MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007513	T	7	7	48522	48528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_007513	TGA	2	6	48546	48551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183634
1003	NC_007513	CCG	2	6	48590	48595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183634
1004	NC_007513	CAT	2	6	48601	48606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183634
1005	NC_007513	CTG	2	6	48629	48634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183634
1006	NC_007513	TCT	2	6	48695	48700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183634
1007	NC_007513	GTG	2	6	48701	48706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183634
1008	NC_007513	GGT	2	6	48819	48824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183635
1009	NC_007513	CGT	2	6	48850	48855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183635
1010	NC_007513	ATGG	2	8	48919	48926	25 %	25 %	50 %	0 %	78183635
1011	NC_007513	GGC	2	6	48993	48998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183635
1012	NC_007513	GGC	2	6	49071	49076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183635
1013	NC_007513	GTT	2	6	49077	49082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183635
1014	NC_007513	CGG	2	6	49217	49222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183635
1015	NC_007513	ATCGG	2	10	49237	49246	20 %	20 %	40 %	20 %	78183635
1016	NC_007513	TGA	2	6	49283	49288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183635
1017	NC_007513	GTT	2	6	49290	49295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183635
1018	NC_007513	GCCA	2	8	49305	49312	25 %	0 %	25 %	50 %	78183635
1019	NC_007513	TCC	2	6	49354	49359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183635
1020	NC_007513	CCG	2	6	49373	49378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183635
1021	NC_007513	TGC	2	6	49499	49504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183635
1022	NC_007513	GATG	2	8	49518	49525	25 %	25 %	50 %	0 %	78183635
1023	NC_007513	GCC	2	6	49569	49574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183635
1024	NC_007513	CAT	2	6	49647	49652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_007513	ACA	2	6	49968	49973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183636
1026	NC_007513	TTGAT	2	10	50011	50020	20 %	60 %	20 %	0 %	78183636
1027	NC_007513	TGA	2	6	50030	50035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183636
1028	NC_007513	ACG	2	6	50122	50127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183636
1029	NC_007513	ATT	2	6	50228	50233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78183637
1030	NC_007513	T	6	6	50250	50255	0 %	100 %	0 %	0 %	78183637
1031	NC_007513	T	6	6	50262	50267	0 %	100 %	0 %	0 %	78183637
1032	NC_007513	CTT	2	6	50321	50326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183637
1033	NC_007513	AAG	2	6	50334	50339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183637
1034	NC_007513	ATT	2	6	50361	50366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78183637
1035	NC_007513	ATC	2	6	50382	50387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183637
1036	NC_007513	TCAA	2	8	50470	50477	50 %	25 %	0 %	25 %	78183637
1037	NC_007513	TCG	2	6	50497	50502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183637
1038	NC_007513	GAACC	2	10	50567	50576	40 %	0 %	20 %	40 %	78183637
1039	NC_007513	CGA	2	6	50653	50658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183637
1040	NC_007513	ACG	2	6	50692	50697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183637
1041	NC_007513	CAG	2	6	50718	50723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183637
1042	NC_007513	GCA	2	6	50735	50740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183637
1043	NC_007513	CAC	2	6	50775	50780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183638
1044	NC_007513	GTG	2	6	50782	50787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183638
1045	NC_007513	T	6	6	50850	50855	0 %	100 %	0 %	0 %	78183638
1046	NC_007513	GCC	2	6	50859	50864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183638
1047	NC_007513	CGG	2	6	50953	50958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183638
1048	NC_007513	TCA	2	6	50984	50989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183638
1049	NC_007513	TGCGG	2	10	51000	51009	0 %	20 %	60 %	20 %	78183638
1050	NC_007513	GCG	2	6	51063	51068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183638
1051	NC_007513	CT	3	6	51086	51091	0 %	50 %	0 %	50 %	78183638
1052	NC_007513	GAAC	2	8	51129	51136	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_007513	TCT	2	6	51153	51158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183639
1054	NC_007513	CAT	2	6	51170	51175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183639
1055	NC_007513	CAG	2	6	51257	51262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183639
1056	NC_007513	CGA	3	9	51279	51287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183639
1057	NC_007513	GGC	2	6	51323	51328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183639
1058	NC_007513	TGCTC	2	10	51356	51365	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1059	NC_007513	ACA	3	9	51379	51387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_007513	GAT	2	6	51412	51417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183640
1061	NC_007513	TGT	2	6	51423	51428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183640
1062	NC_007513	GTC	2	6	51509	51514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183640
1063	NC_007513	ATC	2	6	51597	51602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183640
1064	NC_007513	GCG	2	6	51617	51622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183640
1065	NC_007513	GCGA	2	8	51715	51722	25 %	0 %	50 %	25 %	78183640
1066	NC_007513	CGG	2	6	51786	51791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183640
1067	NC_007513	CTC	2	6	51867	51872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183640
1068	NC_007513	CGT	2	6	51917	51922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183640
1069	NC_007513	CCACG	2	10	51925	51934	20 %	0 %	20 %	60 %	78183640
1070	NC_007513	GCTT	2	8	52008	52015	0 %	50 %	25 %	25 %	78183640
1071	NC_007513	GTG	2	6	52118	52123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183640
1072	NC_007513	CCA	2	6	52311	52316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183640
1073	NC_007513	TCT	2	6	52510	52515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183640
1074	NC_007513	CGT	2	6	52751	52756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183640
1075	NC_007513	TTGT	2	8	52769	52776	0 %	75 %	25 %	0 %	78183640
1076	NC_007513	GGT	2	6	52817	52822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183640
1077	NC_007513	TAC	2	6	52907	52912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183640
1078	NC_007513	CCGC	2	8	53085	53092	0 %	0 %	25 %	75 %	78183641
1079	NC_007513	GGC	2	6	53129	53134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183641
1080	NC_007513	TGC	2	6	53151	53156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183641
1081	NC_007513	GTT	2	6	53164	53169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183641
1082	NC_007513	GAA	2	6	53219	53224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183641
1083	NC_007513	TGG	3	9	53241	53249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183641
1084	NC_007513	GAG	2	6	53261	53266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183641
1085	NC_007513	GGT	2	6	53269	53274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183641
1086	NC_007513	CGA	2	6	53341	53346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183641
1087	NC_007513	GGC	2	6	53438	53443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183641
1088	NC_007513	GTT	2	6	53491	53496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183641
1089	NC_007513	GAC	2	6	53525	53530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183641
1090	NC_007513	CGG	2	6	53574	53579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183641
1091	NC_007513	GCG	2	6	53685	53690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183641
1092	NC_007513	TGAC	2	8	53772	53779	25 %	25 %	25 %	25 %	78183641
1093	NC_007513	GTT	2	6	53800	53805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183641
1094	NC_007513	AGG	2	6	53850	53855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183641
1095	NC_007513	AGC	2	6	53886	53891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183641
1096	NC_007513	GGT	2	6	53909	53914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183641
1097	NC_007513	T	6	6	53924	53929	0 %	100 %	0 %	0 %	78183641
1098	NC_007513	CGT	2	6	53949	53954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183641
1099	NC_007513	C	6	6	54065	54070	0 %	0 %	0 %	100 %	78183641
1100	NC_007513	ATCG	2	8	54085	54092	25 %	25 %	25 %	25 %	78183641
1101	NC_007513	GT	3	6	54102	54107	0 %	50 %	50 %	0 %	78183641
1102	NC_007513	CCTA	2	8	54117	54124	25 %	25 %	0 %	50 %	78183641
1103	NC_007513	TGG	2	6	54186	54191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183641
1104	NC_007513	GTTTG	2	10	54264	54273	0 %	60 %	40 %	0 %	78183641
1105	NC_007513	TCT	2	6	54318	54323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_007513	T	6	6	54351	54356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_007513	AGT	2	6	54358	54363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_007513	GAA	2	6	54386	54391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_007513	GGTTT	2	10	54402	54411	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_007513	GCTGG	2	10	54535	54544	0 %	20 %	60 %	20 %	78183642
1111	NC_007513	TGG	2	6	54612	54617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183642
1112	NC_007513	TTGTG	2	10	54630	54639	0 %	60 %	40 %	0 %	78183642
1113	NC_007513	CAA	2	6	54665	54670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183642
1114	NC_007513	AAC	2	6	54678	54683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183642
1115	NC_007513	GAG	2	6	54737	54742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183642
1116	NC_007513	GCA	2	6	54778	54783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183642
1117	NC_007513	GAT	2	6	54804	54809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183642
1118	NC_007513	CAC	2	6	54903	54908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183642
1119	NC_007513	CTG	2	6	54942	54947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183642
1120	NC_007513	CAG	2	6	54951	54956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183642
1121	NC_007513	TGC	2	6	54994	54999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183642
1122	NC_007513	CCG	2	6	55046	55051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183642
1123	NC_007513	CGC	2	6	55116	55121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183642
1124	NC_007513	GTT	2	6	55126	55131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183642
1125	NC_007513	GAACTG	2	12	55163	55174	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78183642
1126	NC_007513	GGGC	2	8	55220	55227	0 %	0 %	75 %	25 %	78183642
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1128	NC_007513	GCG	2	6	55426	55431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183642
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1257	NC_007513	GCTG	2	8	61692	61699	0 %	25 %	50 %	25 %	78183647
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1261	NC_007513	GCTG	2	8	61882	61889	0 %	25 %	50 %	25 %	78183647
1262	NC_007513	GTCACC	2	12	61910	61921	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	78183647
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1265	NC_007513	GCA	2	6	62001	62006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1269	NC_007513	TTCAG	2	10	62120	62129	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1270	NC_007513	CTTG	2	8	62226	62233	0 %	50 %	25 %	25 %	78183648
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1302	NC_007513	T	7	7	64121	64127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1303	NC_007513	GGT	2	6	64189	64194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183650
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1377	NC_007513	GCTG	2	8	67615	67622	0 %	25 %	50 %	25 %	78183652
1378	NC_007513	CTTCA	2	10	67639	67648	20 %	40 %	0 %	40 %	78183652
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1382	NC_007513	C	6	6	67784	67789	0 %	0 %	0 %	100 %	78183652
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