MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella dysenteriae Sd197

Total Repeats: 86031

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007606	TCAT	2	8	253255	253262	25 %	50 %	0 %	25 %	82775621
5002	NC_007606	TGTT	2	8	253277	253284	0 %	75 %	25 %	0 %	82775621
5003	NC_007606	TAT	2	6	253314	253319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775621
5004	NC_007606	GCA	2	6	253339	253344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775621
5005	NC_007606	TGC	2	6	253391	253396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775621
5006	NC_007606	ATG	2	6	253416	253421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_007606	CCT	2	6	253466	253471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82775622
5008	NC_007606	GTG	2	6	253489	253494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775622
5009	NC_007606	A	6	6	253692	253697	100 %	0 %	0 %	0 %	82775622
5010	NC_007606	GCTG	2	8	253804	253811	0 %	25 %	50 %	25 %	82775623
5011	NC_007606	GTT	2	6	253842	253847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775623
5012	NC_007606	CTG	2	6	253899	253904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775623
5013	NC_007606	GTG	2	6	253917	253922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775623
5014	NC_007606	TGGC	2	8	253937	253944	0 %	25 %	50 %	25 %	82775623
5015	NC_007606	GCA	2	6	254033	254038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775623
5016	NC_007606	GTTT	2	8	254167	254174	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_007606	TAA	2	6	254187	254192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_007606	GC	3	6	254374	254379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_007606	TCT	2	6	254384	254389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_007606	CAC	2	6	254428	254433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_007606	ACG	2	6	254510	254515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_007606	TGC	2	6	254516	254521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_007606	TAG	2	6	254654	254659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775624
5024	NC_007606	GTC	2	6	254851	254856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775624
5025	NC_007606	AGT	2	6	254897	254902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775624
5026	NC_007606	C	7	7	254949	254955	0 %	0 %	0 %	100 %	82775624
5027	NC_007606	TCA	2	6	255023	255028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775624
5028	NC_007606	T	6	6	255094	255099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_007606	TAAGTG	2	12	255217	255228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_007606	AATG	2	8	255326	255333	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_007606	T	6	6	255409	255414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_007606	AAT	2	6	255498	255503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_007606	GCT	2	6	255525	255530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_007606	GC	3	6	255604	255609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5035	NC_007606	CATT	2	8	255716	255723	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5036	NC_007606	CACTTA	2	12	255821	255832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_007606	A	6	6	255950	255955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_007606	TGA	2	6	256021	256026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775625
5039	NC_007606	G	7	7	256094	256100	0 %	0 %	100 %	0 %	82775625
5040	NC_007606	ACT	2	6	256147	256152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775625
5041	NC_007606	CGA	2	6	256192	256197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775625
5042	NC_007606	CTA	2	6	256390	256395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775625
5043	NC_007606	TGC	2	6	256414	256419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_007606	GGC	2	6	256431	256436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_007606	AGCC	2	8	256485	256492	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_007606	ACA	2	6	256532	256537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_007606	TGA	2	6	256547	256552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_007606	TTG	2	6	256612	256617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_007606	GGC	2	6	256626	256631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_007606	TACCTC	2	12	256677	256688	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5051	NC_007606	CTG	2	6	256720	256725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_007606	CTC	2	6	256743	256748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_007606	TCT	2	6	256819	256824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_007606	GGA	2	6	256910	256915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_007606	AG	3	6	256959	256964	50 %	0 %	50 %	0 %	82775626
5056	NC_007606	AG	3	6	256969	256974	50 %	0 %	50 %	0 %	82775626
5057	NC_007606	CGGTTT	2	12	257027	257038	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	82775626
5058	NC_007606	TTTGCC	2	12	257051	257062	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	82775626
5059	NC_007606	CGC	2	6	257167	257172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775626
5060	NC_007606	CAG	2	6	257219	257224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775627
5061	NC_007606	A	6	6	257259	257264	100 %	0 %	0 %	0 %	82775627
5062	NC_007606	GCT	2	6	257308	257313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775627
5063	NC_007606	GTT	2	6	257315	257320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775627
5064	NC_007606	GGC	2	6	257345	257350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775627
5065	NC_007606	GTC	2	6	257369	257374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775627
5066	NC_007606	GGCGC	2	10	257415	257424	0 %	0 %	60 %	40 %	82775627
5067	NC_007606	CAGC	2	8	257452	257459	25 %	0 %	25 %	50 %	82775627
5068	NC_007606	GAC	2	6	257490	257495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775627
5069	NC_007606	A	6	6	257510	257515	100 %	0 %	0 %	0 %	82775627
5070	NC_007606	CTGG	2	8	257602	257609	0 %	25 %	50 %	25 %	82775627
5071	NC_007606	TCA	2	6	257677	257682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775627
5072	NC_007606	ATA	2	6	257736	257741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82775627
5073	NC_007606	GTT	2	6	257840	257845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_007606	GACT	2	8	257902	257909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5075	NC_007606	CGT	2	6	257923	257928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_007606	GC	3	6	257980	257985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5077	NC_007606	AT	3	6	258114	258119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_007606	TCG	2	6	258177	258182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_007606	GCC	2	6	258191	258196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5080	NC_007606	GC	3	6	258216	258221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5081	NC_007606	CTG	2	6	258263	258268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_007606	CAT	2	6	258347	258352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_007606	CAG	2	6	258413	258418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_007606	GCC	2	6	258488	258493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5085	NC_007606	ATT	2	6	258497	258502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_007606	AGA	2	6	258539	258544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_007606	GCG	2	6	258563	258568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_007606	CCT	2	6	258574	258579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5089	NC_007606	CGG	2	6	258588	258593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_007606	TCA	2	6	258657	258662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_007606	TGC	2	6	258681	258686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_007606	TAT	2	6	258847	258852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_007606	GTTCCA	2	12	258856	258867	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_007606	TCAC	2	8	258882	258889	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5095	NC_007606	ATTG	2	8	258962	258969	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_007606	CCA	2	6	259031	259036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5097	NC_007606	TGT	2	6	259074	259079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_007606	GCC	2	6	259110	259115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5099	NC_007606	GCA	3	9	259128	259136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_007606	GCC	2	6	259182	259187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5101	NC_007606	GTT	2	6	259261	259266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_007606	GCG	2	6	259338	259343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_007606	AGA	2	6	259506	259511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_007606	GCA	2	6	259573	259578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_007606	CTC	2	6	259733	259738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_007606	GGA	2	6	259756	259761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_007606	CTT	2	6	259795	259800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_007606	CAA	2	6	259825	259830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_007606	GTAA	2	8	260015	260022	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_007606	AAG	2	6	260093	260098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_007606	CTG	2	6	260141	260146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_007606	GCA	2	6	260206	260211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_007606	TTCC	2	8	260230	260237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5114	NC_007606	GCA	2	6	260244	260249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_007606	GCA	2	6	260343	260348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_007606	TTC	2	6	260375	260380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_007606	GCC	2	6	260415	260420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5118	NC_007606	TCC	2	6	260466	260471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5119	NC_007606	TCA	2	6	260490	260495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_007606	CTG	2	6	260555	260560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_007606	TA	3	6	260564	260569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_007606	TCG	2	6	260595	260600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_007606	ATAA	2	8	260639	260646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_007606	CAG	2	6	260732	260737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_007606	AAC	2	6	260962	260967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775628
5126	NC_007606	GCC	2	6	261044	261049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775628
5127	NC_007606	CTG	2	6	261063	261068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775628
5128	NC_007606	ACA	2	6	261101	261106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775628
5129	NC_007606	GC	3	6	261132	261137	0 %	0 %	50 %	50 %	82775628
5130	NC_007606	GCC	2	6	261220	261225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775628
5131	NC_007606	TCA	2	6	261268	261273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775628
5132	NC_007606	CACGC	2	10	261373	261382	20 %	0 %	20 %	60 %	82775628
5133	NC_007606	GTT	2	6	261494	261499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775628
5134	NC_007606	TGA	2	6	261506	261511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775628
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5138	NC_007606	GC	4	8	261641	261648	0 %	0 %	50 %	50 %	82775628
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5157	NC_007606	AGCG	2	8	262637	262644	25 %	0 %	50 %	25 %	82775628
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5182	NC_007606	A	6	6	263952	263957	100 %	0 %	0 %	0 %	82775630
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5234	NC_007606	GCGT	2	8	265794	265801	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5235	NC_007606	GGC	2	6	265917	265922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775631
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5240	NC_007606	TTC	2	6	266295	266300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82775631
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5252	NC_007606	GGC	2	6	266960	266965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775632
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