MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 2079

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007516	CGGCT	2	10	445	454	0 %	20 %	40 %	40 %	78211559
2	NC_007516	CAACA	2	10	1098	1107	60 %	0 %	0 %	40 %	78211559
3	NC_007516	CTGCA	2	10	1290	1299	20 %	20 %	20 %	40 %	78211559
4	NC_007516	GCGAT	2	10	3954	3963	20 %	20 %	40 %	20 %	78211561
5	NC_007516	ATCCA	2	10	4336	4345	40 %	20 %	0 %	40 %	78211561
6	NC_007516	CGATT	2	10	5657	5666	20 %	40 %	20 %	20 %	78211562
7	NC_007516	GCTGA	2	10	7672	7681	20 %	20 %	40 %	20 %	78211563
8	NC_007516	GACCA	2	10	7906	7915	40 %	0 %	20 %	40 %	78211563
9	NC_007516	CGTTG	2	10	8551	8560	0 %	40 %	40 %	20 %	78211564
10	NC_007516	TCGCT	2	10	8712	8721	0 %	40 %	20 %	40 %	78211564
11	NC_007516	ACCAA	2	10	9346	9355	60 %	0 %	0 %	40 %	78211564
12	NC_007516	GTCCA	2	10	11137	11146	20 %	20 %	20 %	40 %	78211567
13	NC_007516	ATCTG	2	10	11628	11637	20 %	40 %	20 %	20 %	78211567
14	NC_007516	CACCG	2	10	11667	11676	20 %	0 %	20 %	60 %	78211567
15	NC_007516	ACGGC	2	10	13900	13909	20 %	0 %	40 %	40 %	78211569
16	NC_007516	AGCTG	2	10	14374	14383	20 %	20 %	40 %	20 %	78211570
17	NC_007516	CGGAT	2	10	14976	14985	20 %	20 %	40 %	20 %	78211570
18	NC_007516	TGACC	2	10	15623	15632	20 %	20 %	20 %	40 %	78211571
19	NC_007516	CAACG	2	10	16643	16652	40 %	0 %	20 %	40 %	78211571
20	NC_007516	CCTTC	2	10	17087	17096	0 %	40 %	0 %	60 %	78211572
21	NC_007516	CCGAT	2	10	18170	18179	20 %	20 %	20 %	40 %	78211573
22	NC_007516	TGATC	2	10	19139	19148	20 %	40 %	20 %	20 %	78211574
23	NC_007516	TTGGA	2	10	19911	19920	20 %	40 %	40 %	0 %	78211575
24	NC_007516	GCCAT	2	10	20335	20344	20 %	20 %	20 %	40 %	78211575
25	NC_007516	CCAGG	2	10	26275	26284	20 %	0 %	40 %	40 %	78211581
26	NC_007516	GCCAC	2	10	26310	26319	20 %	0 %	20 %	60 %	78211581
27	NC_007516	GAGCA	2	10	26962	26971	40 %	0 %	40 %	20 %	78211581
28	NC_007516	CTTCA	2	10	27368	27377	20 %	40 %	0 %	40 %	78211583
29	NC_007516	CAGCC	2	10	28804	28813	20 %	0 %	20 %	60 %	78211584
30	NC_007516	AGGGC	2	10	28890	28899	20 %	0 %	60 %	20 %	78211584
31	NC_007516	CCTGG	2	10	30754	30763	0 %	20 %	40 %	40 %	78211585
32	NC_007516	TCCTC	2	10	31093	31102	0 %	40 %	0 %	60 %	78211586
33	NC_007516	TGCGC	2	10	37412	37421	0 %	20 %	40 %	40 %	78211593
34	NC_007516	GCGCA	2	10	37597	37606	20 %	0 %	40 %	40 %	78211593
35	NC_007516	AGGCG	2	10	38124	38133	20 %	0 %	60 %	20 %	78211593
36	NC_007516	ACAGC	2	10	40173	40182	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_007516	GCATG	2	10	40362	40371	20 %	20 %	40 %	20 %	78211597
38	NC_007516	ACCTG	2	10	40528	40537	20 %	20 %	20 %	40 %	78211597
39	NC_007516	TTGTT	2	10	40616	40625	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007516	GCCGT	2	10	41651	41660	0 %	20 %	40 %	40 %	78211599
41	NC_007516	GATCG	2	10	42304	42313	20 %	20 %	40 %	20 %	78211600
42	NC_007516	GCAGC	3	15	42701	42715	20 %	0 %	40 %	40 %	78211600
43	NC_007516	CTTCG	2	10	46032	46041	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_007516	CTGGG	2	10	47052	47061	0 %	20 %	60 %	20 %	78211604
45	NC_007516	GCACC	2	10	48681	48690	20 %	0 %	20 %	60 %	78211605
46	NC_007516	CTTCA	2	10	51679	51688	20 %	40 %	0 %	40 %	78211609
47	NC_007516	ATCGG	2	10	52128	52137	20 %	20 %	40 %	20 %	78211609
48	NC_007516	CCTGG	2	10	55792	55801	0 %	20 %	40 %	40 %	78211614
49	NC_007516	GCCTT	2	10	56040	56049	0 %	40 %	20 %	40 %	78211615
50	NC_007516	GTCAG	2	10	57882	57891	20 %	20 %	40 %	20 %	78211616
51	NC_007516	GGGCG	2	10	58388	58397	0 %	0 %	80 %	20 %	78211616
52	NC_007516	GCCAG	2	10	61988	61997	20 %	0 %	40 %	40 %	78211619
53	NC_007516	TGGAA	2	10	62097	62106	40 %	20 %	40 %	0 %	78211619
54	NC_007516	TCAGG	2	10	64266	64275	20 %	20 %	40 %	20 %	78211621
55	NC_007516	GGGAA	2	10	64563	64572	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007516	TCCAC	2	10	64705	64714	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
57	NC_007516	CTGCG	2	10	66284	66293	0 %	20 %	40 %	40 %	78211623
58	NC_007516	CTGGC	2	10	69100	69109	0 %	20 %	40 %	40 %	78211625
59	NC_007516	TCCGA	2	10	71266	71275	20 %	20 %	20 %	40 %	78211626
60	NC_007516	TGGGC	2	10	71346	71355	0 %	20 %	60 %	20 %	78211626
61	NC_007516	GCAGC	2	10	74036	74045	20 %	0 %	40 %	40 %	78211630
62	NC_007516	CTGAT	2	10	74143	74152	20 %	40 %	20 %	20 %	78211630
63	NC_007516	CGGCC	2	10	76957	76966	0 %	0 %	40 %	60 %	78211633
64	NC_007516	CAGCG	2	10	77622	77631	20 %	0 %	40 %	40 %	78211633
65	NC_007516	GTGAT	2	10	79302	79311	20 %	40 %	40 %	0 %	78211635
66	NC_007516	CGCTC	2	10	81278	81287	0 %	20 %	20 %	60 %	78211636
67	NC_007516	TCGAT	2	10	81826	81835	20 %	40 %	20 %	20 %	78211636
68	NC_007516	CCATG	2	10	84815	84824	20 %	20 %	20 %	40 %	78211637
69	NC_007516	TGGAG	2	10	85338	85347	20 %	20 %	60 %	0 %	78211638
70	NC_007516	CGCAG	2	10	85683	85692	20 %	0 %	40 %	40 %	78211638
71	NC_007516	CTGGG	2	10	86175	86184	0 %	20 %	60 %	20 %	78211639
72	NC_007516	GAAGC	2	10	91354	91363	40 %	0 %	40 %	20 %	78211644
73	NC_007516	GTGCC	2	10	91409	91418	0 %	20 %	40 %	40 %	78211645
74	NC_007516	TCCAC	2	10	91822	91831	20 %	20 %	0 %	60 %	78211646
75	NC_007516	GTGAT	2	10	92898	92907	20 %	40 %	40 %	0 %	78211647
76	NC_007516	CAGAT	2	10	94949	94958	40 %	20 %	20 %	20 %	78211649
77	NC_007516	GCCCG	2	10	96073	96082	0 %	0 %	40 %	60 %	78211650
78	NC_007516	ATCGC	2	10	97024	97033	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_007516	CGGTG	2	10	97185	97194	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_007516	TGGGT	2	10	97380	97389	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007516	CGGTT	2	10	97751	97760	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_007516	TGGCT	2	10	99785	99794	0 %	40 %	40 %	20 %	78211652
83	NC_007516	TGAGC	2	10	100603	100612	20 %	20 %	40 %	20 %	78211652
84	NC_007516	CAAAG	2	10	100826	100835	60 %	0 %	20 %	20 %	78211653
85	NC_007516	AGCTG	2	10	101122	101131	20 %	20 %	40 %	20 %	78211654
86	NC_007516	TCTGA	2	10	102610	102619	20 %	40 %	20 %	20 %	78211655
87	NC_007516	TGCCC	2	10	102828	102837	0 %	20 %	20 %	60 %	78211655
88	NC_007516	GCGCC	2	10	104161	104170	0 %	0 %	40 %	60 %	78211657
89	NC_007516	TCTCC	2	10	104518	104527	0 %	40 %	0 %	60 %	78211657
90	NC_007516	TGAGA	2	10	105615	105624	40 %	20 %	40 %	0 %	78211658
91	NC_007516	TGGCT	2	10	105952	105961	0 %	40 %	40 %	20 %	78211659
92	NC_007516	TGGCC	2	10	106445	106454	0 %	20 %	40 %	40 %	78211660
93	NC_007516	GGAAT	2	10	107393	107402	40 %	20 %	40 %	0 %	78211660
94	NC_007516	TGGAT	2	10	107833	107842	20 %	40 %	40 %	0 %	78211661
95	NC_007516	GGCGG	2	10	108510	108519	0 %	0 %	80 %	20 %	78211662
96	NC_007516	GGCCC	2	10	109509	109518	0 %	0 %	40 %	60 %	78211662
97	NC_007516	CCCAG	2	10	110151	110160	20 %	0 %	20 %	60 %	78211664
98	NC_007516	CTCCA	2	10	112133	112142	20 %	20 %	0 %	60 %	78211667
99	NC_007516	CTGTC	2	10	114677	114686	0 %	40 %	20 %	40 %	78211668
100	NC_007516	GCTGG	2	10	117206	117215	0 %	20 %	60 %	20 %	78211672
101	NC_007516	TGCCC	2	10	117305	117314	0 %	20 %	20 %	60 %	78211672
102	NC_007516	CGGCG	2	10	120228	120237	0 %	0 %	60 %	40 %	78211675
103	NC_007516	TGGCA	2	10	120247	120256	20 %	20 %	40 %	20 %	78211675
104	NC_007516	GGCCA	2	10	121737	121746	20 %	0 %	40 %	40 %	78211676
105	NC_007516	GGTGA	2	10	123295	123304	20 %	20 %	60 %	0 %	78211677
106	NC_007516	ATCCG	2	10	123811	123820	20 %	20 %	20 %	40 %	78211677
107	NC_007516	GAGAC	2	10	124724	124733	40 %	0 %	40 %	20 %	78211679
108	NC_007516	CTTTT	2	10	124806	124815	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_007516	GGTGT	2	10	126451	126460	0 %	40 %	60 %	0 %	78211680
110	NC_007516	CTGCT	2	10	127594	127603	0 %	40 %	20 %	40 %	78211681
111	NC_007516	GATCA	2	10	128390	128399	40 %	20 %	20 %	20 %	78211682
112	NC_007516	GCCAT	2	10	128775	128784	20 %	20 %	20 %	40 %	78211682
113	NC_007516	TGGTT	2	10	130469	130478	0 %	60 %	40 %	0 %	78211686
114	NC_007516	TGGTT	2	10	130808	130817	0 %	60 %	40 %	0 %	78211686
115	NC_007516	TGGTT	2	10	131147	131156	0 %	60 %	40 %	0 %	78211686
116	NC_007516	AGGTA	2	10	131648	131657	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007516	AAAAG	2	10	133582	133591	80 %	0 %	20 %	0 %	78211688
118	NC_007516	ATTTT	2	10	134240	134249	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007516	TCACC	2	10	135296	135305	20 %	20 %	0 %	60 %	78211690
120	NC_007516	CTGCA	2	10	135905	135914	20 %	20 %	20 %	40 %	78211691
121	NC_007516	CCGGC	2	10	137459	137468	0 %	0 %	40 %	60 %	78211693
122	NC_007516	GCATC	2	10	137673	137682	20 %	20 %	20 %	40 %	78211693
123	NC_007516	CTGGG	2	10	137705	137714	0 %	20 %	60 %	20 %	78211693
124	NC_007516	TTTGC	2	10	144407	144416	0 %	60 %	20 %	20 %	78211697
125	NC_007516	AATTT	2	10	145094	145103	40 %	60 %	0 %	0 %	78211697
126	NC_007516	GAAAA	2	10	145132	145141	80 %	0 %	20 %	0 %	78211697
127	NC_007516	ATTTT	3	15	145568	145582	20 %	80 %	0 %	0 %	78211698
128	NC_007516	AGATC	2	10	146983	146992	40 %	20 %	20 %	20 %	78211699
129	NC_007516	TTTTC	2	10	149561	149570	0 %	80 %	0 %	20 %	78211700
130	NC_007516	TGGTG	2	10	152598	152607	0 %	40 %	60 %	0 %	78211702
131	NC_007516	GCAGC	2	10	153569	153578	20 %	0 %	40 %	40 %	78211704
132	NC_007516	GCCAT	2	10	153979	153988	20 %	20 %	20 %	40 %	78211704
133	NC_007516	GTTCG	2	10	156113	156122	0 %	40 %	40 %	20 %	78211705
134	NC_007516	GCCCT	2	10	157819	157828	0 %	20 %	20 %	60 %	78211707
135	NC_007516	CCGTT	2	10	159059	159068	0 %	40 %	20 %	40 %	78211708
136	NC_007516	CATGG	2	10	160536	160545	20 %	20 %	40 %	20 %	78211709
137	NC_007516	CACCG	2	10	162597	162606	20 %	0 %	20 %	60 %	78211711
138	NC_007516	TCGTC	2	10	164167	164176	0 %	40 %	20 %	40 %	78211712
139	NC_007516	TCGAT	2	10	166265	166274	20 %	40 %	20 %	20 %	78211714
140	NC_007516	CTGTT	2	10	166634	166643	0 %	60 %	20 %	20 %	78211714
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152	NC_007516	TGCTG	2	10	181535	181544	0 %	40 %	40 %	20 %	78211728
153	NC_007516	TGCGG	2	10	181556	181565	0 %	20 %	60 %	20 %	78211728
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170	NC_007516	GCACC	2	10	201077	201086	20 %	0 %	20 %	60 %	78211743
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174	NC_007516	GTTTT	2	10	207971	207980	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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225	NC_007516	CGGAT	2	10	285329	285338	20 %	20 %	40 %	20 %	78211831
226	NC_007516	GCGAT	2	10	286921	286930	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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246	NC_007516	CTGGC	2	10	308289	308298	0 %	20 %	40 %	40 %	78211856
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248	NC_007516	GCTCA	2	10	312180	312189	20 %	20 %	20 %	40 %	78211860
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251	NC_007516	CATCG	2	10	314978	314987	20 %	20 %	20 %	40 %	78211863
252	NC_007516	GCGCG	2	10	316713	316722	0 %	0 %	60 %	40 %	78211864
253	NC_007516	ATTGG	2	10	317586	317595	20 %	40 %	40 %	0 %	78211864
254	NC_007516	CTGTG	2	10	319056	319065	0 %	40 %	40 %	20 %	78211865
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256	NC_007516	GGCAC	2	10	320599	320608	20 %	0 %	40 %	40 %	78211866
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260	NC_007516	GGAGC	2	10	325521	325530	20 %	0 %	60 %	20 %	78211873
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262	NC_007516	GCACC	2	10	326369	326378	20 %	0 %	20 %	60 %	78211873
263	NC_007516	CGGAC	2	10	329624	329633	20 %	0 %	40 %	40 %	78211877
264	NC_007516	CTGGG	2	10	329933	329942	0 %	20 %	60 %	20 %	78211877
265	NC_007516	GGCCC	2	10	331745	331754	0 %	0 %	40 %	60 %	78211878
266	NC_007516	CGCGG	2	10	331987	331996	0 %	0 %	60 %	40 %	78211878
267	NC_007516	GCTGA	2	10	334514	334523	20 %	20 %	40 %	20 %	78211878
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404	NC_007516	CAGAT	2	10	509989	509998	40 %	20 %	20 %	20 %	78212068
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497	NC_007516	CCATC	2	10	613823	613832	20 %	20 %	0 %	60 %	78212187
498	NC_007516	GGCCG	2	10	614398	614407	0 %	0 %	60 %	40 %	78212187
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