MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305 plasmid pSSP1

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007351	T	6	6	5	10	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007351	T	6	6	801	806	0 %	100 %	0 %	0 %	73663758
3	NC_007351	T	6	6	1290	1295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007351	T	6	6	1455	1460	0 %	100 %	0 %	0 %	73663759
5	NC_007351	T	6	6	2013	2018	0 %	100 %	0 %	0 %	73663759
6	NC_007351	T	6	6	2902	2907	0 %	100 %	0 %	0 %	73663759
7	NC_007351	T	6	6	3802	3807	0 %	100 %	0 %	0 %	73663759
8	NC_007351	T	7	7	3894	3900	0 %	100 %	0 %	0 %	73663759
9	NC_007351	A	6	6	4491	4496	100 %	0 %	0 %	0 %	73663760
10	NC_007351	A	6	6	4570	4575	100 %	0 %	0 %	0 %	73663760
11	NC_007351	A	6	6	4719	4724	100 %	0 %	0 %	0 %	73663760
12	NC_007351	A	8	8	5124	5131	100 %	0 %	0 %	0 %	73663760
13	NC_007351	A	6	6	5351	5356	100 %	0 %	0 %	0 %	73663760
14	NC_007351	A	6	6	5480	5485	100 %	0 %	0 %	0 %	73663760
15	NC_007351	A	6	6	5876	5881	100 %	0 %	0 %	0 %	73663760
16	NC_007351	A	7	7	6083	6089	100 %	0 %	0 %	0 %	73663760
17	NC_007351	T	7	7	6776	6782	0 %	100 %	0 %	0 %	73663761
18	NC_007351	T	6	6	7184	7189	0 %	100 %	0 %	0 %	73663761
19	NC_007351	T	7	7	7688	7694	0 %	100 %	0 %	0 %	73663761
20	NC_007351	T	6	6	7708	7713	0 %	100 %	0 %	0 %	73663761
21	NC_007351	T	6	6	7871	7876	0 %	100 %	0 %	0 %	73663761
22	NC_007351	T	8	8	8202	8209	0 %	100 %	0 %	0 %	73663761
23	NC_007351	T	7	7	8318	8324	0 %	100 %	0 %	0 %	73663761
24	NC_007351	T	6	6	8412	8417	0 %	100 %	0 %	0 %	73663761
25	NC_007351	A	6	6	8735	8740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007351	T	6	6	9293	9298	0 %	100 %	0 %	0 %	73663764
27	NC_007351	T	6	6	9302	9307	0 %	100 %	0 %	0 %	73663764
28	NC_007351	T	6	6	9491	9496	0 %	100 %	0 %	0 %	73663764
29	NC_007351	T	6	6	9705	9710	0 %	100 %	0 %	0 %	73663765
30	NC_007351	T	7	7	9962	9968	0 %	100 %	0 %	0 %	73663765
31	NC_007351	C	7	7	9977	9983	0 %	0 %	0 %	100 %	73663765
32	NC_007351	A	6	6	10074	10079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007351	T	8	8	10142	10149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007351	T	6	6	10226	10231	0 %	100 %	0 %	0 %	73663766
35	NC_007351	T	7	7	10536	10542	0 %	100 %	0 %	0 %	73663766
36	NC_007351	A	6	6	10589	10594	100 %	0 %	0 %	0 %	73663766
37	NC_007351	T	7	7	10677	10683	0 %	100 %	0 %	0 %	73663766
38	NC_007351	T	6	6	10802	10807	0 %	100 %	0 %	0 %	73663766
39	NC_007351	T	6	6	11022	11027	0 %	100 %	0 %	0 %	73663766
40	NC_007351	T	6	6	11110	11115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007351	T	6	6	11126	11131	0 %	100 %	0 %	0 %	73663767
42	NC_007351	T	6	6	11293	11298	0 %	100 %	0 %	0 %	73663767
43	NC_007351	A	6	6	11353	11358	100 %	0 %	0 %	0 %	73663767
44	NC_007351	T	6	6	11900	11905	0 %	100 %	0 %	0 %	73663768
45	NC_007351	T	6	6	12113	12118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007351	T	6	6	12168	12173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007351	T	7	7	12209	12215	0 %	100 %	0 %	0 %	73663769
48	NC_007351	T	6	6	12346	12351	0 %	100 %	0 %	0 %	73663769
49	NC_007351	T	6	6	12467	12472	0 %	100 %	0 %	0 %	73663769
50	NC_007351	A	6	6	12830	12835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007351	A	6	6	13006	13011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007351	T	6	6	13012	13017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007351	A	6	6	13054	13059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007351	T	7	7	13316	13322	0 %	100 %	0 %	0 %	73663770
55	NC_007351	A	6	6	13629	13634	100 %	0 %	0 %	0 %	73663771
56	NC_007351	T	6	6	14512	14517	0 %	100 %	0 %	0 %	73663771
57	NC_007351	T	7	7	15507	15513	0 %	100 %	0 %	0 %	73663773
58	NC_007351	T	7	7	16885	16891	0 %	100 %	0 %	0 %	73663773
59	NC_007351	T	6	6	16978	16983	0 %	100 %	0 %	0 %	73663774
60	NC_007351	T	6	6	17106	17111	0 %	100 %	0 %	0 %	73663774
61	NC_007351	T	6	6	17200	17205	0 %	100 %	0 %	0 %	73663774
62	NC_007351	T	6	6	17428	17433	0 %	100 %	0 %	0 %	73663774
63	NC_007351	A	6	6	18206	18211	100 %	0 %	0 %	0 %	73663774
64	NC_007351	A	6	6	18547	18552	100 %	0 %	0 %	0 %	73663774
65	NC_007351	T	6	6	19126	19131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007351	A	7	7	19174	19180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007351	A	6	6	19458	19463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007351	A	7	7	19675	19681	100 %	0 %	0 %	0 %	73663777
69	NC_007351	T	7	7	19831	19837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007351	A	7	7	19850	19856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007351	T	6	6	19934	19939	0 %	100 %	0 %	0 %	73663778
72	NC_007351	T	6	6	20286	20291	0 %	100 %	0 %	0 %	73663778
73	NC_007351	A	7	7	20807	20813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007351	A	6	6	20868	20873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007351	A	6	6	20889	20894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007351	A	6	6	20926	20931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007351	A	6	6	20984	20989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007351	T	6	6	21332	21337	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
79	NC_007351	T	6	6	21378	21383	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
80	NC_007351	T	9	9	21474	21482	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
81	NC_007351	T	7	7	21530	21536	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
82	NC_007351	T	6	6	21697	21702	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
83	NC_007351	T	6	6	21706	21711	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
84	NC_007351	T	6	6	21720	21725	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
85	NC_007351	T	7	7	21736	21742	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
86	NC_007351	T	6	6	22976	22981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007351	A	6	6	23125	23130	100 %	0 %	0 %	0 %	73663781
88	NC_007351	A	7	7	23242	23248	100 %	0 %	0 %	0 %	73663781
89	NC_007351	T	6	6	23478	23483	0 %	100 %	0 %	0 %	73663781
90	NC_007351	A	6	6	23555	23560	100 %	0 %	0 %	0 %	73663781
91	NC_007351	A	6	6	23675	23680	100 %	0 %	0 %	0 %	73663781
92	NC_007351	A	6	6	23698	23703	100 %	0 %	0 %	0 %	73663781
93	NC_007351	A	6	6	23744	23749	100 %	0 %	0 %	0 %	73663781
94	NC_007351	A	6	6	24116	24121	100 %	0 %	0 %	0 %	73663781
95	NC_007351	A	6	6	24208	24213	100 %	0 %	0 %	0 %	73663781
96	NC_007351	A	6	6	24259	24264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007351	A	6	6	24695	24700	100 %	0 %	0 %	0 %	73663782
98	NC_007351	G	6	6	24900	24905	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007351	A	6	6	25333	25338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007351	T	8	8	25729	25736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007351	A	6	6	26089	26094	100 %	0 %	0 %	0 %	73663784
102	NC_007351	T	7	7	26602	26608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007351	A	6	6	26705	26710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007351	A	6	6	26748	26753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007351	T	6	6	26783	26788	0 %	100 %	0 %	0 %	73663785
106	NC_007351	T	7	7	27755	27761	0 %	100 %	0 %	0 %	73663788
107	NC_007351	T	6	6	28543	28548	0 %	100 %	0 %	0 %	73663788
108	NC_007351	T	6	6	29914	29919	0 %	100 %	0 %	0 %	73663791
109	NC_007351	T	6	6	31112	31117	0 %	100 %	0 %	0 %	73663792
110	NC_007351	A	7	7	31277	31283	100 %	0 %	0 %	0 %	73663792
111	NC_007351	T	7	7	32145	32151	0 %	100 %	0 %	0 %	73663793
112	NC_007351	T	6	6	32507	32512	0 %	100 %	0 %	0 %	73663793
113	NC_007351	A	6	6	33427	33432	100 %	0 %	0 %	0 %	73663794
114	NC_007351	T	6	6	33940	33945	0 %	100 %	0 %	0 %	73663795
115	NC_007351	T	6	6	34020	34025	0 %	100 %	0 %	0 %	73663795
116	NC_007351	T	6	6	34189	34194	0 %	100 %	0 %	0 %	73663795
117	NC_007351	T	7	7	34342	34348	0 %	100 %	0 %	0 %	73663795
118	NC_007351	T	7	7	34400	34406	0 %	100 %	0 %	0 %	73663795
119	NC_007351	T	6	6	34508	34513	0 %	100 %	0 %	0 %	73663795
120	NC_007351	T	6	6	34751	34756	0 %	100 %	0 %	0 %	73663796
121	NC_007351	A	6	6	34820	34825	100 %	0 %	0 %	0 %	73663796
122	NC_007351	T	6	6	34852	34857	0 %	100 %	0 %	0 %	73663796
123	NC_007351	T	7	7	34902	34908	0 %	100 %	0 %	0 %	73663797
124	NC_007351	A	6	6	34998	35003	100 %	0 %	0 %	0 %	73663797
125	NC_007351	T	7	7	35077	35083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007351	T	8	8	36115	36122	0 %	100 %	0 %	0 %	73663799
127	NC_007351	A	6	6	36312	36317	100 %	0 %	0 %	0 %	73663799
128	NC_007351	T	7	7	36848	36854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007351	T	7	7	36968	36974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007351	T	7	7	37063	37069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007351	A	6	6	37137	37142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007351	T	6	6	37273	37278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007351	T	6	6	37535	37540	0 %	100 %	0 %	0 %	73663800
134	NC_007351	A	6	6	37598	37603	100 %	0 %	0 %	0 %	73663800
135	NC_007351	A	6	6	37861	37866	100 %	0 %	0 %	0 %	73663801
136	NC_007351	T	6	6	38374	38379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007351	A	6	6	38425	38430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.