MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella dysenteriae Sd197

Total Repeats: 86031

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007606	CTGA	2	8	149398	149405	25 %	25 %	25 %	25 %	82775522
3002	NC_007606	AAG	2	6	149408	149413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775522
3003	NC_007606	GCT	2	6	149458	149463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775522
3004	NC_007606	GGT	2	6	149542	149547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775522
3005	NC_007606	CGG	2	6	149565	149570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775522
3006	NC_007606	GCT	2	6	149574	149579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775522
3007	NC_007606	CCAT	2	8	149636	149643	25 %	25 %	0 %	50 %	82775522
3008	NC_007606	GGC	2	6	149676	149681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775522
3009	NC_007606	GAA	3	9	149727	149735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775522
3010	NC_007606	A	6	6	149769	149774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_007606	CGC	2	6	149786	149791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3012	NC_007606	T	7	7	149792	149798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_007606	TCT	2	6	149822	149827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82775523
3014	NC_007606	AG	3	6	149840	149845	50 %	0 %	50 %	0 %	82775523
3015	NC_007606	CTG	2	6	149857	149862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775523
3016	NC_007606	GGC	2	6	149917	149922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775523
3017	NC_007606	GTT	2	6	149953	149958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775523
3018	NC_007606	GGCG	2	8	149983	149990	0 %	0 %	75 %	25 %	82775523
3019	NC_007606	GCT	2	6	150019	150024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775523
3020	NC_007606	GCT	2	6	150049	150054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775523
3021	NC_007606	AGGCG	2	10	150056	150065	20 %	0 %	60 %	20 %	82775523
3022	NC_007606	CT	3	6	150089	150094	0 %	50 %	0 %	50 %	82775523
3023	NC_007606	GCT	2	6	150097	150102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775523
3024	NC_007606	GCT	2	6	150145	150150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775523
3025	NC_007606	CTGA	2	8	150160	150167	25 %	25 %	25 %	25 %	82775523
3026	NC_007606	GCG	2	6	150180	150185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775523
3027	NC_007606	TTG	2	6	150191	150196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775523
3028	NC_007606	GTC	2	6	150233	150238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775523
3029	NC_007606	GCG	2	6	150315	150320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775523
3030	NC_007606	TGC	2	6	150344	150349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775523
3031	NC_007606	GCTG	2	8	150358	150365	0 %	25 %	50 %	25 %	82775523
3032	NC_007606	CCG	2	6	150402	150407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775523
3033	NC_007606	TGA	2	6	150420	150425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775523
3034	NC_007606	GCC	2	6	150482	150487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775523
3035	NC_007606	TGT	2	6	150554	150559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775523
3036	NC_007606	GCCA	2	8	150572	150579	25 %	0 %	25 %	50 %	82775523
3037	NC_007606	GTG	2	6	150603	150608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775523
3038	NC_007606	ATC	2	6	150615	150620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775523
3039	NC_007606	ATG	3	9	150624	150632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775523
3040	NC_007606	CGT	2	6	150641	150646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775523
3041	NC_007606	TGC	2	6	150659	150664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775523
3042	NC_007606	A	6	6	150726	150731	100 %	0 %	0 %	0 %	82775523
3043	NC_007606	TGG	3	9	150744	150752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775523
3044	NC_007606	CGG	2	6	150762	150767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775523
3045	NC_007606	GGTTG	2	10	150801	150810	0 %	40 %	60 %	0 %	82775523
3046	NC_007606	GTT	2	6	150862	150867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775524
3047	NC_007606	CTGT	2	8	150921	150928	0 %	50 %	25 %	25 %	82775524
3048	NC_007606	TTC	2	6	150944	150949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82775524
3049	NC_007606	TAA	2	6	150957	150962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82775524
3050	NC_007606	TGA	2	6	150976	150981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775524
3051	NC_007606	TTG	2	6	150997	151002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775524
3052	NC_007606	A	6	6	151055	151060	100 %	0 %	0 %	0 %	82775524
3053	NC_007606	CCA	2	6	151125	151130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775524
3054	NC_007606	GCA	2	6	151178	151183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775524
3055	NC_007606	AG	3	6	151274	151279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_007606	ACG	2	6	151343	151348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_007606	TGC	2	6	151504	151509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775525
3058	NC_007606	GCCA	2	8	151598	151605	25 %	0 %	25 %	50 %	82775525
3059	NC_007606	CAC	2	6	151620	151625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775525
3060	NC_007606	CAG	2	6	151638	151643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775525
3061	NC_007606	CAA	2	6	151694	151699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775525
3062	NC_007606	CAGC	2	8	151731	151738	25 %	0 %	25 %	50 %	82775525
3063	NC_007606	T	6	6	151845	151850	0 %	100 %	0 %	0 %	82775526
3064	NC_007606	CAC	2	6	152048	152053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775526
3065	NC_007606	AGG	2	6	152071	152076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82775526
3066	NC_007606	CAT	2	6	152121	152126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_007606	GCA	2	6	152146	152151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_007606	TCA	2	6	152198	152203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775527
3069	NC_007606	TA	3	6	152350	152355	50 %	50 %	0 %	0 %	82775527
3070	NC_007606	AAT	2	6	152416	152421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82775527
3071	NC_007606	TTTCAC	2	12	152445	152456	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	82775527
3072	NC_007606	ATC	2	6	152498	152503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775527
3073	NC_007606	AAC	2	6	152512	152517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775527
3074	NC_007606	TGT	2	6	152526	152531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775527
3075	NC_007606	GC	3	6	152562	152567	0 %	0 %	50 %	50 %	82775527
3076	NC_007606	TAG	2	6	152622	152627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775527
3077	NC_007606	GTC	2	6	152819	152824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775528
3078	NC_007606	AGT	2	6	152865	152870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775528
3079	NC_007606	C	7	7	152917	152923	0 %	0 %	0 %	100 %	82775528
3080	NC_007606	TCA	2	6	152991	152996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775528
3081	NC_007606	T	6	6	153062	153067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_007606	TAAGTG	2	12	153185	153196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_007606	AATG	2	8	153294	153301	50 %	25 %	25 %	0 %	82775529
3084	NC_007606	CAA	2	6	153484	153489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_007606	GCA	2	6	153543	153548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_007606	ACA	2	6	153666	153671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_007606	GGA	2	6	153672	153677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_007606	CAG	2	6	153735	153740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_007606	CCA	2	6	153778	153783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3090	NC_007606	TAA	2	6	153807	153812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_007606	CACCG	2	10	153816	153825	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3092	NC_007606	CAT	2	6	153827	153832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_007606	GCGGT	2	10	153836	153845	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3094	NC_007606	CCA	2	6	153865	153870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3095	NC_007606	CAT	2	6	153901	153906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_007606	ACC	2	6	153931	153936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775530
3097	NC_007606	A	8	8	153965	153972	100 %	0 %	0 %	0 %	82775530
3098	NC_007606	CCG	2	6	154130	154135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775530
3099	NC_007606	CGT	2	6	154138	154143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775530
3100	NC_007606	GC	3	6	154145	154150	0 %	0 %	50 %	50 %	82775530
3101	NC_007606	CTG	2	6	154159	154164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775530
3102	NC_007606	CGC	2	6	154218	154223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775530
3103	NC_007606	CAGT	2	8	154345	154352	25 %	25 %	25 %	25 %	82775530
3104	NC_007606	GCG	2	6	154385	154390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775530
3105	NC_007606	AGCG	2	8	154395	154402	25 %	0 %	50 %	25 %	82775530
3106	NC_007606	TGCTGG	2	12	154451	154462	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	82775530
3107	NC_007606	ATTGGC	2	12	154519	154530	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	82775530
3108	NC_007606	CGG	2	6	154587	154592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775530
3109	NC_007606	CG	3	6	154642	154647	0 %	0 %	50 %	50 %	82775530
3110	NC_007606	GAA	2	6	154696	154701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775530
3111	NC_007606	GCT	2	6	154751	154756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775531
3112	NC_007606	CGC	2	6	154770	154775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775531
3113	NC_007606	TACC	2	8	154807	154814	25 %	25 %	0 %	50 %	82775531
3114	NC_007606	ATG	2	6	154828	154833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775531
3115	NC_007606	CGA	2	6	154850	154855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775531
3116	NC_007606	GTC	3	9	154878	154886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775531
3117	NC_007606	GGA	2	6	154922	154927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82775531
3118	NC_007606	GC	3	6	155261	155266	0 %	0 %	50 %	50 %	82775531
3119	NC_007606	ATT	2	6	155400	155405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775531
3120	NC_007606	TGAA	2	8	155425	155432	50 %	25 %	25 %	0 %	82775531
3121	NC_007606	GAT	2	6	155448	155453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775531
3122	NC_007606	GCC	2	6	155523	155528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775531
3123	NC_007606	ACA	2	6	155554	155559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775531
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3125	NC_007606	ATT	2	6	155640	155645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3497	NC_007606	GCG	2	6	173162	173167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775544
3498	NC_007606	CGC	2	6	173191	173196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775544
3499	NC_007606	TGA	2	6	173271	173276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775544
3500	NC_007606	GTG	2	6	173289	173294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775544

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