MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS_046

Total Repeats: 617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007385	CAGC	2	8	26	33	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007385	ATCT	2	8	122	129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007385	TCGT	2	8	169	176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007385	GCGA	2	8	244	251	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007385	GTCA	2	8	499	506	25 %	25 %	25 %	25 %	74314839
6	NC_007385	GTAG	2	8	968	975	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007385	TCTA	2	8	1349	1356	25 %	50 %	0 %	25 %	74314841
8	NC_007385	ACAA	2	8	1658	1665	75 %	0 %	0 %	25 %	74314841
9	NC_007385	TCTT	2	8	1781	1788	0 %	75 %	0 %	25 %	74314841
10	NC_007385	AATT	2	8	2345	2352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007385	AAAT	2	8	2362	2369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007385	CGCT	2	8	2560	2567	0 %	25 %	25 %	50 %	74314842
13	NC_007385	TTAT	2	8	2771	2778	25 %	75 %	0 %	0 %	74314842
14	NC_007385	TTGG	2	8	2855	2862	0 %	50 %	50 %	0 %	74314842
15	NC_007385	ACGA	2	8	3757	3764	50 %	0 %	25 %	25 %	74314844
16	NC_007385	CCAT	2	8	3781	3788	25 %	25 %	0 %	50 %	74314844
17	NC_007385	GACT	2	8	3817	3824	25 %	25 %	25 %	25 %	74314844
18	NC_007385	GCTG	2	8	4546	4553	0 %	25 %	50 %	25 %	74314844
19	NC_007385	GGCA	2	8	4627	4634	25 %	0 %	50 %	25 %	74314844
20	NC_007385	TAAG	2	8	4810	4817	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007385	TAAA	2	8	4907	4914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007385	TATT	2	8	5511	5518	25 %	75 %	0 %	0 %	74314845
23	NC_007385	TGTT	2	8	6471	6478	0 %	75 %	25 %	0 %	74314845
24	NC_007385	AAAT	2	8	6815	6822	75 %	25 %	0 %	0 %	74314845
25	NC_007385	ACAT	2	8	6862	6869	50 %	25 %	0 %	25 %	74314845
26	NC_007385	TTTA	2	8	7186	7193	25 %	75 %	0 %	0 %	74314845
27	NC_007385	CATG	2	8	8089	8096	25 %	25 %	25 %	25 %	74314846
28	NC_007385	ATTG	2	8	8389	8396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007385	CCTG	2	8	8835	8842	0 %	25 %	25 %	50 %	74314847
30	NC_007385	TCAT	2	8	9445	9452	25 %	50 %	0 %	25 %	74314848
31	NC_007385	TCTT	2	8	9784	9791	0 %	75 %	0 %	25 %	74314848
32	NC_007385	CATT	2	8	10119	10126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007385	ACGA	2	8	10658	10665	50 %	0 %	25 %	25 %	74314849
34	NC_007385	CCAT	2	8	10682	10689	25 %	25 %	0 %	50 %	74314849
35	NC_007385	GACT	2	8	10718	10725	25 %	25 %	25 %	25 %	74314849
36	NC_007385	GCTG	2	8	11447	11454	0 %	25 %	50 %	25 %	74314849
37	NC_007385	GGCA	2	8	11528	11535	25 %	0 %	50 %	25 %	74314849
38	NC_007385	TTTG	2	8	11739	11746	0 %	75 %	25 %	0 %	74314850
39	NC_007385	ATTG	2	8	11895	11902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007385	CCAG	2	8	12393	12400	25 %	0 %	25 %	50 %	74314851
41	NC_007385	CTGT	2	8	12898	12905	0 %	50 %	25 %	25 %	74314853
42	NC_007385	TACT	2	8	13018	13025	25 %	50 %	0 %	25 %	74314853
43	NC_007385	CAGT	2	8	13086	13093	25 %	25 %	25 %	25 %	74314854
44	NC_007385	ACTG	2	8	13100	13107	25 %	25 %	25 %	25 %	74314854
45	NC_007385	CGTC	2	8	13539	13546	0 %	25 %	25 %	50 %	74314854
46	NC_007385	CTGG	2	8	13822	13829	0 %	25 %	50 %	25 %	74314855
47	NC_007385	TCCG	2	8	14530	14537	0 %	25 %	25 %	50 %	74314856
48	NC_007385	ATCC	2	8	15075	15082	25 %	25 %	0 %	50 %	74314856
49	NC_007385	ATTC	2	8	15315	15322	25 %	50 %	0 %	25 %	74314856
50	NC_007385	TTGA	2	8	15628	15635	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007385	CAAC	2	8	15806	15813	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_007385	ACTA	2	8	15926	15933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007385	ATGA	2	8	16066	16073	50 %	25 %	25 %	0 %	74314857
54	NC_007385	TCAG	2	8	16148	16155	25 %	25 %	25 %	25 %	74314857
55	NC_007385	AATA	2	8	16959	16966	75 %	25 %	0 %	0 %	74314859
56	NC_007385	TTTC	2	8	17129	17136	0 %	75 %	0 %	25 %	74314859
57	NC_007385	CAGA	2	8	17561	17568	50 %	0 %	25 %	25 %	74314859
58	NC_007385	AAAC	2	8	17710	17717	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007385	ACGA	2	8	17764	17771	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007385	ATGA	2	8	18525	18532	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007385	AAAT	2	8	18864	18871	75 %	25 %	0 %	0 %	74314861
62	NC_007385	AAGT	2	8	19386	19393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007385	TCAG	2	8	19859	19866	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_007385	GCAG	2	8	20114	20121	25 %	0 %	50 %	25 %	74314862
65	NC_007385	GCCT	2	8	20508	20515	0 %	25 %	25 %	50 %	74314863
66	NC_007385	GGCT	2	8	20606	20613	0 %	25 %	50 %	25 %	74314863
67	NC_007385	TCGC	2	8	22072	22079	0 %	25 %	25 %	50 %	74314864
68	NC_007385	CATT	2	8	22126	22133	25 %	50 %	0 %	25 %	74314864
69	NC_007385	GCTG	2	8	22639	22646	0 %	25 %	50 %	25 %	74314864
70	NC_007385	AGCC	2	8	22834	22841	25 %	0 %	25 %	50 %	74314864
71	NC_007385	AAAC	2	8	23158	23165	75 %	0 %	0 %	25 %	74314865
72	NC_007385	CAGC	2	8	23222	23229	25 %	0 %	25 %	50 %	74314865
73	NC_007385	ACGC	2	8	23401	23408	25 %	0 %	25 %	50 %	74314865
74	NC_007385	GGCA	2	8	25089	25096	25 %	0 %	50 %	25 %	74314866
75	NC_007385	TGTC	2	8	25590	25597	0 %	50 %	25 %	25 %	74314866
76	NC_007385	CAGA	2	8	25839	25846	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007385	CCGT	2	8	26350	26357	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007385	ATTC	2	8	26493	26500	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007385	TGCA	2	8	26560	26567	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007385	TAAG	2	8	26648	26655	50 %	25 %	25 %	0 %	74314868
81	NC_007385	GGAT	2	8	27528	27535	25 %	25 %	50 %	0 %	74314868
82	NC_007385	ACCG	2	8	27844	27851	25 %	0 %	25 %	50 %	74314869
83	NC_007385	ACAG	2	8	28025	28032	50 %	0 %	25 %	25 %	74314869
84	NC_007385	ACGT	2	8	28706	28713	25 %	25 %	25 %	25 %	74314869
85	NC_007385	CTGG	2	8	29183	29190	0 %	25 %	50 %	25 %	74314870
86	NC_007385	GGTT	2	8	29443	29450	0 %	50 %	50 %	0 %	74314870
87	NC_007385	GCCA	2	8	29628	29635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_007385	TCCT	2	8	29890	29897	0 %	50 %	0 %	50 %	74314871
89	NC_007385	GCAT	2	8	30161	30168	25 %	25 %	25 %	25 %	74314871
90	NC_007385	TCCA	2	8	30429	30436	25 %	25 %	0 %	50 %	74314871
91	NC_007385	TCCA	2	8	30555	30562	25 %	25 %	0 %	50 %	74314872
92	NC_007385	AATG	2	8	31106	31113	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007385	CAGT	2	8	31269	31276	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_007385	ACGG	2	8	31685	31692	25 %	0 %	50 %	25 %	74314873
95	NC_007385	GCCA	2	8	31721	31728	25 %	0 %	25 %	50 %	74314873
96	NC_007385	CGTC	2	8	31899	31906	0 %	25 %	25 %	50 %	74314873
97	NC_007385	GCTG	2	8	32210	32217	0 %	25 %	50 %	25 %	74314873
98	NC_007385	TCAA	2	8	32350	32357	50 %	25 %	0 %	25 %	74314873
99	NC_007385	CTGG	2	8	32668	32675	0 %	25 %	50 %	25 %	74314873
100	NC_007385	GTCA	2	8	32715	32722	25 %	25 %	25 %	25 %	74314873
101	NC_007385	GGCA	2	8	32906	32913	25 %	0 %	50 %	25 %	74314874
102	NC_007385	CTGG	2	8	33026	33033	0 %	25 %	50 %	25 %	74314874
103	NC_007385	CAAA	2	8	33354	33361	75 %	0 %	0 %	25 %	74314874
104	NC_007385	CCAC	2	8	33640	33647	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
105	NC_007385	CCAC	2	8	33997	34004	25 %	0 %	0 %	75 %	74314875
106	NC_007385	ATAC	2	8	34177	34184	50 %	25 %	0 %	25 %	74314875
107	NC_007385	GTAA	2	8	34364	34371	50 %	25 %	25 %	0 %	74314875
108	NC_007385	CCAC	2	8	34378	34385	25 %	0 %	0 %	75 %	74314875
109	NC_007385	TCTT	2	8	34620	34627	0 %	75 %	0 %	25 %	74314875
110	NC_007385	CCCG	2	8	35789	35796	0 %	0 %	25 %	75 %	74314877
111	NC_007385	TCCT	2	8	35833	35840	0 %	50 %	0 %	50 %	74314877
112	NC_007385	GCGG	2	8	35845	35852	0 %	0 %	75 %	25 %	74314877
113	NC_007385	TGCC	2	8	35988	35995	0 %	25 %	25 %	50 %	74314877
114	NC_007385	CGGC	2	8	36494	36501	0 %	0 %	50 %	50 %	74314877
115	NC_007385	GGAT	2	8	36776	36783	25 %	25 %	50 %	0 %	74314877
116	NC_007385	TCTT	2	8	37622	37629	0 %	75 %	0 %	25 %	74314878
117	NC_007385	AGAT	2	8	38108	38115	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007385	TTTA	2	8	38140	38147	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007385	GGCA	2	8	39103	39110	25 %	0 %	50 %	25 %	74314879
120	NC_007385	TGTC	2	8	39604	39611	0 %	50 %	25 %	25 %	74314879
121	NC_007385	CAGT	2	8	40154	40161	25 %	25 %	25 %	25 %	74314880
122	NC_007385	GAAG	2	8	40206	40213	50 %	0 %	50 %	0 %	74314880
123	NC_007385	ATAC	2	8	40938	40945	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007385	GCGT	2	8	42003	42010	0 %	25 %	50 %	25 %	74314883
125	NC_007385	GCTG	2	8	42182	42189	0 %	25 %	50 %	25 %	74314883
126	NC_007385	GTTT	2	8	42246	42253	0 %	75 %	25 %	0 %	74314883
127	NC_007385	TCCT	2	8	42698	42705	0 %	50 %	0 %	50 %	74314885
128	NC_007385	GCGG	2	8	42710	42717	0 %	0 %	75 %	25 %	74314885
129	NC_007385	TGCC	2	8	42853	42860	0 %	25 %	25 %	50 %	74314885
130	NC_007385	CGGC	2	8	43359	43366	0 %	0 %	50 %	50 %	74314885
131	NC_007385	GGAT	2	8	43641	43648	25 %	25 %	50 %	0 %	74314885
132	NC_007385	CGCC	2	8	44010	44017	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_007385	ATTA	2	8	44704	44711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007385	TACA	2	8	44806	44813	50 %	25 %	0 %	25 %	74314886
135	NC_007385	TTTC	2	8	45843	45850	0 %	75 %	0 %	25 %	74314886
136	NC_007385	AATA	2	8	46137	46144	75 %	25 %	0 %	0 %	74314886
137	NC_007385	ATCA	2	8	46403	46410	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_007385	ATAA	2	8	46531	46538	75 %	25 %	0 %	0 %	74314887
139	NC_007385	TGTC	2	8	46665	46672	0 %	50 %	25 %	25 %	74314887
140	NC_007385	AGTG	2	8	46773	46780	25 %	25 %	50 %	0 %	74314887
141	NC_007385	GACA	2	8	47137	47144	50 %	0 %	25 %	25 %	74314887
142	NC_007385	TTAT	2	8	47204	47211	25 %	75 %	0 %	0 %	74314887
143	NC_007385	GGAA	2	8	47445	47452	50 %	0 %	50 %	0 %	74314887
144	NC_007385	AATA	2	8	47544	47551	75 %	25 %	0 %	0 %	74314887
145	NC_007385	ACAG	2	8	47606	47613	50 %	0 %	25 %	25 %	74314887
146	NC_007385	TTGT	2	8	47890	47897	0 %	75 %	25 %	0 %	74314887
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