MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_007516	TGT	2	6	246694	246699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211790
5503	NC_007516	CAA	2	6	246707	246712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78211790
5504	NC_007516	CAG	2	6	246722	246727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211790
5505	NC_007516	AGC	2	6	246790	246795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211790
5506	NC_007516	G	6	6	246805	246810	0 %	0 %	100 %	0 %	78211790
5507	NC_007516	CGC	2	6	246853	246858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211790
5508	NC_007516	CCA	2	6	246859	246864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211790
5509	NC_007516	TG	3	6	246982	246987	0 %	50 %	50 %	0 %	78211790
5510	NC_007516	CGATG	2	10	247015	247024	20 %	20 %	40 %	20 %	78211790
5511	NC_007516	CGC	2	6	247054	247059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211790
5512	NC_007516	AGG	2	6	247084	247089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211790
5513	NC_007516	GCC	2	6	247130	247135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211790
5514	NC_007516	GCG	2	6	247208	247213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211790
5515	NC_007516	CGT	2	6	247228	247233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211790
5516	NC_007516	GGGC	2	8	247250	247257	0 %	0 %	75 %	25 %	78211790
5517	NC_007516	ACC	2	6	247362	247367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211790
5518	NC_007516	GCC	2	6	247415	247420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211790
5519	NC_007516	GCC	3	9	247473	247481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211790
5520	NC_007516	GGT	2	6	247510	247515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211790
5521	NC_007516	GTG	2	6	247609	247614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211790
5522	NC_007516	GCG	2	6	247630	247635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211790
5523	NC_007516	CATC	2	8	247743	247750	25 %	25 %	0 %	50 %	78211791
5524	NC_007516	TCT	2	6	247805	247810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211791
5525	NC_007516	TGC	2	6	247817	247822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211791
5526	NC_007516	CGT	2	6	247844	247849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211791
5527	NC_007516	GCT	2	6	247884	247889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211791
5528	NC_007516	GCT	2	6	247908	247913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211791
5529	NC_007516	CGG	2	6	247946	247951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211791
5530	NC_007516	GTG	2	6	247966	247971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211791
5531	NC_007516	GTG	2	6	247991	247996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211791
5532	NC_007516	CAC	2	6	248002	248007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211791
5533	NC_007516	CGG	2	6	248024	248029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211791
5534	NC_007516	AGCGG	2	10	248046	248055	20 %	0 %	60 %	20 %	78211791
5535	NC_007516	GGA	2	6	248070	248075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211791
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5537	NC_007516	TGC	4	12	248117	248128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211791
5538	NC_007516	G	7	7	248151	248157	0 %	0 %	100 %	0 %	78211791
5539	NC_007516	TGCCC	2	10	248292	248301	0 %	20 %	20 %	60 %	78211791
5540	NC_007516	CTT	2	6	248305	248310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211791
5541	NC_007516	GTT	2	6	248314	248319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211791
5542	NC_007516	GCCCCT	2	12	248340	248351	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	78211791
5543	NC_007516	TCT	2	6	248352	248357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211791
5544	NC_007516	GTG	2	6	248365	248370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211791
5545	NC_007516	G	7	7	248406	248412	0 %	0 %	100 %	0 %	78211791
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5549	NC_007516	CTC	2	6	248653	248658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211792
5550	NC_007516	CTC	2	6	248678	248683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211792
5551	NC_007516	CGG	2	6	248693	248698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211792
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5554	NC_007516	GGC	2	6	248869	248874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211792
5555	NC_007516	CAG	2	6	248906	248911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211792
5556	NC_007516	CAG	2	6	248918	248923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211792
5557	NC_007516	G	6	6	248957	248962	0 %	0 %	100 %	0 %	78211792
5558	NC_007516	TGC	2	6	249003	249008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211792
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5562	NC_007516	GGC	3	9	249251	249259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211792
5563	NC_007516	CG	3	6	249317	249322	0 %	0 %	50 %	50 %	78211792
5564	NC_007516	AGGC	2	8	249380	249387	25 %	0 %	50 %	25 %	78211792
5565	NC_007516	G	6	6	249411	249416	0 %	0 %	100 %	0 %	78211792
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5570	NC_007516	GAA	2	6	249557	249562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211792
5571	NC_007516	CAG	2	6	249745	249750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5573	NC_007516	GT	3	6	249810	249815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_007516	TGTT	2	8	249870	249877	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5588	NC_007516	CAC	2	6	250431	250436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211794
5589	NC_007516	CAG	2	6	250458	250463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211794
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5591	NC_007516	GCC	2	6	250548	250553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211794
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5594	NC_007516	CAC	2	6	250752	250757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211794
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5598	NC_007516	CTG	2	6	250875	250880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_007516	CTG	2	6	250931	250936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211795
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5602	NC_007516	GT	3	6	251061	251066	0 %	50 %	50 %	0 %	78211795
5603	NC_007516	TCCA	2	8	251115	251122	25 %	25 %	0 %	50 %	78211795
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5607	NC_007516	GCGG	2	8	251311	251318	0 %	0 %	75 %	25 %	78211795
5608	NC_007516	CGGG	2	8	251397	251404	0 %	0 %	75 %	25 %	78211795
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5612	NC_007516	GC	3	6	251582	251587	0 %	0 %	50 %	50 %	78211795
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5622	NC_007516	CGT	2	6	251920	251925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211795
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5735	NC_007516	CGC	2	6	257203	257208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211800
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5739	NC_007516	GTG	2	6	257349	257354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5740	NC_007516	TGG	2	6	257414	257419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211801
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5742	NC_007516	GGTG	2	8	257445	257452	0 %	25 %	75 %	0 %	78211801
5743	NC_007516	TGC	2	6	257528	257533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211801
5744	NC_007516	CTG	2	6	257542	257547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211801
5745	NC_007516	CTG	2	6	257551	257556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211801
5746	NC_007516	GCG	2	6	257638	257643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211801
5747	NC_007516	GGC	2	6	257697	257702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211801
5748	NC_007516	GCT	2	6	257793	257798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211801
5749	NC_007516	GGGTT	2	10	257812	257821	0 %	40 %	60 %	0 %	78211801
5750	NC_007516	CGC	2	6	257835	257840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211801
5751	NC_007516	GCG	2	6	257882	257887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211801
5752	NC_007516	ATC	2	6	257893	257898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211801
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5755	NC_007516	GTG	2	6	257968	257973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211801
5756	NC_007516	TGG	2	6	257990	257995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211801
5757	NC_007516	TGC	2	6	258002	258007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211801
5758	NC_007516	GTC	2	6	258126	258131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211801
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5760	NC_007516	TTC	2	6	258166	258171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211801
5761	NC_007516	CGGCG	2	10	258186	258195	0 %	0 %	60 %	40 %	78211801
5762	NC_007516	CTG	2	6	258256	258261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211801
5763	NC_007516	CTG	2	6	258268	258273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211801
5764	NC_007516	GATC	2	8	258318	258325	25 %	25 %	25 %	25 %	78211801
5765	NC_007516	GAT	2	6	258360	258365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211801
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5773	NC_007516	TGG	2	6	258615	258620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211801
5774	NC_007516	GCA	2	6	258729	258734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211801
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5778	NC_007516	GGTG	2	8	258876	258883	0 %	25 %	75 %	0 %	78211801
5779	NC_007516	GTT	2	6	258906	258911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211801
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5783	NC_007516	CGG	2	6	259252	259257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5784	NC_007516	GCTGG	2	10	259312	259321	0 %	20 %	60 %	20 %	78211803
5785	NC_007516	G	6	6	259320	259325	0 %	0 %	100 %	0 %	78211803
5786	NC_007516	TGC	2	6	259397	259402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211803
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5790	NC_007516	TC	3	6	259998	260003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5791	NC_007516	T	10	10	260035	260044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5792	NC_007516	TCA	2	6	260175	260180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211805
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5810	NC_007516	CAA	2	6	261151	261156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78211805
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5814	NC_007516	AGCA	2	8	261374	261381	50 %	0 %	25 %	25 %	78211805
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5817	NC_007516	CTTT	2	8	261559	261566	0 %	75 %	0 %	25 %	78211806
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5822	NC_007516	G	6	6	261739	261744	0 %	0 %	100 %	0 %	78211806
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5828	NC_007516	CGAT	2	8	261921	261928	25 %	25 %	25 %	25 %	78211806
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5832	NC_007516	TGC	2	6	262054	262059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211806
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5866	NC_007516	AGCTG	2	10	263381	263390	20 %	20 %	40 %	20 %	78211807
5867	NC_007516	GGT	2	6	263444	263449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211807
5868	NC_007516	TGGCGG	2	12	263482	263493	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	78211807
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5993	NC_007516	CTGC	2	8	270612	270619	0 %	25 %	25 %	50 %	78211813
5994	NC_007516	GGC	2	6	270623	270628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211813
5995	NC_007516	TGC	2	6	270745	270750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211813
5996	NC_007516	AGC	2	6	270793	270798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211813
5997	NC_007516	CGG	2	6	270860	270865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211813
5998	NC_007516	GAG	2	6	270876	270881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211813
5999	NC_007516	AAGC	2	8	270909	270916	50 %	0 %	25 %	25 %	78211813
6000	NC_007516	CCA	2	6	271036	271041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211813

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