MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Shigella dysenteriae Sd197 plasmid pSD1_197

Total Repeats: 404

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007607	T	7	7	950	956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007607	A	6	6	1145	1150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007607	T	7	7	1183	1189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007607	A	6	6	1297	1302	100 %	0 %	0 %	0 %	82524410
5	NC_007607	A	7	7	1409	1415	100 %	0 %	0 %	0 %	82524410
6	NC_007607	T	7	7	1682	1688	0 %	100 %	0 %	0 %	82524410
7	NC_007607	A	7	7	1718	1724	100 %	0 %	0 %	0 %	82524410
8	NC_007607	T	6	6	2126	2131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007607	T	6	6	2174	2179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007607	T	6	6	2193	2198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007607	T	6	6	2266	2271	0 %	100 %	0 %	0 %	82524411
12	NC_007607	A	6	6	2934	2939	100 %	0 %	0 %	0 %	82524411
13	NC_007607	T	6	6	3359	3364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007607	A	8	8	3368	3375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007607	T	6	6	3447	3452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007607	T	6	6	3636	3641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007607	T	7	7	3677	3683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007607	T	19	19	3761	3779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007607	T	6	6	4271	4276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007607	A	6	6	4612	4617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007607	G	7	7	4756	4762	0 %	0 %	100 %	0 %	82524412
22	NC_007607	G	6	6	5792	5797	0 %	0 %	100 %	0 %	82524413
23	NC_007607	T	7	7	6477	6483	0 %	100 %	0 %	0 %	82524415
24	NC_007607	A	6	6	7428	7433	100 %	0 %	0 %	0 %	82524416
25	NC_007607	T	8	8	7465	7472	0 %	100 %	0 %	0 %	82524416
26	NC_007607	T	6	6	7653	7658	0 %	100 %	0 %	0 %	82524416
27	NC_007607	T	6	6	7737	7742	0 %	100 %	0 %	0 %	82524416
28	NC_007607	G	6	6	7776	7781	0 %	0 %	100 %	0 %	82524416
29	NC_007607	A	6	6	7958	7963	100 %	0 %	0 %	0 %	82524416
30	NC_007607	A	7	7	8489	8495	100 %	0 %	0 %	0 %	82524416
31	NC_007607	T	8	8	8688	8695	0 %	100 %	0 %	0 %	82524416
32	NC_007607	A	8	8	8704	8711	100 %	0 %	0 %	0 %	82524416
33	NC_007607	T	6	6	8785	8790	0 %	100 %	0 %	0 %	82524416
34	NC_007607	T	6	6	8802	8807	0 %	100 %	0 %	0 %	82524416
35	NC_007607	T	6	6	9087	9092	0 %	100 %	0 %	0 %	82524416
36	NC_007607	T	6	6	10404	10409	0 %	100 %	0 %	0 %	82524418
37	NC_007607	A	7	7	11419	11425	100 %	0 %	0 %	0 %	82524419
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39	NC_007607	A	6	6	12844	12849	100 %	0 %	0 %	0 %	82524421
40	NC_007607	T	6	6	13262	13267	0 %	100 %	0 %	0 %	82524421
41	NC_007607	A	6	6	14010	14015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007607	T	6	6	14118	14123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007607	T	6	6	14810	14815	0 %	100 %	0 %	0 %	82524423
44	NC_007607	A	7	7	15253	15259	100 %	0 %	0 %	0 %	82524425
45	NC_007607	A	6	6	15427	15432	100 %	0 %	0 %	0 %	82524425
46	NC_007607	A	6	6	17739	17744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007607	A	6	6	18434	18439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007607	T	7	7	18793	18799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007607	T	9	9	18848	18856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51	NC_007607	T	7	7	19052	19058	0 %	100 %	0 %	0 %	82524429
52	NC_007607	A	6	6	19717	19722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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57	NC_007607	A	6	6	23108	23113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007607	A	6	6	23174	23179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70	NC_007607	A	6	6	34676	34681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007607	T	7	7	36666	36672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007607	A	7	7	36816	36822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007607	T	7	7	37321	37327	0 %	100 %	0 %	0 %	82524445
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75	NC_007607	T	6	6	38677	38682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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93	NC_007607	A	7	7	47389	47395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100	NC_007607	A	7	7	48877	48883	100 %	0 %	0 %	0 %	82524461
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118	NC_007607	A	6	6	55705	55710	100 %	0 %	0 %	0 %	82524470
119	NC_007607	A	6	6	56064	56069	100 %	0 %	0 %	0 %	82524470
120	NC_007607	A	6	6	56739	56744	100 %	0 %	0 %	0 %	82524470
121	NC_007607	A	6	6	57244	57249	100 %	0 %	0 %	0 %	82524471
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.