MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 54497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_007516	TGCT	2	8	202313	202320	0 %	50 %	25 %	25 %	78211745
4503	NC_007516	TTG	2	6	202406	202411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211745
4504	NC_007516	CAC	2	6	202439	202444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211745
4505	NC_007516	ATT	2	6	202519	202524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78211745
4506	NC_007516	CCAA	2	8	202537	202544	50 %	0 %	0 %	50 %	78211745
4507	NC_007516	CTT	3	9	202573	202581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211745
4508	NC_007516	TGA	2	6	202632	202637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211745
4509	NC_007516	ATT	2	6	202655	202660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78211745
4510	NC_007516	TCC	2	6	202752	202757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211745
4511	NC_007516	TGT	2	6	202803	202808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211745
4512	NC_007516	AAG	2	6	202859	202864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211745
4513	NC_007516	TGG	2	6	202892	202897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211745
4514	NC_007516	TGA	2	6	202910	202915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211745
4515	NC_007516	TGTT	2	8	202937	202944	0 %	75 %	25 %	0 %	78211745
4516	NC_007516	ATTA	2	8	202995	203002	50 %	50 %	0 %	0 %	78211745
4517	NC_007516	TTGT	2	8	203003	203010	0 %	75 %	25 %	0 %	78211745
4518	NC_007516	C	6	6	203018	203023	0 %	0 %	0 %	100 %	78211745
4519	NC_007516	TC	3	6	203053	203058	0 %	50 %	0 %	50 %	78211745
4520	NC_007516	TTG	2	6	203108	203113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211745
4521	NC_007516	CTT	2	6	203185	203190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211745
4522	NC_007516	T	6	6	203204	203209	0 %	100 %	0 %	0 %	78211745
4523	NC_007516	GAT	2	6	203215	203220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211745
4524	NC_007516	TAAA	2	8	203291	203298	75 %	25 %	0 %	0 %	78211745
4525	NC_007516	AAG	2	6	203312	203317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211745
4526	NC_007516	TTA	2	6	203323	203328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78211745
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4529	NC_007516	GTT	2	6	203587	203592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211745
4530	NC_007516	GATG	2	8	203596	203603	25 %	25 %	50 %	0 %	78211745
4531	NC_007516	ATC	2	6	203639	203644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211745
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4533	NC_007516	A	6	6	203750	203755	100 %	0 %	0 %	0 %	78211745
4534	NC_007516	ATTT	2	8	203777	203784	25 %	75 %	0 %	0 %	78211745
4535	NC_007516	TAC	2	6	203796	203801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211745
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4537	NC_007516	ATT	2	6	203891	203896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78211745
4538	NC_007516	TAG	2	6	203921	203926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211745
4539	NC_007516	AT	3	6	203958	203963	50 %	50 %	0 %	0 %	78211745
4540	NC_007516	T	6	6	204096	204101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_007516	ATTT	2	8	204121	204128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_007516	GC	3	6	204176	204181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4543	NC_007516	TAA	2	6	204199	204204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_007516	TAT	2	6	204236	204241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_007516	GCTT	2	8	204276	204283	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4546	NC_007516	ATAG	2	8	204292	204299	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_007516	T	6	6	204302	204307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_007516	CAG	2	6	204334	204339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4550	NC_007516	CT	3	6	204440	204445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4551	NC_007516	CAGTT	2	10	204447	204456	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4552	NC_007516	AAC	2	6	204483	204488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_007516	TGCA	2	8	204537	204544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4554	NC_007516	TTG	2	6	204596	204601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_007516	AAACC	2	10	204695	204704	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4556	NC_007516	TCC	2	6	204719	204724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4557	NC_007516	TTTC	2	8	204758	204765	0 %	75 %	0 %	25 %	78211746
4558	NC_007516	CCAA	2	8	204786	204793	50 %	0 %	0 %	50 %	78211746
4559	NC_007516	TCT	2	6	204853	204858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211746
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4564	NC_007516	GAA	2	6	205068	205073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211746
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4568	NC_007516	CTTT	2	8	205259	205266	0 %	75 %	0 %	25 %	78211746
4569	NC_007516	A	6	6	205280	205285	100 %	0 %	0 %	0 %	78211746
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4573	NC_007516	TG	3	6	205409	205414	0 %	50 %	50 %	0 %	78211746
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4585	NC_007516	GA	3	6	205906	205911	50 %	0 %	50 %	0 %	78211746
4586	NC_007516	AGCT	2	8	205935	205942	25 %	25 %	25 %	25 %	78211746
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4594	NC_007516	TTTG	2	8	206216	206223	0 %	75 %	25 %	0 %	78211746
4595	NC_007516	TTG	2	6	206280	206285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211746
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4598	NC_007516	TTA	2	6	206382	206387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78211746
4599	NC_007516	TCTT	2	8	206434	206441	0 %	75 %	0 %	25 %	78211746
4600	NC_007516	TC	3	6	206478	206483	0 %	50 %	0 %	50 %	78211746
4601	NC_007516	CTG	2	6	206559	206564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211746
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4609	NC_007516	TGA	2	6	206749	206754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211746
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4611	NC_007516	AT	3	6	206820	206825	50 %	50 %	0 %	0 %	78211746
4612	NC_007516	TC	3	6	206826	206831	0 %	50 %	0 %	50 %	78211746
4613	NC_007516	AAT	2	6	206867	206872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78211746
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4873	NC_007516	GAC	2	6	217907	217912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211761
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4877	NC_007516	GTGA	2	8	218100	218107	25 %	25 %	50 %	0 %	78211762
4878	NC_007516	GATT	2	8	218120	218127	25 %	50 %	25 %	0 %	78211762
4879	NC_007516	AATT	2	8	218128	218135	50 %	50 %	0 %	0 %	78211762
4880	NC_007516	CTG	2	6	218394	218399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211762
4881	NC_007516	TTC	2	6	218401	218406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211762
4882	NC_007516	ATTG	2	8	218437	218444	25 %	50 %	25 %	0 %	78211762
4883	NC_007516	CTT	2	6	218445	218450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211762
4884	NC_007516	CGT	2	6	218502	218507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211762
4885	NC_007516	AAGC	2	8	218543	218550	50 %	0 %	25 %	25 %	78211762
4886	NC_007516	ATTG	2	8	218572	218579	25 %	50 %	25 %	0 %	78211762
4887	NC_007516	TCA	2	6	218630	218635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211762
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4892	NC_007516	TGC	2	6	218828	218833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211762
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4897	NC_007516	TGA	2	6	219007	219012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211762
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4901	NC_007516	T	6	6	219127	219132	0 %	100 %	0 %	0 %	78211762
4902	NC_007516	TTGT	2	8	219155	219162	0 %	75 %	25 %	0 %	78211762
4903	NC_007516	AGA	2	6	219221	219226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211762
4904	NC_007516	T	6	6	219232	219237	0 %	100 %	0 %	0 %	78211762
4905	NC_007516	TTG	2	6	219248	219253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211762
4906	NC_007516	GTA	2	6	219278	219283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211762
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4908	NC_007516	T	6	6	219391	219396	0 %	100 %	0 %	0 %	78211762
4909	NC_007516	TGA	2	6	219435	219440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211762
4910	NC_007516	T	6	6	219442	219447	0 %	100 %	0 %	0 %	78211762
4911	NC_007516	TTCGTC	2	12	219457	219468	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4913	NC_007516	TCT	2	6	219501	219506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4917	NC_007516	CTC	2	6	219700	219705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211763
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4990	NC_007516	TGGCG	2	10	222972	222981	0 %	20 %	60 %	20 %	78211766
4991	NC_007516	A	6	6	223012	223017	100 %	0 %	0 %	0 %	78211766
4992	NC_007516	CAAC	2	8	223120	223127	50 %	0 %	0 %	50 %	78211766
4993	NC_007516	GGC	2	6	223131	223136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211766
4994	NC_007516	CCT	2	6	223142	223147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211766
4995	NC_007516	TCG	2	6	223231	223236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211766
4996	NC_007516	CTG	2	6	223239	223244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211766
4997	NC_007516	GGA	2	6	223258	223263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211766
4998	NC_007516	GGTCT	2	10	223351	223360	0 %	40 %	40 %	20 %	78211767
4999	NC_007516	GCG	2	6	223397	223402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211767
5000	NC_007516	GGC	2	6	223525	223530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211767

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