MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_007604	TTG	2	6	80931	80936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81298893
1502	NC_007604	AGGC	2	8	80937	80944	25 %	0 %	50 %	25 %	81298893
1503	NC_007604	TAC	2	6	80987	80992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298893
1504	NC_007604	TGC	2	6	81162	81167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298894
1505	NC_007604	ACG	2	6	81262	81267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298895
1506	NC_007604	TGG	2	6	81278	81283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298895
1507	NC_007604	GCT	2	6	81306	81311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298895
1508	NC_007604	CGG	2	6	81314	81319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298895
1509	NC_007604	CAG	2	6	81406	81411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298895
1510	NC_007604	ACT	2	6	81458	81463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298895
1511	NC_007604	AGC	2	6	81564	81569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298895
1512	NC_007604	GAAGCC	2	12	81577	81588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298895
1513	NC_007604	TCAG	2	8	81602	81609	25 %	25 %	25 %	25 %	81298895
1514	NC_007604	GTG	2	6	81624	81629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298895
1515	NC_007604	AAC	2	6	81713	81718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298895
1516	NC_007604	GGC	2	6	81722	81727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298895
1517	NC_007604	CAA	2	6	81802	81807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298895
1518	NC_007604	TGG	2	6	81827	81832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298895
1519	NC_007604	AGA	2	6	81894	81899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81298895
1520	NC_007604	CGC	2	6	81909	81914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298895
1521	NC_007604	AGA	2	6	81929	81934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_007604	TCCCC	2	10	81936	81945	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1523	NC_007604	ATGG	2	8	82000	82007	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_007604	GT	3	6	82153	82158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_007604	GCG	2	6	82163	82168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_007604	CGA	2	6	82215	82220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298896
1527	NC_007604	GCA	2	6	82235	82240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298896
1528	NC_007604	CTT	2	6	82274	82279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81298896
1529	NC_007604	GCC	2	6	82330	82335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298896
1530	NC_007604	CGG	2	6	82406	82411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298896
1531	NC_007604	CAA	2	6	82413	82418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298896
1532	NC_007604	TGA	2	6	82525	82530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298896
1533	NC_007604	CAC	2	6	82532	82537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298896
1534	NC_007604	GGA	2	6	82663	82668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81298896
1535	NC_007604	CAA	2	6	82811	82816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298896
1536	NC_007604	GAG	2	6	83014	83019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81298897
1537	NC_007604	CTG	2	6	83081	83086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298897
1538	NC_007604	GTT	2	6	83140	83145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81298897
1539	NC_007604	GAC	2	6	83176	83181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298897
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1541	NC_007604	GCA	2	6	83200	83205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298897
1542	NC_007604	GTTC	2	8	83206	83213	0 %	50 %	25 %	25 %	81298897
1543	NC_007604	GGC	2	6	83251	83256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298897
1544	NC_007604	CTG	2	6	83348	83353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298897
1545	NC_007604	GCT	2	6	83428	83433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298897
1546	NC_007604	GTCCC	2	10	83511	83520	0 %	20 %	20 %	60 %	81298897
1547	NC_007604	TC	3	6	83527	83532	0 %	50 %	0 %	50 %	81298897
1548	NC_007604	TGA	2	6	83599	83604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298897
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1550	NC_007604	AATC	2	8	83842	83849	50 %	25 %	0 %	25 %	81298897
1551	NC_007604	CAG	2	6	84053	84058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298897
1552	NC_007604	TAG	2	6	84060	84065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298897
1553	NC_007604	CAG	2	6	84118	84123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298897
1554	NC_007604	TGG	2	6	84165	84170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298897
1555	NC_007604	TCA	2	6	84195	84200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298897
1556	NC_007604	A	7	7	84248	84254	100 %	0 %	0 %	0 %	81298897
1557	NC_007604	AGT	2	6	84274	84279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298897
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1559	NC_007604	T	6	6	84370	84375	0 %	100 %	0 %	0 %	81298897
1560	NC_007604	GCC	2	6	84440	84445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298897
1561	NC_007604	CAA	2	6	84526	84531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298897
1562	NC_007604	TTA	2	6	84558	84563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81298897
1563	NC_007604	TGC	2	6	84594	84599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298897
1564	NC_007604	CAG	2	6	84629	84634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298897
1565	NC_007604	TTG	2	6	84639	84644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81298897
1566	NC_007604	TCA	2	6	84807	84812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298897
1567	NC_007604	CAG	2	6	84815	84820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298897
1568	NC_007604	CTG	2	6	84982	84987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298898
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1570	NC_007604	AAG	2	6	85037	85042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81298898
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1572	NC_007604	CAA	2	6	85111	85116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298898
1573	NC_007604	AAC	2	6	85118	85123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298898
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1584	NC_007604	TCT	2	6	85928	85933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81298898
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1588	NC_007604	GCT	3	9	86180	86188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298898
1589	NC_007604	TGGG	2	8	86217	86224	0 %	25 %	75 %	0 %	81298898
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1592	NC_007604	GCA	2	6	86277	86282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298898
1593	NC_007604	C	6	6	86306	86311	0 %	0 %	0 %	100 %	81298898
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1596	NC_007604	CCAG	2	8	86367	86374	25 %	0 %	25 %	50 %	81298898
1597	NC_007604	AACC	2	8	86433	86440	50 %	0 %	0 %	50 %	81298898
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1602	NC_007604	TTGA	2	8	86721	86728	25 %	50 %	25 %	0 %	81298899
1603	NC_007604	GAG	2	6	86766	86771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81298899
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1605	NC_007604	TGG	2	6	86857	86862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298899
1606	NC_007604	CCTA	2	8	86878	86885	25 %	25 %	0 %	50 %	81298899
1607	NC_007604	GAACAG	2	12	86913	86924	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	81298899
1608	NC_007604	GGT	2	6	87003	87008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298899
1609	NC_007604	TGC	2	6	87031	87036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298899
1610	NC_007604	G	7	7	87048	87054	0 %	0 %	100 %	0 %	81298899
1611	NC_007604	CTTGG	2	10	87143	87152	0 %	40 %	40 %	20 %	81298899
1612	NC_007604	CTC	2	6	87261	87266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81298899
1613	NC_007604	T	6	6	87286	87291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_007604	GAA	2	6	87426	87431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_007604	CGATCG	2	12	87439	87450	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_007604	CCAT	2	8	87467	87474	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_007604	CCT	2	6	87488	87493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_007604	GCC	2	6	87502	87507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1619	NC_007604	CGTT	2	8	87565	87572	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1620	NC_007604	TGT	2	6	87588	87593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_007604	TAG	2	6	87597	87602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_007604	CGAT	2	8	87654	87661	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1623	NC_007604	CAGG	2	8	87730	87737	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1624	NC_007604	CTG	2	6	87866	87871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_007604	AGA	2	6	87964	87969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81298900
1626	NC_007604	CGC	2	6	87980	87985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298900
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1628	NC_007604	TTC	2	6	88046	88051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81298900
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1867	NC_007604	TTCG	2	8	102918	102925	0 %	50 %	25 %	25 %	81298913
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1876	NC_007604	TGGAT	2	10	103349	103358	20 %	40 %	40 %	0 %	81298914
1877	NC_007604	GCA	2	6	103482	103487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298914
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1996	NC_007604	AAC	2	6	110763	110768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298922
1997	NC_007604	AGCGG	2	10	110803	110812	20 %	0 %	60 %	20 %	81298922
1998	NC_007604	GCGA	2	8	110843	110850	25 %	0 %	50 %	25 %	81298922
1999	NC_007604	TGA	2	6	110860	110865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298922
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