MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007516	CAG	2	6	23093	23098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_007516	CAGA	2	8	23102	23109	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
503	NC_007516	GCG	2	6	23174	23179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_007516	CGTC	2	8	23184	23191	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
505	NC_007516	CTG	2	6	23333	23338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_007516	GCA	2	6	23380	23385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_007516	CCA	2	6	23395	23400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_007516	ACG	2	6	23406	23411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_007516	CGT	2	6	23473	23478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_007516	TCG	2	6	23484	23489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_007516	TGCT	2	8	23551	23558	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
512	NC_007516	TGGC	2	8	23593	23600	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
513	NC_007516	GATC	2	8	23707	23714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
514	NC_007516	CTGG	2	8	23741	23748	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
515	NC_007516	GGT	2	6	23764	23769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_007516	CGT	2	6	23836	23841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_007516	CAG	2	6	23861	23866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_007516	TGC	2	6	23889	23894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_007516	ATGG	2	8	23964	23971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_007516	GCG	2	6	24060	24065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211578
521	NC_007516	CGG	2	6	24183	24188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211578
522	NC_007516	GCA	2	6	24196	24201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211578
523	NC_007516	GCG	2	6	24269	24274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211578
524	NC_007516	GAC	2	6	24314	24319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211578
525	NC_007516	CGT	2	6	24364	24369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211578
526	NC_007516	CGAG	2	8	24379	24386	25 %	0 %	50 %	25 %	78211578
527	NC_007516	CAG	2	6	24392	24397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211578
528	NC_007516	GGA	2	6	24412	24417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211578
529	NC_007516	TGG	2	6	24462	24467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211578
530	NC_007516	AGC	2	6	24477	24482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211578
531	NC_007516	GGAT	2	8	24495	24502	25 %	25 %	50 %	0 %	78211578
532	NC_007516	TGGT	2	8	24504	24511	0 %	50 %	50 %	0 %	78211578
533	NC_007516	TGC	2	6	24543	24548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211578
534	NC_007516	AGC	2	6	24557	24562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211578
535	NC_007516	GTG	2	6	24578	24583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211578
536	NC_007516	GAG	2	6	24587	24592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211578
537	NC_007516	ACC	2	6	24606	24611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211578
538	NC_007516	TGC	2	6	24624	24629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211578
539	NC_007516	CTG	2	6	24687	24692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211578
540	NC_007516	AGCGGC	2	12	24694	24705	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	78211578
541	NC_007516	CGG	2	6	24717	24722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211578
542	NC_007516	AGG	2	6	24723	24728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211578
543	NC_007516	ACC	2	6	24821	24826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211579
544	NC_007516	CAA	2	6	24834	24839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78211579
545	NC_007516	CGG	2	6	24945	24950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211579
546	NC_007516	CAG	2	6	25072	25077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211579
547	NC_007516	GCAG	2	8	25116	25123	25 %	0 %	50 %	25 %	78211579
548	NC_007516	CAGGAG	2	12	25132	25143	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	78211579
549	NC_007516	GCG	2	6	25178	25183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211579
550	NC_007516	CAC	2	6	25212	25217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211579
551	NC_007516	GCG	2	6	25229	25234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211579
552	NC_007516	TGG	2	6	25350	25355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211579
553	NC_007516	AAG	2	6	25378	25383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211579
554	NC_007516	ATC	2	6	25505	25510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211579
555	NC_007516	TCT	2	6	25538	25543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211579
556	NC_007516	AGGTCA	2	12	25547	25558	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78211579
557	NC_007516	GCA	2	6	25610	25615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211579
558	NC_007516	CCG	2	6	25631	25636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211579
559	NC_007516	CTC	2	6	25771	25776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211579
560	NC_007516	CCGC	2	8	25799	25806	0 %	0 %	25 %	75 %	78211579
561	NC_007516	GCAA	2	8	25808	25815	50 %	0 %	25 %	25 %	78211579
562	NC_007516	CAC	4	12	25816	25827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211579
563	NC_007516	GTCT	2	8	25968	25975	0 %	50 %	25 %	25 %	78211580
564	NC_007516	TGG	3	9	26120	26128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211581
565	NC_007516	GATG	2	8	26173	26180	25 %	25 %	50 %	0 %	78211581
566	NC_007516	GCT	2	6	26190	26195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211581
567	NC_007516	CGC	2	6	26203	26208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211581
568	NC_007516	CCAGG	2	10	26275	26284	20 %	0 %	40 %	40 %	78211581
569	NC_007516	GTG	2	6	26293	26298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211581
570	NC_007516	GCCAC	2	10	26310	26319	20 %	0 %	20 %	60 %	78211581
571	NC_007516	TGG	2	6	26357	26362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211581
572	NC_007516	CGG	2	6	26426	26431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211581
573	NC_007516	CTG	2	6	26455	26460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211581
574	NC_007516	AGAC	2	8	26468	26475	50 %	0 %	25 %	25 %	78211581
575	NC_007516	CTC	2	6	26476	26481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211581
576	NC_007516	TG	3	6	26615	26620	0 %	50 %	50 %	0 %	78211581
577	NC_007516	CTG	2	6	26647	26652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211581
578	NC_007516	CAC	2	6	26721	26726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211581
579	NC_007516	AAC	2	6	26849	26854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78211581
580	NC_007516	CTGC	2	8	26883	26890	0 %	25 %	25 %	50 %	78211581
581	NC_007516	GT	3	6	26912	26917	0 %	50 %	50 %	0 %	78211581
582	NC_007516	ACTG	2	8	26920	26927	25 %	25 %	25 %	25 %	78211581
583	NC_007516	GAGCA	2	10	26962	26971	40 %	0 %	40 %	20 %	78211581
584	NC_007516	GCC	2	6	26978	26983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211581
585	NC_007516	TTC	2	6	27020	27025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211582
586	NC_007516	GCC	2	6	27063	27068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211582
587	NC_007516	TGT	2	6	27102	27107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211582
588	NC_007516	GCA	2	6	27115	27120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211582
589	NC_007516	GCT	2	6	27188	27193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211582
590	NC_007516	CTT	2	6	27263	27268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211582
591	NC_007516	GCC	2	6	27345	27350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211583
592	NC_007516	CTTCA	2	10	27368	27377	20 %	40 %	0 %	40 %	78211583
593	NC_007516	GCC	2	6	27506	27511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211583
594	NC_007516	GTT	2	6	27598	27603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211583
595	NC_007516	CGT	2	6	27614	27619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211583
596	NC_007516	GTG	2	6	27642	27647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211583
597	NC_007516	ACA	2	6	27700	27705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78211583
598	NC_007516	C	6	6	27783	27788	0 %	0 %	0 %	100 %	78211583
599	NC_007516	TCA	2	6	27853	27858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211583
600	NC_007516	GTG	2	6	27981	27986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211583
601	NC_007516	CAGA	2	8	28016	28023	50 %	0 %	25 %	25 %	78211583
602	NC_007516	CAG	2	6	28055	28060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211583
603	NC_007516	AGC	2	6	28103	28108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211583
604	NC_007516	GCCA	2	8	28152	28159	25 %	0 %	25 %	50 %	78211583
605	NC_007516	CTC	2	6	28168	28173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211583
606	NC_007516	GGT	2	6	28184	28189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211583
607	NC_007516	TGC	2	6	28410	28415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211584
608	NC_007516	CAG	4	12	28459	28470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211584
609	NC_007516	CAG	2	6	28549	28554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211584
610	NC_007516	TGG	2	6	28640	28645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211584
611	NC_007516	TCA	2	6	28652	28657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211584
612	NC_007516	GAC	2	6	28665	28670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211584
613	NC_007516	GCG	2	6	28696	28701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211584
614	NC_007516	GGCA	2	8	28764	28771	25 %	0 %	50 %	25 %	78211584
615	NC_007516	CAGCC	2	10	28804	28813	20 %	0 %	20 %	60 %	78211584
616	NC_007516	AGGGC	2	10	28890	28899	20 %	0 %	60 %	20 %	78211584
617	NC_007516	TCG	2	6	28916	28921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211584
618	NC_007516	ACC	2	6	28932	28937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211584
619	NC_007516	C	6	6	29003	29008	0 %	0 %	0 %	100 %	78211584
620	NC_007516	GTC	2	6	29035	29040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211584
621	NC_007516	AGT	2	6	29049	29054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211584
622	NC_007516	AGC	2	6	29147	29152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211584
623	NC_007516	TGC	2	6	29175	29180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211584
624	NC_007516	CAG	2	6	29233	29238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211584
625	NC_007516	GGT	2	6	29242	29247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211584
626	NC_007516	TGG	3	9	29259	29267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211584
627	NC_007516	TGC	2	6	29303	29308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211584
628	NC_007516	GCC	2	6	29318	29323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211584
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630	NC_007516	TTC	2	6	29436	29441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211584
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754	NC_007516	TGC	3	9	35127	35135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
755	NC_007516	TGG	2	6	35148	35153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
756	NC_007516	CCTG	2	8	35227	35234	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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