MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shigella boydii Sb227 plasmid pSB4_227

Total Repeats: 209

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007608	AG	3	6	65	70	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007608	CT	3	6	1006	1011	0 %	50 %	0 %	50 %	161984778
3	NC_007608	TC	4	8	1281	1288	0 %	50 %	0 %	50 %	161984778
4	NC_007608	TG	3	6	1986	1991	0 %	50 %	50 %	0 %	82524668
5	NC_007608	AT	3	6	2491	2496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007608	GA	3	6	2653	2658	50 %	0 %	50 %	0 %	82524669
7	NC_007608	CT	3	6	3134	3139	0 %	50 %	0 %	50 %	82524669
8	NC_007608	AT	3	6	4788	4793	50 %	50 %	0 %	0 %	82524671
9	NC_007608	AT	3	6	6066	6071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007608	CT	3	6	6336	6341	0 %	50 %	0 %	50 %	161984779
11	NC_007608	TC	4	8	6611	6618	0 %	50 %	0 %	50 %	161984779
12	NC_007608	TG	3	6	7316	7321	0 %	50 %	50 %	0 %	82524674
13	NC_007608	AT	3	6	7554	7559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007608	TG	3	6	7580	7585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007608	AT	4	8	7705	7712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007608	AG	3	6	7849	7854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007608	TG	3	6	7864	7869	0 %	50 %	50 %	0 %	82524675
18	NC_007608	AT	3	6	8847	8852	50 %	50 %	0 %	0 %	82524677
19	NC_007608	TA	3	6	10122	10127	50 %	50 %	0 %	0 %	82524679
20	NC_007608	TG	3	6	10182	10187	0 %	50 %	50 %	0 %	82524679
21	NC_007608	TA	3	6	10584	10589	50 %	50 %	0 %	0 %	82524679
22	NC_007608	AT	3	6	10719	10724	50 %	50 %	0 %	0 %	82524679
23	NC_007608	AT	4	8	11277	11284	50 %	50 %	0 %	0 %	82524679
24	NC_007608	AT	3	6	12457	12462	50 %	50 %	0 %	0 %	82524680
25	NC_007608	AT	3	6	12532	12537	50 %	50 %	0 %	0 %	82524680
26	NC_007608	AT	3	6	12670	12675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007608	GC	3	6	13320	13325	0 %	0 %	50 %	50 %	82524681
28	NC_007608	TA	3	6	13696	13701	50 %	50 %	0 %	0 %	82524682
29	NC_007608	AT	3	6	13848	13853	50 %	50 %	0 %	0 %	82524682
30	NC_007608	AT	3	6	13980	13985	50 %	50 %	0 %	0 %	82524682
31	NC_007608	GT	3	6	14202	14207	0 %	50 %	50 %	0 %	82524682
32	NC_007608	TA	4	8	14215	14222	50 %	50 %	0 %	0 %	82524682
33	NC_007608	AT	5	10	14291	14300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007608	CT	3	6	14781	14786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007608	AC	3	6	17151	17156	50 %	0 %	0 %	50 %	82524686
36	NC_007608	GA	3	6	17457	17462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007608	TG	3	6	17709	17714	0 %	50 %	50 %	0 %	82524687
38	NC_007608	AT	3	6	21021	21026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007608	AT	3	6	21737	21742	50 %	50 %	0 %	0 %	82524694
40	NC_007608	AT	3	6	21745	21750	50 %	50 %	0 %	0 %	82524694
41	NC_007608	TG	3	6	21906	21911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007608	AG	3	6	22379	22384	50 %	0 %	50 %	0 %	82524695
43	NC_007608	CT	3	6	22816	22821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007608	AG	3	6	22827	22832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007608	AT	3	6	23459	23464	50 %	50 %	0 %	0 %	82524696
46	NC_007608	AT	3	6	23620	23625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007608	GA	3	6	23928	23933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007608	TC	4	8	26479	26486	0 %	50 %	0 %	50 %	82524699
49	NC_007608	CG	3	6	26708	26713	0 %	0 %	50 %	50 %	82524699
50	NC_007608	TC	3	6	26822	26827	0 %	50 %	0 %	50 %	82524699
51	NC_007608	AC	3	6	28067	28072	50 %	0 %	0 %	50 %	82524702
52	NC_007608	GT	3	6	29217	29222	0 %	50 %	50 %	0 %	82524704
53	NC_007608	GC	3	6	29731	29736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007608	CG	3	6	29994	29999	0 %	0 %	50 %	50 %	82524706
55	NC_007608	GT	3	6	30192	30197	0 %	50 %	50 %	0 %	82524706
56	NC_007608	GA	3	6	30884	30889	50 %	0 %	50 %	0 %	82524706
57	NC_007608	AG	3	6	31543	31548	50 %	0 %	50 %	0 %	82524707
58	NC_007608	AT	3	6	31694	31699	50 %	50 %	0 %	0 %	82524707
59	NC_007608	GA	3	6	32978	32983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007608	TA	3	6	35059	35064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007608	TA	3	6	38978	38983	50 %	50 %	0 %	0 %	82524715
62	NC_007608	CG	3	6	40025	40030	0 %	0 %	50 %	50 %	82524716
63	NC_007608	TG	3	6	40370	40375	0 %	50 %	50 %	0 %	82524717
64	NC_007608	AG	3	6	42675	42680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007608	TA	3	6	44707	44712	50 %	50 %	0 %	0 %	82524722
66	NC_007608	TC	3	6	44961	44966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007608	AT	3	6	45002	45007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007608	AT	3	6	45117	45122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007608	CA	3	6	45766	45771	50 %	0 %	0 %	50 %	82524723
70	NC_007608	AT	3	6	47291	47296	50 %	50 %	0 %	0 %	82524725
71	NC_007608	TG	3	6	47884	47889	0 %	50 %	50 %	0 %	82524727
72	NC_007608	TA	3	6	52273	52278	50 %	50 %	0 %	0 %	82524730
73	NC_007608	GT	3	6	52700	52705	0 %	50 %	50 %	0 %	82524730
74	NC_007608	TG	3	6	53101	53106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007608	AC	3	6	53538	53543	50 %	0 %	0 %	50 %	82524731
76	NC_007608	CA	3	6	54737	54742	50 %	0 %	0 %	50 %	82524732
77	NC_007608	GT	3	6	55096	55101	0 %	50 %	50 %	0 %	82524732
78	NC_007608	GC	3	6	55532	55537	0 %	0 %	50 %	50 %	82524733
79	NC_007608	TC	4	8	56218	56225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007608	CG	3	6	56334	56339	0 %	0 %	50 %	50 %	82524736
81	NC_007608	TC	3	6	56521	56526	0 %	50 %	0 %	50 %	82524736
82	NC_007608	CA	3	6	56527	56532	50 %	0 %	0 %	50 %	82524736
83	NC_007608	AC	3	6	57527	57532	50 %	0 %	0 %	50 %	82524737
84	NC_007608	GA	3	6	57833	57838	50 %	0 %	50 %	0 %	82524737
85	NC_007608	GC	3	6	58188	58193	0 %	0 %	50 %	50 %	82524738
86	NC_007608	CT	3	6	58321	58326	0 %	50 %	0 %	50 %	82524738
87	NC_007608	TG	3	6	59190	59195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007608	CT	3	6	60237	60242	0 %	50 %	0 %	50 %	82524739
89	NC_007608	TA	3	6	61303	61308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007608	AT	3	6	61572	61577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007608	AT	3	6	61631	61636	50 %	50 %	0 %	0 %	82524740
92	NC_007608	TA	4	8	61891	61898	50 %	50 %	0 %	0 %	82524740
93	NC_007608	AT	3	6	62375	62380	50 %	50 %	0 %	0 %	82524740
94	NC_007608	AT	3	6	62715	62720	50 %	50 %	0 %	0 %	82524740
95	NC_007608	GA	3	6	62823	62828	50 %	0 %	50 %	0 %	82524740
96	NC_007608	AT	3	6	63030	63035	50 %	50 %	0 %	0 %	82524740
97	NC_007608	TA	4	8	63121	63128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007608	AT	3	6	63453	63458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007608	TG	3	6	63544	63549	0 %	50 %	50 %	0 %	82524741
100	NC_007608	GA	3	6	63952	63957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007608	AG	3	6	64109	64114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007608	TG	3	6	64267	64272	0 %	50 %	50 %	0 %	82524742
103	NC_007608	CG	3	6	64334	64339	0 %	0 %	50 %	50 %	82524742
104	NC_007608	TG	3	6	65022	65027	0 %	50 %	50 %	0 %	82524744
105	NC_007608	GT	3	6	65575	65580	0 %	50 %	50 %	0 %	82524744
106	NC_007608	AG	3	6	65950	65955	50 %	0 %	50 %	0 %	82524743
107	NC_007608	CG	3	6	66030	66035	0 %	0 %	50 %	50 %	82524743
108	NC_007608	AG	3	6	66428	66433	50 %	0 %	50 %	0 %	82524745
109	NC_007608	GC	3	6	66810	66815	0 %	0 %	50 %	50 %	82524745
110	NC_007608	GT	3	6	66982	66987	0 %	50 %	50 %	0 %	82524745
111	NC_007608	CG	3	6	67018	67023	0 %	0 %	50 %	50 %	82524745
112	NC_007608	AT	3	6	67500	67505	50 %	50 %	0 %	0 %	82524745
113	NC_007608	AG	3	6	69441	69446	50 %	0 %	50 %	0 %	82524747
114	NC_007608	AC	3	6	69788	69793	50 %	0 %	0 %	50 %	82524747
115	NC_007608	AT	3	6	70096	70101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007608	AT	3	6	70106	70111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007608	GC	3	6	70395	70400	0 %	0 %	50 %	50 %	82524748
118	NC_007608	TC	3	6	70750	70755	0 %	50 %	0 %	50 %	82524749
119	NC_007608	GT	3	6	71056	71061	0 %	50 %	50 %	0 %	82524749
120	NC_007608	GT	3	6	72055	72060	0 %	50 %	50 %	0 %	82524750
121	NC_007608	GA	3	6	72062	72067	50 %	0 %	50 %	0 %	82524750
122	NC_007608	TG	3	6	72182	72187	0 %	50 %	50 %	0 %	82524750
123	NC_007608	CG	3	6	72249	72254	0 %	0 %	50 %	50 %	82524750
124	NC_007608	AG	4	8	72362	72369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007608	AT	3	6	72764	72769	50 %	50 %	0 %	0 %	82524752
126	NC_007608	CA	3	6	73889	73894	50 %	0 %	0 %	50 %	82524753
127	NC_007608	TC	3	6	75332	75337	0 %	50 %	0 %	50 %	82524754
128	NC_007608	AT	3	6	77517	77522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007608	AT	3	6	77572	77577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007608	AT	3	6	78421	78426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007608	AT	3	6	78534	78539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007608	TA	3	6	78709	78714	50 %	50 %	0 %	0 %	157042765
133	NC_007608	GA	3	6	79067	79072	50 %	0 %	50 %	0 %	82524758
134	NC_007608	CT	3	6	79258	79263	0 %	50 %	0 %	50 %	82524758
135	NC_007608	TC	3	6	81294	81299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007608	CT	3	6	81738	81743	0 %	50 %	0 %	50 %	161984780
137	NC_007608	TC	4	8	82013	82020	0 %	50 %	0 %	50 %	161984780
138	NC_007608	TG	3	6	82718	82723	0 %	50 %	50 %	0 %	82524762
139	NC_007608	AT	3	6	83147	83152	50 %	50 %	0 %	0 %	82524763
140	NC_007608	CT	3	6	83635	83640	0 %	50 %	0 %	50 %	82524764
141	NC_007608	TA	4	8	83890	83897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007608	AC	3	6	85004	85009	50 %	0 %	0 %	50 %	82524766
143	NC_007608	AT	3	6	86324	86329	50 %	50 %	0 %	0 %	82524767
144	NC_007608	AG	3	6	86553	86558	50 %	0 %	50 %	0 %	82524767
145	NC_007608	AT	3	6	87686	87691	50 %	50 %	0 %	0 %	82524768
146	NC_007608	TG	3	6	89269	89274	0 %	50 %	50 %	0 %	82524770
147	NC_007608	TG	3	6	90996	91001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007608	AT	3	6	91552	91557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007608	AG	4	8	91845	91852	50 %	0 %	50 %	0 %	228861767
150	NC_007608	AG	3	6	93065	93070	50 %	0 %	50 %	0 %	82524776
151	NC_007608	TA	3	6	94322	94327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007608	TA	3	6	94333	94338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007608	CA	3	6	94807	94812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_007608	TG	3	6	94834	94839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_007608	AT	3	6	96131	96136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_007608	GA	3	6	96798	96803	50 %	0 %	50 %	0 %	82524779
157	NC_007608	TA	3	6	96911	96916	50 %	50 %	0 %	0 %	82524779
158	NC_007608	AT	3	6	98454	98459	50 %	50 %	0 %	0 %	82524781
159	NC_007608	GA	3	6	98561	98566	50 %	0 %	50 %	0 %	82524781
160	NC_007608	GT	3	6	100214	100219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_007608	CA	3	6	100902	100907	50 %	0 %	0 %	50 %	82524783
162	NC_007608	GT	4	8	102380	102387	0 %	50 %	50 %	0 %	82524786
163	NC_007608	AT	3	6	102484	102489	50 %	50 %	0 %	0 %	82524786
164	NC_007608	TC	3	6	102710	102715	0 %	50 %	0 %	50 %	82524786
165	NC_007608	AC	3	6	103401	103406	50 %	0 %	0 %	50 %	82524789
166	NC_007608	AG	3	6	104718	104723	50 %	0 %	50 %	0 %	82524789
167	NC_007608	CA	3	6	105309	105314	50 %	0 %	0 %	50 %	82524789
168	NC_007608	GA	3	6	105808	105813	50 %	0 %	50 %	0 %	82524789
169	NC_007608	GC	3	6	105852	105857	0 %	0 %	50 %	50 %	82524789
170	NC_007608	CA	3	6	105930	105935	50 %	0 %	0 %	50 %	82524789
171	NC_007608	CA	3	6	106008	106013	50 %	0 %	0 %	50 %	82524789
172	NC_007608	TG	3	6	108873	108878	0 %	50 %	50 %	0 %	82524790
173	NC_007608	TG	3	6	109425	109430	0 %	50 %	50 %	0 %	82524791
174	NC_007608	AG	4	8	109600	109607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
175	NC_007608	TG	3	6	110109	110114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
176	NC_007608	AT	3	6	110180	110185	50 %	50 %	0 %	0 %	82524793
177	NC_007608	AC	3	6	111874	111879	50 %	0 %	0 %	50 %	82524796
178	NC_007608	GA	4	8	111937	111944	50 %	0 %	50 %	0 %	82524796
179	NC_007608	GC	3	6	112809	112814	0 %	0 %	50 %	50 %	82524797
180	NC_007608	CA	3	6	114277	114282	50 %	0 %	0 %	50 %	82524798
181	NC_007608	CA	3	6	114349	114354	50 %	0 %	0 %	50 %	82524798
182	NC_007608	TC	4	8	114571	114578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
183	NC_007608	CG	3	6	114687	114692	0 %	0 %	50 %	50 %	82524799
184	NC_007608	TC	3	6	114874	114879	0 %	50 %	0 %	50 %	82524799
185	NC_007608	CA	3	6	114880	114885	50 %	0 %	0 %	50 %	82524799
186	NC_007608	GC	3	6	115103	115108	0 %	0 %	50 %	50 %	82524799
187	NC_007608	AG	3	6	116012	116017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
188	NC_007608	AT	4	8	116605	116612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_007608	TC	3	6	117030	117035	0 %	50 %	0 %	50 %	82524801
190	NC_007608	CT	3	6	117194	117199	0 %	50 %	0 %	50 %	82524801
191	NC_007608	AT	3	6	117478	117483	50 %	50 %	0 %	0 %	82524801
192	NC_007608	AT	3	6	117837	117842	50 %	50 %	0 %	0 %	82524801
193	NC_007608	AT	3	6	118265	118270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_007608	CG	3	6	118431	118436	0 %	0 %	50 %	50 %	82524802
195	NC_007608	TC	3	6	118618	118623	0 %	50 %	0 %	50 %	82524802
196	NC_007608	CA	3	6	118624	118629	50 %	0 %	0 %	50 %	82524802
197	NC_007608	GC	3	6	118847	118852	0 %	0 %	50 %	50 %	82524802
198	NC_007608	TG	3	6	119849	119854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
199	NC_007608	AT	3	6	121217	121222	50 %	50 %	0 %	0 %	82524805
200	NC_007608	TG	3	6	121810	121815	0 %	50 %	50 %	0 %	82524807
201	NC_007608	TC	3	6	123316	123321	0 %	50 %	0 %	50 %	82524810
202	NC_007608	TA	3	6	123398	123403	50 %	50 %	0 %	0 %	82524810
203	NC_007608	AT	3	6	123710	123715	50 %	50 %	0 %	0 %	82524810
204	NC_007608	TA	3	6	123770	123775	50 %	50 %	0 %	0 %	82524810
205	NC_007608	GA	3	6	125101	125106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
206	NC_007608	AG	3	6	125843	125848	50 %	0 %	50 %	0 %	82524812
207	NC_007608	TA	3	6	126174	126179	50 %	50 %	0 %	0 %	82524812
208	NC_007608	AT	3	6	126244	126249	50 %	50 %	0 %	0 %	82524812
209	NC_007608	AT	3	6	126281	126286	50 %	50 %	0 %	0 %	82524812

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.