MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007384	GAA	2	6	171123	171128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_007384	AAATT	2	10	171253	171262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_007384	AAAT	2	8	171285	171292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_007384	TAT	2	6	171352	171357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_007384	TTA	2	6	171388	171393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_007384	AG	3	6	171399	171404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_007384	ATAA	2	8	171441	171448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_007384	TGTA	2	8	171480	171487	25 %	50 %	25 %	0 %	74310763
3509	NC_007384	TTC	2	6	171568	171573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310763
3510	NC_007384	GCGT	2	8	171647	171654	0 %	25 %	50 %	25 %	74310763
3511	NC_007384	GCGA	2	8	171733	171740	25 %	0 %	50 %	25 %	74310763
3512	NC_007384	CGG	2	6	171755	171760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310763
3513	NC_007384	GAA	2	6	171814	171819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310763
3514	NC_007384	GCA	2	6	171865	171870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310763
3515	NC_007384	TGC	2	6	171899	171904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310763
3516	NC_007384	ACG	2	6	171941	171946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986592
3517	NC_007384	GAC	2	6	171964	171969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986592
3518	NC_007384	TGG	2	6	172028	172033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161986592
3519	NC_007384	CCA	2	6	172055	172060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161986592
3520	NC_007384	CAG	2	6	172148	172153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986592
3521	NC_007384	GCAACT	2	12	172189	172200	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	161986592
3522	NC_007384	CGT	2	6	172220	172225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986592
3523	NC_007384	CGT	2	6	172270	172275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986592
3524	NC_007384	CGT	2	6	172294	172299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986592
3525	NC_007384	TCT	2	6	172327	172332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161986592
3526	NC_007384	CAG	2	6	172343	172348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986592
3527	NC_007384	GGC	2	6	172364	172369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986592
3528	NC_007384	TTC	2	6	172422	172427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161986592
3529	NC_007384	GAT	2	6	172513	172518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986592
3530	NC_007384	CA	3	6	172522	172527	50 %	0 %	0 %	50 %	161986592
3531	NC_007384	TTC	2	6	172577	172582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161986592
3532	NC_007384	CAG	2	6	172610	172615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986592
3533	NC_007384	GCGAG	2	10	172620	172629	20 %	0 %	60 %	20 %	161986592
3534	NC_007384	GGC	2	6	172673	172678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986592
3535	NC_007384	CG	3	6	172688	172693	0 %	0 %	50 %	50 %	161986592
3536	NC_007384	ACGG	2	8	172790	172797	25 %	0 %	50 %	25 %	161986592
3537	NC_007384	TCT	2	6	172854	172859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161986592
3538	NC_007384	TGT	2	6	172876	172881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161986592
3539	NC_007384	GCA	2	6	172885	172890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986592
3540	NC_007384	GTG	2	6	172943	172948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161986592
3541	NC_007384	GGC	2	6	173023	173028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986592
3542	NC_007384	GGCGT	2	10	173058	173067	0 %	20 %	60 %	20 %	161986592
3543	NC_007384	CGC	3	9	173119	173127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986592
3544	NC_007384	CCAG	2	8	173131	173138	25 %	0 %	25 %	50 %	161986592
3545	NC_007384	TTG	2	6	173154	173159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161986592
3546	NC_007384	TGC	2	6	173214	173219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986592
3547	NC_007384	CAT	2	6	173346	173351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_007384	A	7	7	173359	173365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_007384	CGG	2	6	173433	173438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986591
3550	NC_007384	CTG	2	6	173457	173462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986591
3551	NC_007384	CTGC	2	8	173505	173512	0 %	25 %	25 %	50 %	161986591
3552	NC_007384	ATCAG	2	10	173696	173705	40 %	20 %	20 %	20 %	161986591
3553	NC_007384	ATC	2	6	173740	173745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986591
3554	NC_007384	AAC	2	6	173771	173776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161986591
3555	NC_007384	ATGA	2	8	173788	173795	50 %	25 %	25 %	0 %	161986591
3556	NC_007384	TCG	2	6	173819	173824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986591
3557	NC_007384	AAT	2	6	173830	173835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161986591
3558	NC_007384	TGC	2	6	173870	173875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986591
3559	NC_007384	ATG	2	6	173908	173913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986591
3560	NC_007384	CGT	2	6	173931	173936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986591
3561	NC_007384	TAA	2	6	173981	173986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161986591
3562	NC_007384	CGT	2	6	174030	174035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986591
3563	NC_007384	TCT	2	6	174143	174148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161986591
3564	NC_007384	CCAG	2	8	174156	174163	25 %	0 %	25 %	50 %	161986591
3565	NC_007384	GCG	2	6	174203	174208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986591
3566	NC_007384	AG	3	6	174212	174217	50 %	0 %	50 %	0 %	161986591
3567	NC_007384	TG	3	6	174266	174271	0 %	50 %	50 %	0 %	161986591
3568	NC_007384	A	6	6	174290	174295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_007384	AGCC	2	8	174348	174355	25 %	0 %	25 %	50 %	74310766
3570	NC_007384	CAGC	2	8	174375	174382	25 %	0 %	25 %	50 %	74310766
3571	NC_007384	GC	3	6	174415	174420	0 %	0 %	50 %	50 %	74310766
3572	NC_007384	T	6	6	174487	174492	0 %	100 %	0 %	0 %	74310766
3573	NC_007384	TCT	2	6	174498	174503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310766
3574	NC_007384	CTT	2	6	174561	174566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310766
3575	NC_007384	GCT	2	6	174602	174607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310766
3576	NC_007384	ACG	2	6	174676	174681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310766
3577	NC_007384	TTCA	2	8	174700	174707	25 %	50 %	0 %	25 %	74310766
3578	NC_007384	CTT	2	6	174792	174797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310766
3579	NC_007384	TG	3	6	174916	174921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_007384	TTAC	2	8	174967	174974	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3581	NC_007384	TAC	2	6	174977	174982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310767
3582	NC_007384	T	6	6	175000	175005	0 %	100 %	0 %	0 %	74310767
3583	NC_007384	CAG	2	6	175020	175025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310767
3584	NC_007384	C	6	6	175056	175061	0 %	0 %	0 %	100 %	74310767
3585	NC_007384	GC	3	6	175108	175113	0 %	0 %	50 %	50 %	74310767
3586	NC_007384	GCA	2	6	175140	175145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310767
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3588	NC_007384	GTTC	2	8	175248	175255	0 %	50 %	25 %	25 %	74310767
3589	NC_007384	AAAT	2	8	175449	175456	75 %	25 %	0 %	0 %	74310767
3590	NC_007384	AGTT	2	8	175474	175481	25 %	50 %	25 %	0 %	74310767
3591	NC_007384	GT	3	6	175487	175492	0 %	50 %	50 %	0 %	74310767
3592	NC_007384	A	6	6	175625	175630	100 %	0 %	0 %	0 %	74310767
3593	NC_007384	CG	3	6	175654	175659	0 %	0 %	50 %	50 %	74310767
3594	NC_007384	GA	3	6	175671	175676	50 %	0 %	50 %	0 %	74310767
3595	NC_007384	GCG	2	6	175724	175729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310768
3596	NC_007384	GAG	2	6	175756	175761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74310768
3597	NC_007384	GGC	2	6	175807	175812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310768
3598	NC_007384	AAC	2	6	175883	175888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310768
3599	NC_007384	GGC	2	6	175942	175947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310768
3600	NC_007384	ACCAC	2	10	175961	175970	40 %	0 %	0 %	60 %	74310768
3601	NC_007384	TCA	2	6	175996	176001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310768
3602	NC_007384	TCCG	2	8	176030	176037	0 %	25 %	25 %	50 %	74310768
3603	NC_007384	CGG	2	6	176111	176116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310768
3604	NC_007384	GT	3	6	176145	176150	0 %	50 %	50 %	0 %	74310768
3605	NC_007384	GC	3	6	176152	176157	0 %	0 %	50 %	50 %	74310768
3606	NC_007384	GAA	2	6	176274	176279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310769
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3608	NC_007384	TGC	2	6	176319	176324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310769
3609	NC_007384	TTAC	2	8	176338	176345	25 %	50 %	0 %	25 %	74310769
3610	NC_007384	CGC	2	6	176360	176365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310769
3611	NC_007384	TAT	2	6	176369	176374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310769
3612	NC_007384	CTG	2	6	176422	176427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310769
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3614	NC_007384	CGT	2	6	176470	176475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310769
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3622	NC_007384	CAA	2	6	176728	176733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310769
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3993	NC_007384	GAA	2	6	193875	193880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3994	NC_007384	GCG	2	6	193895	193900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3995	NC_007384	GTG	2	6	194027	194032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3996	NC_007384	TTA	2	6	194081	194086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3997	NC_007384	GAA	2	6	194094	194099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3998	NC_007384	CGA	2	6	194180	194185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3999	NC_007384	TG	3	6	194196	194201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4000	NC_007384	TGC	2	6	194219	194224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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