MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella dysenteriae Sd197 plasmid pSD1_197

Total Repeats: 3823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_007607	CA	3	6	99078	99083	50 %	0 %	0 %	50 %	82524528
2002	NC_007607	TGC	2	6	99113	99118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524528
2003	NC_007607	TGGGGC	2	12	99143	99154	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	82524528
2004	NC_007607	AC	3	6	99157	99162	50 %	0 %	0 %	50 %	82524528
2005	NC_007607	GCA	2	6	99237	99242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524528
2006	NC_007607	TGG	2	6	99302	99307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524528
2007	NC_007607	CAG	2	6	99424	99429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524528
2008	NC_007607	TGC	2	6	99438	99443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524528
2009	NC_007607	TCA	2	6	99452	99457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524528
2010	NC_007607	GCA	2	6	99651	99656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524528
2011	NC_007607	ATG	2	6	99815	99820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524528
2012	NC_007607	GCAGGT	2	12	99846	99857	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	82524528
2013	NC_007607	CGT	2	6	99904	99909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524528
2014	NC_007607	TGCCCT	2	12	99936	99947	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	82524528
2015	NC_007607	CAG	2	6	100006	100011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524528
2016	NC_007607	CAG	2	6	100213	100218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524528
2017	NC_007607	TG	3	6	100222	100227	0 %	50 %	50 %	0 %	82524528
2018	NC_007607	AGC	2	6	100400	100405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524528
2019	NC_007607	CAA	2	6	100452	100457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524528
2020	NC_007607	ACCGG	2	10	100500	100509	20 %	0 %	40 %	40 %	82524528
2021	NC_007607	GGC	2	6	100563	100568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524528
2022	NC_007607	GCCGT	2	10	100571	100580	0 %	20 %	40 %	40 %	82524528
2023	NC_007607	CCG	2	6	100693	100698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524528
2024	NC_007607	CTG	2	6	100827	100832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524529
2025	NC_007607	ATA	2	6	100837	100842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524529
2026	NC_007607	GTG	2	6	100882	100887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524529
2027	NC_007607	TGG	2	6	100888	100893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524529
2028	NC_007607	CCGT	2	8	100913	100920	0 %	25 %	25 %	50 %	82524529
2029	NC_007607	G	6	6	100954	100959	0 %	0 %	100 %	0 %	82524529
2030	NC_007607	ACA	2	6	100969	100974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524529
2031	NC_007607	CCG	2	6	101051	101056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524529
2032	NC_007607	ACCTG	2	10	101108	101117	20 %	20 %	20 %	40 %	82524529
2033	NC_007607	TGC	2	6	101272	101277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524529
2034	NC_007607	GCA	2	6	101288	101293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524529
2035	NC_007607	TGA	2	6	101369	101374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524530
2036	NC_007607	AACACG	2	12	101383	101394	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	82524530
2037	NC_007607	TCTGG	2	10	101445	101454	0 %	40 %	40 %	20 %	82524530
2038	NC_007607	ATC	2	6	101473	101478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524530
2039	NC_007607	GAG	2	6	101564	101569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524530
2040	NC_007607	TGGGGA	2	12	101650	101661	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	82524530
2041	NC_007607	ATT	2	6	101662	101667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524530
2042	NC_007607	GGC	2	6	101736	101741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524530
2043	NC_007607	GTG	2	6	101754	101759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524530
2044	NC_007607	GTGG	2	8	101771	101778	0 %	25 %	75 %	0 %	82524530
2045	NC_007607	CAG	2	6	101783	101788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524530
2046	NC_007607	GCCT	2	8	101920	101927	0 %	25 %	25 %	50 %	82524530
2047	NC_007607	GCTG	2	8	101928	101935	0 %	25 %	50 %	25 %	82524530
2048	NC_007607	CCA	2	6	101957	101962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524530
2049	NC_007607	GCG	2	6	101971	101976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524530
2050	NC_007607	TGA	2	6	101990	101995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524530
2051	NC_007607	TG	3	6	102020	102025	0 %	50 %	50 %	0 %	82524530
2052	NC_007607	GAT	2	6	102145	102150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_007607	CAT	2	6	102249	102254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524531
2054	NC_007607	CAC	2	6	102261	102266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524531
2055	NC_007607	CCA	2	6	102268	102273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524531
2056	NC_007607	GGC	2	6	102330	102335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524531
2057	NC_007607	A	7	7	102336	102342	100 %	0 %	0 %	0 %	82524531
2058	NC_007607	TGG	2	6	102418	102423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524531
2059	NC_007607	ATT	2	6	102429	102434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524531
2060	NC_007607	A	6	6	102523	102528	100 %	0 %	0 %	0 %	82524531
2061	NC_007607	TG	3	6	102572	102577	0 %	50 %	50 %	0 %	82524531
2062	NC_007607	TGCC	2	8	102591	102598	0 %	25 %	25 %	50 %	82524531
2063	NC_007607	AGG	3	9	102638	102646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524531
2064	NC_007607	TCG	2	6	102678	102683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524531
2065	NC_007607	TGA	2	6	102720	102725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524531
2066	NC_007607	A	7	7	102731	102737	100 %	0 %	0 %	0 %	82524531
2067	NC_007607	AG	4	8	102747	102754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2068	NC_007607	CTTCCG	2	12	102787	102798	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2069	NC_007607	ATT	2	6	102819	102824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2070	NC_007607	AAT	2	6	102831	102836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2071	NC_007607	AATG	2	8	102862	102869	50 %	25 %	25 %	0 %	82524532
2072	NC_007607	CGG	2	6	102919	102924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524532
2073	NC_007607	TGGA	2	8	102956	102963	25 %	25 %	50 %	0 %	82524532
2074	NC_007607	GCA	2	6	103015	103020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524532
2075	NC_007607	A	6	6	103078	103083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2076	NC_007607	CTT	2	6	103137	103142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2077	NC_007607	T	6	6	103210	103215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2078	NC_007607	TG	3	6	103256	103261	0 %	50 %	50 %	0 %	82524533
2079	NC_007607	AT	3	6	103327	103332	50 %	50 %	0 %	0 %	82524533
2080	NC_007607	TAT	2	6	103341	103346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524533
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2082	NC_007607	TGC	2	6	103596	103601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524534
2083	NC_007607	GCCA	2	8	103690	103697	25 %	0 %	25 %	50 %	82524534
2084	NC_007607	CAC	2	6	103712	103717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524534
2085	NC_007607	CAG	2	6	103730	103735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524534
2086	NC_007607	CAGC	2	8	103822	103829	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2087	NC_007607	T	6	6	103936	103941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2088	NC_007607	CAC	2	6	104139	104144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524535
2089	NC_007607	AGG	2	6	104162	104167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524535
2090	NC_007607	CAT	2	6	104212	104217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524535
2091	NC_007607	GCA	2	6	104237	104242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2092	NC_007607	GGT	2	6	104276	104281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2093	NC_007607	ATG	2	6	104290	104295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524536
2094	NC_007607	GAAT	2	8	104387	104394	50 %	25 %	25 %	0 %	82524536
2095	NC_007607	CCGGG	2	10	104412	104421	0 %	0 %	60 %	40 %	82524536
2096	NC_007607	ACA	2	6	104444	104449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524536
2097	NC_007607	ACA	2	6	104487	104492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524536
2098	NC_007607	C	6	6	104528	104533	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2099	NC_007607	TAAA	2	8	104551	104558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2100	NC_007607	TCAT	2	8	104574	104581	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2101	NC_007607	AAAAC	2	10	104609	104618	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2102	NC_007607	TCA	2	6	104648	104653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524537
2103	NC_007607	ATT	2	6	104671	104676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524537
2104	NC_007607	CAG	3	9	104726	104734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524537
2105	NC_007607	ACC	2	6	104735	104740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524537
2106	NC_007607	TAA	2	6	104809	104814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524537
2107	NC_007607	AAT	2	6	104821	104826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2108	NC_007607	ATAA	2	8	104843	104850	75 %	25 %	0 %	0 %	82524538
2109	NC_007607	ATT	2	6	104859	104864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524538
2110	NC_007607	ATT	2	6	104883	104888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524538
2111	NC_007607	TAG	2	6	104961	104966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524538
2112	NC_007607	GTC	2	6	105158	105163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524539
2113	NC_007607	AGT	2	6	105204	105209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524539
2114	NC_007607	C	8	8	105255	105262	0 %	0 %	0 %	100 %	82524539
2115	NC_007607	TCA	2	6	105330	105335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524539
2116	NC_007607	T	6	6	105401	105406	0 %	100 %	0 %	0 %	82524540
2117	NC_007607	TAAGTG	2	12	105524	105535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524540
2118	NC_007607	AATG	2	8	105633	105640	50 %	25 %	25 %	0 %	82524540
2119	NC_007607	AGA	2	6	105796	105801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524541
2120	NC_007607	GCT	2	6	105803	105808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524541
2121	NC_007607	GGT	2	6	105865	105870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524541
2122	NC_007607	GTG	2	6	105941	105946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524541
2123	NC_007607	CGTT	2	8	106002	106009	0 %	50 %	25 %	25 %	82524541
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2125	NC_007607	CAG	2	6	106021	106026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524541
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2250	NC_007607	T	7	7	112280	112286	0 %	100 %	0 %	0 %	82524549
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