MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 97740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_007384	CGG	2	6	220442	220447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310804
4502	NC_007384	GC	3	6	220489	220494	0 %	0 %	50 %	50 %	74310804
4503	NC_007384	GT	3	6	220505	220510	0 %	50 %	50 %	0 %	74310804
4504	NC_007384	GAA	2	6	220521	220526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310804
4505	NC_007384	GAA	2	6	220578	220583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310804
4506	NC_007384	CGG	2	6	220597	220602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310804
4507	NC_007384	GC	3	6	220617	220622	0 %	0 %	50 %	50 %	74310804
4508	NC_007384	CGT	2	6	220631	220636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310804
4509	NC_007384	ACG	2	6	220645	220650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310804
4510	NC_007384	CAG	2	6	220664	220669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310804
4511	NC_007384	ACG	2	6	220705	220710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310804
4512	NC_007384	CGA	2	6	220721	220726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310804
4513	NC_007384	CGC	2	6	220750	220755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310804
4514	NC_007384	AT	3	6	220760	220765	50 %	50 %	0 %	0 %	74310804
4515	NC_007384	GTAAC	2	10	220846	220855	40 %	20 %	20 %	20 %	74310804
4516	NC_007384	GAA	2	6	220980	220985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310804
4517	NC_007384	GCC	2	6	220996	221001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310804
4518	NC_007384	TGG	2	6	221152	221157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310804
4519	NC_007384	CTG	2	6	221202	221207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310804
4520	NC_007384	ATC	2	6	221334	221339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310804
4521	NC_007384	GGC	2	6	221354	221359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310804
4522	NC_007384	CCCG	2	8	221435	221442	0 %	0 %	25 %	75 %	74310804
4523	NC_007384	AGCCG	2	10	221474	221483	20 %	0 %	40 %	40 %	74310804
4524	NC_007384	GAA	2	6	221511	221516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310804
4525	NC_007384	GC	3	6	221538	221543	0 %	0 %	50 %	50 %	74310804
4526	NC_007384	GGTGG	2	10	221583	221592	0 %	20 %	80 %	0 %	74310804
4527	NC_007384	CAT	2	6	221735	221740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310804
4528	NC_007384	GAT	2	6	221756	221761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310804
4529	NC_007384	CAA	2	6	221762	221767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310804
4530	NC_007384	GCG	2	6	221768	221773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310804
4531	NC_007384	GAA	2	6	221777	221782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310804
4532	NC_007384	GCC	2	6	221789	221794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310804
4533	NC_007384	GAT	2	6	221820	221825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310804
4534	NC_007384	TGC	2	6	221842	221847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310804
4535	NC_007384	CGG	2	6	221863	221868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310804
4536	NC_007384	CG	3	6	221884	221889	0 %	0 %	50 %	50 %	74310804
4537	NC_007384	TGG	2	6	221947	221952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310804
4538	NC_007384	TGG	2	6	221986	221991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310804
4539	NC_007384	GCA	2	6	222050	222055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310804
4540	NC_007384	CAT	2	6	222092	222097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310804
4541	NC_007384	TGC	2	6	222166	222171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310804
4542	NC_007384	AGC	2	6	222211	222216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310804
4543	NC_007384	TGG	2	6	222286	222291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310804
4544	NC_007384	CGG	2	6	222382	222387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310804
4545	NC_007384	GGC	2	6	222395	222400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310804
4546	NC_007384	CCG	2	6	222409	222414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310804
4547	NC_007384	ACA	2	6	222421	222426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310804
4548	NC_007384	GGT	2	6	222434	222439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310804
4549	NC_007384	TGG	2	6	222445	222450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310804
4550	NC_007384	CCA	2	6	222483	222488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310804
4551	NC_007384	ACG	3	9	222523	222531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310804
4552	NC_007384	CAT	2	6	222590	222595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310804
4553	NC_007384	TAA	2	6	222605	222610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310804
4554	NC_007384	GGC	2	6	222612	222617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310804
4555	NC_007384	CGG	2	6	222672	222677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310804
4556	NC_007384	CG	3	6	222729	222734	0 %	0 %	50 %	50 %	74310804
4557	NC_007384	TGA	2	6	222739	222744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310804
4558	NC_007384	GGT	2	6	222887	222892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310804
4559	NC_007384	TCA	2	6	223024	223029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310804
4560	NC_007384	GTT	2	6	223044	223049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310804
4561	NC_007384	CG	3	6	223052	223057	0 %	0 %	50 %	50 %	74310804
4562	NC_007384	GGC	2	6	223117	223122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310804
4563	NC_007384	TGT	2	6	223132	223137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310804
4564	NC_007384	TGA	2	6	223214	223219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310804
4565	NC_007384	TGA	2	6	223325	223330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310804
4566	NC_007384	CTA	2	6	223397	223402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310804
4567	NC_007384	CG	4	8	223419	223426	0 %	0 %	50 %	50 %	74310804
4568	NC_007384	TC	3	6	223453	223458	0 %	50 %	0 %	50 %	74310804
4569	NC_007384	TTA	2	6	223470	223475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310804
4570	NC_007384	GAA	2	6	223653	223658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310805
4571	NC_007384	A	6	6	223675	223680	100 %	0 %	0 %	0 %	74310805
4572	NC_007384	TGA	2	6	223790	223795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310805
4573	NC_007384	CTGG	2	8	223806	223813	0 %	25 %	50 %	25 %	74310805
4574	NC_007384	CG	3	6	223818	223823	0 %	0 %	50 %	50 %	74310805
4575	NC_007384	TCG	2	6	223843	223848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310805
4576	NC_007384	GTC	2	6	223870	223875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310805
4577	NC_007384	TGA	2	6	223879	223884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310805
4578	NC_007384	TCA	2	6	223892	223897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310805
4579	NC_007384	A	6	6	223918	223923	100 %	0 %	0 %	0 %	74310805
4580	NC_007384	ATC	2	6	224010	224015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310805
4581	NC_007384	AGA	2	6	224057	224062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310805
4582	NC_007384	GGT	2	6	224148	224153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310805
4583	NC_007384	TGC	2	6	224197	224202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310805
4584	NC_007384	GGC	2	6	224279	224284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310805
4585	NC_007384	ATC	2	6	224298	224303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310805
4586	NC_007384	CAT	2	6	224339	224344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310805
4587	NC_007384	GCG	2	6	224359	224364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310805
4588	NC_007384	CTG	2	6	224409	224414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310805
4589	NC_007384	A	6	6	224456	224461	100 %	0 %	0 %	0 %	74310805
4590	NC_007384	TCG	2	6	224462	224467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310805
4591	NC_007384	TGA	2	6	224479	224484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310805
4592	NC_007384	GGT	2	6	224532	224537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_007384	CAGT	2	8	224543	224550	25 %	25 %	25 %	25 %	74310806
4594	NC_007384	ACTG	2	8	224557	224564	25 %	25 %	25 %	25 %	74310806
4595	NC_007384	TCG	2	6	224636	224641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310806
4596	NC_007384	TCA	2	6	224720	224725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310806
4597	NC_007384	TCA	2	6	224732	224737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310806
4598	NC_007384	ATC	2	6	224806	224811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310806
4599	NC_007384	TCC	2	6	224976	224981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74310806
4600	NC_007384	CGTC	2	8	224996	225003	0 %	25 %	25 %	50 %	74310806
4601	NC_007384	CAG	2	6	225012	225017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310806
4602	NC_007384	CAG	2	6	225048	225053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310806
4603	NC_007384	T	6	6	225088	225093	0 %	100 %	0 %	0 %	74310806
4604	NC_007384	GAT	2	6	225125	225130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310806
4605	NC_007384	ATC	2	6	225184	225189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310806
4606	NC_007384	TAA	2	6	225241	225246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310806
4607	NC_007384	TTC	2	6	225319	225324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74310806
4608	NC_007384	CAG	2	6	225348	225353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310806
4609	NC_007384	AC	3	6	225473	225478	50 %	0 %	0 %	50 %	74310806
4610	NC_007384	CAG	2	6	225489	225494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310806
4611	NC_007384	GCG	2	6	225518	225523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310806
4612	NC_007384	CGG	2	6	225562	225567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310806
4613	NC_007384	GCA	2	6	225638	225643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310806
4614	NC_007384	CAA	2	6	225701	225706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310806
4615	NC_007384	CAT	2	6	225717	225722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310806
4616	NC_007384	GGCAA	2	10	225768	225777	40 %	0 %	40 %	20 %	74310806
4617	NC_007384	GA	3	6	225779	225784	50 %	0 %	50 %	0 %	74310806
4618	NC_007384	A	7	7	225879	225885	100 %	0 %	0 %	0 %	74310806
4619	NC_007384	T	6	6	225979	225984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_007384	AAGG	2	8	226013	226020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_007384	AGG	2	6	226028	226033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_007384	CAT	2	6	226044	226049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310807
4623	NC_007384	TGG	2	6	226115	226120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310807
4624	NC_007384	ATCA	2	8	226246	226253	50 %	25 %	0 %	25 %	74310807
4625	NC_007384	TCA	2	6	226283	226288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310807
4626	NC_007384	CGA	2	6	226298	226303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310807
4627	NC_007384	T	6	6	226342	226347	0 %	100 %	0 %	0 %	74310807
4628	NC_007384	CGC	2	6	226424	226429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310807
4629	NC_007384	GGC	2	6	226498	226503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310807
4630	NC_007384	A	6	6	226514	226519	100 %	0 %	0 %	0 %	74310807
4631	NC_007384	T	6	6	226545	226550	0 %	100 %	0 %	0 %	74310807
4632	NC_007384	CGG	2	6	226551	226556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310807
4633	NC_007384	CG	3	6	226650	226655	0 %	0 %	50 %	50 %	74310807
4634	NC_007384	CGC	2	6	226728	226733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310807
4635	NC_007384	TGA	3	9	226793	226801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310807
4636	NC_007384	TGG	2	6	226854	226859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74310807
4637	NC_007384	CCA	2	6	226910	226915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310807
4638	NC_007384	ATG	2	6	226961	226966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310807
4639	NC_007384	ACA	2	6	226976	226981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	74310807
4640	NC_007384	GCG	2	6	227087	227092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310807
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4642	NC_007384	ATG	2	6	227218	227223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310807
4643	NC_007384	ACC	3	9	227227	227235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	74310807
4644	NC_007384	TTG	2	6	227252	227257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74310807
4645	NC_007384	GGC	3	9	227271	227279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310807
4646	NC_007384	TGC	2	6	227282	227287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310807
4647	NC_007384	GGTT	2	8	227380	227387	0 %	50 %	50 %	0 %	74310807
4648	NC_007384	CCG	2	6	227404	227409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74310807
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4652	NC_007384	CGA	2	6	227592	227597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74310807
4653	NC_007384	GTA	2	6	227608	227613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310807
4654	NC_007384	CTG	2	6	227635	227640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310807
4655	NC_007384	ATT	2	6	227682	227687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74310807
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4657	NC_007384	AG	3	6	228039	228044	50 %	0 %	50 %	0 %	74310807
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4660	NC_007384	CCG	2	6	228426	228431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986587
4661	NC_007384	TGA	2	6	228485	228490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986587
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4663	NC_007384	CAT	2	6	228687	228692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74310809
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4703	NC_007384	CCT	2	6	230625	230630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4724	NC_007384	GCG	2	6	231447	231452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4725	NC_007384	TGG	2	6	231463	231468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4726	NC_007384	AAC	2	6	231485	231490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4727	NC_007384	CGA	2	6	231504	231509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4729	NC_007384	A	6	6	231634	231639	100 %	0 %	0 %	0 %	74310813
4730	NC_007384	TAA	2	6	231690	231695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74310813
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4732	NC_007384	TGC	2	6	231770	231775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74310813
4733	NC_007384	CT	3	6	231804	231809	0 %	50 %	0 %	50 %	74310813
4734	NC_007384	TGA	2	6	231836	231841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310813
4735	NC_007384	GAA	2	6	231865	231870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74310813
4736	NC_007384	TCC	2	6	231874	231879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74310813
4737	NC_007384	GCG	2	6	232102	232107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310813
4738	NC_007384	GC	3	6	232183	232188	0 %	0 %	50 %	50 %	74310813
4739	NC_007384	CCAA	2	8	232264	232271	50 %	0 %	0 %	50 %	74310813
4740	NC_007384	CGG	2	6	232289	232294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74310813
4741	NC_007384	AGT	2	6	232321	232326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74310813
4742	NC_007384	AAAC	2	8	232354	232361	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4743	NC_007384	TGCGC	2	10	232376	232385	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4744	NC_007384	ACG	2	6	232455	232460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4745	NC_007384	GGCT	2	8	232482	232489	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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