MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_007384	TTG	2	6	269932	269937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_007384	GGT	2	6	269940	269945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_007384	ATT	2	6	269953	269958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310847
5505	NC_007384	T	6	6	269966	269971	0 %	100 %	0 %	0 %	74310847
5506	NC_007384	TGC	2	6	269980	269985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310847
5507	NC_007384	CAG	2	6	270002	270007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310847
5508	NC_007384	TGG	2	6	270015	270020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310847
5509	NC_007384	TTCC	2	8	270025	270032	0 %	50 %	0 %	50 %	74310847
5510	NC_007384	CGG	2	6	270122	270127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310847
5511	NC_007384	TGG	2	6	270165	270170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310847
5512	NC_007384	GCG	2	6	270202	270207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310847
5513	NC_007384	GTC	2	6	270248	270253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310847
5514	NC_007384	CGG	2	6	270280	270285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310847
5515	NC_007384	ATTGGT	2	12	270302	270313	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	74310847
5516	NC_007384	CAG	2	6	270326	270331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310847
5517	NC_007384	T	7	7	270406	270412	0 %	100 %	0 %	0 %	74310847
5518	NC_007384	CTG	2	6	270559	270564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310848
5519	NC_007384	TTC	2	6	270580	270585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310848
5520	NC_007384	TAA	2	6	270587	270592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310848
5521	NC_007384	CAT	2	6	270618	270623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310848
5522	NC_007384	GCG	2	6	270649	270654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310848
5523	NC_007384	GCG	2	6	270667	270672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310848
5524	NC_007384	CAG	2	6	270673	270678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310848
5525	NC_007384	CAG	2	6	270700	270705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310848
5526	NC_007384	CTT	2	6	270741	270746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310848
5527	NC_007384	GTG	2	6	270748	270753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310848
5528	NC_007384	CGG	3	9	270780	270788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310848
5529	NC_007384	GCC	2	6	270791	270796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310848
5530	NC_007384	GCT	3	9	270915	270923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310848
5531	NC_007384	CCT	2	6	270969	270974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74310848
5532	NC_007384	ATC	2	6	270982	270987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310848
5533	NC_007384	TCG	2	6	270992	270997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310848
5534	NC_007384	GCC	2	6	271018	271023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310848
5535	NC_007384	CGT	2	6	271083	271088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310848
5536	NC_007384	GGC	2	6	271118	271123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310848
5537	NC_007384	C	6	6	271147	271152	0 %	0 %	0 %	100 %	74310848
5538	NC_007384	CTG	2	6	271606	271611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310848
5539	NC_007384	CTG	2	6	271660	271665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310848
5540	NC_007384	TG	3	6	271664	271669	0 %	50 %	50 %	0 %	74310848
5541	NC_007384	ACAG	2	8	271671	271678	50 %	0 %	25 %	25 %	74310848
5542	NC_007384	CGC	2	6	271681	271686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310848
5543	NC_007384	CCGC	3	12	271683	271694	0 %	0 %	25 %	75 %	74310848
5544	NC_007384	TTC	2	6	271813	271818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310849
5545	NC_007384	CCAGC	2	10	271840	271849	20 %	0 %	20 %	60 %	74310849
5546	NC_007384	AG	3	6	271993	271998	50 %	0 %	50 %	0 %	74310849
5547	NC_007384	CCG	2	6	272375	272380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310849
5548	NC_007384	CCAGG	2	10	272497	272506	20 %	0 %	40 %	40 %	74310849
5549	NC_007384	TAA	2	6	272516	272521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310849
5550	NC_007384	GGT	3	9	272560	272568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310849
5551	NC_007384	AAGGC	2	10	272624	272633	40 %	0 %	40 %	20 %	74310849
5552	NC_007384	TCG	2	6	272672	272677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310849
5553	NC_007384	A	7	7	272743	272749	100 %	0 %	0 %	0 %	74310849
5554	NC_007384	TGC	2	6	272839	272844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310849
5555	NC_007384	AGCC	2	8	273015	273022	25 %	0 %	25 %	50 %	74310850
5556	NC_007384	TGT	2	6	273094	273099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310850
5557	NC_007384	GCCGT	2	10	273104	273113	0 %	20 %	40 %	40 %	74310850
5558	NC_007384	GAT	2	6	273119	273124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310850
5559	NC_007384	CGGG	2	8	273261	273268	0 %	0 %	75 %	25 %	74310850
5560	NC_007384	T	6	6	273298	273303	0 %	100 %	0 %	0 %	74310850
5561	NC_007384	GC	3	6	273561	273566	0 %	0 %	50 %	50 %	74310850
5562	NC_007384	T	6	6	273597	273602	0 %	100 %	0 %	0 %	74310850
5563	NC_007384	CAC	2	6	273627	273632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310850
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5570	NC_007384	GCA	2	6	273962	273967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310850
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5572	NC_007384	ATAA	2	8	274073	274080	75 %	25 %	0 %	0 %	74310850
5573	NC_007384	GTC	2	6	274101	274106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310850
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5577	NC_007384	GCA	2	6	274307	274312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310850
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5582	NC_007384	CAG	2	6	274539	274544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310850
5583	NC_007384	CAG	2	6	274611	274616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310850
5584	NC_007384	TTC	2	6	274644	274649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310850
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5587	NC_007384	CTGC	2	8	274811	274818	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5588	NC_007384	TCA	2	6	274912	274917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_007384	ACCGG	2	10	274947	274956	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5590	NC_007384	GAAT	2	8	275002	275009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_007384	GT	3	6	275095	275100	0 %	50 %	50 %	0 %	74310851
5592	NC_007384	GC	3	6	275233	275238	0 %	0 %	50 %	50 %	74310851
5593	NC_007384	CAG	2	6	275261	275266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310851
5594	NC_007384	CT	3	6	275313	275318	0 %	50 %	0 %	50 %	74310851
5595	NC_007384	CTTT	2	8	275332	275339	0 %	75 %	0 %	25 %	74310851
5596	NC_007384	GTT	2	6	275351	275356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310851
5597	NC_007384	TGA	3	9	275393	275401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310851
5598	NC_007384	GCC	2	6	275652	275657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5599	NC_007384	GC	3	6	275890	275895	0 %	0 %	50 %	50 %	74310852
5600	NC_007384	GGA	2	6	275991	275996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74310852
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5602	NC_007384	GCA	2	6	276041	276046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310852
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5605	NC_007384	CTG	2	6	276294	276299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310852
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5607	NC_007384	GAT	2	6	276315	276320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310852
5608	NC_007384	CATC	2	8	276323	276330	25 %	25 %	0 %	50 %	74310852
5609	NC_007384	GGC	2	6	276332	276337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310852
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5613	NC_007384	ACGG	2	8	276759	276766	25 %	0 %	50 %	25 %	74310853
5614	NC_007384	ACC	2	6	276786	276791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310853
5615	NC_007384	AG	3	6	276809	276814	50 %	0 %	50 %	0 %	74310853
5616	NC_007384	TG	3	6	276838	276843	0 %	50 %	50 %	0 %	74310853
5617	NC_007384	GTG	2	6	276878	276883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_007384	TTAT	2	8	276885	276892	25 %	75 %	0 %	0 %	74310854
5619	NC_007384	CAGT	2	8	277004	277011	25 %	25 %	25 %	25 %	74310854
5620	NC_007384	ATC	2	6	277077	277082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310854
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5623	NC_007384	AT	3	6	277334	277339	50 %	50 %	0 %	0 %	74310854
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