC_007613	GGC	2	6	30559	30564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542648
617	NC_007613	GTG	2	6	30595	30600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542648
618	NC_007613	AGCC	2	8	30750	30757	25 %	0 %	25 %	50 %	82542648
619	NC_007613	ACG	2	6	30767	30772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542648
620	NC_007613	GTT	2	6	30780	30785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542648
621	NC_007613	ACT	2	6	30931	30936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542649
622	NC_007613	GC	3	6	30940	30945	0 %	0 %	50 %	50 %	82542649
623	NC_007613	CAT	2	6	31010	31015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542649
624	NC_007613	GACC	2	8	31016	31023	25 %	0 %	25 %	50 %	82542649
625	NC_007613	AGT	2	6	31067	31072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542649
626	NC_007613	ATT	2	6	31080	31085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542649
627	NC_007613	TGC	2	6	31108	31113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542649
628	NC_007613	CTGGAG	2	12	31149	31160	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	82542649
629	NC_007613	CCG	2	6	31207	31212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542649
630	NC_007613	AGA	2	6	31229	31234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542649
631	NC_007613	CCG	2	6	31235	31240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542649
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760	NC_007613	TGCG	2	8	37075	37082	0 %	25 %	50 %	25 %	82542653
761	NC_007613	CGG	2	6	37091	37096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542653
762	NC_007613	GCG	2	6	37120	37125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542653
763	NC_007613	CTG	2	6	37128	37133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542653
764	NC_007613	CTC	2	6	37202	37207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82542653
765	NC_007613	ATGA	2	8	37230	37237	50 %	25 %	25 %	0 %	82542653
766	NC_007613	TGC	2	6	37282	37287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542653
767	NC_007613	TGG	2	6	37315	37320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542653
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770	NC_007613	CT	3	6	37375	37380	0 %	50 %	0 %	50 %	82542653
771	NC_007613	GCTGGT	2	12	37403	37414	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	82542653
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773	NC_007613	CGATGG	2	12	37549	37560	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	82542653
774	NC_007613	GGCG	2	8	37571	37578	0 %	0 %	75 %	25 %	82542653
775	NC_007613	CTG	2	6	37581	37586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542653
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783	NC_007613	GGC	2	6	37934	37939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542653
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798	NC_007613	TGGC	2	8	38618	38625	0 %	25 %	50 %	25 %	82542653
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801	NC_007613	TAA	2	6	38691	38696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82542653
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