MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae A909 chromosome

Total Repeats: 47702

< Previous12...678910111213141516...9596Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_007432	GTTGAA	2	12	226320	226331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76788289
5003	NC_007432	GCA	2	6	226362	226367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788289
5004	NC_007432	TTG	2	6	226378	226383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788289
5005	NC_007432	GGA	2	6	226394	226399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76788289
5006	NC_007432	GA	3	6	226460	226465	50 %	0 %	50 %	0 %	76788289
5007	NC_007432	AGG	2	6	226504	226509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76788289
5008	NC_007432	T	6	6	226535	226540	0 %	100 %	0 %	0 %	76787609
5009	NC_007432	A	6	6	226608	226613	100 %	0 %	0 %	0 %	76787609
5010	NC_007432	CTT	2	6	226658	226663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76787609
5011	NC_007432	TGG	2	6	226741	226746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76787609
5012	NC_007432	TAA	2	6	226757	226762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76787609
5013	NC_007432	AT	3	6	226871	226876	50 %	50 %	0 %	0 %	76787609
5014	NC_007432	CAT	2	6	226890	226895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76787609
5015	NC_007432	ATT	2	6	226989	226994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787609
5016	NC_007432	TGG	2	6	227105	227110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76787609
5017	NC_007432	TTG	2	6	227113	227118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76787609
5018	NC_007432	AAATCA	2	12	227124	227135	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	76787609
5019	NC_007432	AGA	2	6	227138	227143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76787609
5020	NC_007432	ATT	2	6	227211	227216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787609
5021	NC_007432	ATTG	2	8	227468	227475	25 %	50 %	25 %	0 %	76787609
5022	NC_007432	TGG	2	6	227495	227500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76787609
5023	NC_007432	ACT	2	6	227535	227540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76787609
5024	NC_007432	TCT	2	6	227569	227574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76787609
5025	NC_007432	TGG	2	6	227609	227614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76787609
5026	NC_007432	GAG	2	6	227620	227625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76787609
5027	NC_007432	TCA	2	6	227656	227661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76787609
5028	NC_007432	CGG	2	6	227777	227782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76787609
5029	NC_007432	CATTT	2	10	227834	227843	20 %	60 %	0 %	20 %	76787609
5030	NC_007432	AAGG	2	8	227862	227869	50 %	0 %	50 %	0 %	76787609
5031	NC_007432	TAA	2	6	227871	227876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76787609
5032	NC_007432	AGA	2	6	227887	227892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76787590
5033	NC_007432	TTG	2	6	227994	227999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76787590
5034	NC_007432	AAAG	2	8	228053	228060	75 %	0 %	25 %	0 %	76787590
5035	NC_007432	T	7	7	228133	228139	0 %	100 %	0 %	0 %	76787590
5036	NC_007432	TAT	2	6	228302	228307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787590
5037	NC_007432	TGC	2	6	228370	228375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76787590
5038	NC_007432	CAT	2	6	228377	228382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76787590
5039	NC_007432	GAT	2	6	228410	228415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76787590
5040	NC_007432	A	6	6	228419	228424	100 %	0 %	0 %	0 %	76787590
5041	NC_007432	TTG	2	6	228468	228473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76787590
5042	NC_007432	GGA	2	6	228628	228633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76787590
5043	NC_007432	ATC	2	6	228645	228650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76787590
5044	NC_007432	ACA	2	6	228667	228672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76787590
5045	NC_007432	A	6	6	228672	228677	100 %	0 %	0 %	0 %	76787590
5046	NC_007432	AGCG	2	8	228687	228694	25 %	0 %	50 %	25 %	76787590
5047	NC_007432	GA	3	6	228706	228711	50 %	0 %	50 %	0 %	76787590
5048	NC_007432	GGT	2	6	228721	228726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76787590
5049	NC_007432	TCC	2	6	228773	228778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76786827
5050	NC_007432	CAA	2	6	228842	228847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76786827
5051	NC_007432	TAT	2	6	228891	228896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76786827
5052	NC_007432	GCA	2	6	228919	228924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76786827
5053	NC_007432	ATT	2	6	229039	229044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76786827
5054	NC_007432	AATG	2	8	229071	229078	50 %	25 %	25 %	0 %	76786827
5055	NC_007432	CTA	2	6	229111	229116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76786827
5056	NC_007432	TGA	2	6	229152	229157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76786827
5057	NC_007432	AAAC	2	8	229180	229187	75 %	0 %	0 %	25 %	76786827
5058	NC_007432	TAT	2	6	229323	229328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76786827
5059	NC_007432	AGC	2	6	229347	229352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76786827
5060	NC_007432	AGA	2	6	229419	229424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76786827
5061	NC_007432	ACT	2	6	229531	229536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76786827
5062	NC_007432	TGA	2	6	229554	229559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76786827
5063	NC_007432	AGGT	2	8	229571	229578	25 %	25 %	50 %	0 %	76786827
5064	NC_007432	TTA	2	6	229591	229596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76786827
5065	NC_007432	GAG	2	6	229597	229602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76786827
5066	NC_007432	GGT	2	6	229758	229763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_007432	GTG	2	6	229810	229815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76787947
5068	NC_007432	TAG	2	6	229820	229825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76787947
5069	NC_007432	TGT	2	6	229854	229859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76787947
5070	NC_007432	T	6	6	230115	230120	0 %	100 %	0 %	0 %	76787947
5071	NC_007432	TTTA	2	8	230156	230163	25 %	75 %	0 %	0 %	76787947
5072	NC_007432	TAT	2	6	230283	230288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787947
5073	NC_007432	TCG	2	6	230313	230318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76787947
5074	NC_007432	T	6	6	230418	230423	0 %	100 %	0 %	0 %	76787947
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5077	NC_007432	TAGA	2	8	230573	230580	50 %	25 %	25 %	0 %	76787947
5078	NC_007432	AAGA	2	8	230611	230618	75 %	0 %	25 %	0 %	76787947
5079	NC_007432	AGG	2	6	230634	230639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76787947
5080	NC_007432	TTCAT	2	10	230656	230665	20 %	60 %	0 %	20 %	76787947
5081	NC_007432	TTA	2	6	230666	230671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787947
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5083	NC_007432	CTT	2	6	230703	230708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76787947
5084	NC_007432	ATA	2	6	230798	230803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76787947
5085	NC_007432	AGTC	2	8	230830	230837	25 %	25 %	25 %	25 %	76787947
5086	NC_007432	CAAC	2	8	230851	230858	50 %	0 %	0 %	50 %	76787947
5087	NC_007432	TG	3	6	230867	230872	0 %	50 %	50 %	0 %	76787947
5088	NC_007432	AT	3	6	231108	231113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_007432	A	8	8	231133	231140	100 %	0 %	0 %	0 %	76787061
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5093	NC_007432	TGA	2	6	231281	231286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76787061
5094	NC_007432	A	7	7	231286	231292	100 %	0 %	0 %	0 %	76787061
5095	NC_007432	CGT	2	6	231301	231306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76787061
5096	NC_007432	TTA	2	6	231310	231315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76787061
5097	NC_007432	CGT	2	6	231325	231330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76787061
5098	NC_007432	TCG	2	6	231375	231380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76787061
5099	NC_007432	ACA	2	6	231388	231393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_007432	T	6	6	231428	231433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_007432	GAG	2	6	231465	231470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_007432	CAG	2	6	231473	231478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_007432	TTA	2	6	231508	231513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_007432	ATTT	2	8	231538	231545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_007432	TAA	2	6	231578	231583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_007432	AATG	2	8	231606	231613	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_007432	ATA	2	6	231614	231619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_007432	TCC	2	6	231625	231630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_007432	A	7	7	231745	231751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_007432	AAT	2	6	231759	231764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_007432	A	7	7	231800	231806	100 %	0 %	0 %	0 %	76788173
5112	NC_007432	GTT	2	6	231810	231815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76788173
5113	NC_007432	TCGT	2	8	231856	231863	0 %	50 %	25 %	25 %	76788173
5114	NC_007432	CAG	3	9	231886	231894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76788173
5115	NC_007432	T	6	6	231923	231928	0 %	100 %	0 %	0 %	76788173
5116	NC_007432	GAA	2	6	231948	231953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788173
5117	NC_007432	A	6	6	231952	231957	100 %	0 %	0 %	0 %	76788173
5118	NC_007432	TGC	2	6	231962	231967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76788173
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5120	NC_007432	TCA	2	6	232096	232101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76788173
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5123	NC_007432	TCA	2	6	232158	232163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76788173
5124	NC_007432	TAT	2	6	232241	232246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	76788173
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5126	NC_007432	AGA	2	6	232349	232354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76788173
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5231	NC_007432	TAA	2	6	237347	237352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	76787268
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