MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_007384	AGC	2	6	320677	320682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310889
6502	NC_007384	TC	3	6	320746	320751	0 %	50 %	0 %	50 %	74310889
6503	NC_007384	AG	3	6	320786	320791	50 %	0 %	50 %	0 %	74310889
6504	NC_007384	ACA	2	6	320857	320862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310889
6505	NC_007384	CAA	2	6	320864	320869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310889
6506	NC_007384	GGA	2	6	320915	320920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74310889
6507	NC_007384	GCT	3	9	320969	320977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310889
6508	NC_007384	TGG	2	6	321070	321075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310889
6509	NC_007384	ACTT	2	8	321087	321094	25 %	50 %	0 %	25 %	74310889
6510	NC_007384	AAT	2	6	321095	321100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310889
6511	NC_007384	AATG	2	8	321292	321299	50 %	25 %	25 %	0 %	74310889
6512	NC_007384	CTG	2	6	321345	321350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310889
6513	NC_007384	GTC	2	6	321414	321419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310889
6514	NC_007384	GAC	2	6	321434	321439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310889
6515	NC_007384	CTC	2	6	321440	321445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74310889
6516	NC_007384	AG	3	6	321476	321481	50 %	0 %	50 %	0 %	74310889
6517	NC_007384	GCC	2	6	321509	321514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310889
6518	NC_007384	TCCT	2	8	321658	321665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6519	NC_007384	TAA	2	6	321691	321696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310890
6520	NC_007384	CCG	2	6	321832	321837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310890
6521	NC_007384	AT	3	6	321940	321945	50 %	50 %	0 %	0 %	74310890
6522	NC_007384	A	7	7	321947	321953	100 %	0 %	0 %	0 %	74310890
6523	NC_007384	ACA	2	6	322012	322017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_007384	TTA	2	6	322066	322071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_007384	CAGA	2	8	322095	322102	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6526	NC_007384	TGA	2	6	322111	322116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_007384	CGG	2	6	322175	322180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310891
6528	NC_007384	CAT	2	6	322207	322212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310891
6529	NC_007384	CTG	2	6	322328	322333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310891
6530	NC_007384	CA	3	6	322396	322401	50 %	0 %	0 %	50 %	74310891
6531	NC_007384	CCA	2	6	322549	322554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310891
6532	NC_007384	GTCTG	2	10	322609	322618	0 %	40 %	40 %	20 %	74310891
6533	NC_007384	TAA	2	6	322717	322722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310891
6534	NC_007384	CGT	2	6	322781	322786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310891
6535	NC_007384	ATC	2	6	322833	322838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310891
6536	NC_007384	GCT	2	6	322844	322849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310891
6537	NC_007384	A	7	7	322851	322857	100 %	0 %	0 %	0 %	74310891
6538	NC_007384	GCC	2	6	322906	322911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6539	NC_007384	CAG	2	6	322924	322929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_007384	CCA	2	6	322956	322961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6541	NC_007384	CAG	2	6	323044	323049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_007384	CCAG	2	8	323104	323111	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6543	NC_007384	GCA	2	6	323133	323138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_007384	TCG	2	6	323150	323155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_007384	CTT	2	6	323199	323204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_007384	TGG	2	6	323223	323228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_007384	TCA	2	6	323253	323258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_007384	TCT	2	6	323259	323264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_007384	TAA	2	6	323335	323340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310892
6550	NC_007384	GCG	2	6	323386	323391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310892
6551	NC_007384	CAA	2	6	323546	323551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310892
6552	NC_007384	GCG	2	6	323560	323565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310892
6553	NC_007384	CGG	2	6	323673	323678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310892
6554	NC_007384	GCG	2	6	323786	323791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310892
6555	NC_007384	TGA	2	6	323804	323809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310892
6556	NC_007384	GATC	2	8	323906	323913	25 %	25 %	25 %	25 %	74310892
6557	NC_007384	CAC	2	6	324078	324083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310892
6558	NC_007384	CCA	2	6	324176	324181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310892
6559	NC_007384	TCA	2	6	324267	324272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310893
6560	NC_007384	TGGCGG	2	12	324315	324326	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	74310893
6561	NC_007384	CAA	2	6	324327	324332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310893
6562	NC_007384	CAC	2	6	324349	324354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310893
6563	NC_007384	GAC	2	6	324390	324395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310893
6564	NC_007384	CGT	2	6	324423	324428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310893
6565	NC_007384	CAC	2	6	324463	324468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310893
6566	NC_007384	TGAA	2	8	324470	324477	50 %	25 %	25 %	0 %	74310893
6567	NC_007384	CG	3	6	324490	324495	0 %	0 %	50 %	50 %	74310893
6568	NC_007384	CTG	2	6	324499	324504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310893
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6572	NC_007384	CCG	2	6	324680	324685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310893
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6583	NC_007384	CG	3	6	325046	325051	0 %	0 %	50 %	50 %	74310893
6584	NC_007384	GCA	2	6	325101	325106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310893
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6591	NC_007384	AGC	2	6	325479	325484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310893
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6593	NC_007384	CCGA	2	8	325673	325680	25 %	0 %	25 %	50 %	74310893
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6600	NC_007384	TTA	2	6	325986	325991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_007384	TAAA	2	8	325999	326006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_007384	GCT	2	6	326030	326035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6603	NC_007384	CAC	2	6	326060	326065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6604	NC_007384	GCG	2	6	326069	326074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6605	NC_007384	CTG	2	6	326076	326081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6606	NC_007384	CCG	2	6	326108	326113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6607	NC_007384	GGC	2	6	326201	326206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6608	NC_007384	GCT	2	6	326210	326215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6609	NC_007384	TGG	2	6	326278	326283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6611	NC_007384	CTGG	2	8	326378	326385	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6612	NC_007384	GCC	2	6	326430	326435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6613	NC_007384	TGA	2	6	326444	326449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_007384	GC	6	12	326493	326504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6615	NC_007384	AGG	2	6	326542	326547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_007384	AGA	2	6	326548	326553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_007384	AAC	2	6	326584	326589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6618	NC_007384	GAA	2	6	326694	326699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_007384	TGG	2	6	326722	326727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_007384	GCG	2	6	326740	326745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6621	NC_007384	AG	3	6	326811	326816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_007384	GTG	2	6	326827	326832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_007384	GTG	2	6	326902	326907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310894
6624	NC_007384	GCCA	2	8	326914	326921	25 %	0 %	25 %	50 %	74310894
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