MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii Sb227 plasmid pSB4_227

Total Repeats: 2544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_007608	TC	3	6	75332	75337	0 %	50 %	0 %	50 %	82524754
1502	NC_007608	CCA	2	6	75354	75359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524754
1503	NC_007608	AGT	2	6	75413	75418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524754
1504	NC_007608	TCA	2	6	75456	75461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524754
1505	NC_007608	T	7	7	75521	75527	0 %	100 %	0 %	0 %	82524755
1506	NC_007608	ATGC	2	8	75533	75540	25 %	25 %	25 %	25 %	82524755
1507	NC_007608	AGAT	2	8	75544	75551	50 %	25 %	25 %	0 %	82524755
1508	NC_007608	CATTTT	2	12	75648	75659	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	82524755
1509	NC_007608	TCA	2	6	75831	75836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_007608	G	6	6	75865	75870	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_007608	T	6	6	75888	75893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_007608	GGC	2	6	75917	75922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_007608	GTT	2	6	75928	75933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_007608	CCG	2	6	75955	75960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_007608	AGCC	2	8	76042	76049	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1516	NC_007608	GTC	2	6	76075	76080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_007608	G	6	6	76089	76094	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_007608	TGG	2	6	76110	76115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_007608	AGGTC	2	10	76137	76146	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1520	NC_007608	ACG	2	6	76359	76364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524756
1521	NC_007608	AAAC	2	8	76366	76373	75 %	0 %	0 %	25 %	82524756
1522	NC_007608	ACA	2	6	76399	76404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524756
1523	NC_007608	CTG	2	6	76415	76420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524756
1524	NC_007608	GTT	2	6	76421	76426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524756
1525	NC_007608	CAGC	2	8	76430	76437	25 %	0 %	25 %	50 %	82524756
1526	NC_007608	CAT	2	6	76570	76575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524756
1527	NC_007608	ACGC	2	8	76609	76616	25 %	0 %	25 %	50 %	82524756
1528	NC_007608	GAT	3	9	76667	76675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524756
1529	NC_007608	CGG	2	6	76776	76781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524756
1530	NC_007608	TCT	2	6	76789	76794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524756
1531	NC_007608	TCGCT	2	10	76821	76830	0 %	40 %	20 %	40 %	82524756
1532	NC_007608	GAA	2	6	76837	76842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524756
1533	NC_007608	GCA	2	6	76847	76852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524756
1534	NC_007608	GCA	2	6	76892	76897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524756
1535	NC_007608	CGT	3	9	76927	76935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524756
1536	NC_007608	GTA	2	6	76958	76963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524756
1537	NC_007608	TCA	2	6	76986	76991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524756
1538	NC_007608	CTC	2	6	77108	77113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524756
1539	NC_007608	GCT	2	6	77156	77161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524756
1540	NC_007608	TAA	2	6	77233	77238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524756
1541	NC_007608	GTT	2	6	77254	77259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524756
1542	NC_007608	CGC	2	6	77272	77277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524756
1543	NC_007608	TAC	2	6	77303	77308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524756
1544	NC_007608	GAC	2	6	77364	77369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524756
1545	NC_007608	ATG	2	6	77390	77395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524756
1546	NC_007608	C	6	6	77457	77462	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1547	NC_007608	CTG	2	6	77485	77490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_007608	AT	3	6	77517	77522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_007608	AT	3	6	77572	77577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_007608	CTA	2	6	77579	77584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_007608	ATG	2	6	77639	77644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_007608	TTCCAT	2	12	77669	77680	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_007608	TCCT	2	8	77687	77694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_007608	GTG	2	6	77712	77717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_007608	A	6	6	77915	77920	100 %	0 %	0 %	0 %	82524757
1556	NC_007608	GTGAT	2	10	77961	77970	20 %	40 %	40 %	0 %	82524757
1557	NC_007608	GCTG	2	8	78027	78034	0 %	25 %	50 %	25 %	82524757
1558	NC_007608	GGA	2	6	78057	78062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524757
1559	NC_007608	TCT	2	6	78112	78117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524757
1560	NC_007608	CTG	2	6	78122	78127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524757
1561	NC_007608	TGGC	2	8	78160	78167	0 %	25 %	50 %	25 %	82524757
1562	NC_007608	AATCTG	2	12	78242	78253	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82524757
1563	NC_007608	ACA	2	6	78256	78261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524757
1564	NC_007608	AAT	2	6	78396	78401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_007608	GAA	2	6	78405	78410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_007608	ATG	2	6	78414	78419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_007608	AT	3	6	78421	78426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_007608	GTAT	2	8	78441	78448	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_007608	CTC	2	6	78467	78472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_007608	ATT	2	6	78514	78519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_007608	AT	3	6	78534	78539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_007608	CAA	2	6	78611	78616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157042765
1573	NC_007608	TA	3	6	78709	78714	50 %	50 %	0 %	0 %	157042765
1574	NC_007608	GCT	2	6	78715	78720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157042765
1575	NC_007608	T	6	6	78720	78725	0 %	100 %	0 %	0 %	157042765
1576	NC_007608	GTA	2	6	78748	78753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157042765
1577	NC_007608	AGA	2	6	78759	78764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157042765
1578	NC_007608	TAA	2	6	78765	78770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157042765
1579	NC_007608	GAT	2	6	78792	78797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157042765
1580	NC_007608	ATTT	2	8	78877	78884	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_007608	T	6	6	78882	78887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_007608	A	7	7	78919	78925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_007608	T	6	6	78932	78937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_007608	GA	3	6	79067	79072	50 %	0 %	50 %	0 %	82524758
1585	NC_007608	CTTC	2	8	79173	79180	0 %	50 %	0 %	50 %	82524758
1586	NC_007608	ACTG	2	8	79225	79232	25 %	25 %	25 %	25 %	82524758
1587	NC_007608	CGT	2	6	79234	79239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524758
1588	NC_007608	CT	3	6	79258	79263	0 %	50 %	0 %	50 %	82524758
1589	NC_007608	TGACA	2	10	79351	79360	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1590	NC_007608	CTG	2	6	79395	79400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_007608	CCG	2	6	79670	79675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1592	NC_007608	T	6	6	79744	79749	0 %	100 %	0 %	0 %	82524759
1593	NC_007608	GTT	2	6	79765	79770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524759
1594	NC_007608	GACA	2	8	79775	79782	50 %	0 %	25 %	25 %	82524759
1595	NC_007608	GCAACA	2	12	79827	79838	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	82524759
1596	NC_007608	CGGGG	2	10	79927	79936	0 %	0 %	80 %	20 %	82524759
1597	NC_007608	T	6	6	79951	79956	0 %	100 %	0 %	0 %	82524759
1598	NC_007608	TGC	2	6	80047	80052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524759
1599	NC_007608	TAA	2	6	80173	80178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524759
1600	NC_007608	CTA	2	6	80209	80214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524759
1601	NC_007608	CCT	2	6	80242	80247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524759
1602	NC_007608	TGCC	2	8	80276	80283	0 %	25 %	25 %	50 %	82524759
1603	NC_007608	TCT	2	6	80286	80291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524759
1604	NC_007608	ACG	2	6	80297	80302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524759
1605	NC_007608	AGA	2	6	80415	80420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524759
1606	NC_007608	ATC	2	6	80453	80458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524759
1607	NC_007608	ATGCCC	2	12	80467	80478	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	82524759
1608	NC_007608	CAG	2	6	80524	80529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524759
1609	NC_007608	T	6	6	80603	80608	0 %	100 %	0 %	0 %	82524759
1610	NC_007608	CGA	2	6	80661	80666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524759
1611	NC_007608	TTG	2	6	80865	80870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524759
1612	NC_007608	GTG	2	6	80886	80891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_007608	CAA	2	6	81010	81015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524760
1614	NC_007608	TTA	2	6	81024	81029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524760
1615	NC_007608	CGAA	2	8	81045	81052	50 %	0 %	25 %	25 %	82524760
1616	NC_007608	ACA	2	6	81136	81141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524760
1617	NC_007608	T	6	6	81193	81198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_007608	AGA	2	6	81203	81208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_007608	AATG	2	8	81231	81238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_007608	GGAA	2	8	81240	81247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_007608	ATG	2	6	81287	81292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_007608	TC	3	6	81294	81299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_007608	CTG	2	6	81327	81332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_007608	CGC	2	6	81404	81409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1625	NC_007608	CGT	2	6	81473	81478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_007608	GCGA	2	8	81601	81608	25 %	0 %	50 %	25 %	161984780
1627	NC_007608	TGC	2	6	81671	81676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161984780
1628	NC_007608	CT	3	6	81738	81743	0 %	50 %	0 %	50 %	161984780
1629	NC_007608	CCG	2	6	81772	81777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984780
1630	NC_007608	TTC	2	6	81780	81785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161984780
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