MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS_046

Total Repeats: 4514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007385	CGC	2	6	24064	24069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314865
502	NC_007385	TAC	2	6	24095	24100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314865
503	NC_007385	GAC	2	6	24156	24161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314865
504	NC_007385	ATG	2	6	24182	24187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314865
505	NC_007385	C	6	6	24249	24254	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
506	NC_007385	CAT	2	6	24257	24262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_007385	TGA	2	6	24302	24307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_007385	CCA	2	6	24480	24485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_007385	AAC	2	6	24500	24505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314866
510	NC_007385	TCG	2	6	24706	24711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314866
511	NC_007385	A	6	6	24764	24769	100 %	0 %	0 %	0 %	74314866
512	NC_007385	CTG	2	6	24843	24848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314866
513	NC_007385	GGGCAT	2	12	24894	24905	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	74314866
514	NC_007385	GAT	2	6	24914	24919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314866
515	NC_007385	TCT	2	6	24952	24957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314866
516	NC_007385	CGT	2	6	25070	25075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314866
517	NC_007385	AGA	2	6	25081	25086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314866
518	NC_007385	GGCA	2	8	25089	25096	25 %	0 %	50 %	25 %	74314866
519	NC_007385	AGG	2	6	25125	25130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74314866
520	NC_007385	GTA	2	6	25157	25162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314866
521	NC_007385	TTA	2	6	25194	25199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314866
522	NC_007385	GCA	2	6	25320	25325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314866
523	NC_007385	A	6	6	25416	25421	100 %	0 %	0 %	0 %	74314866
524	NC_007385	CCCCG	2	10	25436	25445	0 %	0 %	20 %	80 %	74314866
525	NC_007385	TTG	2	6	25533	25538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314866
526	NC_007385	TGTC	2	8	25590	25597	0 %	50 %	25 %	25 %	74314866
527	NC_007385	CAA	2	6	25601	25606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314866
528	NC_007385	A	6	6	25623	25628	100 %	0 %	0 %	0 %	74314866
529	NC_007385	CGG	2	6	25697	25702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_007385	ATT	2	6	25802	25807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_007385	TCAAA	2	10	25812	25821	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
532	NC_007385	CAGA	2	8	25839	25846	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
533	NC_007385	TGG	2	6	25912	25917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_007385	CGT	2	6	25943	25948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_007385	ACA	2	6	25953	25958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_007385	ACA	2	6	25976	25981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_007385	GT	3	6	25994	25999	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_007385	ATG	2	6	26031	26036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_007385	TGG	2	6	26085	26090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_007385	ACGCA	2	10	26167	26176	40 %	0 %	20 %	40 %	74314867
541	NC_007385	AAC	2	6	26185	26190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314867
542	NC_007385	CCGT	2	8	26350	26357	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
543	NC_007385	GAA	2	6	26399	26404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_007385	TGT	2	6	26408	26413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_007385	GTG	3	9	26421	26429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_007385	ATT	2	6	26436	26441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_007385	ATTC	2	8	26493	26500	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
548	NC_007385	GAT	2	6	26502	26507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_007385	TAA	2	6	26508	26513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_007385	GC	3	6	26523	26528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
551	NC_007385	TGCA	2	8	26560	26567	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
552	NC_007385	T	8	8	26585	26592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_007385	TAA	2	6	26594	26599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_007385	TAAG	2	8	26648	26655	50 %	25 %	25 %	0 %	74314868
555	NC_007385	T	6	6	26735	26740	0 %	100 %	0 %	0 %	74314868
556	NC_007385	CTG	2	6	26759	26764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314868
557	NC_007385	CG	3	6	26786	26791	0 %	0 %	50 %	50 %	74314868
558	NC_007385	CAG	2	6	26852	26857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314868
559	NC_007385	GT	3	6	26984	26989	0 %	50 %	50 %	0 %	74314868
560	NC_007385	AGT	2	6	27001	27006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314868
561	NC_007385	CTG	2	6	27043	27048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314868
562	NC_007385	AGA	2	6	27051	27056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314868
563	NC_007385	TCA	2	6	27091	27096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314868
564	NC_007385	ACT	2	6	27113	27118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314868
565	NC_007385	ACCGC	2	10	27145	27154	20 %	0 %	20 %	60 %	74314868
566	NC_007385	ACT	2	6	27186	27191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314868
567	NC_007385	TTATG	2	10	27228	27237	20 %	60 %	20 %	0 %	74314868
568	NC_007385	GAC	2	6	27250	27255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314868
569	NC_007385	GAG	2	6	27289	27294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74314868
570	NC_007385	ACAAA	2	10	27306	27315	80 %	0 %	0 %	20 %	74314868
571	NC_007385	ATT	2	6	27337	27342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314868
572	NC_007385	TGC	2	6	27420	27425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314868
573	NC_007385	GCC	2	6	27450	27455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74314868
574	NC_007385	TTCCA	2	10	27469	27478	20 %	40 %	0 %	40 %	74314868
575	NC_007385	ATT	2	6	27517	27522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314868
576	NC_007385	GGAT	2	8	27528	27535	25 %	25 %	50 %	0 %	74314868
577	NC_007385	GGT	2	6	27631	27636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314868
578	NC_007385	GA	3	6	27676	27681	50 %	0 %	50 %	0 %	74314868
579	NC_007385	GCG	2	6	27683	27688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74314868
580	NC_007385	GTG	2	6	27737	27742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314868
581	NC_007385	GCA	2	6	27766	27771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314868
582	NC_007385	ACT	2	6	27821	27826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314868
583	NC_007385	ACCG	2	8	27844	27851	25 %	0 %	25 %	50 %	74314869
584	NC_007385	AAT	2	6	27885	27890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314869
585	NC_007385	GAA	2	6	27894	27899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314869
586	NC_007385	ACAG	2	8	28025	28032	50 %	0 %	25 %	25 %	74314869
587	NC_007385	ACA	2	6	28079	28084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74314869
588	NC_007385	CGT	2	6	28143	28148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314869
589	NC_007385	GCA	2	6	28152	28157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314869
590	NC_007385	GAT	2	6	28197	28202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314869
591	NC_007385	ATA	2	6	28261	28266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74314869
592	NC_007385	AG	3	6	28335	28340	50 %	0 %	50 %	0 %	74314869
593	NC_007385	AGC	2	6	28376	28381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314869
594	NC_007385	AT	3	6	28486	28491	50 %	50 %	0 %	0 %	74314869
595	NC_007385	TGA	2	6	28496	28501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314869
596	NC_007385	GAA	2	6	28508	28513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74314869
597	NC_007385	TTA	2	6	28534	28539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314869
598	NC_007385	CTG	2	6	28540	28545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314869
599	NC_007385	TAT	2	6	28580	28585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314869
600	NC_007385	ACGT	2	8	28706	28713	25 %	25 %	25 %	25 %	74314869
601	NC_007385	TTA	2	6	28874	28879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_007385	T	8	8	28883	28890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_007385	TCT	2	6	28929	28934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_007385	ATG	2	6	29024	29029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_007385	CTGG	2	8	29183	29190	0 %	25 %	50 %	25 %	74314870
606	NC_007385	ATG	2	6	29272	29277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314870
607	NC_007385	ACG	2	6	29338	29343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314870
608	NC_007385	T	6	6	29426	29431	0 %	100 %	0 %	0 %	74314870
609	NC_007385	GGTT	2	8	29443	29450	0 %	50 %	50 %	0 %	74314870
610	NC_007385	CTT	2	6	29490	29495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314870
611	NC_007385	GCA	2	6	29526	29531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74314870
612	NC_007385	GCCA	2	8	29628	29635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
613	NC_007385	ACA	2	6	29716	29721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_007385	CCG	2	6	29722	29727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_007385	CGAGT	2	10	29755	29764	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
616	NC_007385	GA	3	6	29771	29776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
617	NC_007385	GCT	2	6	29790	29795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_007385	GTA	2	6	29855	29860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314871
619	NC_007385	TCCT	2	8	29890	29897	0 %	50 %	0 %	50 %	74314871
620	NC_007385	GTA	2	6	30024	30029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74314871
621	NC_007385	CTT	2	6	30111	30116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314871
622	NC_007385	TGC	2	6	30141	30146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74314871
623	NC_007385	GCAT	2	8	30161	30168	25 %	25 %	25 %	25 %	74314871
624	NC_007385	TTC	2	6	30193	30198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314871
625	NC_007385	TTC	2	6	30340	30345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314871
626	NC_007385	TTG	2	6	30350	30355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74314871
627	NC_007385	TAC	2	6	30378	30383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74314871
628	NC_007385	TCCA	2	8	30429	30436	25 %	25 %	0 %	50 %	74314871
629	NC_007385	CAAAT	2	10	30437	30446	60 %	20 %	0 %	20 %	74314871
630	NC_007385	TTA	2	6	30517	30522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74314872
631	NC_007385	TCCA	2	8	30555	30562	25 %	25 %	0 %	50 %	74314872
632	NC_007385	GTG	2	6	30599	30604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74314872
633	NC_007385	TTC	2	6	30779	30784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74314872
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