MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_007513	GAC	2	6	290771	290776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183859
6002	NC_007513	TGG	2	6	291056	291061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183859
6003	NC_007513	TGCC	2	8	291095	291102	0 %	25 %	25 %	50 %	78183859
6004	NC_007513	TGCT	2	8	291135	291142	0 %	50 %	25 %	25 %	78183859
6005	NC_007513	GAC	2	6	291252	291257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183859
6006	NC_007513	TGA	2	6	291305	291310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183859
6007	NC_007513	G	7	7	291356	291362	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_007513	TGC	2	6	291552	291557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183860
6009	NC_007513	ACG	2	6	291560	291565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183860
6010	NC_007513	TCC	2	6	291605	291610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183860
6011	NC_007513	GAG	2	6	291673	291678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183860
6012	NC_007513	TGC	2	6	291693	291698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183860
6013	NC_007513	ACC	2	6	291706	291711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183860
6014	NC_007513	CTT	2	6	291724	291729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183860
6015	NC_007513	TGT	2	6	291740	291745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183860
6016	NC_007513	GGT	2	6	291816	291821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183860
6017	NC_007513	TTGGTT	2	12	291872	291883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183860
6018	NC_007513	GCC	2	6	291892	291897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183860
6019	NC_007513	CGC	2	6	291923	291928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183860
6020	NC_007513	TGGT	2	8	291950	291957	0 %	50 %	50 %	0 %	78183860
6021	NC_007513	CCT	2	6	291963	291968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183860
6022	NC_007513	TGG	2	6	291970	291975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183860
6023	NC_007513	GGA	2	6	291982	291987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183860
6024	NC_007513	GA	3	6	291986	291991	50 %	0 %	50 %	0 %	78183860
6025	NC_007513	TCC	2	6	292003	292008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183860
6026	NC_007513	TGGT	2	8	292013	292020	0 %	50 %	50 %	0 %	78183860
6027	NC_007513	GCT	2	6	292033	292038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183860
6028	NC_007513	GTC	2	6	292182	292187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183860
6029	NC_007513	TCTTT	2	10	292218	292227	0 %	80 %	0 %	20 %	78183860
6030	NC_007513	CTG	2	6	292273	292278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183860
6031	NC_007513	GTT	2	6	292311	292316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183860
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6033	NC_007513	GC	3	6	292339	292344	0 %	0 %	50 %	50 %	78183860
6034	NC_007513	GTT	2	6	292434	292439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183860
6035	NC_007513	GCC	2	6	292498	292503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183860
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6037	NC_007513	TGG	2	6	292667	292672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183860
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6039	NC_007513	CGC	2	6	292789	292794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183860
6040	NC_007513	ACG	2	6	292831	292836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183860
6041	NC_007513	TGGTT	2	10	292912	292921	0 %	60 %	40 %	0 %	78183860
6042	NC_007513	CTT	2	6	292962	292967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183860
6043	NC_007513	G	6	6	293087	293092	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_007513	TC	3	6	293122	293127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_007513	CAG	2	6	293165	293170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183861
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6047	NC_007513	GGA	2	6	293305	293310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183861
6048	NC_007513	CAG	2	6	293323	293328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183861
6049	NC_007513	T	6	6	293329	293334	0 %	100 %	0 %	0 %	78183861
6050	NC_007513	TACT	2	8	293345	293352	25 %	50 %	0 %	25 %	78183861
6051	NC_007513	ATG	2	6	293444	293449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183861
6052	NC_007513	TGC	2	6	293497	293502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183861
6053	NC_007513	TGT	2	6	293563	293568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183861
6054	NC_007513	CGA	2	6	293589	293594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183861
6055	NC_007513	TGG	2	6	293595	293600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183861
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6058	NC_007513	GAG	2	6	293894	293899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183861
6059	NC_007513	TGA	2	6	293932	293937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183861
6060	NC_007513	TGC	2	6	293944	293949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183861
6061	NC_007513	GGA	2	6	294028	294033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183861
6062	NC_007513	ACG	2	6	294054	294059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183861
6063	NC_007513	ACG	2	6	294066	294071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183861
6064	NC_007513	CG	3	6	294177	294182	0 %	0 %	50 %	50 %	78183861
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6066	NC_007513	CGT	2	6	294302	294307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183861
6067	NC_007513	TGA	2	6	294352	294357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_007513	TGC	2	6	294477	294482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183862
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6079	NC_007513	CAG	2	6	294790	294795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183862
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6082	NC_007513	GC	3	6	294865	294870	0 %	0 %	50 %	50 %	78183862
6083	NC_007513	TGA	3	9	294927	294935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183862
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6088	NC_007513	CTG	2	6	295442	295447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183862
6089	NC_007513	CGG	2	6	295486	295491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183862
6090	NC_007513	CAT	2	6	295522	295527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_007513	CCGTC	2	10	295673	295682	0 %	20 %	20 %	60 %	78183863
6092	NC_007513	GT	4	8	295773	295780	0 %	50 %	50 %	0 %	78183863
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6095	NC_007513	T	6	6	295882	295887	0 %	100 %	0 %	0 %	78183863
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6101	NC_007513	GC	3	6	296262	296267	0 %	0 %	50 %	50 %	78183864
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6108	NC_007513	CT	3	6	296523	296528	0 %	50 %	0 %	50 %	78183864
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6110	NC_007513	CCTG	2	8	296560	296567	0 %	25 %	25 %	50 %	78183864
6111	NC_007513	GAA	2	6	296585	296590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183864
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6113	NC_007513	CGT	2	6	296696	296701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183864
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6119	NC_007513	CTTC	2	8	296833	296840	0 %	50 %	0 %	50 %	78183865
6120	NC_007513	TGG	2	6	296858	296863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183865
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6122	NC_007513	TGA	2	6	296927	296932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183865
6123	NC_007513	TCC	2	6	296980	296985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183865
6124	NC_007513	CTG	2	6	297127	297132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183865
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6131	NC_007513	GAT	2	6	297525	297530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183866
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6142	NC_007513	TG	3	6	297979	297984	0 %	50 %	50 %	0 %	78183866
6143	NC_007513	CGT	2	6	298034	298039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183866
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6151	NC_007513	TTTG	2	8	298761	298768	0 %	75 %	25 %	0 %	78183868
6152	NC_007513	CGT	2	6	298812	298817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183868
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6155	NC_007513	CCA	2	6	299029	299034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183869
6156	NC_007513	GATCTC	2	12	299042	299053	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78183869
6157	NC_007513	CAGA	2	8	299059	299066	50 %	0 %	25 %	25 %	78183869
6158	NC_007513	GTG	2	6	299157	299162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6159	NC_007513	GCC	2	6	299245	299250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183870
6160	NC_007513	TGCT	2	8	299274	299281	0 %	50 %	25 %	25 %	78183870
6161	NC_007513	GGC	2	6	299284	299289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183870
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6213	NC_007513	AAG	2	6	302663	302668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6214	NC_007513	ACC	2	6	302682	302687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6491	NC_007513	TGA	2	6	317697	317702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183889
6492	NC_007513	ACC	2	6	317825	317830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183889
6493	NC_007513	ACA	2	6	317847	317852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183889
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6500	NC_007513	GTC	2	6	318150	318155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183889

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