MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella dysenteriae Sd197

Total Repeats: 86031

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007606	GCG	2	6	24861	24866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161950172
502	NC_007606	GCA	2	6	24910	24915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161950172
503	NC_007606	TAAA	2	8	24920	24927	75 %	25 %	0 %	0 %	161950172
504	NC_007606	TAA	2	6	24985	24990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82775409
505	NC_007606	TTTC	2	8	25001	25008	0 %	75 %	0 %	25 %	82775409
506	NC_007606	CAGCG	2	10	25011	25020	20 %	0 %	40 %	40 %	82775409
507	NC_007606	CCA	2	6	25145	25150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775409
508	NC_007606	TGG	2	6	25291	25296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775409
509	NC_007606	CGC	2	6	25331	25336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775409
510	NC_007606	GGTA	2	8	25397	25404	25 %	25 %	50 %	0 %	82775409
511	NC_007606	TTC	2	6	25500	25505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82775409
512	NC_007606	GGCG	2	8	25550	25557	0 %	0 %	75 %	25 %	82775409
513	NC_007606	ATT	2	6	25722	25727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775409
514	NC_007606	CAGTTT	2	12	25737	25748	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	82775409
515	NC_007606	T	6	6	25746	25751	0 %	100 %	0 %	0 %	82775409
516	NC_007606	TCT	2	6	25762	25767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_007606	TAA	2	6	25846	25851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82775410
518	NC_007606	AAT	2	6	25887	25892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82775410
519	NC_007606	GA	3	6	25900	25905	50 %	0 %	50 %	0 %	82775410
520	NC_007606	CGT	2	6	25916	25921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775410
521	NC_007606	CCG	2	6	25951	25956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775410
522	NC_007606	CGC	2	6	25971	25976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775410
523	NC_007606	CTT	2	6	26033	26038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82775410
524	NC_007606	CTG	2	6	26040	26045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775410
525	NC_007606	CGA	2	6	26069	26074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775410
526	NC_007606	CTGG	2	8	26187	26194	0 %	25 %	50 %	25 %	82775410
527	NC_007606	TCG	2	6	26218	26223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775410
528	NC_007606	TCG	2	6	26245	26250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775410
529	NC_007606	ACGAC	2	10	26291	26300	40 %	0 %	20 %	40 %	82775410
530	NC_007606	CCA	2	6	26315	26320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775410
531	NC_007606	GCA	2	6	26360	26365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775410
532	NC_007606	CGC	3	9	26375	26383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775410
533	NC_007606	TCA	2	6	26435	26440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775410
534	NC_007606	GATA	2	8	26447	26454	50 %	25 %	25 %	0 %	82775410
535	NC_007606	TCG	2	6	26458	26463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775410
536	NC_007606	GGT	2	6	26469	26474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775410
537	NC_007606	T	8	8	26622	26629	0 %	100 %	0 %	0 %	82775410
538	NC_007606	CCT	2	6	26646	26651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_007606	A	7	7	26666	26672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_007606	ATA	2	6	26682	26687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_007606	ATT	2	6	26741	26746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775411
542	NC_007606	T	6	6	26793	26798	0 %	100 %	0 %	0 %	82775411
543	NC_007606	AATGCC	2	12	26808	26819	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	82775411
544	NC_007606	CGA	2	6	26920	26925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775411
545	NC_007606	TTC	2	6	26962	26967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82775411
546	NC_007606	AGA	2	6	27110	27115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775411
547	NC_007606	GCGA	2	8	27132	27139	25 %	0 %	50 %	25 %	82775411
548	NC_007606	CGA	2	6	27142	27147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775411
549	NC_007606	ATT	2	6	27150	27155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775411
550	NC_007606	CGT	2	6	27261	27266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775412
551	NC_007606	GCG	2	6	27336	27341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775412
552	NC_007606	CTG	2	6	27471	27476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775412
553	NC_007606	CGG	2	6	27481	27486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775412
554	NC_007606	GAC	2	6	27545	27550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775412
555	NC_007606	CGG	2	6	27590	27595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775412
556	NC_007606	ATT	2	6	27606	27611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775412
557	NC_007606	CTG	2	6	27665	27670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775412
558	NC_007606	TCCA	2	8	27673	27680	25 %	25 %	0 %	50 %	82775412
559	NC_007606	GCTG	2	8	27719	27726	0 %	25 %	50 %	25 %	82775412
560	NC_007606	TGG	2	6	27730	27735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775412
561	NC_007606	TGC	2	6	27766	27771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775412
562	NC_007606	GAT	2	6	27789	27794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775412
563	NC_007606	GATT	2	8	27839	27846	25 %	50 %	25 %	0 %	82775412
564	NC_007606	TGA	2	6	27859	27864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775412
565	NC_007606	CCG	3	9	27865	27873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775412
566	NC_007606	CGCT	2	8	27978	27985	0 %	25 %	25 %	50 %	82775412
567	NC_007606	CCA	2	6	27994	27999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775412
568	NC_007606	GGT	2	6	28035	28040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775412
569	NC_007606	GGTGAA	2	12	28055	28066	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	82775412
570	NC_007606	TGG	2	6	28105	28110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775412
571	NC_007606	ACA	2	6	28120	28125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775412
572	NC_007606	GCCT	2	8	28261	28268	0 %	25 %	25 %	50 %	82775412
573	NC_007606	ATG	2	6	28335	28340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775412
574	NC_007606	GAT	2	6	28403	28408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775412
575	NC_007606	CGG	2	6	28448	28453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775412
576	NC_007606	CCA	2	6	28466	28471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775412
577	NC_007606	GCG	3	9	28521	28529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775412
578	NC_007606	ATG	2	6	28572	28577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775412
579	NC_007606	CG	3	6	28650	28655	0 %	0 %	50 %	50 %	82775412
580	NC_007606	ACG	2	6	28717	28722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775412
581	NC_007606	CTG	2	6	28758	28763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775412
582	NC_007606	GAT	2	6	28781	28786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775412
583	NC_007606	TC	3	6	28834	28839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
584	NC_007606	CAT	2	6	28860	28865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_007606	CAC	2	6	28936	28941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_007606	ACC	2	6	28984	28989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_007606	TGT	2	6	29031	29036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_007606	CTG	2	6	29055	29060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_007606	GCG	2	6	29063	29068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_007606	CCG	2	6	29085	29090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_007606	GCCC	2	8	29100	29107	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
592	NC_007606	GCG	2	6	29169	29174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_007606	CAC	2	6	29194	29199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_007606	GCTG	2	8	29240	29247	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
595	NC_007606	GCT	2	6	29358	29363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_007606	AAAC	2	8	29400	29407	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
597	NC_007606	GGC	2	6	29519	29524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_007606	TGG	2	6	29549	29554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_007606	TGG	2	6	29586	29591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_007606	TCG	2	6	29622	29627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_007606	GCA	2	6	29681	29686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_007606	ACC	2	6	29717	29722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_007606	ACG	2	6	29734	29739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_007606	TGC	2	6	29749	29754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_007606	ATG	2	6	29774	29779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_007606	CCT	2	6	29824	29829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82779654
607	NC_007606	GTG	2	6	29847	29852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82779654
608	NC_007606	A	6	6	30050	30055	100 %	0 %	0 %	0 %	82779654
609	NC_007606	GTT	2	6	30200	30205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775413
610	NC_007606	CTG	2	6	30257	30262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775413
611	NC_007606	GTG	2	6	30275	30280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775413
612	NC_007606	TGGC	2	8	30295	30302	0 %	25 %	50 %	25 %	82775413
613	NC_007606	GCA	2	6	30391	30396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775413
614	NC_007606	CGA	2	6	30511	30516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_007606	GTG	2	6	30633	30638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_007606	TAAAGG	2	12	30824	30835	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_007606	CAG	2	6	30891	30896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_007606	CAT	2	6	31130	31135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_007606	GAA	2	6	31142	31147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_007606	ACG	2	6	31152	31157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_007606	GGC	2	6	31293	31298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_007606	GCT	2	6	31397	31402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_007606	CTT	2	6	31430	31435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_007606	AGGC	2	8	31508	31515	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
625	NC_007606	ACC	2	6	31620	31625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_007606	CAG	2	6	31632	31637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_007606	ACC	2	6	31642	31647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_007606	GAA	2	6	31719	31724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_007606	AGC	2	6	31801	31806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_007606	GTA	2	6	31890	31895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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632	NC_007606	CCAG	2	8	31916	31923	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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