MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007513	CTG	2	6	190223	190228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183767
4002	NC_007513	GTG	2	6	190298	190303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183767
4003	NC_007513	TGA	2	6	190341	190346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183767
4004	NC_007513	CCA	2	6	190401	190406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183767
4005	NC_007513	GGT	3	9	190522	190530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183767
4006	NC_007513	ATT	2	6	190568	190573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78183767
4007	NC_007513	GTC	2	6	190580	190585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183767
4008	NC_007513	GTT	2	6	190594	190599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183767
4009	NC_007513	GTT	3	9	190601	190609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183767
4010	NC_007513	CGG	2	6	190675	190680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183767
4011	NC_007513	TGG	2	6	190686	190691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183767
4012	NC_007513	TGT	2	6	190701	190706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183767
4013	NC_007513	CAGCCA	2	12	190725	190736	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	78183767
4014	NC_007513	GGC	2	6	190747	190752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183767
4015	NC_007513	CGC	2	6	190765	190770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183767
4016	NC_007513	GCG	2	6	190814	190819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183767
4017	NC_007513	TGG	2	6	190863	190868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183767
4018	NC_007513	CTT	2	6	190939	190944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183767
4019	NC_007513	TGT	2	6	190948	190953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183767
4020	NC_007513	GGT	2	6	190969	190974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183767
4021	NC_007513	TGGG	2	8	190978	190985	0 %	25 %	75 %	0 %	78183767
4022	NC_007513	ATC	2	6	191010	191015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183767
4023	NC_007513	TGG	3	9	191016	191024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183767
4024	NC_007513	ATG	2	6	191033	191038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183767
4025	NC_007513	CCTTGG	2	12	191065	191076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183767
4026	NC_007513	AGC	2	6	191110	191115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183767
4027	NC_007513	CAC	2	6	191137	191142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183767
4028	NC_007513	CTG	2	6	191159	191164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183767
4029	NC_007513	GCC	2	6	191185	191190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183767
4030	NC_007513	GAG	2	6	191213	191218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183767
4031	NC_007513	TGG	2	6	191236	191241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183767
4032	NC_007513	GTC	2	6	191242	191247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183767
4033	NC_007513	ATT	2	6	191271	191276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78183768
4034	NC_007513	GCG	2	6	191288	191293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183768
4035	NC_007513	CAG	2	6	191404	191409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183768
4036	NC_007513	GCT	2	6	191410	191415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183768
4037	NC_007513	AG	3	6	191508	191513	50 %	0 %	50 %	0 %	78183768
4038	NC_007513	CAGAG	2	10	191522	191531	40 %	0 %	40 %	20 %	78183768
4039	NC_007513	CCA	2	6	191564	191569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183768
4040	NC_007513	TGT	2	6	191634	191639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183769
4041	NC_007513	GT	3	6	191683	191688	0 %	50 %	50 %	0 %	78183769
4042	NC_007513	ACA	2	6	191774	191779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183769
4043	NC_007513	CGAT	2	8	191813	191820	25 %	25 %	25 %	25 %	78183769
4044	NC_007513	CGG	2	6	191865	191870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183769
4045	NC_007513	CT	3	6	191943	191948	0 %	50 %	0 %	50 %	78183769
4046	NC_007513	TGGTG	2	10	192000	192009	0 %	40 %	60 %	0 %	78183769
4047	NC_007513	CCG	2	6	192141	192146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183769
4048	NC_007513	GAC	2	6	192202	192207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183769
4049	NC_007513	TGG	2	6	192212	192217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183769
4050	NC_007513	CGTC	2	8	192229	192236	0 %	25 %	25 %	50 %	78183769
4051	NC_007513	TGC	3	9	192332	192340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183769
4052	NC_007513	CCA	2	6	192413	192418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183769
4053	NC_007513	GGT	2	6	192423	192428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183769
4054	NC_007513	TGGC	2	8	192493	192500	0 %	25 %	50 %	25 %	78183769
4055	NC_007513	CTG	2	6	192519	192524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_007513	CT	4	8	192563	192570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4057	NC_007513	GCA	2	6	192598	192603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183770
4058	NC_007513	CGG	2	6	192676	192681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183770
4059	NC_007513	GAC	2	6	192896	192901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183770
4060	NC_007513	CGG	2	6	192996	193001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183770
4061	NC_007513	ACC	2	6	193016	193021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183770
4062	NC_007513	GCCG	3	12	193206	193217	0 %	0 %	50 %	50 %	78183770
4063	NC_007513	CGA	2	6	193234	193239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183770
4064	NC_007513	GC	3	6	193248	193253	0 %	0 %	50 %	50 %	78183770
4065	NC_007513	GTG	2	6	193365	193370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183770
4066	NC_007513	CCA	2	6	193539	193544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183771
4067	NC_007513	GCACCA	2	12	193563	193574	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	78183771
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4069	NC_007513	CGT	2	6	193604	193609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183771
4070	NC_007513	GCG	2	6	193634	193639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183771
4071	NC_007513	CGC	2	6	193656	193661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183771
4072	NC_007513	CCGGCT	2	12	193664	193675	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	78183771
4073	NC_007513	TGAG	2	8	193698	193705	25 %	25 %	50 %	0 %	78183771
4074	NC_007513	ATGC	2	8	193732	193739	25 %	25 %	25 %	25 %	78183771
4075	NC_007513	TGC	2	6	193741	193746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183771
4076	NC_007513	GCA	2	6	193749	193754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183771
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4078	NC_007513	CAG	2	6	193978	193983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183771
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4083	NC_007513	CGAT	2	8	194311	194318	25 %	25 %	25 %	25 %	78183771
4084	NC_007513	GTC	2	6	194324	194329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183771
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4087	NC_007513	GCTCG	2	10	194589	194598	0 %	20 %	40 %	40 %	78183771
4088	NC_007513	CGA	3	9	194651	194659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183772
4089	NC_007513	TGC	3	9	194695	194703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183772
4090	NC_007513	GCAAC	2	10	194801	194810	40 %	0 %	20 %	40 %	78183772
4091	NC_007513	GGA	2	6	194846	194851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183772
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4093	NC_007513	G	7	7	194990	194996	0 %	0 %	100 %	0 %	78183772
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4095	NC_007513	CAC	2	6	195044	195049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183772
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4098	NC_007513	G	6	6	195186	195191	0 %	0 %	100 %	0 %	78183772
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4101	NC_007513	GCT	2	6	195285	195290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183772
4102	NC_007513	CGG	2	6	195312	195317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183772
4103	NC_007513	GTG	2	6	195342	195347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183772
4104	NC_007513	CGA	2	6	195405	195410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183772
4105	NC_007513	GAG	2	6	195426	195431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183772
4106	NC_007513	TGG	2	6	195448	195453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183772
4107	NC_007513	GCTG	2	8	195467	195474	0 %	25 %	50 %	25 %	78183772
4108	NC_007513	CAG	2	6	195477	195482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183772
4109	NC_007513	CTG	2	6	195573	195578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183772
4110	NC_007513	GTG	2	6	195599	195604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183772
4111	NC_007513	GTT	2	6	195647	195652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183772
4112	NC_007513	CGG	2	6	195688	195693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183772
4113	NC_007513	TTG	2	6	195699	195704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183772
4114	NC_007513	CG	3	6	195716	195721	0 %	0 %	50 %	50 %	78183772
4115	NC_007513	G	7	7	195779	195785	0 %	0 %	100 %	0 %	78183772
4116	NC_007513	TTG	2	6	195801	195806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183772
4117	NC_007513	TGGGT	2	10	195812	195821	0 %	40 %	60 %	0 %	78183772
4118	NC_007513	TGC	2	6	195981	195986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183773
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4121	NC_007513	AC	3	6	196173	196178	50 %	0 %	0 %	50 %	78183773
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4123	NC_007513	GGC	2	6	196218	196223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183773
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4242	NC_007513	ATTG	2	8	201751	201758	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_007513	CGA	2	6	201831	201836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183777
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4246	NC_007513	GCT	2	6	201979	201984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183777
4247	NC_007513	GGC	2	6	202041	202046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183777
4248	NC_007513	GCA	2	6	202082	202087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183777
4249	NC_007513	CAC	2	6	202126	202131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183777
4250	NC_007513	GGTT	2	8	202145	202152	0 %	50 %	50 %	0 %	78183777
4251	NC_007513	TCGT	2	8	202270	202277	0 %	50 %	25 %	25 %	78183777
4252	NC_007513	GCT	2	6	202286	202291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183777
4253	NC_007513	CGT	2	6	202345	202350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183777
4254	NC_007513	TTG	2	6	202391	202396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183777
4255	NC_007513	GGA	2	6	202459	202464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183777
4256	NC_007513	CAA	2	6	202518	202523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183777
4257	NC_007513	TGAT	2	8	202545	202552	25 %	50 %	25 %	0 %	78183777
4258	NC_007513	TGG	2	6	202614	202619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183777
4259	NC_007513	GCA	2	6	202754	202759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183777
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4261	NC_007513	GCCA	2	8	202795	202802	25 %	0 %	25 %	50 %	78183777
4262	NC_007513	GCG	2	6	202803	202808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183777
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4276	NC_007513	ACG	2	6	203463	203468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183778
4277	NC_007513	CGG	2	6	203509	203514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183778
4278	NC_007513	CAG	2	6	203564	203569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183778
4279	NC_007513	GCG	2	6	203586	203591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183778
4280	NC_007513	GATG	2	8	203653	203660	25 %	25 %	50 %	0 %	78183778
4281	NC_007513	AGC	2	6	203688	203693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183778
4282	NC_007513	TTC	2	6	203720	203725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183778
4283	NC_007513	CGG	2	6	203795	203800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4284	NC_007513	GCC	2	6	203807	203812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4285	NC_007513	GT	3	6	203839	203844	0 %	50 %	50 %	0 %	78183779
4286	NC_007513	GAG	2	6	203866	203871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183779
4287	NC_007513	CAG	2	6	203928	203933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183779
4288	NC_007513	GAC	2	6	203960	203965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183779
4289	NC_007513	GT	3	6	204111	204116	0 %	50 %	50 %	0 %	78183779
4290	NC_007513	ACG	2	6	204135	204140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183779
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4292	NC_007513	TCA	2	6	204268	204273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183779
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4299	NC_007513	GGAA	2	8	204638	204645	50 %	0 %	50 %	0 %	78183780
4300	NC_007513	GCCATC	2	12	204654	204665	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	78183780
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4304	NC_007513	ATGG	2	8	204805	204812	25 %	25 %	50 %	0 %	78183780
4305	NC_007513	CGA	2	6	204840	204845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183780
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4308	NC_007513	GATCG	2	10	204922	204931	20 %	20 %	40 %	20 %	78183780
4309	NC_007513	CAA	2	6	204942	204947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183780
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4312	NC_007513	GTA	2	6	205052	205057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183780
4313	NC_007513	GAC	2	6	205255	205260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183781
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4317	NC_007513	CAG	2	6	205425	205430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183781
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4322	NC_007513	CAA	2	6	205876	205881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183781
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4327	NC_007513	CTGG	2	8	206060	206067	0 %	25 %	50 %	25 %	78183781
4328	NC_007513	TTGG	2	8	206085	206092	0 %	50 %	50 %	0 %	78183781
4329	NC_007513	TCA	2	6	206137	206142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183781
4330	NC_007513	GCA	2	6	206212	206217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183782
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4332	NC_007513	TTC	2	6	206304	206309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183782
4333	NC_007513	T	6	6	206318	206323	0 %	100 %	0 %	0 %	78183782
4334	NC_007513	TTG	2	6	206367	206372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183782
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4337	NC_007513	CAT	2	6	206475	206480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183782
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4339	NC_007513	GTT	2	6	206672	206677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183782
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4342	NC_007513	TTGG	2	8	206748	206755	0 %	50 %	50 %	0 %	78183782
4343	NC_007513	T	6	6	206762	206767	0 %	100 %	0 %	0 %	78183782
4344	NC_007513	TGT	2	6	206781	206786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183782
4345	NC_007513	GCTTC	2	10	206801	206810	0 %	40 %	20 %	40 %	78183782
4346	NC_007513	AGC	2	6	206841	206846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183782
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4351	NC_007513	TCAG	2	8	207241	207248	25 %	25 %	25 %	25 %	78183782
4352	NC_007513	CAA	2	6	207279	207284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183782
4353	NC_007513	A	6	6	207353	207358	100 %	0 %	0 %	0 %	78183782
4354	NC_007513	GTT	2	6	207359	207364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183782
4355	NC_007513	TGGT	2	8	207408	207415	0 %	50 %	50 %	0 %	78183782
4356	NC_007513	TCT	2	6	207448	207453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183782
4357	NC_007513	GAT	3	9	207629	207637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183782
4358	NC_007513	GTT	2	6	207674	207679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183782
4359	NC_007513	GCCAGC	2	12	207741	207752	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	78183782
4360	NC_007513	TTG	2	6	207864	207869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183782
4361	NC_007513	GTC	2	6	207870	207875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183782
4362	NC_007513	TCA	2	6	207995	208000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183782
4363	NC_007513	CAT	2	6	208056	208061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183783
4364	NC_007513	AGC	2	6	208106	208111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183783
4365	NC_007513	TGCG	2	8	208172	208179	0 %	25 %	50 %	25 %	78183783
4366	NC_007513	CCG	2	6	208279	208284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183783
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4369	NC_007513	GAA	2	6	208516	208521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183783
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4491	NC_007513	TCG	2	6	213665	213670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183786
4492	NC_007513	CGAT	2	8	213734	213741	25 %	25 %	25 %	25 %	78183786
4493	NC_007513	CCGA	2	8	213806	213813	25 %	0 %	25 %	50 %	78183786
4494	NC_007513	GAC	2	6	213815	213820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183786
4495	NC_007513	TGT	2	6	213832	213837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183787
4496	NC_007513	CAC	2	6	213863	213868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183787
4497	NC_007513	ACG	2	6	214075	214080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183787
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4499	NC_007513	GGT	2	6	214148	214153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183787
4500	NC_007513	TTCC	2	8	214157	214164	0 %	50 %	0 %	50 %	78183787

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