MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 2542

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007516	GC	3	6	209	214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007516	CA	3	6	305	310	50 %	0 %	0 %	50 %	78211559
3	NC_007516	TC	3	6	402	407	0 %	50 %	0 %	50 %	78211559
4	NC_007516	GA	3	6	460	465	50 %	0 %	50 %	0 %	78211559
5	NC_007516	TG	3	6	1554	1559	0 %	50 %	50 %	0 %	78211560
6	NC_007516	TG	3	6	3677	3682	0 %	50 %	50 %	0 %	78211561
7	NC_007516	TC	3	6	4532	4537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007516	GT	3	6	4577	4582	0 %	50 %	50 %	0 %	78211562
9	NC_007516	CA	3	6	4671	4676	50 %	0 %	0 %	50 %	78211562
10	NC_007516	GC	3	6	9999	10004	0 %	0 %	50 %	50 %	78211565
11	NC_007516	GT	3	6	11654	11659	0 %	50 %	50 %	0 %	78211567
12	NC_007516	GT	3	6	12461	12466	0 %	50 %	50 %	0 %	78211568
13	NC_007516	CG	3	6	14773	14778	0 %	0 %	50 %	50 %	78211570
14	NC_007516	GC	3	6	14947	14952	0 %	0 %	50 %	50 %	78211570
15	NC_007516	GC	3	6	15124	15129	0 %	0 %	50 %	50 %	78211570
16	NC_007516	GC	3	6	17155	17160	0 %	0 %	50 %	50 %	78211572
17	NC_007516	GT	3	6	21226	21231	0 %	50 %	50 %	0 %	78211577
18	NC_007516	CG	3	6	21738	21743	0 %	0 %	50 %	50 %	78211577
19	NC_007516	TG	3	6	26615	26620	0 %	50 %	50 %	0 %	78211581
20	NC_007516	GT	3	6	26912	26917	0 %	50 %	50 %	0 %	78211581
21	NC_007516	GT	3	6	30117	30122	0 %	50 %	50 %	0 %	78211585
22	NC_007516	CA	3	6	31048	31053	50 %	0 %	0 %	50 %	78211586
23	NC_007516	GC	3	6	31711	31716	0 %	0 %	50 %	50 %	78211586
24	NC_007516	GA	3	6	34641	34646	50 %	0 %	50 %	0 %	78211590
25	NC_007516	CG	3	6	34940	34945	0 %	0 %	50 %	50 %	78211590
26	NC_007516	GC	3	6	36922	36927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007516	TC	4	8	37005	37012	0 %	50 %	0 %	50 %	78211593
28	NC_007516	AG	3	6	39763	39768	50 %	0 %	50 %	0 %	78211596
29	NC_007516	GC	3	6	40282	40287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007516	CG	3	6	42412	42417	0 %	0 %	50 %	50 %	78211600
31	NC_007516	TC	3	6	42524	42529	0 %	50 %	0 %	50 %	78211600
32	NC_007516	GC	3	6	44174	44179	0 %	0 %	50 %	50 %	78211601
33	NC_007516	TG	3	6	44744	44749	0 %	50 %	50 %	0 %	78211601
34	NC_007516	AG	3	6	45126	45131	50 %	0 %	50 %	0 %	78211602
35	NC_007516	CA	3	6	45474	45479	50 %	0 %	0 %	50 %	78211602
36	NC_007516	AG	3	6	48450	48455	50 %	0 %	50 %	0 %	78211605
37	NC_007516	CT	3	6	53999	54004	0 %	50 %	0 %	50 %	78211612
38	NC_007516	GC	3	6	55109	55114	0 %	0 %	50 %	50 %	78211614
39	NC_007516	CG	3	6	57956	57961	0 %	0 %	50 %	50 %	78211616
40	NC_007516	GT	3	6	61045	61050	0 %	50 %	50 %	0 %	78211619
41	NC_007516	AC	3	6	62402	62407	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007516	TG	3	6	65667	65672	0 %	50 %	50 %	0 %	78211622
43	NC_007516	CT	3	6	66589	66594	0 %	50 %	0 %	50 %	78211623
44	NC_007516	TG	3	6	66791	66796	0 %	50 %	50 %	0 %	78211624
45	NC_007516	CG	3	6	67092	67097	0 %	0 %	50 %	50 %	78211624
46	NC_007516	GC	4	8	67543	67550	0 %	0 %	50 %	50 %	78211624
47	NC_007516	CA	3	6	69655	69660	50 %	0 %	0 %	50 %	78211626
48	NC_007516	AG	3	6	70462	70467	50 %	0 %	50 %	0 %	78211626
49	NC_007516	GC	4	8	72728	72735	0 %	0 %	50 %	50 %	78211628
50	NC_007516	AG	3	6	73865	73870	50 %	0 %	50 %	0 %	78211629
51	NC_007516	GT	5	10	74214	74223	0 %	50 %	50 %	0 %	78211630
52	NC_007516	GC	3	6	75451	75456	0 %	0 %	50 %	50 %	78211632
53	NC_007516	GC	3	6	82475	82480	0 %	0 %	50 %	50 %	78211636
54	NC_007516	GT	4	8	84215	84222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007516	CA	3	6	85396	85401	50 %	0 %	0 %	50 %	78211638
56	NC_007516	TG	3	6	85815	85820	0 %	50 %	50 %	0 %	78211638
57	NC_007516	GT	3	6	86148	86153	0 %	50 %	50 %	0 %	78211639
58	NC_007516	TG	3	6	86717	86722	0 %	50 %	50 %	0 %	78211639
59	NC_007516	CT	3	6	90956	90961	0 %	50 %	0 %	50 %	78211643
60	NC_007516	CG	3	6	92690	92695	0 %	0 %	50 %	50 %	78211647
61	NC_007516	TG	3	6	95237	95242	0 %	50 %	50 %	0 %	78211649
62	NC_007516	TC	4	8	96502	96509	0 %	50 %	0 %	50 %	78211650
63	NC_007516	AC	3	6	96877	96882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007516	CT	3	6	97054	97059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007516	CT	3	6	98358	98363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007516	GC	3	6	98982	98987	0 %	0 %	50 %	50 %	78211651
67	NC_007516	GC	3	6	99000	99005	0 %	0 %	50 %	50 %	78211651
68	NC_007516	CG	3	6	100106	100111	0 %	0 %	50 %	50 %	78211652
69	NC_007516	GC	4	8	100713	100720	0 %	0 %	50 %	50 %	78211653
70	NC_007516	GA	3	6	101235	101240	50 %	0 %	50 %	0 %	78211654
71	NC_007516	GC	3	6	101848	101853	0 %	0 %	50 %	50 %	78211654
72	NC_007516	CG	3	6	103839	103844	0 %	0 %	50 %	50 %	78211657
73	NC_007516	GC	3	6	104688	104693	0 %	0 %	50 %	50 %	78211657
74	NC_007516	TG	3	6	104768	104773	0 %	50 %	50 %	0 %	78211657
75	NC_007516	GT	3	6	105352	105357	0 %	50 %	50 %	0 %	78211658
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77	NC_007516	GC	3	6	107121	107126	0 %	0 %	50 %	50 %	78211660
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79	NC_007516	GT	3	6	109210	109215	0 %	50 %	50 %	0 %	78211662
80	NC_007516	GC	3	6	109284	109289	0 %	0 %	50 %	50 %	78211662
81	NC_007516	GC	3	6	109642	109647	0 %	0 %	50 %	50 %	78211662
82	NC_007516	GT	3	6	111681	111686	0 %	50 %	50 %	0 %	78211666
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85	NC_007516	GC	3	6	113155	113160	0 %	0 %	50 %	50 %	78211668
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89	NC_007516	GC	3	6	118442	118447	0 %	0 %	50 %	50 %	78211673
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92	NC_007516	TC	3	6	119306	119311	0 %	50 %	0 %	50 %	78211675
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95	NC_007516	GC	3	6	125653	125658	0 %	0 %	50 %	50 %	78211680
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97	NC_007516	AG	3	6	130341	130346	50 %	0 %	50 %	0 %	78211686
98	NC_007516	GA	3	6	130654	130659	50 %	0 %	50 %	0 %	78211686
99	NC_007516	AG	3	6	130680	130685	50 %	0 %	50 %	0 %	78211686
100	NC_007516	GA	3	6	130993	130998	50 %	0 %	50 %	0 %	78211686
101	NC_007516	AG	3	6	131019	131024	50 %	0 %	50 %	0 %	78211686
102	NC_007516	GA	3	6	131219	131224	50 %	0 %	50 %	0 %	78211686
103	NC_007516	AT	3	6	131431	131436	50 %	50 %	0 %	0 %	78211686
104	NC_007516	CA	3	6	131590	131595	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_007516	GT	3	6	132989	132994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007516	AT	3	6	133001	133006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007516	TG	3	6	133404	133409	0 %	50 %	50 %	0 %	78211688
108	NC_007516	GA	3	6	133684	133689	50 %	0 %	50 %	0 %	78211688
109	NC_007516	AT	3	6	134288	134293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007516	CT	3	6	134521	134526	0 %	50 %	0 %	50 %	78211689
111	NC_007516	AG	3	6	135048	135053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007516	CA	3	6	136026	136031	50 %	0 %	0 %	50 %	78211691
113	NC_007516	GA	3	6	136766	136771	50 %	0 %	50 %	0 %	78211692
114	NC_007516	GT	3	6	137443	137448	0 %	50 %	50 %	0 %	78211693
115	NC_007516	AC	3	6	138202	138207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007516	TC	3	6	138439	138444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_007516	AT	3	6	138663	138668	50 %	50 %	0 %	0 %	78211694
118	NC_007516	TA	3	6	139406	139411	50 %	50 %	0 %	0 %	78211694
119	NC_007516	CT	3	6	139631	139636	0 %	50 %	0 %	50 %	78211694
120	NC_007516	TG	3	6	139844	139849	0 %	50 %	50 %	0 %	78211694
121	NC_007516	TC	3	6	140553	140558	0 %	50 %	0 %	50 %	78211695
122	NC_007516	TG	3	6	140823	140828	0 %	50 %	50 %	0 %	78211695
123	NC_007516	AT	3	6	143147	143152	50 %	50 %	0 %	0 %	78211696
124	NC_007516	AT	3	6	143289	143294	50 %	50 %	0 %	0 %	78211696
125	NC_007516	AT	3	6	144276	144281	50 %	50 %	0 %	0 %	78211697
126	NC_007516	AT	3	6	144665	144670	50 %	50 %	0 %	0 %	78211697
127	NC_007516	TC	3	6	145291	145296	0 %	50 %	0 %	50 %	78211698
128	NC_007516	AT	3	6	145300	145305	50 %	50 %	0 %	0 %	78211698
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130	NC_007516	CA	3	6	145880	145885	50 %	0 %	0 %	50 %	78211698
131	NC_007516	GT	3	6	146019	146024	0 %	50 %	50 %	0 %	78211698
132	NC_007516	TA	3	6	146250	146255	50 %	50 %	0 %	0 %	78211698
133	NC_007516	TG	3	6	146626	146631	0 %	50 %	50 %	0 %	78211699
134	NC_007516	GA	3	6	147662	147667	50 %	0 %	50 %	0 %	78211699
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136	NC_007516	CT	3	6	148823	148828	0 %	50 %	0 %	50 %	78211700
137	NC_007516	AG	3	6	148863	148868	50 %	0 %	50 %	0 %	78211700
138	NC_007516	TG	3	6	149973	149978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007516	TC	3	6	150141	150146	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_007516	TG	3	6	150365	150370	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007516	AG	3	6	154923	154928	50 %	0 %	50 %	0 %	78211704
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