MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Shigella boydii Sb227 plasmid pSB4_227

Total Repeats: 1539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007608	TGA	2	6	5	10	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007608	TGC	2	6	314	319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524666
3	NC_007608	CCG	2	6	415	420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524666
4	NC_007608	TTC	2	6	423	428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524666
5	NC_007608	CAA	2	6	433	438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524666
6	NC_007608	AAT	2	6	727	732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524665
7	NC_007608	TTG	2	6	773	778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007608	TGC	2	6	939	944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161984778
9	NC_007608	CCG	2	6	1040	1045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984778
10	NC_007608	TTC	2	6	1048	1053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161984778
11	NC_007608	GAC	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
12	NC_007608	GCG	2	6	1161	1166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984778
13	NC_007608	GCC	2	6	1212	1217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984778
14	NC_007608	CAG	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
15	NC_007608	CAG	2	6	1297	1302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
16	NC_007608	ACA	2	6	1384	1389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161984778
17	NC_007608	AGC	2	6	1486	1491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
18	NC_007608	CGA	2	6	1501	1506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
19	NC_007608	ATC	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161984778
20	NC_007608	GAC	2	6	1574	1579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
21	NC_007608	GCG	2	6	1581	1586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984778
22	NC_007608	CTT	2	6	1735	1740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524668
23	NC_007608	GAG	2	6	1742	1747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524668
24	NC_007608	GGC	2	6	1805	1810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524668
25	NC_007608	AAC	2	6	1829	1834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524668
26	NC_007608	CGG	2	6	1843	1848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524668
27	NC_007608	CAG	2	6	1852	1857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524668
28	NC_007608	CTG	2	6	1961	1966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524668
29	NC_007608	AGC	2	6	2123	2128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007608	TCA	2	6	2141	2146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007608	GAT	2	6	2263	2268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007608	TAT	2	6	2297	2302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007608	AAT	2	6	2347	2352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007608	AAG	2	6	2433	2438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007608	ATG	2	6	2474	2479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007608	ATA	2	6	2592	2597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524669
37	NC_007608	TCA	2	6	2613	2618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524669
38	NC_007608	AGC	2	6	2633	2638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524669
39	NC_007608	ATG	2	6	2677	2682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524669
40	NC_007608	ACA	2	6	2699	2704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524669
41	NC_007608	TAA	2	6	2821	2826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524669
42	NC_007608	ATG	3	9	2830	2838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524669
43	NC_007608	TGC	3	9	2849	2857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524669
44	NC_007608	TAA	2	6	2918	2923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524669
45	NC_007608	TCA	2	6	2957	2962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524669
46	NC_007608	CTG	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524669
47	NC_007608	CTG	2	6	3304	3309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524669
48	NC_007608	AAG	2	6	3329	3334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524669
49	NC_007608	TAT	2	6	3353	3358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524669
50	NC_007608	TAA	2	6	3359	3364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524669
51	NC_007608	TAG	2	6	3437	3442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007608	ATC	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007608	ATA	2	6	3480	3485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007608	CAT	2	6	3521	3526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007608	TAC	2	6	3532	3537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007608	ATT	2	6	3538	3543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007608	TTA	2	6	3567	3572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007608	ATC	2	6	3675	3680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007608	TCT	2	6	3724	3729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524670
60	NC_007608	CAA	2	6	3800	3805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524670
61	NC_007608	CCG	2	6	3833	3838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524670
62	NC_007608	AGT	2	6	3856	3861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524670
63	NC_007608	TAC	2	6	3944	3949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524670
64	NC_007608	GTT	2	6	4024	4029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524670
65	NC_007608	TAC	2	6	4038	4043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524670
66	NC_007608	GTT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524670
67	NC_007608	ATA	2	6	4359	4364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524670
68	NC_007608	GAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524670
69	NC_007608	AGG	2	6	4509	4514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007608	CAC	2	6	4527	4532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_007608	TTA	2	6	4603	4608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007608	TGC	2	6	4609	4614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007608	GAT	2	6	4625	4630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007608	CAC	2	6	4688	4693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_007608	ATT	2	6	4945	4950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007608	TGT	2	6	5086	5091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524672
77	NC_007608	CAG	2	6	5220	5225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524672
78	NC_007608	AGA	2	6	5230	5235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524672
79	NC_007608	TCC	2	6	5285	5290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524672
80	NC_007608	CAC	2	6	5630	5635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_007608	CAT	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007608	GCA	2	6	5728	5733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007608	TAA	3	9	5769	5777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007608	GAA	2	6	5801	5806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007608	TAT	2	6	5824	5829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007608	ATG	2	6	5880	5885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007608	GCT	2	6	5969	5974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007608	AGA	3	9	6040	6048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007608	TTG	2	6	6086	6091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007608	CAA	2	6	6116	6121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007608	TGC	2	6	6269	6274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161984779
92	NC_007608	CCG	2	6	6370	6375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984779
93	NC_007608	TTC	2	6	6378	6383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161984779
94	NC_007608	GAC	2	6	6468	6473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984779
95	NC_007608	GCG	2	6	6491	6496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984779
96	NC_007608	GCC	2	6	6542	6547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984779
97	NC_007608	CAG	2	6	6582	6587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984779
98	NC_007608	CAG	2	6	6627	6632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984779
99	NC_007608	CAG	2	6	6715	6720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984779
100	NC_007608	AGC	2	6	6816	6821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984779
101	NC_007608	CGA	2	6	6831	6836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984779
102	NC_007608	ATC	2	6	6893	6898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161984779
103	NC_007608	GAC	2	6	6904	6909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984779
104	NC_007608	GCG	2	6	6911	6916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984779
105	NC_007608	CTT	2	6	7065	7070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524674
106	NC_007608	GAG	2	6	7072	7077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524674
107	NC_007608	GGC	2	6	7135	7140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524674
108	NC_007608	AAC	2	6	7159	7164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524674
109	NC_007608	CGG	2	6	7173	7178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524674
110	NC_007608	CAG	2	6	7182	7187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524674
111	NC_007608	CTG	2	6	7291	7296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524674
112	NC_007608	ATT	2	6	7465	7470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007608	TAT	2	6	7586	7591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007608	TGT	2	6	7615	7620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007608	CCT	2	6	7658	7663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_007608	ATT	2	6	7676	7681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007608	TAT	2	6	7689	7694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007608	CAT	2	6	7787	7792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007608	AAT	2	6	7803	7808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007608	CAA	2	6	7841	7846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007608	TAG	2	6	7873	7878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524675
122	NC_007608	AAC	2	6	7924	7929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524675
123	NC_007608	GTT	2	6	8031	8036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524675
124	NC_007608	GCT	2	6	8056	8061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524675
125	NC_007608	GCT	2	6	8073	8078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524675
126	NC_007608	CAC	3	9	8109	8117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524675
127	NC_007608	TCC	2	6	8258	8263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_007608	CCG	2	6	8299	8304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_007608	CAG	2	6	8459	8464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524676
130	NC_007608	GCC	2	6	8611	8616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524676
131	NC_007608	TCA	2	6	8676	8681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524676
132	NC_007608	TAA	2	6	8721	8726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524676
133	NC_007608	TTG	2	6	8774	8779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007608	GCG	2	6	8954	8959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524677
135	NC_007608	ATT	2	6	9095	9100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524677
136	NC_007608	GGA	3	9	9314	9322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007608	GAC	2	6	9336	9341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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266	NC_007608	TGT	2	6	18971	18976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524691
267	NC_007608	CGT	2	6	19029	19034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_007608	CTG	2	6	19092	19097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524692
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280	NC_007608	CAC	2	6	20018	20023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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291	NC_007608	GCA	2	6	20865	20870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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391	NC_007608	GAA	2	6	29607	29612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524705
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