MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007604	ACG	2	6	269335	269340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299085
5002	NC_007604	TGA	2	6	269451	269456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299085
5003	NC_007604	TTGAC	2	10	269573	269582	20 %	40 %	20 %	20 %	81299085
5004	NC_007604	TCG	2	6	269619	269624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299085
5005	NC_007604	TTAT	2	8	269651	269658	25 %	75 %	0 %	0 %	81299085
5006	NC_007604	ATTG	2	8	269962	269969	25 %	50 %	25 %	0 %	81299086
5007	NC_007604	TAA	2	6	270002	270007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81299087
5008	NC_007604	CAC	2	6	270048	270053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299087
5009	NC_007604	AGC	2	6	270168	270173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299087
5010	NC_007604	GCC	2	6	270211	270216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299087
5011	NC_007604	GTA	2	6	270430	270435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299087
5012	NC_007604	TCCG	2	8	270447	270454	0 %	25 %	25 %	50 %	81299087
5013	NC_007604	CAG	2	6	270456	270461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299087
5014	NC_007604	GCGATC	2	12	270515	270526	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81299087
5015	NC_007604	TGT	2	6	270539	270544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299087
5016	NC_007604	TGC	2	6	270572	270577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299087
5017	NC_007604	CAC	2	6	270652	270657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299087
5018	NC_007604	CCG	2	6	270702	270707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299087
5019	NC_007604	GAT	2	6	270724	270729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299087
5020	NC_007604	CAG	2	6	270738	270743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299087
5021	NC_007604	GCT	2	6	270749	270754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299087
5022	NC_007604	TGC	2	6	270759	270764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299087
5023	NC_007604	CGC	2	6	270900	270905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299087
5024	NC_007604	GCA	2	6	270930	270935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299087
5025	NC_007604	GCC	2	6	271015	271020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299087
5026	NC_007604	A	6	6	271061	271066	100 %	0 %	0 %	0 %	81299087
5027	NC_007604	CGT	2	6	271075	271080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299087
5028	NC_007604	GAACGC	2	12	271116	271127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299087
5029	NC_007604	CAC	2	6	271206	271211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299087
5030	NC_007604	GA	3	6	271247	271252	50 %	0 %	50 %	0 %	81299087
5031	NC_007604	CAG	2	6	271275	271280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299087
5032	NC_007604	CTT	2	6	271287	271292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299087
5033	NC_007604	AAC	2	6	271309	271314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299087
5034	NC_007604	GAT	2	6	271332	271337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299087
5035	NC_007604	TTC	2	6	271369	271374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299087
5036	NC_007604	GCA	2	6	271445	271450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299087
5037	NC_007604	CGG	2	6	271452	271457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299087
5038	NC_007604	GCAA	2	8	271509	271516	50 %	0 %	25 %	25 %	81299088
5039	NC_007604	CAG	2	6	271520	271525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299088
5040	NC_007604	GCTT	2	8	271573	271580	0 %	50 %	25 %	25 %	81299088
5041	NC_007604	CTT	2	6	271585	271590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299088
5042	NC_007604	ACA	2	6	271599	271604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299088
5043	NC_007604	GCC	2	6	271640	271645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299088
5044	NC_007604	CGC	2	6	271646	271651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299088
5045	NC_007604	TCAA	2	8	271653	271660	50 %	25 %	0 %	25 %	81299088
5046	NC_007604	GCT	2	6	271746	271751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299088
5047	NC_007604	TTGC	2	8	271885	271892	0 %	50 %	25 %	25 %	81299088
5048	NC_007604	GAG	2	6	272063	272068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81299088
5049	NC_007604	CGA	2	6	272131	272136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299088
5050	NC_007604	C	6	6	272194	272199	0 %	0 %	0 %	100 %	81299088
5051	NC_007604	CTT	3	9	272242	272250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299088
5052	NC_007604	GCA	2	6	272293	272298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299088
5053	NC_007604	CGGC	2	8	272314	272321	0 %	0 %	50 %	50 %	81299088
5054	NC_007604	CGCC	2	8	272362	272369	0 %	0 %	25 %	75 %	81299088
5055	NC_007604	CAC	2	6	272375	272380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299088
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5057	NC_007604	TGC	2	6	272529	272534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299088
5058	NC_007604	TCG	2	6	272550	272555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299088
5059	NC_007604	GGC	2	6	272620	272625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299088
5060	NC_007604	CGG	3	9	272673	272681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299088
5061	NC_007604	GCGGT	2	10	272735	272744	0 %	20 %	60 %	20 %	81299088
5062	NC_007604	GGC	2	6	272783	272788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299088
5063	NC_007604	A	6	6	272834	272839	100 %	0 %	0 %	0 %	81299088
5064	NC_007604	CGG	3	9	272890	272898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299088
5065	NC_007604	TTC	2	6	273071	273076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299088
5066	NC_007604	CAG	2	6	273113	273118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299088
5067	NC_007604	TGC	2	6	273363	273368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299088
5068	NC_007604	GTA	2	6	273437	273442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299088
5069	NC_007604	CTG	2	6	273455	273460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299088
5070	NC_007604	GC	3	6	273483	273488	0 %	0 %	50 %	50 %	81299088
5071	NC_007604	GGT	3	9	273500	273508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299088
5072	NC_007604	GGCT	2	8	273596	273603	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5073	NC_007604	AG	3	6	273631	273636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_007604	TCG	4	12	273692	273703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299089
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5076	NC_007604	GCA	2	6	273838	273843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299089
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5080	NC_007604	CGT	2	6	274064	274069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299089
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5089	NC_007604	CAA	2	6	274496	274501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299090
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5114	NC_007604	CCCAA	2	10	275669	275678	40 %	0 %	0 %	60 %	81299090
5115	NC_007604	CGCTG	2	10	275688	275697	0 %	20 %	40 %	40 %	81299090
5116	NC_007604	CGAT	2	8	275760	275767	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5117	NC_007604	CAG	2	6	275780	275785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299091
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5119	NC_007604	CCA	2	6	275937	275942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299091
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5123	NC_007604	GAG	2	6	276074	276079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81299091
5124	NC_007604	ACC	2	6	276167	276172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299091
5125	NC_007604	ACC	2	6	276231	276236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299091
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5233	NC_007604	CTC	2	6	281872	281877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5237	NC_007604	T	6	6	282077	282082	0 %	100 %	0 %	0 %	81299098
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5239	NC_007604	TTCTT	2	10	282111	282120	0 %	80 %	0 %	20 %	81299098
5240	NC_007604	TGG	2	6	282131	282136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299098
5241	NC_007604	ATT	2	6	282260	282265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81299098
5242	NC_007604	GGC	2	6	282323	282328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299098
5243	NC_007604	CAG	2	6	282342	282347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299098
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5362	NC_007604	GAAT	2	8	288239	288246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5363	NC_007604	AGC	2	6	288383	288388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299102
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