MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella dysenteriae Sd197

Total Repeats: 86031

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_007606	AT	3	6	497218	497223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_007606	TGG	2	6	497299	497304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_007606	TGG	2	6	497365	497370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775862
10005	NC_007606	GAA	2	6	497389	497394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775862
10006	NC_007606	CGA	2	6	497399	497404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775862
10007	NC_007606	ATC	3	9	497441	497449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775862
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10009	NC_007606	GAC	2	6	497505	497510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775862
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10011	NC_007606	GGCG	2	8	497671	497678	0 %	0 %	75 %	25 %	82775862
10012	NC_007606	GGGAT	2	10	497727	497736	20 %	20 %	60 %	0 %	82775862
10013	NC_007606	CGT	2	6	497803	497808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775862
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10016	NC_007606	TCC	2	6	497940	497945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82775862
10017	NC_007606	CTGG	2	8	498018	498025	0 %	25 %	50 %	25 %	82775862
10018	NC_007606	TTA	2	6	498040	498045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775862
10019	NC_007606	TGG	2	6	498114	498119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775862
10020	NC_007606	TGG	2	6	498193	498198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775862
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10022	NC_007606	GAT	2	6	498306	498311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775862
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10033	NC_007606	GAT	2	6	498908	498913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775864
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10052	NC_007606	TGG	2	6	500067	500072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775864
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10103	NC_007606	A	6	6	502530	502535	100 %	0 %	0 %	0 %	82775864
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10106	NC_007606	ATC	2	6	502619	502624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10108	NC_007606	GAAT	2	8	502685	502692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_007606	TGC	2	6	502890	502895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775865
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10119	NC_007606	GCA	2	6	503532	503537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10122	NC_007606	TAATC	2	10	503651	503660	40 %	40 %	0 %	20 %	82775867
10123	NC_007606	A	7	7	503679	503685	100 %	0 %	0 %	0 %	82775867
10124	NC_007606	GCG	2	6	503763	503768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775867
10125	NC_007606	CTGGAT	2	12	503835	503846	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	82775867
10126	NC_007606	TCA	2	6	503928	503933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775867
10127	NC_007606	CGA	2	6	503969	503974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775867
10128	NC_007606	A	6	6	504010	504015	100 %	0 %	0 %	0 %	82775867
10129	NC_007606	TGA	2	6	504026	504031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775867
10130	NC_007606	A	6	6	504045	504050	100 %	0 %	0 %	0 %	82775867
10131	NC_007606	TGG	2	6	504154	504159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775867
10132	NC_007606	TAA	2	6	504185	504190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82775867
10133	NC_007606	GAAAAA	2	12	504213	504224	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	82775867
10134	NC_007606	ATT	2	6	504283	504288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775867
10135	NC_007606	TC	3	6	504375	504380	0 %	50 %	0 %	50 %	82775867
10136	NC_007606	TTG	2	6	504472	504477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775867
10137	NC_007606	A	6	6	504555	504560	100 %	0 %	0 %	0 %	82775867
10138	NC_007606	TAT	2	6	504578	504583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775867
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10140	NC_007606	TGG	2	6	504613	504618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775867
10141	NC_007606	ATG	2	6	504672	504677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775867
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10144	NC_007606	CAG	2	6	504805	504810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775868
10145	NC_007606	CAA	2	6	504838	504843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775868
10146	NC_007606	GCAAT	2	10	504856	504865	40 %	20 %	20 %	20 %	82775868
10147	NC_007606	TGGC	2	8	504870	504877	0 %	25 %	50 %	25 %	82775868
10148	NC_007606	GCA	2	6	504904	504909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775868
10149	NC_007606	CCG	2	6	504910	504915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775868
10150	NC_007606	TGA	2	6	504972	504977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775868
10151	NC_007606	CCAG	2	8	504985	504992	25 %	0 %	25 %	50 %	82775868
10152	NC_007606	TCG	2	6	505002	505007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775868
10153	NC_007606	AGC	2	6	505008	505013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775868
10154	NC_007606	CGCT	2	8	505052	505059	0 %	25 %	25 %	50 %	82775868
10155	NC_007606	CTT	2	6	505141	505146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82775868
10156	NC_007606	CCA	2	6	505201	505206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775868
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10159	NC_007606	CTT	2	6	505273	505278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82775868
10160	NC_007606	CCAG	2	8	505309	505316	25 %	0 %	25 %	50 %	82775868
10161	NC_007606	TCA	2	6	505336	505341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775868
10162	NC_007606	GGC	2	6	505342	505347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775868
10163	NC_007606	CGC	2	6	505477	505482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775868
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10165	NC_007606	ACC	2	6	505549	505554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775869
10166	NC_007606	ACG	2	6	505568	505573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775869
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10169	NC_007606	GCC	2	6	505652	505657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775869
10170	NC_007606	AGCG	2	8	505671	505678	25 %	0 %	50 %	25 %	82775869
10171	NC_007606	GCG	2	6	505704	505709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775869
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10174	NC_007606	ATC	2	6	505831	505836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775869
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10177	NC_007606	ATG	2	6	505898	505903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775869
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10179	NC_007606	CCGATA	2	12	506039	506050	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	82775869
10180	NC_007606	AGC	2	6	506090	506095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775869
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10182	NC_007606	GCC	2	6	506119	506124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775869
10183	NC_007606	TGC	2	6	506131	506136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775869
10184	NC_007606	CCA	2	6	506178	506183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775869
10185	NC_007606	CGC	2	6	506187	506192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775869
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10187	NC_007606	ACC	2	6	506333	506338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775869
10188	NC_007606	GCG	2	6	506352	506357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775869
10189	NC_007606	GCG	2	6	506372	506377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775869
10190	NC_007606	CA	3	6	506437	506442	50 %	0 %	0 %	50 %	82775869
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10196	NC_007606	CAG	3	9	506616	506624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775870
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10199	NC_007606	CAT	2	6	506700	506705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775870
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10203	NC_007606	GC	3	6	506849	506854	0 %	0 %	50 %	50 %	82775870
10204	NC_007606	CAC	2	6	506901	506906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775870
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10206	NC_007606	CGCC	2	8	507032	507039	0 %	0 %	25 %	75 %	82775870
10207	NC_007606	CGC	2	6	507068	507073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775870
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10210	NC_007606	GTT	2	6	507137	507142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775870
10211	NC_007606	CAAG	2	8	507212	507219	50 %	0 %	25 %	25 %	82775870
10212	NC_007606	GC	3	6	507278	507283	0 %	0 %	50 %	50 %	82775870
10213	NC_007606	CG	3	6	507319	507324	0 %	0 %	50 %	50 %	82775870
10214	NC_007606	TAA	2	6	507441	507446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82775870
10215	NC_007606	ATTA	2	8	507519	507526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10216	NC_007606	GCT	2	6	507625	507630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775871
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10218	NC_007606	CGGTGC	2	12	507723	507734	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	82775871
10219	NC_007606	GAT	2	6	507742	507747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775871
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10221	NC_007606	TGTT	2	8	507801	507808	0 %	75 %	25 %	0 %	82775871
10222	NC_007606	A	6	6	507851	507856	100 %	0 %	0 %	0 %	82775871
10223	NC_007606	GC	3	6	507869	507874	0 %	0 %	50 %	50 %	82775871
10224	NC_007606	CTG	2	6	507917	507922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775871
10225	NC_007606	T	6	6	507970	507975	0 %	100 %	0 %	0 %	82775871
10226	NC_007606	GGC	2	6	508003	508008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775871
10227	NC_007606	CTG	2	6	508112	508117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775871
10228	NC_007606	GGC	3	9	508150	508158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775871
10229	NC_007606	TTA	2	6	508167	508172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775871
10230	NC_007606	GTT	2	6	508183	508188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775871
10231	NC_007606	GCCACC	2	12	508204	508215	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	82775871
10232	NC_007606	AGG	2	6	508285	508290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82775871
10233	NC_007606	GCT	2	6	508297	508302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775871
10234	NC_007606	GGT	2	6	508304	508309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775871
10235	NC_007606	GCTG	2	8	508351	508358	0 %	25 %	50 %	25 %	82775871
10236	NC_007606	GC	3	6	508458	508463	0 %	0 %	50 %	50 %	82775871
10237	NC_007606	TGC	2	6	508479	508484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775871
10238	NC_007606	TGC	2	6	508596	508601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775871
10239	NC_007606	TGC	2	6	508611	508616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775871
10240	NC_007606	GGCGC	2	10	508694	508703	0 %	0 %	60 %	40 %	82775871
10241	NC_007606	GGT	2	6	508709	508714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775871
10242	NC_007606	GAT	2	6	508723	508728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775871
10243	NC_007606	TTG	2	6	508766	508771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775871
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10490	NC_007606	CAC	2	6	518840	518845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10491	NC_007606	GC	3	6	518863	518868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10492	NC_007606	GCA	2	6	518873	518878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10493	NC_007606	ACC	2	6	519227	519232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775880
10494	NC_007606	AGCG	2	8	519273	519280	25 %	0 %	50 %	25 %	82775880
10495	NC_007606	AC	3	6	519301	519306	50 %	0 %	0 %	50 %	82775880
10496	NC_007606	GCA	2	6	519332	519337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775880
10497	NC_007606	CGC	2	6	519347	519352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775880
10498	NC_007606	GGCA	2	8	519358	519365	25 %	0 %	50 %	25 %	82775880
10499	NC_007606	CAG	2	6	519426	519431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775880
10500	NC_007606	TTGCG	2	10	519533	519542	0 %	40 %	40 %	20 %	82775880

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