MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305 plasmid pSSP2

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007352	CTCC	2	8	787	794	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_007352	AATT	2	8	994	1001	50 %	50 %	0 %	0 %	73663804
3	NC_007352	AATT	2	8	1401	1408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007352	AATT	2	8	1541	1548	50 %	50 %	0 %	0 %	73663805
5	NC_007352	TCTT	2	8	1828	1835	0 %	75 %	0 %	25 %	73663805
6	NC_007352	TATT	2	8	1920	1927	25 %	75 %	0 %	0 %	73663805
7	NC_007352	TTTG	2	8	2611	2618	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007352	ACTT	2	8	2685	2692	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007352	TCAA	2	8	3024	3031	50 %	25 %	0 %	25 %	73663806
10	NC_007352	TAAA	2	8	3045	3052	75 %	25 %	0 %	0 %	73663806
11	NC_007352	ATGA	2	8	3299	3306	50 %	25 %	25 %	0 %	73663806
12	NC_007352	GTAA	2	8	3431	3438	50 %	25 %	25 %	0 %	73663806
13	NC_007352	TATT	2	8	4113	4120	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007352	AATT	2	8	5175	5182	50 %	50 %	0 %	0 %	73663808
15	NC_007352	TACT	2	8	5197	5204	25 %	50 %	0 %	25 %	73663808
16	NC_007352	GATA	2	8	5473	5480	50 %	25 %	25 %	0 %	73663808
17	NC_007352	GTTA	2	8	6062	6069	25 %	50 %	25 %	0 %	73663809
18	NC_007352	GAAT	2	8	6266	6273	50 %	25 %	25 %	0 %	73663809
19	NC_007352	ATTT	2	8	6911	6918	25 %	75 %	0 %	0 %	73663810
20	NC_007352	TCTT	2	8	7243	7250	0 %	75 %	0 %	25 %	73663811
21	NC_007352	AAAT	2	8	7979	7986	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007352	ATTT	2	8	8127	8134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007352	TAAA	2	8	8362	8369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007352	ATTA	2	8	8793	8800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007352	ACAT	2	8	9359	9366	50 %	25 %	0 %	25 %	73663812
26	NC_007352	AAGA	2	8	9593	9600	75 %	0 %	25 %	0 %	73663812
27	NC_007352	AAAT	2	8	11196	11203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007352	ATTA	2	8	11378	11385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007352	TATC	2	8	11408	11415	25 %	50 %	0 %	25 %	73663815
30	NC_007352	ACAT	2	8	12198	12205	50 %	25 %	0 %	25 %	73663816
31	NC_007352	AAGA	2	8	12432	12439	75 %	0 %	25 %	0 %	73663816
32	NC_007352	AAAT	2	8	12899	12906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007352	CATA	2	8	13057	13064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007352	CTTA	2	8	14272	14279	25 %	50 %	0 %	25 %	73663819
35	NC_007352	AGTA	2	8	14760	14767	50 %	25 %	25 %	0 %	73663819
36	NC_007352	TCCA	2	8	15496	15503	25 %	25 %	0 %	50 %	73663819
37	NC_007352	CGTA	2	8	16610	16617	25 %	25 %	25 %	25 %	73663820
38	NC_007352	GTAA	2	8	16700	16707	50 %	25 %	25 %	0 %	73663820
39	NC_007352	TCTT	2	8	16833	16840	0 %	75 %	0 %	25 %	73663820
40	NC_007352	TTCA	2	8	16861	16868	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007352	ATTT	2	8	16872	16879	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007352	GCAA	2	8	16911	16918	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_007352	TGAA	2	8	16924	16931	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007352	AAGT	2	8	16940	16947	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007352	GCTA	2	8	17071	17078	25 %	25 %	25 %	25 %	73663821
46	NC_007352	TAAA	2	8	17184	17191	75 %	25 %	0 %	0 %	73663821
47	NC_007352	AAGA	2	8	17213	17220	75 %	0 %	25 %	0 %	73663821
48	NC_007352	AGTC	2	8	17372	17379	25 %	25 %	25 %	25 %	73663821
49	NC_007352	TTAG	2	8	17630	17637	25 %	50 %	25 %	0 %	73663822
50	NC_007352	ACAA	2	8	17899	17906	75 %	0 %	0 %	25 %	73663822
51	NC_007352	TAAG	2	8	18249	18256	50 %	25 %	25 %	0 %	73663823
52	NC_007352	ACAA	2	8	18429	18436	75 %	0 %	0 %	25 %	73663823
53	NC_007352	TAAA	2	8	18764	18771	75 %	25 %	0 %	0 %	73663823
54	NC_007352	GCAA	2	8	18942	18949	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_007352	AATG	2	8	19403	19410	50 %	25 %	25 %	0 %	73663824
56	NC_007352	ATAA	2	8	19440	19447	75 %	25 %	0 %	0 %	73663824
57	NC_007352	CAAA	2	8	19613	19620	75 %	0 %	0 %	25 %	73663824
58	NC_007352	GCAG	2	8	20088	20095	25 %	0 %	50 %	25 %	73663824
59	NC_007352	AACA	2	8	20727	20734	75 %	0 %	0 %	25 %	73663824
60	NC_007352	AAAG	2	8	21150	21157	75 %	0 %	25 %	0 %	73663824
61	NC_007352	TATT	2	8	21199	21206	25 %	75 %	0 %	0 %	73663824
62	NC_007352	TAAA	2	8	21673	21680	75 %	25 %	0 %	0 %	73663824
63	NC_007352	TATG	2	8	22109	22116	25 %	50 %	25 %	0 %	73663825
64	NC_007352	AAGA	2	8	22761	22768	75 %	0 %	25 %	0 %	73663825

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.