MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_007516	G	7	7	46930	46936	0 %	0 %	100 %	0 %	78211604
1003	NC_007516	GGT	2	6	46945	46950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211604
1004	NC_007516	CGG	2	6	46962	46967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211604
1005	NC_007516	GGA	2	6	46972	46977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211604
1006	NC_007516	CTGGG	2	10	47052	47061	0 %	20 %	60 %	20 %	78211604
1007	NC_007516	CGA	2	6	47125	47130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211604
1008	NC_007516	CTG	2	6	47132	47137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211604
1009	NC_007516	GCG	2	6	47146	47151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211604
1010	NC_007516	GAA	2	6	47156	47161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211604
1011	NC_007516	GAG	2	6	47168	47173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211604
1012	NC_007516	GCC	2	6	47178	47183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211604
1013	NC_007516	GCA	3	9	47194	47202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211604
1014	NC_007516	CAG	2	6	47221	47226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211605
1015	NC_007516	TGC	4	12	47258	47269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211605
1016	NC_007516	GCT	2	6	47319	47324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211605
1017	NC_007516	CCA	2	6	47429	47434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211605
1018	NC_007516	GAC	2	6	47482	47487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211605
1019	NC_007516	GCT	2	6	47517	47522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211605
1020	NC_007516	CAC	2	6	47586	47591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211605
1021	NC_007516	TGC	2	6	47621	47626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211605
1022	NC_007516	GGT	2	6	47848	47853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211605
1023	NC_007516	TGT	2	6	48000	48005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211605
1024	NC_007516	GTC	2	6	48047	48052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211605
1025	NC_007516	T	6	6	48069	48074	0 %	100 %	0 %	0 %	78211605
1026	NC_007516	CAC	2	6	48087	48092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211605
1027	NC_007516	ACG	2	6	48104	48109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211605
1028	NC_007516	A	6	6	48127	48132	100 %	0 %	0 %	0 %	78211605
1029	NC_007516	GCA	2	6	48170	48175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211605
1030	NC_007516	CGG	2	6	48264	48269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211605
1031	NC_007516	TTC	2	6	48349	48354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211605
1032	NC_007516	GCT	2	6	48397	48402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211605
1033	NC_007516	CAG	2	6	48418	48423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211605
1034	NC_007516	AG	3	6	48450	48455	50 %	0 %	50 %	0 %	78211605
1035	NC_007516	TGG	2	6	48464	48469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211605
1036	NC_007516	C	6	6	48581	48586	0 %	0 %	0 %	100 %	78211605
1037	NC_007516	GGTT	2	8	48625	48632	0 %	50 %	50 %	0 %	78211605
1038	NC_007516	CGC	2	6	48638	48643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211605
1039	NC_007516	CGC	2	6	48648	48653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211605
1040	NC_007516	GCACC	2	10	48681	48690	20 %	0 %	20 %	60 %	78211605
1041	NC_007516	GGT	2	6	48744	48749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211605
1042	NC_007516	CGG	3	9	48794	48802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211605
1043	NC_007516	AGA	2	6	48819	48824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211605
1044	NC_007516	GCT	2	6	48857	48862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211605
1045	NC_007516	GTG	3	9	48889	48897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211605
1046	NC_007516	GGTC	2	8	48926	48933	0 %	25 %	50 %	25 %	78211605
1047	NC_007516	GGC	2	6	48993	48998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211605
1048	NC_007516	GTA	2	6	49029	49034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211606
1049	NC_007516	GTT	2	6	49043	49048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211606
1050	NC_007516	CCCAGC	2	12	49061	49072	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	78211606
1051	NC_007516	GCA	2	6	49090	49095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211606
1052	NC_007516	CAG	2	6	49128	49133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211606
1053	NC_007516	GCG	2	6	49134	49139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211606
1054	NC_007516	CCG	2	6	49165	49170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211606
1055	NC_007516	TGA	2	6	49214	49219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211606
1056	NC_007516	GCC	2	6	49230	49235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211606
1057	NC_007516	GCC	2	6	49264	49269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211606
1058	NC_007516	CAG	2	6	49278	49283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211606
1059	NC_007516	CGC	2	6	49328	49333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211606
1060	NC_007516	CGA	2	6	49373	49378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211606
1061	NC_007516	GGT	2	6	49380	49385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211606
1062	NC_007516	GTT	2	6	49412	49417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211606
1063	NC_007516	CCA	2	6	49436	49441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211606
1064	NC_007516	GGC	2	6	49511	49516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211606
1065	NC_007516	AGC	3	9	49525	49533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211606
1066	NC_007516	GTC	2	6	49542	49547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211606
1067	NC_007516	CGCC	2	8	49549	49556	0 %	0 %	25 %	75 %	78211606
1068	NC_007516	AAC	2	6	49600	49605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78211606
1069	NC_007516	CAG	2	6	49695	49700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211606
1070	NC_007516	GGC	2	6	49713	49718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211606
1071	NC_007516	GGTG	2	8	49784	49791	0 %	25 %	75 %	0 %	78211606
1072	NC_007516	TTC	2	6	49822	49827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211606
1073	NC_007516	GCC	2	6	49839	49844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211606
1074	NC_007516	CCG	2	6	49856	49861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211606
1075	NC_007516	ATCG	2	8	49896	49903	25 %	25 %	25 %	25 %	78211606
1076	NC_007516	CCG	2	6	49913	49918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211606
1077	NC_007516	AGCGGC	2	12	49951	49962	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	78211606
1078	NC_007516	CTC	2	6	49998	50003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211606
1079	NC_007516	AGA	2	6	50021	50026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211606
1080	NC_007516	CCA	2	6	50027	50032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211606
1081	NC_007516	CCA	2	6	50048	50053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211606
1082	NC_007516	GAA	2	6	50118	50123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211606
1083	NC_007516	GGCCTG	2	12	50167	50178	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	78211607
1084	NC_007516	TGCGGT	2	12	50208	50219	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	78211607
1085	NC_007516	CTTC	2	8	50256	50263	0 %	50 %	0 %	50 %	78211607
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1088	NC_007516	CTT	2	6	50401	50406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211607
1089	NC_007516	GGC	2	6	50578	50583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211607
1090	NC_007516	CGT	2	6	50622	50627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211607
1091	NC_007516	CGGT	2	8	50657	50664	0 %	25 %	50 %	25 %	78211607
1092	NC_007516	TGT	2	6	50730	50735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211607
1093	NC_007516	AGC	2	6	50747	50752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211607
1094	NC_007516	GGA	2	6	50802	50807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211607
1095	NC_007516	TGG	2	6	50871	50876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211607
1096	NC_007516	CGC	2	6	50877	50882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211607
1097	NC_007516	CAC	2	6	50923	50928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211607
1098	NC_007516	GGC	2	6	50956	50961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211607
1099	NC_007516	CAG	2	6	50962	50967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211607
1100	NC_007516	GTT	2	6	50986	50991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211607
1101	NC_007516	TGG	2	6	51009	51014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211607
1102	NC_007516	GCT	2	6	51016	51021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211607
1103	NC_007516	GGC	2	6	51037	51042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211607
1104	NC_007516	CTC	2	6	51079	51084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211607
1105	NC_007516	TCC	2	6	51161	51166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211607
1106	NC_007516	GTCGAT	2	12	51223	51234	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	78211607
1107	NC_007516	CCG	2	6	51323	51328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211607
1108	NC_007516	CTG	2	6	51355	51360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_007516	CTA	2	6	51390	51395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_007516	CCA	2	6	51443	51448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211608
1111	NC_007516	CAT	3	9	51480	51488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211608
1112	NC_007516	GAC	2	6	51563	51568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211608
1113	NC_007516	TGCC	2	8	51638	51645	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_007516	CTTCA	2	10	51679	51688	20 %	40 %	0 %	40 %	78211609
1115	NC_007516	GGC	2	6	51812	51817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211609
1116	NC_007516	CGCC	2	8	51823	51830	0 %	0 %	25 %	75 %	78211609
1117	NC_007516	GCC	2	6	51885	51890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211609
1118	NC_007516	CCA	3	9	51916	51924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211609
1119	NC_007516	GAT	2	6	51944	51949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211609
1120	NC_007516	GGC	2	6	51962	51967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211609
1121	NC_007516	TTG	2	6	51969	51974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211609
1122	NC_007516	CCT	2	6	52030	52035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211609
1123	NC_007516	GCAA	2	8	52047	52054	50 %	0 %	25 %	25 %	78211609
1124	NC_007516	GCA	2	6	52075	52080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211609
1125	NC_007516	CTT	2	6	52090	52095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211609
1126	NC_007516	GTT	2	6	52102	52107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211609
1127	NC_007516	ATCGG	2	10	52128	52137	20 %	20 %	40 %	20 %	78211609
1128	NC_007516	AGA	2	6	52140	52145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211609
1129	NC_007516	TCC	2	6	52188	52193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211609
1130	NC_007516	TCC	2	6	52245	52250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211609
1131	NC_007516	GCA	2	6	52276	52281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211609
1132	NC_007516	CAAT	2	8	52296	52303	50 %	25 %	0 %	25 %	78211609
1133	NC_007516	CTG	2	6	52394	52399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211609
1134	NC_007516	ATGG	2	8	52410	52417	25 %	25 %	50 %	0 %	78211609
1135	NC_007516	CGCC	2	8	52458	52465	0 %	0 %	25 %	75 %	78211609
1136	NC_007516	TCA	2	6	52537	52542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_007516	TGG	2	6	52821	52826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211610
1138	NC_007516	CAC	2	6	52858	52863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211610
1139	NC_007516	CGG	2	6	52948	52953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211610
1140	NC_007516	CCA	2	6	52983	52988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211610
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1144	NC_007516	TGT	2	6	53187	53192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211611
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1147	NC_007516	CAC	2	6	53409	53414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211611
1148	NC_007516	GCT	2	6	53447	53452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211611
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1160	NC_007516	TTG	2	6	54043	54048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1161	NC_007516	GCT	2	6	54064	54069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1164	NC_007516	TGG	2	6	54133	54138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211613
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1168	NC_007516	ACG	2	6	54294	54299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1169	NC_007516	C	6	6	54318	54323	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1239	NC_007516	CAA	3	9	58074	58082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78211616
1240	NC_007516	TCCA	2	8	58087	58094	25 %	25 %	0 %	50 %	78211616
1241	NC_007516	GAT	2	6	58125	58130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211616
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1245	NC_007516	GAC	2	6	58243	58248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211616
1246	NC_007516	GGGCG	2	10	58388	58397	0 %	0 %	80 %	20 %	78211616
1247	NC_007516	AGG	2	6	58430	58435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211616
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1249	NC_007516	GAA	2	6	58518	58523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211617
1250	NC_007516	CGG	2	6	58560	58565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211617
1251	NC_007516	G	6	6	58734	58739	0 %	0 %	100 %	0 %	78211617
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1379	NC_007516	CGG	2	6	63659	63664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211621
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1490	NC_007516	TGG	2	6	68419	68424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211624
1491	NC_007516	TGCTGA	2	12	68446	68457	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	78211624
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1493	NC_007516	CGG	2	6	68527	68532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211624
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1496	NC_007516	GTG	2	6	68630	68635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211624
1497	NC_007516	CTC	2	6	68646	68651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211624
1498	NC_007516	CCGGAG	2	12	68684	68695	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	78211624
1499	NC_007516	CGT	4	12	68714	68725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211624
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