MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 44761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_007513	GAC	2	6	214167	214172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183787
4502	NC_007513	CTC	2	6	214308	214313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183787
4503	NC_007513	TGG	2	6	214317	214322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183787
4504	NC_007513	GAG	2	6	214389	214394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183787
4505	NC_007513	GCGTC	2	10	214421	214430	0 %	20 %	40 %	40 %	78183787
4506	NC_007513	GCTTG	2	10	214434	214443	0 %	40 %	40 %	20 %	78183787
4507	NC_007513	ACG	2	6	214552	214557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183787
4508	NC_007513	GCT	2	6	214572	214577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183787
4509	NC_007513	T	7	7	214799	214805	0 %	100 %	0 %	0 %	78183788
4510	NC_007513	GTCG	2	8	214879	214886	0 %	25 %	50 %	25 %	78183788
4511	NC_007513	GATT	2	8	214942	214949	25 %	50 %	25 %	0 %	78183788
4512	NC_007513	TCT	2	6	214950	214955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183788
4513	NC_007513	CGT	2	6	214981	214986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183788
4514	NC_007513	CGG	2	6	214990	214995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183788
4515	NC_007513	GGCT	2	8	214999	215006	0 %	25 %	50 %	25 %	78183788
4516	NC_007513	CGG	2	6	215113	215118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183788
4517	NC_007513	CGTTG	2	10	215124	215133	0 %	40 %	40 %	20 %	78183788
4518	NC_007513	GCC	2	6	215277	215282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183788
4519	NC_007513	ACC	2	6	215311	215316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183788
4520	NC_007513	GC	3	6	215337	215342	0 %	0 %	50 %	50 %	78183788
4521	NC_007513	GCG	2	6	215391	215396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183788
4522	NC_007513	GAA	2	6	215443	215448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183788
4523	NC_007513	AAG	2	6	215468	215473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183788
4524	NC_007513	TGAA	2	8	215549	215556	50 %	25 %	25 %	0 %	78183788
4525	NC_007513	GCT	2	6	215569	215574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183788
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4527	NC_007513	GGC	2	6	215672	215677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183788
4528	NC_007513	AGT	2	6	215716	215721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183788
4529	NC_007513	CAG	2	6	215741	215746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183788
4530	NC_007513	AGT	2	6	215779	215784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183788
4531	NC_007513	AGAAT	2	10	215809	215818	60 %	20 %	20 %	0 %	78183788
4532	NC_007513	TAG	2	6	215831	215836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183788
4533	NC_007513	CGA	2	6	215853	215858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183788
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4537	NC_007513	TCG	2	6	216075	216080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183788
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4539	NC_007513	GCT	2	6	216110	216115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183788
4540	NC_007513	GAT	2	6	216299	216304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183788
4541	NC_007513	TGA	2	6	216313	216318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183788
4542	NC_007513	ATG	2	6	216333	216338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183788
4543	NC_007513	AGTG	2	8	216344	216351	25 %	25 %	50 %	0 %	78183788
4544	NC_007513	TCG	2	6	216402	216407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183788
4545	NC_007513	ATCCAG	2	12	216408	216419	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	78183788
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4547	NC_007513	TCGA	2	8	216532	216539	25 %	25 %	25 %	25 %	78183789
4548	NC_007513	GCT	2	6	216552	216557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183789
4549	NC_007513	CT	3	6	216556	216561	0 %	50 %	0 %	50 %	78183789
4550	NC_007513	GTAG	2	8	216574	216581	25 %	25 %	50 %	0 %	78183789
4551	NC_007513	AGT	2	6	216628	216633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183789
4552	NC_007513	GCT	2	6	216637	216642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183789
4553	NC_007513	TGG	2	6	216707	216712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183789
4554	NC_007513	GCT	2	6	216879	216884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183789
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4559	NC_007513	AAG	2	6	217112	217117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183789
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4561	NC_007513	AG	3	6	217146	217151	50 %	0 %	50 %	0 %	78183789
4562	NC_007513	GCG	2	6	217243	217248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183789
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4564	NC_007513	TCA	2	6	217348	217353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183790
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4581	NC_007513	GATT	2	8	218300	218307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4583	NC_007513	ATT	2	6	218388	218393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_007513	GTC	2	6	218418	218423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_007513	GCG	2	6	218542	218547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_007513	TAC	2	6	218549	218554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4588	NC_007513	TGT	2	6	218629	218634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_007513	TTC	2	6	218713	218718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_007513	GGCC	2	8	218747	218754	0 %	0 %	50 %	50 %	78183791
4591	NC_007513	ACG	2	6	218758	218763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183791
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4594	NC_007513	CATCG	2	10	218847	218856	20 %	20 %	20 %	40 %	78183791
4595	NC_007513	GGC	2	6	218921	218926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183791
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4602	NC_007513	CGG	2	6	219346	219351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183791
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4606	NC_007513	TCG	2	6	219455	219460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183791
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4609	NC_007513	CTGGT	2	10	219581	219590	0 %	40 %	40 %	20 %	78183791
4610	NC_007513	TGT	2	6	219602	219607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183791
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4617	NC_007513	GAGGCG	2	12	219876	219887	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	78183791
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4623	NC_007513	GCTT	2	8	220114	220121	0 %	50 %	25 %	25 %	78183791
4624	NC_007513	ACC	2	6	220158	220163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183791
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4653	NC_007513	CGC	2	6	221384	221389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183792
4654	NC_007513	TTTC	2	8	221447	221454	0 %	75 %	0 %	25 %	78183792
4655	NC_007513	GGGCT	2	10	221490	221499	0 %	20 %	60 %	20 %	78183792
4656	NC_007513	TGA	2	6	221559	221564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183792
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4869	NC_007513	TCGA	2	8	231824	231831	25 %	25 %	25 %	25 %	78183801
4870	NC_007513	ACA	2	6	231846	231851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183801
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4872	NC_007513	GGC	2	6	231922	231927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183801
4873	NC_007513	GGC	2	6	231986	231991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183801
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4877	NC_007513	GGC	2	6	232210	232215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183801
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4881	NC_007513	CTT	2	6	232439	232444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183801
4882	NC_007513	CGT	2	6	232469	232474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183801
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4885	NC_007513	CTT	2	6	232661	232666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183801
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4893	NC_007513	GAAGT	2	10	233216	233225	40 %	20 %	40 %	0 %	78183801
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4897	NC_007513	CGT	2	6	233369	233374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183801
4898	NC_007513	GTGA	2	8	233420	233427	25 %	25 %	50 %	0 %	78183801
4899	NC_007513	GCG	2	6	233477	233482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183801
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4911	NC_007513	TGA	2	6	233910	233915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183802
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4958	NC_007513	TGA	2	6	236150	236155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183803
4959	NC_007513	CTT	2	6	236178	236183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183803
4960	NC_007513	GT	3	6	236258	236263	0 %	50 %	50 %	0 %	78183803
4961	NC_007513	TGA	2	6	236313	236318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183803
4962	NC_007513	TGA	3	9	236341	236349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4965	NC_007513	TTTGT	2	10	236506	236515	0 %	80 %	20 %	0 %	78183804
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4970	NC_007513	GCA	2	6	236759	236764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183804
4971	NC_007513	TGG	2	6	236827	236832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183804
4972	NC_007513	GAT	2	6	236867	236872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183804
4973	NC_007513	TC	3	6	237035	237040	0 %	50 %	0 %	50 %	78183804
4974	NC_007513	GCA	2	6	237073	237078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183804
4975	NC_007513	GCTT	2	8	237082	237089	0 %	50 %	25 %	25 %	78183804
4976	NC_007513	ATTCC	2	10	237098	237107	20 %	40 %	0 %	40 %	78183804
4977	NC_007513	ACT	3	9	237138	237146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183804
4978	NC_007513	GGT	2	6	237206	237211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183804
4979	NC_007513	AGG	2	6	237238	237243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183804
4980	NC_007513	GTTG	2	8	237292	237299	0 %	50 %	50 %	0 %	78183804
4981	NC_007513	GCC	2	6	237308	237313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183804
4982	NC_007513	CCCA	2	8	237358	237365	25 %	0 %	0 %	75 %	78183804
4983	NC_007513	GCC	2	6	237404	237409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183804
4984	NC_007513	AGCA	2	8	237479	237486	50 %	0 %	25 %	25 %	78183804
4985	NC_007513	TGA	2	6	237535	237540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183804
4986	NC_007513	TGA	2	6	237580	237585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183804
4987	NC_007513	T	7	7	237595	237601	0 %	100 %	0 %	0 %	78183804
4988	NC_007513	AATT	2	8	237860	237867	50 %	50 %	0 %	0 %	78183805
4989	NC_007513	ATG	2	6	237872	237877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183805
4990	NC_007513	CCTGC	2	10	237923	237932	0 %	20 %	20 %	60 %	78183805
4991	NC_007513	T	6	6	237981	237986	0 %	100 %	0 %	0 %	78183805
4992	NC_007513	TCG	2	6	238014	238019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183805
4993	NC_007513	GC	3	6	238025	238030	0 %	0 %	50 %	50 %	78183805
4994	NC_007513	AAGTG	2	10	238050	238059	40 %	20 %	40 %	0 %	78183805
4995	NC_007513	GTT	2	6	238130	238135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183805
4996	NC_007513	CTTTG	2	10	238165	238174	0 %	60 %	20 %	20 %	78183805
4997	NC_007513	ATG	2	6	238250	238255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183805
4998	NC_007513	CGC	2	6	238298	238303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183805
4999	NC_007513	TGA	2	6	238350	238355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183805
5000	NC_007513	TCG	2	6	238358	238363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183805

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