MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS_046

Total Repeats: 2752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007385	TGA	2	6	5	10	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007385	TGC	2	6	314	319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314840
3	NC_007385	CCG	2	6	415	420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314840
4	NC_007385	TTC	2	6	423	428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314840
5	NC_007385	CAA	2	6	433	438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314840
6	NC_007385	AAT	2	6	728	733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314839
7	NC_007385	TTG	2	6	774	779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314839
8	NC_007385	TCA	2	6	806	811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314839
9	NC_007385	GAT	2	6	928	933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314839
10	NC_007385	TAT	2	6	962	967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007385	AAT	2	6	1012	1017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007385	AAG	2	6	1098	1103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007385	ATG	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007385	ATA	2	6	1257	1262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314841
15	NC_007385	TCA	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314841
16	NC_007385	AGC	2	6	1298	1303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314841
17	NC_007385	ATG	2	6	1342	1347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314841
18	NC_007385	ACA	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314841
19	NC_007385	TAA	2	6	1486	1491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314841
20	NC_007385	ATG	3	9	1495	1503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314841
21	NC_007385	TGC	3	9	1514	1522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314841
22	NC_007385	TAA	2	6	1583	1588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314841
23	NC_007385	TCA	2	6	1622	1627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314841
24	NC_007385	CTG	2	6	1771	1776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314841
25	NC_007385	CTG	2	6	1969	1974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314841
26	NC_007385	AAG	2	6	1994	1999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314841
27	NC_007385	TAT	2	6	2018	2023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314841
28	NC_007385	TAA	2	6	2024	2029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314841
29	NC_007385	TAG	2	6	2101	2106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007385	ATC	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007385	ATA	2	6	2144	2149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007385	CAT	2	6	2185	2190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007385	ATT	2	6	2202	2207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007385	TTA	2	6	2231	2236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007385	ATC	2	6	2339	2344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007385	TCT	2	6	2388	2393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314842
37	NC_007385	CAA	2	6	2464	2469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314842
38	NC_007385	CCG	2	6	2497	2502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314842
39	NC_007385	AGT	2	6	2520	2525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314842
40	NC_007385	TAC	2	6	2608	2613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314842
41	NC_007385	GTT	2	6	2688	2693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314842
42	NC_007385	TAC	2	6	2702	2707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314842
43	NC_007385	GTT	2	6	3007	3012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314842
44	NC_007385	ATA	2	6	3023	3028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314842
45	NC_007385	GAA	2	6	3073	3078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314842
46	NC_007385	AGG	2	6	3173	3178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007385	CAC	2	6	3191	3196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_007385	TTA	2	6	3267	3272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007385	TGC	2	6	3273	3278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007385	GAT	2	6	3289	3294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007385	CAC	2	6	3352	3357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_007385	ATT	2	6	3608	3613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007385	TAG	2	6	3643	3648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007385	CTG	2	6	3878	3883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314844
55	NC_007385	CTG	2	6	4068	4073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314844
56	NC_007385	CGC	2	6	4125	4130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314844
57	NC_007385	GCA	2	6	4212	4217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314844
58	NC_007385	GGT	2	6	4337	4342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314844
59	NC_007385	GGC	2	6	4416	4421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314844
60	NC_007385	TCA	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314844
61	NC_007385	CTG	2	6	4452	4457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314844
62	NC_007385	ATC	2	6	4657	4662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314844
63	NC_007385	CAT	2	6	4825	4830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007385	TTG	2	6	4848	4853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007385	TGA	2	6	4959	4964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007385	TCC	2	6	5025	5030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_007385	GAA	2	6	5290	5295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007385	ATC	2	6	5325	5330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007385	GGT	2	6	5397	5402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007385	TTG	2	6	5438	5443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007385	TCT	2	6	5541	5546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314845
72	NC_007385	TAT	2	6	5593	5598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314845
73	NC_007385	TAC	2	6	5635	5640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314845
74	NC_007385	TTA	2	6	5669	5674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314845
75	NC_007385	ATA	2	6	5814	5819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314845
76	NC_007385	AAC	2	6	5912	5917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314845
77	NC_007385	AAT	2	6	5933	5938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314845
78	NC_007385	ACT	2	6	5953	5958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314845
79	NC_007385	TTA	2	6	5969	5974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314845
80	NC_007385	GCA	2	6	6191	6196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314845
81	NC_007385	AAT	2	6	6259	6264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314845
82	NC_007385	ATA	2	6	6390	6395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314845
83	NC_007385	ATC	2	6	6550	6555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314845
84	NC_007385	AAC	2	6	6655	6660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314845
85	NC_007385	TGG	2	6	6710	6715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314845
86	NC_007385	TAA	2	6	6783	6788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314845
87	NC_007385	AAG	2	6	6895	6900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314845
88	NC_007385	ATA	2	6	7094	7099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314845
89	NC_007385	TAT	2	6	7116	7121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314845
90	NC_007385	AGA	2	6	7201	7206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007385	CCT	2	6	7259	7264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_007385	AGG	2	6	7269	7274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007385	GAT	2	6	7324	7329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007385	GTG	2	6	7473	7478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007385	CAG	2	6	7509	7514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007385	GGT	2	6	7610	7615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007385	TCT	2	6	7626	7631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007385	ATC	2	6	7639	7644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314846
99	NC_007385	CTT	2	6	7789	7794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314846
100	NC_007385	TAA	2	6	7842	7847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314846
101	NC_007385	ATA	2	6	7982	7987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314846
102	NC_007385	CAA	2	6	8054	8059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314846
103	NC_007385	ATC	2	6	8400	8405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007385	TCT	2	6	8451	8456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007385	TGG	2	6	8464	8469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007385	CAG	2	6	8563	8568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314847
107	NC_007385	TTC	2	6	8669	8674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314847
108	NC_007385	GCC	2	6	8696	8701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314847
109	NC_007385	GAC	3	9	8898	8906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314847
110	NC_007385	CCA	2	6	8949	8954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74314847
111	NC_007385	GTT	2	6	8964	8969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314847
112	NC_007385	TGA	2	6	9224	9229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007385	ATC	2	6	9243	9248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007385	ACC	3	9	9268	9276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_007385	CTG	2	6	9329	9334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007385	TTG	2	6	9358	9363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007385	TCA	2	6	9481	9486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314848
118	NC_007385	TGC	2	6	9566	9571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314848
119	NC_007385	TAT	2	6	9599	9604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314848
120	NC_007385	TGA	2	6	9606	9611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314848
121	NC_007385	TTG	2	6	9729	9734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314848
122	NC_007385	TAT	2	6	9768	9773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314848
123	NC_007385	GCA	2	6	10084	10089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007385	ACT	2	6	10151	10156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007385	CTG	2	6	10160	10165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007385	CCG	2	6	10247	10252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_007385	TGA	2	6	10303	10308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007385	CCT	2	6	10321	10326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_007385	CCA	2	6	10414	10419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_007385	TCA	3	9	10422	10430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007385	AGC	2	6	10516	10521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007385	TAG	2	6	10544	10549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007385	CTG	2	6	10779	10784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314849
134	NC_007385	CTG	2	6	10969	10974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314849
135	NC_007385	CGC	2	6	11026	11031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314849
136	NC_007385	GCA	2	6	11113	11118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314849
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