MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_007513	CCT	2	6	118638	118643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183698
2502	NC_007513	TTAT	2	8	118703	118710	25 %	75 %	0 %	0 %	78183698
2503	NC_007513	ACTA	2	8	118729	118736	50 %	25 %	0 %	25 %	78183698
2504	NC_007513	TGTGA	2	10	118811	118820	20 %	40 %	40 %	0 %	78183698
2505	NC_007513	T	6	6	118849	118854	0 %	100 %	0 %	0 %	78183698
2506	NC_007513	GCCTT	2	10	118872	118881	0 %	40 %	20 %	40 %	78183698
2507	NC_007513	TA	3	6	118908	118913	50 %	50 %	0 %	0 %	78183698
2508	NC_007513	ATTT	2	8	118935	118942	25 %	75 %	0 %	0 %	78183698
2509	NC_007513	CTT	2	6	118944	118949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183698
2510	NC_007513	TGC	2	6	118969	118974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183698
2511	NC_007513	CCA	2	6	119020	119025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183698
2512	NC_007513	CTT	2	6	119046	119051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183698
2513	NC_007513	CTT	2	6	119066	119071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183698
2514	NC_007513	TCC	2	6	119099	119104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183698
2515	NC_007513	CT	4	8	119109	119116	0 %	50 %	0 %	50 %	78183698
2516	NC_007513	AAAT	2	8	119129	119136	75 %	25 %	0 %	0 %	78183698
2517	NC_007513	T	6	6	119136	119141	0 %	100 %	0 %	0 %	78183698
2518	NC_007513	TTA	2	6	119148	119153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78183698
2519	NC_007513	CT	5	10	119183	119192	0 %	50 %	0 %	50 %	78183698
2520	NC_007513	A	6	6	119271	119276	100 %	0 %	0 %	0 %	78183699
2521	NC_007513	TC	3	6	119316	119321	0 %	50 %	0 %	50 %	78183699
2522	NC_007513	TTC	2	6	119485	119490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183699
2523	NC_007513	TC	3	6	119495	119500	0 %	50 %	0 %	50 %	78183699
2524	NC_007513	TCT	2	6	119585	119590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183699
2525	NC_007513	TCA	2	6	119599	119604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183699
2526	NC_007513	TAGT	2	8	119610	119617	25 %	50 %	25 %	0 %	78183699
2527	NC_007513	TCT	2	6	119665	119670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183699
2528	NC_007513	TTCTT	2	10	119684	119693	0 %	80 %	0 %	20 %	78183699
2529	NC_007513	ATG	2	6	119736	119741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183699
2530	NC_007513	CTG	2	6	119796	119801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183699
2531	NC_007513	TTA	2	6	119874	119879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78183699
2532	NC_007513	TCG	2	6	119884	119889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183699
2533	NC_007513	AAG	2	6	119916	119921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183699
2534	NC_007513	GTT	2	6	119937	119942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183699
2535	NC_007513	ATTTA	2	10	119962	119971	40 %	60 %	0 %	0 %	78183699
2536	NC_007513	TCT	3	9	119983	119991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183699
2537	NC_007513	TA	3	6	120033	120038	50 %	50 %	0 %	0 %	78183699
2538	NC_007513	TTGA	2	8	120080	120087	25 %	50 %	25 %	0 %	78183699
2539	NC_007513	TTC	2	6	120112	120117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183699
2540	NC_007513	CCA	2	6	120119	120124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183699
2541	NC_007513	CTT	2	6	120125	120130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183699
2542	NC_007513	GTT	2	6	120196	120201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183699
2543	NC_007513	CTT	2	6	120214	120219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183699
2544	NC_007513	CTT	2	6	120326	120331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183699
2545	NC_007513	ACA	2	6	120353	120358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183699
2546	NC_007513	CAA	2	6	120468	120473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183699
2547	NC_007513	CTT	2	6	120521	120526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183699
2548	NC_007513	GATCTT	2	12	120551	120562	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	78183699
2549	NC_007513	TCA	2	6	120619	120624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183699
2550	NC_007513	GCT	2	6	120737	120742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183699
2551	NC_007513	ATCG	2	8	120797	120804	25 %	25 %	25 %	25 %	78183699
2552	NC_007513	ATT	2	6	120838	120843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78183699
2553	NC_007513	TGA	2	6	120859	120864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183699
2554	NC_007513	GTT	2	6	120875	120880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183699
2555	NC_007513	TGA	2	6	120901	120906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183699
2556	NC_007513	CTTG	2	8	120913	120920	0 %	50 %	25 %	25 %	78183699
2557	NC_007513	CTT	2	6	120953	120958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_007513	CCG	2	6	121039	121044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183700
2559	NC_007513	AAG	2	6	121080	121085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183700
2560	NC_007513	AAC	2	6	121151	121156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183700
2561	NC_007513	GAT	2	6	121166	121171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183700
2562	NC_007513	AGT	2	6	121181	121186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183700
2563	NC_007513	GAAG	2	8	121192	121199	50 %	0 %	50 %	0 %	78183700
2564	NC_007513	CG	3	6	121219	121224	0 %	0 %	50 %	50 %	78183700
2565	NC_007513	TTAT	2	8	121314	121321	25 %	75 %	0 %	0 %	78183700
2566	NC_007513	GCC	2	6	121406	121411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183700
2567	NC_007513	ACAA	2	8	121599	121606	75 %	0 %	0 %	25 %	78183700
2568	NC_007513	TAT	2	6	121666	121671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78183700
2569	NC_007513	CGA	2	6	121687	121692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183700
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2571	NC_007513	TGA	2	6	121776	121781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183701
2572	NC_007513	CAT	2	6	121909	121914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183701
2573	NC_007513	CGT	2	6	121927	121932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183701
2574	NC_007513	CTG	2	6	122048	122053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183701
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2577	NC_007513	TGA	2	6	122129	122134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183701
2578	NC_007513	CTGTC	2	10	122135	122144	0 %	40 %	20 %	40 %	78183701
2579	NC_007513	TC	3	6	122149	122154	0 %	50 %	0 %	50 %	78183701
2580	NC_007513	AACG	2	8	122179	122186	50 %	0 %	25 %	25 %	78183701
2581	NC_007513	CTT	2	6	122203	122208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183701
2582	NC_007513	CTG	2	6	122261	122266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183701
2583	NC_007513	TTA	2	6	122275	122280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78183701
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2587	NC_007513	AT	3	6	122447	122452	50 %	50 %	0 %	0 %	78183701
2588	NC_007513	GCT	2	6	122493	122498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183701
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2590	NC_007513	GTT	2	6	122602	122607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183701
2591	NC_007513	TGT	2	6	122651	122656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183701
2592	NC_007513	TC	3	6	122754	122759	0 %	50 %	0 %	50 %	78183701
2593	NC_007513	TCTT	2	8	122817	122824	0 %	75 %	0 %	25 %	78183701
2594	NC_007513	AATT	2	8	122852	122859	50 %	50 %	0 %	0 %	78183701
2595	NC_007513	TC	3	6	122873	122878	0 %	50 %	0 %	50 %	78183701
2596	NC_007513	GTT	2	6	122917	122922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183701
2597	NC_007513	AAT	2	6	122947	122952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78183701
2598	NC_007513	TTGTCT	2	12	122968	122979	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	78183701
2599	NC_007513	A	7	7	122999	123005	100 %	0 %	0 %	0 %	78183701
2600	NC_007513	AAG	2	6	123037	123042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183701
2601	NC_007513	AGC	2	6	123069	123074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183701
2602	NC_007513	CTC	2	6	123091	123096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183701
2603	NC_007513	CAG	2	6	123148	123153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183701
2604	NC_007513	ACT	2	6	123250	123255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183701
2605	NC_007513	T	6	6	123425	123430	0 %	100 %	0 %	0 %	78183701
2606	NC_007513	CTG	2	6	123476	123481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183701
2607	NC_007513	GTT	2	6	123493	123498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183701
2608	NC_007513	TTG	2	6	123521	123526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183701
2609	NC_007513	ATT	2	6	123535	123540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78183701
2610	NC_007513	AGC	2	6	123558	123563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183701
2611	NC_007513	A	7	7	123566	123572	100 %	0 %	0 %	0 %	78183701
2612	NC_007513	ACG	2	6	123666	123671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183701
2613	NC_007513	TCT	2	6	123762	123767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183701
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2617	NC_007513	TTA	2	6	124055	124060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78183701
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2619	NC_007513	AGTGGT	2	12	124114	124125	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	78183701
2620	NC_007513	ATT	2	6	124143	124148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78183701
2621	NC_007513	TCG	2	6	124227	124232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183701
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2623	NC_007513	ACA	2	6	124286	124291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183701
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2625	NC_007513	TTG	2	6	124328	124333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183701
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