MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_007384	CCT	2	6	194294	194299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_007384	GTG	2	6	194317	194322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_007384	A	6	6	194520	194525	100 %	0 %	0 %	0 %	74310781
4005	NC_007384	GCTG	2	8	194632	194639	0 %	25 %	50 %	25 %	74310781
4006	NC_007384	GTT	2	6	194670	194675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310781
4007	NC_007384	CTG	2	6	194727	194732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310781
4008	NC_007384	GTG	2	6	194745	194750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310781
4009	NC_007384	TGGC	2	8	194765	194772	0 %	25 %	50 %	25 %	74310781
4010	NC_007384	GCA	2	6	194861	194866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310781
4011	NC_007384	AGC	2	6	195022	195027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_007384	ATC	2	6	195031	195036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_007384	T	6	6	195150	195155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_007384	TAAA	2	8	195178	195185	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_007384	CTGC	2	8	195222	195229	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4016	NC_007384	ATT	2	6	195257	195262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_007384	TCT	2	6	195287	195292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_007384	TA	3	6	195298	195303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_007384	AGC	2	6	195346	195351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_007384	ATT	2	6	195383	195388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_007384	TTA	2	6	195405	195410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_007384	ATT	2	6	195577	195582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_007384	GCC	2	6	195589	195594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_007384	GACC	2	8	195620	195627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4025	NC_007384	GAA	2	6	195757	195762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_007384	A	7	7	195807	195813	100 %	0 %	0 %	0 %	74310782
4027	NC_007384	CT	3	6	195867	195872	0 %	50 %	0 %	50 %	74310782
4028	NC_007384	CGG	2	6	195877	195882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310782
4029	NC_007384	CTT	2	6	195889	195894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310782
4030	NC_007384	CAG	2	6	195909	195914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310782
4031	NC_007384	CGC	2	6	195997	196002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310782
4032	NC_007384	CAG	2	6	196020	196025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310782
4033	NC_007384	TTC	2	6	196026	196031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310782
4034	NC_007384	TGA	2	6	196034	196039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310782
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4036	NC_007384	GGC	3	9	196110	196118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310782
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4038	NC_007384	GTC	2	6	196179	196184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310782
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4040	NC_007384	TGT	2	6	196196	196201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310782
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4042	NC_007384	CGG	2	6	196577	196582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310782
4043	NC_007384	ATCGGT	2	12	196587	196598	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	74310782
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4054	NC_007384	GTGAT	2	10	197092	197101	20 %	40 %	40 %	0 %	74310782
4055	NC_007384	CAG	2	6	197115	197120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310782
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4058	NC_007384	TACGT	2	10	197337	197346	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4059	NC_007384	GGA	2	6	197374	197379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_007384	TGGC	3	12	197384	197395	0 %	25 %	50 %	25 %	161986590
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4063	NC_007384	GTC	2	6	197560	197565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986590
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4091	NC_007384	CGA	2	6	198841	198846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310784
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4095	NC_007384	TTC	2	6	199105	199110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_007384	A	6	6	199137	199142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_007384	GGC	2	6	199206	199211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986589
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4105	NC_007384	T	7	7	199601	199607	0 %	100 %	0 %	0 %	161986589
4106	NC_007384	G	6	6	199668	199673	0 %	0 %	100 %	0 %	161986589
4107	NC_007384	ATA	2	6	199716	199721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161986589
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4111	NC_007384	TCG	2	6	199947	199952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986589
4112	NC_007384	CAA	2	6	199966	199971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161986589
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4114	NC_007384	ATC	2	6	199985	199990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_007384	A	8	8	200003	200010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_007384	CGT	2	6	200019	200024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4124	NC_007384	CCG	2	6	200538	200543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310786
4125	NC_007384	TGG	2	6	200545	200550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310786
4126	NC_007384	CTT	2	6	200565	200570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310786
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4128	NC_007384	AG	3	6	200671	200676	50 %	0 %	50 %	0 %	74310786
4129	NC_007384	T	6	6	200686	200691	0 %	100 %	0 %	0 %	74310786
4130	NC_007384	T	6	6	200724	200729	0 %	100 %	0 %	0 %	74310786
4131	NC_007384	CAG	2	6	200755	200760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310786
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4134	NC_007384	CTG	2	6	200860	200865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310786
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4141	NC_007384	CGGT	2	8	201134	201141	0 %	25 %	50 %	25 %	74310787
4142	NC_007384	GAC	2	6	201201	201206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310787
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4154	NC_007384	TGG	2	6	201768	201773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310787
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4156	NC_007384	TGA	2	6	201849	201854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310787
4157	NC_007384	CCAG	2	8	201915	201922	25 %	0 %	25 %	50 %	74310787
4158	NC_007384	CGC	3	9	202005	202013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310787
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4160	NC_007384	CA	4	8	202087	202094	50 %	0 %	0 %	50 %	74310787
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4182	NC_007384	AGC	2	6	203180	203185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310787
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4184	NC_007384	TCAA	2	8	203387	203394	50 %	25 %	0 %	25 %	74310787
4185	NC_007384	TCA	2	6	203483	203488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310787
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4187	NC_007384	TCG	2	6	203637	203642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310788
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4206	NC_007384	CAA	2	6	204588	204593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4209	NC_007384	AC	4	8	204697	204704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4210	NC_007384	TA	3	6	204777	204782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4211	NC_007384	CAT	2	6	204911	204916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310789
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4217	NC_007384	AAGA	2	8	205185	205192	75 %	0 %	25 %	0 %	74310789
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4224	NC_007384	GGC	2	6	205563	205568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4226	NC_007384	GCG	2	6	205637	205642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4227	NC_007384	GTA	2	6	205677	205682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4230	NC_007384	ACTG	2	8	205855	205862	25 %	25 %	25 %	25 %	74310790
4231	NC_007384	AGC	2	6	205921	205926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310790
4232	NC_007384	A	6	6	205928	205933	100 %	0 %	0 %	0 %	74310790
4233	NC_007384	TGC	2	6	205945	205950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310790
4234	NC_007384	CAT	2	6	205990	205995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310790
4235	NC_007384	GACT	2	8	206014	206021	25 %	25 %	25 %	25 %	74310790
4236	NC_007384	GAA	3	9	206123	206131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310790
4237	NC_007384	CGC	2	6	206174	206179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310790
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4240	NC_007384	TGC	2	6	206296	206301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310790
4241	NC_007384	AAGC	2	8	206302	206309	50 %	0 %	25 %	25 %	74310790
4242	NC_007384	TCA	2	6	206316	206321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310790
4243	NC_007384	AGA	2	6	206326	206331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310790
4244	NC_007384	GAAA	2	8	206401	206408	75 %	0 %	25 %	0 %	74310790
4245	NC_007384	GAA	2	6	206437	206442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310790
4246	NC_007384	CGTT	2	8	206475	206482	0 %	50 %	25 %	25 %	74310790
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4248	NC_007384	GACT	2	8	206584	206591	25 %	25 %	25 %	25 %	74310790
4249	NC_007384	GCA	2	6	206594	206599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310790
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4373	NC_007384	GAA	2	6	212831	212836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4374	NC_007384	ATA	2	6	212840	212845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4375	NC_007384	GCT	2	6	212878	212883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310797
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4382	NC_007384	TTG	2	6	213393	213398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310797
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4403	NC_007384	GTT	2	6	214730	214735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310797
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4411	NC_007384	GTAGTG	2	12	215301	215312	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4483	NC_007384	GC	3	6	219522	219527	0 %	0 %	50 %	50 %	74310803
4484	NC_007384	CG	3	6	219627	219632	0 %	0 %	50 %	50 %	74310803
4485	NC_007384	CGA	2	6	219647	219652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310803
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4492	NC_007384	A	6	6	220130	220135	100 %	0 %	0 %	0 %	74310804
4493	NC_007384	GGC	3	9	220136	220144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310804
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4496	NC_007384	TGA	2	6	220280	220285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310804
4497	NC_007384	GGC	2	6	220307	220312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310804
4498	NC_007384	GCC	2	6	220377	220382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310804
4499	NC_007384	ATC	2	6	220389	220394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310804
4500	NC_007384	CTT	2	6	220434	220439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310804

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