MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007384	TGC	2	6	146725	146730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310741
3002	NC_007384	GAT	2	6	146748	146753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310741
3003	NC_007384	A	6	6	146775	146780	100 %	0 %	0 %	0 %	74310741
3004	NC_007384	GATT	2	8	146798	146805	25 %	50 %	25 %	0 %	74310741
3005	NC_007384	TGA	2	6	146818	146823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310741
3006	NC_007384	CCG	3	9	146824	146832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310741
3007	NC_007384	GCT	2	6	146852	146857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310741
3008	NC_007384	TGGC	2	8	146897	146904	0 %	25 %	50 %	25 %	74310741
3009	NC_007384	CGCT	2	8	146937	146944	0 %	25 %	25 %	50 %	74310741
3010	NC_007384	CCA	2	6	146953	146958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310741
3011	NC_007384	GGT	2	6	146994	146999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310741
3012	NC_007384	GAGC	2	8	147023	147030	25 %	0 %	50 %	25 %	74310741
3013	NC_007384	TGG	2	6	147064	147069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310741
3014	NC_007384	ACA	2	6	147079	147084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310741
3015	NC_007384	GCCT	2	8	147220	147227	0 %	25 %	25 %	50 %	74310741
3016	NC_007384	ATG	2	6	147294	147299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310741
3017	NC_007384	GAT	2	6	147362	147367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310741
3018	NC_007384	CGG	2	6	147407	147412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310741
3019	NC_007384	CCA	2	6	147425	147430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310741
3020	NC_007384	GCG	3	9	147480	147488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310741
3021	NC_007384	ATG	2	6	147531	147536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310741
3022	NC_007384	CG	3	6	147609	147614	0 %	0 %	50 %	50 %	74310741
3023	NC_007384	CTG	2	6	147717	147722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310741
3024	NC_007384	GAT	2	6	147740	147745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310741
3025	NC_007384	TC	3	6	147793	147798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_007384	CAT	2	6	147819	147824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310742
3027	NC_007384	CAC	2	6	147895	147900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310742
3028	NC_007384	ACC	2	6	147943	147948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310742
3029	NC_007384	TGT	2	6	147990	147995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310742
3030	NC_007384	GC	3	6	147998	148003	0 %	0 %	50 %	50 %	74310742
3031	NC_007384	AGC	2	6	148021	148026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310742
3032	NC_007384	CCG	2	6	148044	148049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310742
3033	NC_007384	GCCC	2	8	148059	148066	0 %	0 %	25 %	75 %	74310742
3034	NC_007384	GCG	2	6	148128	148133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310742
3035	NC_007384	CAC	2	6	148153	148158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310742
3036	NC_007384	GCTG	2	8	148199	148206	0 %	25 %	50 %	25 %	74310742
3037	NC_007384	GCT	2	6	148317	148322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310742
3038	NC_007384	AAAC	2	8	148359	148366	75 %	0 %	0 %	25 %	74310742
3039	NC_007384	GGC	2	6	148478	148483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310742
3040	NC_007384	TGG	2	6	148508	148513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310742
3041	NC_007384	TGG	2	6	148545	148550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310742
3042	NC_007384	TCTT	2	8	148577	148584	0 %	75 %	0 %	25 %	74310742
3043	NC_007384	CGGA	2	8	148585	148592	25 %	0 %	50 %	25 %	74310742
3044	NC_007384	GCA	2	6	148640	148645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310742
3045	NC_007384	ACC	2	6	148676	148681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310742
3046	NC_007384	CGA	2	6	148694	148699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310742
3047	NC_007384	GTG	2	6	148816	148821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310742
3048	NC_007384	TAAAGG	2	12	149007	149018	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	74310742
3049	NC_007384	CAG	2	6	149074	149079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310742
3050	NC_007384	CAT	2	6	149313	149318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310742
3051	NC_007384	GAA	2	6	149325	149330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310742
3052	NC_007384	ACG	2	6	149335	149340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310742
3053	NC_007384	GGC	2	6	149476	149481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310742
3054	NC_007384	GCT	2	6	149580	149585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310742
3055	NC_007384	CTT	2	6	149613	149618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310742
3056	NC_007384	AGGC	2	8	149691	149698	25 %	0 %	50 %	25 %	74310742
3057	NC_007384	TAC	2	6	149802	149807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310742
3058	NC_007384	CAG	2	6	149815	149820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310742
3059	NC_007384	CCA	3	9	149823	149831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310742
3060	NC_007384	GAA	2	6	149902	149907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310742
3061	NC_007384	AGC	2	6	149984	149989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310742
3062	NC_007384	GCGCG	2	10	150009	150018	0 %	0 %	60 %	40 %	74310742
3063	NC_007384	CAC	2	6	150026	150031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310742
3064	NC_007384	GTA	2	6	150073	150078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310742
3065	NC_007384	GCC	2	6	150085	150090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310742
3066	NC_007384	CCAG	2	8	150099	150106	25 %	0 %	25 %	50 %	74310742
3067	NC_007384	TCG	2	6	150172	150177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310742
3068	NC_007384	TAG	2	6	150233	150238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_007384	AATT	2	8	150240	150247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_007384	TG	3	6	150261	150266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_007384	TCA	2	6	150271	150276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_007384	TTA	2	6	150288	150293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_007384	GAAT	2	8	150305	150312	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_007384	TTG	2	6	150344	150349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_007384	GTC	2	6	150471	150476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986596
3076	NC_007384	TGG	2	6	150519	150524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161986596
3077	NC_007384	CTG	2	6	150527	150532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986596
3078	NC_007384	TTTATG	2	12	150542	150553	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	161986596
3079	NC_007384	CCA	2	6	150630	150635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161986596
3080	NC_007384	TTG	2	6	150696	150701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161986596
3081	NC_007384	ATC	2	6	150707	150712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986596
3082	NC_007384	GCT	2	6	150787	150792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986596
3083	NC_007384	CCGTC	2	10	150800	150809	0 %	20 %	20 %	60 %	161986596
3084	NC_007384	GTGAA	2	10	150810	150819	40 %	20 %	40 %	0 %	161986596
3085	NC_007384	TGG	2	6	150864	150869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161986596
3086	NC_007384	GGCAT	2	10	150972	150981	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3087	NC_007384	GCA	2	6	151082	151087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310744
3088	NC_007384	CGT	2	6	151091	151096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310744
3089	NC_007384	TGG	2	6	151160	151165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310744
3090	NC_007384	GTTCA	2	10	151197	151206	20 %	40 %	20 %	20 %	74310744
3091	NC_007384	CA	3	6	151205	151210	50 %	0 %	0 %	50 %	74310744
3092	NC_007384	GCA	2	6	151283	151288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310744
3093	NC_007384	GTT	2	6	151293	151298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310744
3094	NC_007384	CGG	2	6	151325	151330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310744
3095	NC_007384	CGC	3	9	151337	151345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310744
3096	NC_007384	ATA	2	6	151363	151368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310744
3097	NC_007384	ATCCA	2	10	151523	151532	40 %	20 %	0 %	40 %	74310744
3098	NC_007384	A	6	6	151569	151574	100 %	0 %	0 %	0 %	74310744
3099	NC_007384	CCA	2	6	151589	151594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310744
3100	NC_007384	TTG	2	6	151615	151620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310744
3101	NC_007384	TGA	2	6	151622	151627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310744
3102	NC_007384	AAT	2	6	151669	151674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_007384	GTAAG	2	10	151736	151745	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_007384	A	7	7	151785	151791	100 %	0 %	0 %	0 %	74310745
3105	NC_007384	GGC	2	6	151800	151805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310745
3106	NC_007384	TAT	2	6	151901	151906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310745
3107	NC_007384	CT	3	6	151910	151915	0 %	50 %	0 %	50 %	74310745
3108	NC_007384	TAAA	2	8	151918	151925	75 %	25 %	0 %	0 %	74310745
3109	NC_007384	CGGG	2	8	151931	151938	0 %	0 %	75 %	25 %	74310745
3110	NC_007384	GCA	2	6	152039	152044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310745
3111	NC_007384	CAGG	2	8	152058	152065	25 %	0 %	50 %	25 %	74310745
3112	NC_007384	TAC	2	6	152067	152072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310745
3113	NC_007384	AAC	2	6	152119	152124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310745
3114	NC_007384	AACG	2	8	152145	152152	50 %	0 %	25 %	25 %	74310745
3115	NC_007384	ACT	2	6	152222	152227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310745
3116	NC_007384	CGA	2	6	152234	152239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310745
3117	NC_007384	ACCG	2	8	152240	152247	25 %	0 %	25 %	50 %	74310745
3118	NC_007384	CGC	2	6	152268	152273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310745
3119	NC_007384	CAC	2	6	152312	152317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310745
3120	NC_007384	CAT	2	6	152318	152323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310745
3121	NC_007384	CAC	2	6	152327	152332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310745
3122	NC_007384	AC	3	6	152331	152336	50 %	0 %	0 %	50 %	74310745
3123	NC_007384	GAA	2	6	152343	152348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310745
3124	NC_007384	ATT	2	6	152376	152381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310745
3125	NC_007384	TGG	2	6	152395	152400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310745
3126	NC_007384	GCT	2	6	152420	152425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310745
3127	NC_007384	TGC	2	6	152539	152544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310745
3128	NC_007384	TGTT	2	8	152638	152645	0 %	75 %	25 %	0 %	74310745
3129	NC_007384	ATG	2	6	152678	152683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310745
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3133	NC_007384	ATG	2	6	152879	152884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310746
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3140	NC_007384	TGTT	2	8	153030	153037	0 %	75 %	25 %	0 %	74310746
3141	NC_007384	T	6	6	153065	153070	0 %	100 %	0 %	0 %	74310746
3142	NC_007384	CGG	2	6	153123	153128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310746
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3145	NC_007384	TGGG	2	8	153228	153235	0 %	25 %	75 %	0 %	74310746
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3151	NC_007384	GAG	2	6	153479	153484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3152	NC_007384	CAA	2	6	153508	153513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3153	NC_007384	AGG	2	6	153541	153546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3154	NC_007384	A	6	6	153616	153621	100 %	0 %	0 %	0 %	74310747
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3164	NC_007384	GTT	2	6	154031	154036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3165	NC_007384	T	6	6	154050	154055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3232	NC_007384	TCC	2	6	157751	157756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74310751
3233	NC_007384	GAC	3	9	157825	157833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310751
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3235	NC_007384	TAG	2	6	157896	157901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310751
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3239	NC_007384	CG	3	6	158064	158069	0 %	0 %	50 %	50 %	74310752
3240	NC_007384	CCG	2	6	158119	158124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310752
3241	NC_007384	CGT	2	6	158138	158143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310752
3242	NC_007384	GCCAAT	2	12	158181	158192	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	74310752
3243	NC_007384	CCAGCA	2	12	158249	158260	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	74310752
3244	NC_007384	CGC	2	6	158321	158326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310752
3245	NC_007384	ACTG	2	8	158359	158366	25 %	25 %	25 %	25 %	74310752
3246	NC_007384	GCG	2	6	158488	158493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310752
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