MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_007513	TGA	2	6	2221198	2221203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44502	NC_007513	ATG	2	6	2221204	2221209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44503	NC_007513	TG	3	6	2221214	2221219	0 %	50 %	50 %	0 %	78185881
44504	NC_007513	CTC	2	6	2221262	2221267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185881
44505	NC_007513	AGG	2	6	2221416	2221421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185881
44506	NC_007513	AC	3	6	2221594	2221599	50 %	0 %	0 %	50 %	78185881
44507	NC_007513	GCA	2	6	2221646	2221651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185881
44508	NC_007513	TGT	2	6	2221666	2221671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185881
44509	NC_007513	TGA	2	6	2221683	2221688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185881
44510	NC_007513	CTC	2	6	2221690	2221695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185881
44511	NC_007513	GTT	2	6	2221712	2221717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185881
44512	NC_007513	AGC	2	6	2221728	2221733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185881
44513	NC_007513	GCA	2	6	2221751	2221756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185881
44514	NC_007513	GGA	2	6	2221795	2221800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185881
44515	NC_007513	GCAAC	2	10	2221843	2221852	40 %	0 %	20 %	40 %	78185881
44516	NC_007513	CCG	2	6	2221871	2221876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185881
44517	NC_007513	G	6	6	2221896	2221901	0 %	0 %	100 %	0 %	78185881
44518	NC_007513	ATT	2	6	2222002	2222007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78185881
44519	NC_007513	TTC	2	6	2222018	2222023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185881
44520	NC_007513	GCA	2	6	2222174	2222179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185881
44521	NC_007513	TGC	2	6	2222268	2222273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185881
44522	NC_007513	GCA	2	6	2222369	2222374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185881
44523	NC_007513	TGGC	2	8	2222533	2222540	0 %	25 %	50 %	25 %	78185882
44524	NC_007513	ATCC	2	8	2222542	2222549	25 %	25 %	0 %	50 %	78185882
44525	NC_007513	GCTG	2	8	2222569	2222576	0 %	25 %	50 %	25 %	78185882
44526	NC_007513	CCA	3	9	2222578	2222586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185882
44527	NC_007513	CGC	2	6	2222715	2222720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185882
44528	NC_007513	CAG	2	6	2222741	2222746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185882
44529	NC_007513	CTT	2	6	2222758	2222763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185882
44530	NC_007513	TAAC	2	8	2222772	2222779	50 %	25 %	0 %	25 %	78185882
44531	NC_007513	GTGAT	2	10	2222814	2222823	20 %	40 %	40 %	0 %	78185882
44532	NC_007513	TCC	2	6	2222832	2222837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185882
44533	NC_007513	GGCA	2	8	2223092	2223099	25 %	0 %	50 %	25 %	78185882
44534	NC_007513	GCT	2	6	2223107	2223112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185882
44535	NC_007513	GAAC	2	8	2223138	2223145	50 %	0 %	25 %	25 %	78185882
44536	NC_007513	GTCG	2	8	2223150	2223157	0 %	25 %	50 %	25 %	78185882
44537	NC_007513	CTG	2	6	2223203	2223208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185882
44538	NC_007513	CA	3	6	2223228	2223233	50 %	0 %	0 %	50 %	78185882
44539	NC_007513	GAC	2	6	2223253	2223258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185882
44540	NC_007513	AGA	2	6	2223300	2223305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185882
44541	NC_007513	CCA	2	6	2223358	2223363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185882
44542	NC_007513	CAT	2	6	2223406	2223411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185882
44543	NC_007513	CCA	2	6	2223418	2223423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185882
44544	NC_007513	ACAA	2	8	2223489	2223496	75 %	0 %	0 %	25 %	78185882
44545	NC_007513	GCC	2	6	2223497	2223502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185882
44546	NC_007513	ACG	2	6	2223508	2223513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185882
44547	NC_007513	TGC	2	6	2223549	2223554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185882
44548	NC_007513	CTG	2	6	2223608	2223613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185882
44549	NC_007513	TCT	2	6	2223651	2223656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185882
44550	NC_007513	GCA	2	6	2223694	2223699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185882
44551	NC_007513	GCAA	2	8	2223765	2223772	50 %	0 %	25 %	25 %	78185882
44552	NC_007513	GAG	2	6	2223835	2223840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185882
44553	NC_007513	ACC	2	6	2223882	2223887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185882
44554	NC_007513	TGA	2	6	2223927	2223932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185882
44555	NC_007513	CTT	2	6	2223937	2223942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185882
44556	NC_007513	GT	3	6	2223944	2223949	0 %	50 %	50 %	0 %	78185882
44557	NC_007513	CAC	2	6	2223956	2223961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185882
44558	NC_007513	TTC	2	6	2223986	2223991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185882
44559	NC_007513	ATCCA	2	10	2224170	2224179	40 %	20 %	0 %	40 %	78185882
44560	NC_007513	GGA	2	6	2224288	2224293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185882
44561	NC_007513	CCG	2	6	2224443	2224448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185882
44562	NC_007513	CAA	2	6	2224511	2224516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185882
44563	NC_007513	TCC	2	6	2224530	2224535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44564	NC_007513	AACG	2	8	2224550	2224557	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44565	NC_007513	GAA	2	6	2224586	2224591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44566	NC_007513	ACA	2	6	2224631	2224636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44567	NC_007513	CAA	2	6	2224639	2224644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44568	NC_007513	AGC	2	6	2224717	2224722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44569	NC_007513	GCT	2	6	2224736	2224741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185883
44570	NC_007513	CAAC	2	8	2224750	2224757	50 %	0 %	0 %	50 %	78185883
44571	NC_007513	AAAAC	2	10	2224789	2224798	80 %	0 %	0 %	20 %	78185883
44572	NC_007513	GTTC	2	8	2224819	2224826	0 %	50 %	25 %	25 %	78185883
44573	NC_007513	TCT	2	6	2224866	2224871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185883
44574	NC_007513	ACC	2	6	2224986	2224991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185883
44575	NC_007513	CAA	2	6	2225012	2225017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185883
44576	NC_007513	CTG	2	6	2225043	2225048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185883
44577	NC_007513	CGG	2	6	2225069	2225074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185883
44578	NC_007513	TCGA	2	8	2225292	2225299	25 %	25 %	25 %	25 %	78185883
44579	NC_007513	GGC	2	6	2225314	2225319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185883
44580	NC_007513	TTC	2	6	2225372	2225377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185883
44581	NC_007513	CGCC	2	8	2225398	2225405	0 %	0 %	25 %	75 %	78185883
44582	NC_007513	ATTG	2	8	2225409	2225416	25 %	50 %	25 %	0 %	78185883
44583	NC_007513	CTG	2	6	2225417	2225422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185883
44584	NC_007513	GAT	2	6	2225440	2225445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185883
44585	NC_007513	GTC	2	6	2225510	2225515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185883
44586	NC_007513	CAG	2	6	2225576	2225581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185883
44587	NC_007513	GCT	2	6	2225617	2225622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185883
44588	NC_007513	ACA	2	6	2225739	2225744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185883
44589	NC_007513	TGCT	2	8	2225768	2225775	0 %	50 %	25 %	25 %	78185883
44590	NC_007513	TCA	2	6	2225823	2225828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185883
44591	NC_007513	CCA	2	6	2225890	2225895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185883
44592	NC_007513	GCC	2	6	2225904	2225909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185883
44593	NC_007513	CAG	2	6	2225924	2225929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185883
44594	NC_007513	CAA	2	6	2225951	2225956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185883
44595	NC_007513	A	6	6	2226117	2226122	100 %	0 %	0 %	0 %	78185883
44596	NC_007513	GGAC	2	8	2226155	2226162	25 %	0 %	50 %	25 %	78185883
44597	NC_007513	AGG	2	6	2226204	2226209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185883
44598	NC_007513	GAG	2	6	2226249	2226254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185884
44599	NC_007513	TGC	2	6	2226257	2226262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185884
44600	NC_007513	ACT	2	6	2226295	2226300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185884
44601	NC_007513	TCC	2	6	2226346	2226351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185884
44602	NC_007513	AATTG	2	10	2226430	2226439	40 %	40 %	20 %	0 %	78185884
44603	NC_007513	CAA	2	6	2226447	2226452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185884
44604	NC_007513	CTG	2	6	2226663	2226668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185884
44605	NC_007513	CAG	2	6	2226693	2226698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185884
44606	NC_007513	GAA	2	6	2226816	2226821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185884
44607	NC_007513	ACTGA	2	10	2226889	2226898	40 %	20 %	20 %	20 %	78185884
44608	NC_007513	GCA	2	6	2226935	2226940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185884
44609	NC_007513	AAT	3	9	2227021	2227029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78185884
44610	NC_007513	ATCG	2	8	2227036	2227043	25 %	25 %	25 %	25 %	78185884
44611	NC_007513	CCACTA	2	12	2227148	2227159	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	78185884
44612	NC_007513	GTT	2	6	2227216	2227221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185884
44613	NC_007513	CAAT	2	8	2227229	2227236	50 %	25 %	0 %	25 %	78185884
44614	NC_007513	GTC	2	6	2227245	2227250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185884
44615	NC_007513	TTCC	2	8	2227254	2227261	0 %	50 %	0 %	50 %	78185884
44616	NC_007513	CGT	2	6	2227265	2227270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185884
44617	NC_007513	CGA	2	6	2227292	2227297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185884
44618	NC_007513	TTC	2	6	2227324	2227329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185884
44619	NC_007513	ATC	2	6	2227342	2227347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185884
44620	NC_007513	CAA	2	6	2227362	2227367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185884
44621	NC_007513	TCG	2	6	2227436	2227441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185884
44622	NC_007513	ACC	2	6	2227451	2227456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185884
44623	NC_007513	GT	3	6	2227458	2227463	0 %	50 %	50 %	0 %	78185884
44624	NC_007513	TGA	2	6	2227517	2227522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185884
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44631	NC_007513	TGT	2	6	2228169	2228174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185884
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44633	NC_007513	GA	3	6	2228319	2228324	50 %	0 %	50 %	0 %	78185884
44634	NC_007513	TCC	2	6	2228327	2228332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185884
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44637	NC_007513	AGCCA	2	10	2228437	2228446	40 %	0 %	20 %	40 %	78185884
44638	NC_007513	CAC	2	6	2228448	2228453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185884
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44642	NC_007513	GCG	2	6	2228621	2228626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185884
44643	NC_007513	AAC	2	6	2228668	2228673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185884
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44645	NC_007513	CAAA	2	8	2228796	2228803	75 %	0 %	0 %	25 %	78185884
44646	NC_007513	TTG	2	6	2228862	2228867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185884
44647	NC_007513	GATC	2	8	2228874	2228881	25 %	25 %	25 %	25 %	78185884
44648	NC_007513	GC	3	6	2228947	2228952	0 %	0 %	50 %	50 %	78185884
44649	NC_007513	ACC	2	6	2229050	2229055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185884
44650	NC_007513	CCG	2	6	2229140	2229145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185884
44651	NC_007513	GCTG	2	8	2229268	2229275	0 %	25 %	50 %	25 %	78185885
44652	NC_007513	GCCA	2	8	2229298	2229305	25 %	0 %	25 %	50 %	78185885
44653	NC_007513	TGA	2	6	2229401	2229406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185885
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44658	NC_007513	A	6	6	2229657	2229662	100 %	0 %	0 %	0 %	78185885
44659	NC_007513	TCCGAT	2	12	2229698	2229709	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78185885
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44666	NC_007513	GCC	2	6	2229935	2229940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185885
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44671	NC_007513	TGCT	2	8	2230180	2230187	0 %	50 %	25 %	25 %	78185885
44672	NC_007513	GAC	2	6	2230203	2230208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185885
44673	NC_007513	ACCA	2	8	2230220	2230227	50 %	0 %	0 %	50 %	78185885
44674	NC_007513	TCA	2	6	2230295	2230300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185885
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44677	NC_007513	CTG	2	6	2230486	2230491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185885
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44679	NC_007513	ATCA	2	8	2230534	2230541	50 %	25 %	0 %	25 %	78185885
44680	NC_007513	GCT	2	6	2230563	2230568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185885
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44682	NC_007513	CGGA	2	8	2230707	2230714	25 %	0 %	50 %	25 %	78185885
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44688	NC_007513	GGA	2	6	2231011	2231016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185886
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44704	NC_007513	ATG	2	6	2231969	2231974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185886
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44713	NC_007513	AGCTC	2	10	2232454	2232463	20 %	20 %	20 %	40 %	78185886
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44716	NC_007513	TAC	2	6	2232522	2232527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185886
44717	NC_007513	CAAT	2	8	2232529	2232536	50 %	25 %	0 %	25 %	78185886
44718	NC_007513	CTG	2	6	2232624	2232629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185886
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44720	NC_007513	TGC	2	6	2232982	2232987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185887
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44722	NC_007513	TCG	2	6	2233018	2233023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185887
44723	NC_007513	CCT	2	6	2233090	2233095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185887
44724	NC_007513	AGA	2	6	2233117	2233122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185887
44725	NC_007513	TCAA	2	8	2233137	2233144	50 %	25 %	0 %	25 %	78185887
44726	NC_007513	AC	3	6	2233185	2233190	50 %	0 %	0 %	50 %	78185887
44727	NC_007513	CAT	2	6	2233204	2233209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185887
44728	NC_007513	ATC	2	6	2233226	2233231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185887
44729	NC_007513	AATC	2	8	2233301	2233308	50 %	25 %	0 %	25 %	78185887
44730	NC_007513	A	6	6	2233395	2233400	100 %	0 %	0 %	0 %	78185887
44731	NC_007513	TTC	2	6	2233427	2233432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185887
44732	NC_007513	TGA	2	6	2233480	2233485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44733	NC_007513	TCG	2	6	2233546	2233551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185888
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44738	NC_007513	TGC	2	6	2233846	2233851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185888
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44747	NC_007513	ATC	2	6	2234390	2234395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185888
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44750	NC_007513	TCT	2	6	2234430	2234435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185888
44751	NC_007513	CCAG	2	8	2234441	2234448	25 %	0 %	25 %	50 %	78185888
44752	NC_007513	GCA	2	6	2234450	2234455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185888
44753	NC_007513	GGCC	2	8	2234461	2234468	0 %	0 %	50 %	50 %	78185888
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44759	NC_007513	T	7	7	2234683	2234689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44760	NC_007513	ACAA	2	8	2234731	2234738	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44761	NC_007513	CAC	2	6	2234765	2234770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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