MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella dysenteriae Sd197 plasmid pSD1_197

Total Repeats: 3823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007607	GCAG	2	8	22036	22043	25 %	0 %	50 %	25 %	82524432
502	NC_007607	TCC	2	6	22056	22061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524432
503	NC_007607	GTG	2	6	22188	22193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524433
504	NC_007607	GCG	2	6	22197	22202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524433
505	NC_007607	CAG	2	6	22222	22227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524433
506	NC_007607	CGG	2	6	22259	22264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524433
507	NC_007607	CAC	2	6	22295	22300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524433
508	NC_007607	GGC	2	6	22353	22358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524433
509	NC_007607	GCCT	2	8	22430	22437	0 %	25 %	25 %	50 %	82524433
510	NC_007607	CTG	2	6	22450	22455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524433
511	NC_007607	GGCT	2	8	22528	22535	0 %	25 %	50 %	25 %	82524433
512	NC_007607	CAC	2	6	22592	22597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524433
513	NC_007607	GGC	2	6	22643	22648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524433
514	NC_007607	CAG	2	6	22703	22708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524433
515	NC_007607	GCT	2	6	22719	22724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524433
516	NC_007607	GCT	3	9	22763	22771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524433
517	NC_007607	CTT	2	6	22794	22799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524433
518	NC_007607	AAT	2	6	22851	22856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524433
519	NC_007607	GGC	2	6	22921	22926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524433
520	NC_007607	TCC	2	6	23065	23070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_007607	A	6	6	23108	23113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_007607	TCT	2	6	23123	23128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_007607	ATA	2	6	23169	23174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_007607	A	6	6	23174	23179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_007607	CGG	2	6	23568	23573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524434
526	NC_007607	GCA	2	6	23647	23652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_007607	CAA	2	6	23658	23663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_007607	GCC	2	6	23870	23875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524435
529	NC_007607	CGC	2	6	23884	23889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524435
530	NC_007607	CTG	2	6	23893	23898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524435
531	NC_007607	TCGC	2	8	23983	23990	0 %	25 %	25 %	50 %	82524435
532	NC_007607	CATT	2	8	24037	24044	25 %	50 %	0 %	25 %	82524435
533	NC_007607	TC	4	8	24048	24055	0 %	50 %	0 %	50 %	82524435
534	NC_007607	CAGGAG	2	12	24063	24074	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	82524435
535	NC_007607	GTTCG	2	10	24081	24090	0 %	40 %	40 %	20 %	82524435
536	NC_007607	GAC	2	6	24103	24108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524435
537	NC_007607	TGT	2	6	24190	24195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524435
538	NC_007607	CTT	2	6	24260	24265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524435
539	NC_007607	TGG	2	6	24266	24271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524435
540	NC_007607	CG	3	6	24277	24282	0 %	0 %	50 %	50 %	82524435
541	NC_007607	TC	3	6	24391	24396	0 %	50 %	0 %	50 %	82524435
542	NC_007607	AAGGT	2	10	24430	24439	40 %	20 %	40 %	0 %	82524435
543	NC_007607	GCTG	2	8	24550	24557	0 %	25 %	50 %	25 %	82524435
544	NC_007607	AGC	2	6	24625	24630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524435
545	NC_007607	A	6	6	24657	24662	100 %	0 %	0 %	0 %	82524435
546	NC_007607	C	7	7	24707	24713	0 %	0 %	0 %	100 %	82524435
547	NC_007607	CAT	2	6	24716	24721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524435
548	NC_007607	TGA	2	6	24761	24766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524435
549	NC_007607	AGCGC	2	10	24829	24838	20 %	0 %	40 %	40 %	82524435
550	NC_007607	GAA	2	6	24907	24912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524435
551	NC_007607	TCA	2	6	24924	24929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524436
552	NC_007607	CGG	2	6	24968	24973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524436
553	NC_007607	CTCA	2	8	25044	25051	25 %	25 %	0 %	50 %	82524436
554	NC_007607	CAG	3	9	25172	25180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524436
555	NC_007607	ACG	2	6	25228	25233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524436
556	NC_007607	C	6	6	25253	25258	0 %	0 %	0 %	100 %	82524436
557	NC_007607	TCA	2	6	25265	25270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524436
558	NC_007607	TGA	2	6	25272	25277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524436
559	NC_007607	TCAG	2	8	25295	25302	25 %	25 %	25 %	25 %	82524436
560	NC_007607	GAA	2	6	25303	25308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524436
561	NC_007607	TTC	2	6	25318	25323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524436
562	NC_007607	GCA	2	6	25414	25419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524436
563	NC_007607	TCAAA	2	10	25466	25475	60 %	20 %	0 %	20 %	82524436
564	NC_007607	CAGA	2	8	25493	25500	50 %	0 %	25 %	25 %	82524436
565	NC_007607	TGG	2	6	25566	25571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_007607	CGT	2	6	25597	25602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_007607	ACA	2	6	25607	25612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_007607	ACA	2	6	25630	25635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_007607	GT	3	6	25648	25653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_007607	ATG	2	6	25678	25683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_007607	AAC	2	6	25824	25829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_007607	C	6	6	25958	25963	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
573	NC_007607	CCGT	2	8	25989	25996	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
574	NC_007607	GAA	2	6	26038	26043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_007607	TGT	2	6	26047	26052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_007607	GTG	3	9	26060	26068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_007607	ATT	2	6	26075	26080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_007607	ATTC	2	8	26132	26139	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
579	NC_007607	GAT	2	6	26141	26146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_007607	TAA	2	6	26147	26152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_007607	GC	3	6	26162	26167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
582	NC_007607	T	8	8	26224	26231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_007607	TAA	2	6	26233	26238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_007607	TAAG	2	8	26287	26294	50 %	25 %	25 %	0 %	82524437
585	NC_007607	T	6	6	26374	26379	0 %	100 %	0 %	0 %	82524437
586	NC_007607	CTG	2	6	26398	26403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524437
587	NC_007607	CG	3	6	26425	26430	0 %	0 %	50 %	50 %	82524437
588	NC_007607	CAG	2	6	26491	26496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524437
589	NC_007607	GT	3	6	26623	26628	0 %	50 %	50 %	0 %	82524437
590	NC_007607	AGT	2	6	26640	26645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524437
591	NC_007607	CTG	2	6	26682	26687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524437
592	NC_007607	AGA	2	6	26690	26695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524437
593	NC_007607	TCA	2	6	26730	26735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524437
594	NC_007607	ACT	2	6	26752	26757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524437
595	NC_007607	GTTG	2	8	26771	26778	0 %	50 %	50 %	0 %	82524437
596	NC_007607	ACCGC	2	10	26784	26793	20 %	0 %	20 %	60 %	82524437
597	NC_007607	TTATG	2	10	26867	26876	20 %	60 %	20 %	0 %	82524437
598	NC_007607	GAC	2	6	26889	26894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524437
599	NC_007607	GAG	2	6	26928	26933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524437
600	NC_007607	ACAAA	2	10	26945	26954	80 %	0 %	0 %	20 %	82524437
601	NC_007607	ATT	2	6	26976	26981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524437
602	NC_007607	TGC	2	6	27059	27064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524437
603	NC_007607	GCC	2	6	27089	27094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524437
604	NC_007607	TTCCA	2	10	27108	27117	20 %	40 %	0 %	40 %	82524437
605	NC_007607	ATT	2	6	27156	27161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524437
606	NC_007607	GGAT	2	8	27167	27174	25 %	25 %	50 %	0 %	82524437
607	NC_007607	GGT	2	6	27270	27275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524437
608	NC_007607	GA	3	6	27315	27320	50 %	0 %	50 %	0 %	82524437
609	NC_007607	GCG	2	6	27322	27327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524437
610	NC_007607	GTG	2	6	27376	27381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524437
611	NC_007607	GCA	2	6	27405	27410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524437
612	NC_007607	ACT	2	6	27460	27465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524437
613	NC_007607	ACCG	2	8	27483	27490	25 %	0 %	25 %	50 %	82524438
614	NC_007607	AAT	2	6	27524	27529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524438
615	NC_007607	GAA	2	6	27533	27538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524438
616	NC_007607	ACAG	2	8	27664	27671	50 %	0 %	25 %	25 %	82524438
617	NC_007607	ACA	2	6	27718	27723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524438
618	NC_007607	CGT	2	6	27782	27787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524438
619	NC_007607	GCA	2	6	27791	27796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524438
620	NC_007607	GAT	2	6	27836	27841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524438
621	NC_007607	ATA	2	6	27900	27905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524438
622	NC_007607	AG	3	6	27974	27979	50 %	0 %	50 %	0 %	82524438
623	NC_007607	AGC	2	6	28015	28020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524438
624	NC_007607	AT	3	6	28125	28130	50 %	50 %	0 %	0 %	82524438
625	NC_007607	TGA	2	6	28135	28140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524438
626	NC_007607	GAA	2	6	28147	28152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524438
627	NC_007607	TTA	2	6	28173	28178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524438
628	NC_007607	CTG	2	6	28179	28184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524438
629	NC_007607	TAT	2	6	28219	28224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524438
630	NC_007607	ACGT	2	8	28345	28352	25 %	25 %	25 %	25 %	82524438
631	NC_007607	TTA	2	6	28513	28518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_007607	TCT	2	6	28568	28573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_007607	ATG	2	6	28663	28668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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