MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007384	ATT	2	6	24347	24352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310637
502	NC_007384	TTG	3	9	24353	24361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310637
503	NC_007384	AT	3	6	24371	24376	50 %	50 %	0 %	0 %	74310637
504	NC_007384	TTG	2	6	24426	24431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310637
505	NC_007384	TGC	2	6	24509	24514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310637
506	NC_007384	ATG	2	6	24534	24539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_007384	CCT	2	6	24584	24589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_007384	GTG	2	6	24607	24612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_007384	A	6	6	24810	24815	100 %	0 %	0 %	0 %	74310638
510	NC_007384	GCTG	2	8	24922	24929	0 %	25 %	50 %	25 %	74310638
511	NC_007384	GTT	2	6	24960	24965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310638
512	NC_007384	CTG	2	6	25017	25022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310638
513	NC_007384	GTG	2	6	25035	25040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310638
514	NC_007384	TGGC	2	8	25055	25062	0 %	25 %	50 %	25 %	74310638
515	NC_007384	GCA	2	6	25151	25156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310638
516	NC_007384	ATC	2	6	25276	25281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310639
517	NC_007384	C	6	6	25281	25286	0 %	0 %	0 %	100 %	74310639
518	NC_007384	CTC	2	6	25321	25326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74310639
519	NC_007384	TAT	2	6	25332	25337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310639
520	NC_007384	TCA	2	6	25340	25345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310639
521	NC_007384	TGGC	2	8	25352	25359	0 %	25 %	50 %	25 %	74310639
522	NC_007384	ATT	2	6	25477	25482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310639
523	NC_007384	ATA	2	6	25496	25501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310639
524	NC_007384	T	6	6	25517	25522	0 %	100 %	0 %	0 %	74310639
525	NC_007384	ATC	2	6	25540	25545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310639
526	NC_007384	TGA	2	6	25556	25561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310639
527	NC_007384	GGC	2	6	25627	25632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310639
528	NC_007384	TAT	2	6	25668	25673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_007384	ATT	2	6	25711	25716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_007384	TAC	2	6	25722	25727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_007384	GTT	2	6	25837	25842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_007384	ATT	2	6	25843	25848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_007384	T	6	6	25865	25870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_007384	TGA	2	6	25889	25894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_007384	CTT	2	6	25927	25932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_007384	AAG	2	6	25936	25941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_007384	CAT	2	6	25952	25957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_007384	T	6	6	26000	26005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_007384	TAA	2	6	26023	26028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_007384	TCA	2	6	26029	26034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_007384	CTTT	2	8	26061	26068	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
542	NC_007384	TGA	2	6	26083	26088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310640
543	NC_007384	T	6	6	26095	26100	0 %	100 %	0 %	0 %	74310640
544	NC_007384	TGA	2	6	26148	26153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310640
545	NC_007384	TTA	2	6	26179	26184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310640
546	NC_007384	CAT	2	6	26198	26203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310640
547	NC_007384	TCA	2	6	26275	26280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310640
548	NC_007384	ATA	2	6	26362	26367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310640
549	NC_007384	T	6	6	26383	26388	0 %	100 %	0 %	0 %	74310640
550	NC_007384	T	7	7	26426	26432	0 %	100 %	0 %	0 %	74310640
551	NC_007384	GTT	2	6	26442	26447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310640
552	NC_007384	AT	3	6	26498	26503	50 %	50 %	0 %	0 %	74310640
553	NC_007384	ACA	2	6	26514	26519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310640
554	NC_007384	ATA	2	6	26523	26528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310640
555	NC_007384	TATTAA	2	12	26585	26596	50 %	50 %	0 %	0 %	74310640
556	NC_007384	TAT	2	6	26651	26656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310640
557	NC_007384	TAA	2	6	26661	26666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310640
558	NC_007384	TAT	2	6	26684	26689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310640
559	NC_007384	GAC	2	6	26706	26711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310640
560	NC_007384	TTA	2	6	26719	26724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310640
561	NC_007384	TAAA	2	8	26786	26793	75 %	25 %	0 %	0 %	74310640
562	NC_007384	ATT	2	6	26851	26856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310640
563	NC_007384	ATC	2	6	26865	26870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310640
564	NC_007384	GAG	2	6	26878	26883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74310640
565	NC_007384	ATTGC	2	10	26892	26901	20 %	40 %	20 %	20 %	74310640
566	NC_007384	T	8	8	26926	26933	0 %	100 %	0 %	0 %	74310640
567	NC_007384	T	7	7	26966	26972	0 %	100 %	0 %	0 %	74310640
568	NC_007384	TGA	2	6	27013	27018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310640
569	NC_007384	TA	3	6	27068	27073	50 %	50 %	0 %	0 %	74310640
570	NC_007384	A	6	6	27109	27114	100 %	0 %	0 %	0 %	74310640
571	NC_007384	TCA	2	6	27181	27186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310640
572	NC_007384	A	6	6	27225	27230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_007384	TC	3	6	27279	27284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_007384	A	7	7	27299	27305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_007384	TGA	2	6	27306	27311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_007384	A	6	6	27347	27352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_007384	TCA	2	6	27354	27359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_007384	TATT	2	8	27424	27431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_007384	CAT	2	6	27436	27441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_007384	CTA	2	6	27442	27447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_007384	TGA	2	6	27513	27518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_007384	TTAAT	2	10	27526	27535	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_007384	ACT	2	6	27551	27556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_007384	TTG	2	6	27618	27623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_007384	ATT	2	6	27627	27632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_007384	TAA	2	6	27642	27647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_007384	GT	3	6	27893	27898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
588	NC_007384	TC	3	6	27899	27904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
589	NC_007384	CAT	2	6	27908	27913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_007384	AGC	2	6	27917	27922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_007384	A	8	8	27929	27936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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595	NC_007384	TGA	2	6	28148	28153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310641
596	NC_007384	CAT	2	6	28161	28166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310641
597	NC_007384	GC	3	6	28213	28218	0 %	0 %	50 %	50 %	74310641
598	NC_007384	CTT	2	6	28308	28313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_007384	GCA	2	6	28431	28436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310642
600	NC_007384	TTC	2	6	28447	28452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310642
601	NC_007384	CTT	2	6	28484	28489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310642
602	NC_007384	CATA	2	8	28590	28597	50 %	25 %	0 %	25 %	74310643
603	NC_007384	AAG	2	6	28616	28621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310643
604	NC_007384	GT	3	6	28623	28628	0 %	50 %	50 %	0 %	74310643
605	NC_007384	CG	3	6	28669	28674	0 %	0 %	50 %	50 %	74310643
606	NC_007384	GAA	2	6	28693	28698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310643
607	NC_007384	GCGCAA	2	12	28701	28712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310643
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609	NC_007384	TGCG	2	8	28846	28853	0 %	25 %	50 %	25 %	74310643
610	NC_007384	TCA	2	6	28892	28897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310643
611	NC_007384	TCT	2	6	28902	28907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310643
612	NC_007384	GAT	2	6	28945	28950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310643
613	NC_007384	TTA	2	6	28987	28992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310643
614	NC_007384	GCGT	2	8	29054	29061	0 %	25 %	50 %	25 %	74310643
615	NC_007384	AGC	2	6	29065	29070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310643
616	NC_007384	TCTGGC	2	12	29103	29114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310643
617	NC_007384	TGA	2	6	29166	29171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310643
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619	NC_007384	AGT	2	6	29391	29396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310643
620	NC_007384	A	7	7	29404	29410	100 %	0 %	0 %	0 %	74310643
621	NC_007384	AGC	2	6	29420	29425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310643
622	NC_007384	TGA	2	6	29466	29471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310643
623	NC_007384	CCGC	2	8	29477	29484	0 %	0 %	25 %	75 %	74310643
624	NC_007384	T	6	6	29488	29493	0 %	100 %	0 %	0 %	74310643
625	NC_007384	TGA	2	6	29555	29560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310644
626	NC_007384	TGA	3	9	29655	29663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310644
627	NC_007384	CAT	2	6	29673	29678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310644
628	NC_007384	A	6	6	29689	29694	100 %	0 %	0 %	0 %	74310644
629	NC_007384	A	7	7	29698	29704	100 %	0 %	0 %	0 %	74310644
630	NC_007384	ATG	2	6	29717	29722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310644
631	NC_007384	CCT	2	6	29725	29730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74310644
632	NC_007384	GCA	2	6	29741	29746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310644
633	NC_007384	CTGG	2	8	29834	29841	0 %	25 %	50 %	25 %	74310644
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