MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii Sb227 plasmid pSB4_227

Total Repeats: 2544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_007608	ATGC	2	8	99993	100000	25 %	25 %	25 %	25 %	82524782
2002	NC_007608	TGG	2	6	100059	100064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524782
2003	NC_007608	GTT	2	6	100172	100177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_007608	GT	3	6	100214	100219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_007608	GGA	2	6	100234	100239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_007608	ATTTA	2	10	100262	100271	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_007608	T	6	6	100364	100369	0 %	100 %	0 %	0 %	82524783
2008	NC_007608	TGA	2	6	100395	100400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524783
2009	NC_007608	TGCC	2	8	100424	100431	0 %	25 %	25 %	50 %	82524783
2010	NC_007608	CAGC	2	8	100505	100512	25 %	0 %	25 %	50 %	82524783
2011	NC_007608	CAG	2	6	100601	100606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524783
2012	NC_007608	TGA	2	6	100609	100614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524783
2013	NC_007608	GCC	2	6	100637	100642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524783
2014	NC_007608	ATA	2	6	100688	100693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524783
2015	NC_007608	ACC	2	6	100716	100721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524783
2016	NC_007608	CTTCAT	2	12	100783	100794	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	82524783
2017	NC_007608	TGC	2	6	100841	100846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524783
2018	NC_007608	CA	3	6	100902	100907	50 %	0 %	0 %	50 %	82524783
2019	NC_007608	GCG	2	6	100928	100933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2020	NC_007608	TGT	2	6	101085	101090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524784
2021	NC_007608	TCAGAT	2	12	101092	101103	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82524784
2022	NC_007608	GCCA	2	8	101179	101186	25 %	0 %	25 %	50 %	82524784
2023	NC_007608	CAG	2	6	101219	101224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524784
2024	NC_007608	AGA	2	6	101229	101234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524784
2025	NC_007608	TCC	2	6	101284	101289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524784
2026	NC_007608	CAGC	2	8	101312	101319	25 %	0 %	25 %	50 %	82524784
2027	NC_007608	ATCAC	2	10	101376	101385	40 %	20 %	0 %	40 %	82524784
2028	NC_007608	T	6	6	101426	101431	0 %	100 %	0 %	0 %	82524784
2029	NC_007608	CAC	2	6	101629	101634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2030	NC_007608	AGGA	2	8	101652	101659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_007608	ATGGAA	2	12	101666	101677	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_007608	CAT	2	6	101702	101707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2033	NC_007608	GCA	2	6	101727	101732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2034	NC_007608	GTC	2	6	101844	101849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524785
2035	NC_007608	GTT	2	6	101885	101890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524785
2036	NC_007608	TCA	2	6	101943	101948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524785
2037	NC_007608	AAG	2	6	101954	101959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524785
2038	NC_007608	G	6	6	101987	101992	0 %	0 %	100 %	0 %	82524785
2039	NC_007608	GAA	2	6	102020	102025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524785
2040	NC_007608	GTG	2	6	102071	102076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524785
2041	NC_007608	GCA	2	6	102100	102105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524785
2042	NC_007608	ATC	2	6	102111	102116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524785
2043	NC_007608	GCA	2	6	102127	102132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524785
2044	NC_007608	CGT	2	6	102140	102145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524785
2045	NC_007608	GGA	2	6	102181	102186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524785
2046	NC_007608	GAT	2	6	102200	102205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524785
2047	NC_007608	TGA	2	6	102209	102214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524785
2048	NC_007608	GCC	2	6	102244	102249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524786
2049	NC_007608	TTA	2	6	102272	102277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524786
2050	NC_007608	AAT	2	6	102283	102288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524786
2051	NC_007608	GT	4	8	102380	102387	0 %	50 %	50 %	0 %	82524786
2052	NC_007608	GCA	2	6	102392	102397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524786
2053	NC_007608	CGT	2	6	102399	102404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524786
2054	NC_007608	T	6	6	102471	102476	0 %	100 %	0 %	0 %	82524786
2055	NC_007608	AT	3	6	102484	102489	50 %	50 %	0 %	0 %	82524786
2056	NC_007608	TC	3	6	102710	102715	0 %	50 %	0 %	50 %	82524786
2057	NC_007608	GGT	2	6	102834	102839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524786
2058	NC_007608	ATT	2	6	102844	102849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524786
2059	NC_007608	CCT	2	6	102852	102857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524786
2060	NC_007608	ATG	2	6	102927	102932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524786
2061	NC_007608	ATT	2	6	102970	102975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524788
2062	NC_007608	CAA	2	6	102980	102985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524788
2063	NC_007608	GCA	2	6	103006	103011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524788
2064	NC_007608	GGCC	2	8	103025	103032	0 %	0 %	50 %	50 %	82524788
2065	NC_007608	AAC	2	6	103042	103047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524788
2066	NC_007608	GACCT	2	10	103167	103176	20 %	20 %	20 %	40 %	82524788
2067	NC_007608	ATG	2	6	103200	103205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524788
2068	NC_007608	G	7	7	103215	103221	0 %	0 %	100 %	0 %	82524788
2069	NC_007608	TCA	2	6	103271	103276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524788
2070	NC_007608	GAT	2	6	103305	103310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524788
2071	NC_007608	GACG	2	8	103311	103318	25 %	0 %	50 %	25 %	82524788
2072	NC_007608	AC	3	6	103401	103406	50 %	0 %	0 %	50 %	82524789
2073	NC_007608	GGT	2	6	103413	103418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524789
2074	NC_007608	GCA	2	6	103431	103436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524789
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2077	NC_007608	CGCA	2	8	103837	103844	25 %	0 %	25 %	50 %	82524789
2078	NC_007608	GCA	2	6	103881	103886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524789
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2080	NC_007608	GCC	2	6	103974	103979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524789
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2082	NC_007608	CAT	2	6	104127	104132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524789
2083	NC_007608	CCGT	2	8	104220	104227	0 %	25 %	25 %	50 %	82524789
2084	NC_007608	ATG	2	6	104293	104298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524789
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2087	NC_007608	CGT	2	6	104401	104406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524789
2088	NC_007608	TCG	2	6	104450	104455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524789
2089	NC_007608	CTG	2	6	104494	104499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524789
2090	NC_007608	G	6	6	104616	104621	0 %	0 %	100 %	0 %	82524789
2091	NC_007608	CCA	2	6	104636	104641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524789
2092	NC_007608	TCA	2	6	104642	104647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524789
2093	NC_007608	AG	3	6	104718	104723	50 %	0 %	50 %	0 %	82524789
2094	NC_007608	CTGG	2	8	104844	104851	0 %	25 %	50 %	25 %	82524789
2095	NC_007608	GGT	2	6	105006	105011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524789
2096	NC_007608	TTC	2	6	105018	105023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524789
2097	NC_007608	CAG	2	6	105030	105035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524789
2098	NC_007608	CCGG	2	8	105048	105055	0 %	0 %	50 %	50 %	82524789
2099	NC_007608	A	6	6	105056	105061	100 %	0 %	0 %	0 %	82524789
2100	NC_007608	CGG	2	6	105123	105128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524789
2101	NC_007608	GTT	2	6	105172	105177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524789
2102	NC_007608	CCTG	2	8	105204	105211	0 %	25 %	25 %	50 %	82524789
2103	NC_007608	CA	3	6	105309	105314	50 %	0 %	0 %	50 %	82524789
2104	NC_007608	TCCT	2	8	105423	105430	0 %	50 %	0 %	50 %	82524789
2105	NC_007608	GGT	2	6	105435	105440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524789
2106	NC_007608	CAG	2	6	105526	105531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524789
2107	NC_007608	TGG	2	6	105584	105589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524789
2108	NC_007608	CTG	2	6	105592	105597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524789
2109	NC_007608	TGC	2	6	105615	105620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524789
2110	NC_007608	ATGTGG	2	12	105689	105700	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	82524789
2111	NC_007608	CTG	2	6	105721	105726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524789
2112	NC_007608	CGT	2	6	105737	105742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524789
2113	NC_007608	TTC	2	6	105761	105766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524789
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2117	NC_007608	GC	3	6	105852	105857	0 %	0 %	50 %	50 %	82524789
2118	NC_007608	CGC	3	9	105855	105863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524789
2119	NC_007608	GGT	2	6	105897	105902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524789
2120	NC_007608	CA	3	6	105930	105935	50 %	0 %	0 %	50 %	82524789
2121	NC_007608	TGC	2	6	105965	105970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524789
2122	NC_007608	TGGGGC	2	12	105995	106006	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	82524789
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2124	NC_007608	GCA	2	6	106089	106094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524789
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2248	NC_007608	GCTC	2	8	112272	112279	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2378	NC_007608	CAA	2	6	118349	118354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2499	NC_007608	A	6	6	124576	124581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2500	NC_007608	TAG	2	6	124607	124612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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