MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shigella dysenteriae Sd197 plasmid pSD1_197

Total Repeats: 544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007607	CAGC	2	8	26	33	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007607	ATCT	2	8	122	129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007607	TGAA	2	8	135	142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007607	TCGT	2	8	169	176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007607	GTCA	2	8	373	380	25 %	25 %	25 %	25 %	82524408
6	NC_007607	GTAG	2	8	842	849	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007607	AATT	2	8	854	861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007607	AAGA	2	8	896	903	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007607	TCTA	2	8	1223	1230	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_007607	AATA	2	8	1361	1368	75 %	25 %	0 %	0 %	82524410
11	NC_007607	ACAA	2	8	1532	1539	75 %	0 %	0 %	25 %	82524410
12	NC_007607	TCTT	2	8	1655	1662	0 %	75 %	0 %	25 %	82524410
13	NC_007607	AATT	2	8	2218	2225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007607	AAAT	2	8	2235	2242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007607	CGCT	2	8	2433	2440	0 %	25 %	25 %	50 %	82524411
16	NC_007607	TTAT	2	8	2644	2651	25 %	75 %	0 %	0 %	82524411
17	NC_007607	TTGG	2	8	2728	2735	0 %	50 %	50 %	0 %	82524411
18	NC_007607	TAAG	2	8	3518	3525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007607	TAAA	2	8	3615	3622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007607	AAGT	2	8	3978	3985	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007607	TCAG	2	8	4027	4034	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007607	CATT	2	8	4378	4385	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007607	GATA	2	8	5386	5393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007607	CCGG	2	8	5777	5784	0 %	0 %	50 %	50 %	82524413
25	NC_007607	CGAC	2	8	6209	6216	25 %	0 %	25 %	50 %	82524414
26	NC_007607	TCTG	2	8	6328	6335	0 %	50 %	25 %	25 %	82524414
27	NC_007607	AGGA	2	8	6765	6772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007607	TATT	2	8	7444	7451	25 %	75 %	0 %	0 %	82524416
29	NC_007607	TGTT	2	8	8404	8411	0 %	75 %	25 %	0 %	82524416
30	NC_007607	AAAT	2	8	8748	8755	75 %	25 %	0 %	0 %	82524416
31	NC_007607	ACAT	2	8	8795	8802	50 %	25 %	0 %	25 %	82524416
32	NC_007607	TTTA	2	8	9119	9126	25 %	75 %	0 %	0 %	82524416
33	NC_007607	GCGA	2	8	9563	9570	25 %	0 %	50 %	25 %	161986650
34	NC_007607	CTTT	2	8	10030	10037	0 %	75 %	0 %	25 %	161986650
35	NC_007607	CCAT	2	8	10282	10289	25 %	25 %	0 %	50 %	161986650
36	NC_007607	CTTC	2	8	10557	10564	0 %	50 %	0 %	50 %	82524418
37	NC_007607	CTGG	2	8	10592	10599	0 %	25 %	50 %	25 %	82524418
38	NC_007607	ATCA	2	8	10718	10725	50 %	25 %	0 %	25 %	82524418
39	NC_007607	CATG	2	8	11358	11365	25 %	25 %	25 %	25 %	82524419
40	NC_007607	ATTG	2	8	11658	11665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007607	ATGT	2	8	11710	11717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007607	ATGT	2	8	11719	11726	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007607	ATGT	2	8	11728	11735	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007607	ATGT	2	8	11737	11744	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007607	ATGT	2	8	11746	11753	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007607	ATGT	2	8	11755	11762	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007607	ATGT	2	8	11764	11771	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007607	ATGT	2	8	11773	11780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007607	ATGT	2	8	11782	11789	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007607	CCTG	2	8	12185	12192	0 %	25 %	25 %	50 %	82524420
51	NC_007607	TCAT	2	8	12795	12802	25 %	50 %	0 %	25 %	82524421
52	NC_007607	TCTT	2	8	13134	13141	0 %	75 %	0 %	25 %	82524421
53	NC_007607	CATT	2	8	13469	13476	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007607	TTTG	2	8	13934	13941	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007607	ATTG	2	8	14090	14097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007607	CCAG	2	8	14588	14595	25 %	0 %	25 %	50 %	82524424
57	NC_007607	CTGT	2	8	15093	15100	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007607	TACT	2	8	15213	15220	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007607	GCCG	2	8	15553	15560	0 %	0 %	50 %	50 %	82524425
60	NC_007607	CTGG	2	8	15669	15676	0 %	25 %	50 %	25 %	82524426
61	NC_007607	TCCG	2	8	16377	16384	0 %	25 %	25 %	50 %	82524427
62	NC_007607	ATCC	2	8	16922	16929	25 %	25 %	0 %	50 %	82524427
63	NC_007607	TGCA	2	8	17061	17068	25 %	25 %	25 %	25 %	82524427
64	NC_007607	ATTC	2	8	17237	17244	25 %	50 %	0 %	25 %	82524427
65	NC_007607	TTGA	2	8	17550	17557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007607	CAAC	2	8	17728	17735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007607	ATGA	2	8	17988	17995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007607	TCAG	2	8	18070	18077	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007607	AATA	2	8	18882	18889	75 %	25 %	0 %	0 %	82524429
70	NC_007607	CAGA	2	8	19484	19491	50 %	0 %	25 %	25 %	82524429
71	NC_007607	AAAC	2	8	19633	19640	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007607	ACGA	2	8	19687	19694	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_007607	ATGA	2	8	20448	20455	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007607	AAAT	2	8	20786	20793	75 %	25 %	0 %	0 %	82524431
75	NC_007607	AAGT	2	8	21308	21315	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007607	TCAG	2	8	21781	21788	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007607	GCAG	2	8	22036	22043	25 %	0 %	50 %	25 %	82524432
78	NC_007607	GCCT	2	8	22430	22437	0 %	25 %	25 %	50 %	82524433
79	NC_007607	GGCT	2	8	22528	22535	0 %	25 %	50 %	25 %	82524433
80	NC_007607	TCGC	2	8	23983	23990	0 %	25 %	25 %	50 %	82524435
81	NC_007607	CATT	2	8	24037	24044	25 %	50 %	0 %	25 %	82524435
82	NC_007607	GCTG	2	8	24550	24557	0 %	25 %	50 %	25 %	82524435
83	NC_007607	CTCA	2	8	25044	25051	25 %	25 %	0 %	50 %	82524436
84	NC_007607	TCAG	2	8	25295	25302	25 %	25 %	25 %	25 %	82524436
85	NC_007607	CAGA	2	8	25493	25500	50 %	0 %	25 %	25 %	82524436
86	NC_007607	CCGT	2	8	25989	25996	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007607	ATTC	2	8	26132	26139	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_007607	TAAG	2	8	26287	26294	50 %	25 %	25 %	0 %	82524437
89	NC_007607	GTTG	2	8	26771	26778	0 %	50 %	50 %	0 %	82524437
90	NC_007607	GGAT	2	8	27167	27174	25 %	25 %	50 %	0 %	82524437
91	NC_007607	ACCG	2	8	27483	27490	25 %	0 %	25 %	50 %	82524438
92	NC_007607	ACAG	2	8	27664	27671	50 %	0 %	25 %	25 %	82524438
93	NC_007607	ACGT	2	8	28345	28352	25 %	25 %	25 %	25 %	82524438
94	NC_007607	CTGG	2	8	28822	28829	0 %	25 %	50 %	25 %	82524439
95	NC_007607	GGTT	2	8	29082	29089	0 %	50 %	50 %	0 %	82524439
96	NC_007607	GCAT	2	8	29800	29807	25 %	25 %	25 %	25 %	82524440
97	NC_007607	TCCA	2	8	30069	30076	25 %	25 %	0 %	50 %	82524440
98	NC_007607	TCCA	2	8	30195	30202	25 %	25 %	0 %	50 %	82524440
99	NC_007607	AATG	2	8	30746	30753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007607	CAGT	2	8	30909	30916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_007607	TCCA	2	8	31145	31152	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007607	CCAC	2	8	31503	31510	25 %	0 %	0 %	75 %	82524441
103	NC_007607	ATAC	2	8	31683	31690	50 %	25 %	0 %	25 %	82524441
104	NC_007607	GTAA	2	8	31870	31877	50 %	25 %	25 %	0 %	82524441
105	NC_007607	CCAC	2	8	31884	31891	25 %	0 %	0 %	75 %	82524441
106	NC_007607	TCTT	2	8	32122	32129	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_007607	GTCA	2	8	32672	32679	25 %	25 %	25 %	25 %	82524443
108	NC_007607	CTGC	2	8	32830	32837	0 %	25 %	25 %	50 %	82524443
109	NC_007607	ATTC	2	8	32908	32915	25 %	50 %	0 %	25 %	82524443
110	NC_007607	TTGT	2	8	33455	33462	0 %	75 %	25 %	0 %	82524443
111	NC_007607	ACCT	2	8	33749	33756	25 %	25 %	0 %	50 %	82524443
112	NC_007607	TGAA	2	8	33988	33995	50 %	25 %	25 %	0 %	82524443
113	NC_007607	TGGT	2	8	34659	34666	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007607	GTCA	2	8	34863	34870	25 %	25 %	25 %	25 %	82524444
115	NC_007607	CTGC	2	8	35021	35028	0 %	25 %	25 %	50 %	82524444
116	NC_007607	ATTC	2	8	35099	35106	25 %	50 %	0 %	25 %	82524444
117	NC_007607	TTGT	2	8	35646	35653	0 %	75 %	25 %	0 %	82524444
118	NC_007607	TCTG	2	8	35897	35904	0 %	50 %	25 %	25 %	82524444
119	NC_007607	GAAC	2	8	36130	36137	50 %	0 %	25 %	25 %	82524444
120	NC_007607	GCAG	2	8	36217	36224	25 %	0 %	50 %	25 %	82524444
121	NC_007607	TCAG	2	8	36409	36416	25 %	25 %	25 %	25 %	82524444
122	NC_007607	AATA	2	8	36535	36542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007607	ATTT	2	8	36636	36643	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007607	AGTA	2	8	36737	36744	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007607	GAGG	2	8	36840	36847	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007607	TCTG	2	8	38065	38072	0 %	50 %	25 %	25 %	82524446
127	NC_007607	GCCA	2	8	38430	38437	25 %	0 %	25 %	50 %	82524447
128	NC_007607	CAGC	2	8	38563	38570	25 %	0 %	25 %	50 %	82524447
129	NC_007607	CTGT	2	8	39219	39226	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_007607	AACT	2	8	40353	40360	50 %	25 %	0 %	25 %	82524450
131	NC_007607	GTCA	2	8	40465	40472	25 %	25 %	25 %	25 %	82524451
132	NC_007607	CTGC	2	8	40623	40630	0 %	25 %	25 %	50 %	82524451
133	NC_007607	ATTC	2	8	40701	40708	25 %	50 %	0 %	25 %	82524451
134	NC_007607	TTGT	2	8	41248	41255	0 %	75 %	25 %	0 %	82524451
135	NC_007607	TAAA	2	8	42016	42023	75 %	25 %	0 %	0 %	82524451
136	NC_007607	ATTT	2	8	42827	42834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007607	TCCT	2	8	43595	43602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_007607	CAGA	2	8	44032	44039	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_007607	AATG	2	8	44757	44764	50 %	25 %	25 %	0 %	82524456
140	NC_007607	CCAC	2	8	45080	45087	25 %	0 %	0 %	75 %	82524457
141	NC_007607	ATAC	2	8	45260	45267	50 %	25 %	0 %	25 %	82524457
142	NC_007607	GTAA	2	8	45447	45454	50 %	25 %	25 %	0 %	82524457
143	NC_007607	TCTT	2	8	45699	45706	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_007607	CATC	2	8	46510	46517	25 %	25 %	0 %	50 %	82524459
145	NC_007607	CAGG	2	8	46643	46650	25 %	0 %	50 %	25 %	82524460
146	NC_007607	AGGA	2	8	47154	47161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007607	ATTA	2	8	47762	47769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007607	TACA	2	8	47864	47871	50 %	25 %	0 %	25 %	82524461
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