MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii Sb227 plasmid pSB4_227

Total Repeats: 2544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007608	TCC	2	6	49322	49327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524729
1002	NC_007608	AGG	2	6	49415	49420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524729
1003	NC_007608	CAG	2	6	49479	49484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524729
1004	NC_007608	CTG	2	6	49498	49503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524729
1005	NC_007608	TTGT	2	8	49672	49679	0 %	75 %	25 %	0 %	82524729
1006	NC_007608	TGT	2	6	49733	49738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524729
1007	NC_007608	TAG	2	6	49894	49899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524729
1008	NC_007608	ACCT	2	8	49966	49973	25 %	25 %	0 %	50 %	82524729
1009	NC_007608	TGG	2	6	50170	50175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524729
1010	NC_007608	ATG	2	6	50178	50183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524729
1011	NC_007608	TGAA	2	8	50205	50212	50 %	25 %	25 %	0 %	82524729
1012	NC_007608	GTT	2	6	50260	50265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524729
1013	NC_007608	TTG	2	6	50324	50329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524729
1014	NC_007608	GTG	2	6	50361	50366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524729
1015	NC_007608	AAT	2	6	50432	50437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524729
1016	NC_007608	TGT	3	9	50461	50469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524729
1017	NC_007608	GGT	2	6	50499	50504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524729
1018	NC_007608	TTC	2	6	50521	50526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524729
1019	NC_007608	A	7	7	50569	50575	100 %	0 %	0 %	0 %	82524729
1020	NC_007608	TTG	2	6	50582	50587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524729
1021	NC_007608	TTA	2	6	50599	50604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_007608	A	7	7	50660	50666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_007608	GGA	2	6	50703	50708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_007608	TGGT	2	8	50876	50883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_007608	A	6	6	50893	50898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_007608	GTT	3	9	50948	50956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_007608	TTATGC	2	12	51007	51018	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1028	NC_007608	GTCA	2	8	51080	51087	25 %	25 %	25 %	25 %	82524730
1029	NC_007608	CTG	2	6	51101	51106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524730
1030	NC_007608	CTGC	2	8	51238	51245	0 %	25 %	25 %	50 %	82524730
1031	NC_007608	ATTC	2	8	51316	51323	25 %	50 %	0 %	25 %	82524730
1032	NC_007608	TCC	2	6	51513	51518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524730
1033	NC_007608	AGG	2	6	51606	51611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524730
1034	NC_007608	CAG	2	6	51670	51675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524730
1035	NC_007608	CTG	2	6	51689	51694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524730
1036	NC_007608	TTGT	2	8	51863	51870	0 %	75 %	25 %	0 %	82524730
1037	NC_007608	TGT	2	6	51924	51929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524730
1038	NC_007608	ATA	2	6	52103	52108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524730
1039	NC_007608	ATT	2	6	52160	52165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524730
1040	NC_007608	TGT	2	6	52211	52216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524730
1041	NC_007608	TAA	2	6	52227	52232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524730
1042	NC_007608	TA	3	6	52273	52278	50 %	50 %	0 %	0 %	82524730
1043	NC_007608	CAA	2	6	52291	52296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524730
1044	NC_007608	ATG	2	6	52300	52305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524730
1045	NC_007608	GAAC	2	8	52347	52354	50 %	0 %	25 %	25 %	82524730
1046	NC_007608	GTT	2	6	52362	52367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524730
1047	NC_007608	TTA	2	6	52404	52409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524730
1048	NC_007608	GCAG	2	8	52434	52441	25 %	0 %	50 %	25 %	82524730
1049	NC_007608	ATG	2	6	52450	52455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524730
1050	NC_007608	TAT	2	6	52462	52467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524730
1051	NC_007608	CTT	2	6	52546	52551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524730
1052	NC_007608	TCAG	2	8	52626	52633	25 %	25 %	25 %	25 %	82524730
1053	NC_007608	TTGAGT	2	12	52660	52671	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	82524730
1054	NC_007608	TGA	2	6	52694	52699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524730
1055	NC_007608	GT	3	6	52700	52705	0 %	50 %	50 %	0 %	82524730
1056	NC_007608	ATT	2	6	52706	52711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524730
1057	NC_007608	AATA	2	8	52752	52759	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_007608	AGTT	2	8	52841	52848	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_007608	ATTT	2	8	52852	52859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_007608	T	8	8	52882	52889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_007608	AAT	2	6	52905	52910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_007608	AGTA	2	8	52954	52961	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_007608	TAT	2	6	53003	53008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_007608	AAATTA	2	12	53017	53028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_007608	A	7	7	53033	53039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_007608	GAGG	2	8	53057	53064	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_007608	TG	3	6	53101	53106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_007608	GTA	2	6	53233	53238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_007608	GTT	2	6	53363	53368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524731
1070	NC_007608	TCC	2	6	53411	53416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524731
1071	NC_007608	TCA	2	6	53507	53512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524731
1072	NC_007608	AC	3	6	53538	53543	50 %	0 %	0 %	50 %	82524731
1073	NC_007608	GTT	2	6	53580	53585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_007608	TGC	2	6	53592	53597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_007608	TCA	2	6	53615	53620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_007608	CCG	2	6	53671	53676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_007608	AAC	2	6	53870	53875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_007608	A	7	7	54056	54062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_007608	T	6	6	54068	54073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_007608	GTG	2	6	54085	54090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_007608	AAT	2	6	54104	54109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_007608	T	6	6	54199	54204	0 %	100 %	0 %	0 %	82524732
1083	NC_007608	TGA	2	6	54230	54235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524732
1084	NC_007608	TGCC	2	8	54259	54266	0 %	25 %	25 %	50 %	82524732
1085	NC_007608	CAGC	2	8	54340	54347	25 %	0 %	25 %	50 %	82524732
1086	NC_007608	CAG	2	6	54436	54441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524732
1087	NC_007608	TGA	2	6	54444	54449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524732
1088	NC_007608	GCC	2	6	54472	54477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524732
1089	NC_007608	ATA	2	6	54523	54528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524732
1090	NC_007608	ACC	2	6	54551	54556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524732
1091	NC_007608	CTTCAT	2	12	54618	54629	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	82524732
1092	NC_007608	TGC	2	6	54676	54681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524732
1093	NC_007608	CA	3	6	54737	54742	50 %	0 %	0 %	50 %	82524732
1094	NC_007608	GCG	2	6	54763	54768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524732
1095	NC_007608	CAG	2	6	54820	54825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524732
1096	NC_007608	GCA	2	6	55009	55014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524732
1097	NC_007608	GCA	2	6	55053	55058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524732
1098	NC_007608	CAGT	2	8	55068	55075	25 %	25 %	25 %	25 %	82524732
1099	NC_007608	GT	3	6	55096	55101	0 %	50 %	50 %	0 %	82524732
1100	NC_007608	ATGG	2	8	55105	55112	25 %	25 %	50 %	0 %	82524732
1101	NC_007608	CGT	2	6	55127	55132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524732
1102	NC_007608	CTA	2	6	55245	55250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_007608	GCG	2	6	55372	55377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524733
1104	NC_007608	GCC	2	6	55389	55394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524733
1105	NC_007608	GC	3	6	55532	55537	0 %	0 %	50 %	50 %	82524733
1106	NC_007608	TGC	2	6	55584	55589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524733
1107	NC_007608	CCG	2	6	55724	55729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524734
1108	NC_007608	T	7	7	55771	55777	0 %	100 %	0 %	0 %	82524734
1109	NC_007608	CGG	2	6	55784	55789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524734
1110	NC_007608	ATA	2	6	55885	55890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524734
1111	NC_007608	ATC	2	6	55910	55915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524735
1112	NC_007608	TGA	2	6	56009	56014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524735
1113	NC_007608	GTG	2	6	56048	56053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524735
1114	NC_007608	AGG	2	6	56064	56069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524735
1115	NC_007608	TGA	2	6	56081	56086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524735
1116	NC_007608	TC	4	8	56218	56225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_007608	T	6	6	56258	56263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_007608	CAG	2	6	56318	56323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524736
1119	NC_007608	CG	3	6	56334	56339	0 %	0 %	50 %	50 %	82524736
1120	NC_007608	TTC	2	6	56343	56348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524736
1121	NC_007608	CGG	2	6	56379	56384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524736
1122	NC_007608	GCC	2	6	56396	56401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524736
1123	NC_007608	ATCC	2	8	56486	56493	25 %	25 %	0 %	50 %	82524736
1124	NC_007608	TC	3	6	56521	56526	0 %	50 %	0 %	50 %	82524736
1125	NC_007608	CA	3	6	56527	56532	50 %	0 %	0 %	50 %	82524736
1126	NC_007608	A	6	6	56570	56575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_007608	CAGT	2	8	56597	56604	25 %	25 %	25 %	25 %	82524737
1128	NC_007608	ACTG	2	8	56611	56618	25 %	25 %	25 %	25 %	82524737
1129	NC_007608	CCCTTC	2	12	56678	56689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524737
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