MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305 plasmid pSSP1

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007351	ATCA	2	8	431	438	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007351	TGAA	2	8	534	541	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007351	AATT	2	8	779	786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007351	CCTT	2	8	1252	1259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007351	AAAT	2	8	1673	1680	75 %	25 %	0 %	0 %	73663759
6	NC_007351	TGCT	2	8	1934	1941	0 %	50 %	25 %	25 %	73663759
7	NC_007351	CTTT	2	8	2158	2165	0 %	75 %	0 %	25 %	73663759
8	NC_007351	TTAA	2	8	2695	2702	50 %	50 %	0 %	0 %	73663759
9	NC_007351	ACTT	2	8	2810	2817	25 %	50 %	0 %	25 %	73663759
10	NC_007351	TTGT	2	8	2940	2947	0 %	75 %	25 %	0 %	73663759
11	NC_007351	TTCA	2	8	3243	3250	25 %	50 %	0 %	25 %	73663759
12	NC_007351	GCTC	2	8	3397	3404	0 %	25 %	25 %	50 %	73663759
13	NC_007351	TTTA	2	8	3606	3613	25 %	75 %	0 %	0 %	73663759
14	NC_007351	TGCT	2	8	3789	3796	0 %	50 %	25 %	25 %	73663759
15	NC_007351	GAAG	2	8	4084	4091	50 %	0 %	50 %	0 %	73663759
16	NC_007351	AAAC	2	8	4862	4869	75 %	0 %	0 %	25 %	73663760
17	NC_007351	AAAT	2	8	4941	4948	75 %	25 %	0 %	0 %	73663760
18	NC_007351	CAAA	2	8	5097	5104	75 %	0 %	0 %	25 %	73663760
19	NC_007351	ATTT	2	8	5763	5770	25 %	75 %	0 %	0 %	73663760
20	NC_007351	AGAA	2	8	6280	6287	75 %	0 %	25 %	0 %	73663760
21	NC_007351	ATTC	2	8	6571	6578	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007351	ATTT	2	8	6703	6710	25 %	75 %	0 %	0 %	73663761
23	NC_007351	CAAA	2	8	7063	7070	75 %	0 %	0 %	25 %	73663761
24	NC_007351	TAGC	2	8	7237	7244	25 %	25 %	25 %	25 %	73663761
25	NC_007351	TCAT	2	8	8007	8014	25 %	50 %	0 %	25 %	73663761
26	NC_007351	TAAT	2	8	8912	8919	50 %	50 %	0 %	0 %	73663763
27	NC_007351	TTTA	2	8	9102	9109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007351	CATA	2	8	9463	9470	50 %	25 %	0 %	25 %	73663764
29	NC_007351	CCAT	2	8	9643	9650	25 %	25 %	0 %	50 %	73663765
30	NC_007351	TTTC	2	8	9757	9764	0 %	75 %	0 %	25 %	73663765
31	NC_007351	ATTA	2	8	10011	10018	50 %	50 %	0 %	0 %	73663765
32	NC_007351	TTAA	2	8	10190	10197	50 %	50 %	0 %	0 %	73663766
33	NC_007351	AAAG	2	8	10876	10883	75 %	0 %	25 %	0 %	73663766
34	NC_007351	TAAA	2	8	10926	10933	75 %	25 %	0 %	0 %	73663766
35	NC_007351	TCTG	2	8	11162	11169	0 %	50 %	25 %	25 %	73663767
36	NC_007351	AATT	2	8	11446	11453	50 %	50 %	0 %	0 %	73663767
37	NC_007351	CACT	2	8	11559	11566	25 %	25 %	0 %	50 %	73663767
38	NC_007351	AAAT	2	8	11941	11948	75 %	25 %	0 %	0 %	73663768
39	NC_007351	CATA	2	8	12724	12731	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007351	ATAA	2	8	12900	12907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007351	TGTT	2	8	13980	13987	0 %	75 %	25 %	0 %	73663771
42	NC_007351	ATAC	2	8	14044	14051	50 %	25 %	0 %	25 %	73663771
43	NC_007351	AGTC	2	8	14979	14986	25 %	25 %	25 %	25 %	73663772
44	NC_007351	AAAT	2	8	15638	15645	75 %	25 %	0 %	0 %	73663773
45	NC_007351	AATT	2	8	16193	16200	50 %	50 %	0 %	0 %	73663773
46	NC_007351	TGAT	2	8	17023	17030	25 %	50 %	25 %	0 %	73663774
47	NC_007351	TAAA	2	8	17613	17620	75 %	25 %	0 %	0 %	73663774
48	NC_007351	TACT	2	8	18456	18463	25 %	50 %	0 %	25 %	73663774
49	NC_007351	CTTT	2	8	18471	18478	0 %	75 %	0 %	25 %	73663774
50	NC_007351	ATTT	2	8	18588	18595	25 %	75 %	0 %	0 %	73663774
51	NC_007351	CATC	2	8	18609	18616	25 %	25 %	0 %	50 %	73663774
52	NC_007351	ATTC	2	8	18787	18794	25 %	50 %	0 %	25 %	73663775
53	NC_007351	ATTA	2	8	18962	18969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007351	ACAA	2	8	19400	19407	75 %	0 %	0 %	25 %	73663776
55	NC_007351	ATGA	2	8	19505	19512	50 %	25 %	25 %	0 %	73663777
56	NC_007351	TAAA	2	8	19863	19870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007351	AAGC	2	8	20375	20382	50 %	0 %	25 %	25 %	73663778
58	NC_007351	ATTT	2	8	20452	20459	25 %	75 %	0 %	0 %	73663778
59	NC_007351	ATTA	2	8	20629	20636	50 %	50 %	0 %	0 %	73663778
60	NC_007351	AATT	2	8	21275	21282	50 %	50 %	0 %	0 %	73663780
61	NC_007351	TTCT	2	8	21385	21392	0 %	75 %	0 %	25 %	73663780
62	NC_007351	AAAG	2	8	21558	21565	75 %	0 %	25 %	0 %	73663780
63	NC_007351	ATGA	2	8	21867	21874	50 %	25 %	25 %	0 %	73663780
64	NC_007351	ATTC	2	8	22090	22097	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_007351	TTTC	2	8	22151	22158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007351	ATTC	2	8	22186	22193	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007351	TTTC	2	8	22247	22254	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007351	ATTC	2	8	22282	22289	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007351	TTTC	2	8	22342	22349	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007351	ATTC	2	8	22377	22384	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007351	TTTC	2	8	22438	22445	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007351	ATTC	2	8	22473	22480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_007351	TTTC	2	8	22533	22540	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007351	ATTC	2	8	22568	22575	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007351	TTTC	2	8	22628	22635	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007351	ATTC	2	8	22663	22670	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007351	AAAT	2	8	22727	22734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007351	TTTA	2	8	22842	22849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007351	AATG	2	8	22876	22883	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007351	ATTG	2	8	23251	23258	25 %	50 %	25 %	0 %	73663781
81	NC_007351	ATGA	2	8	23810	23817	50 %	25 %	25 %	0 %	73663781
82	NC_007351	ATGA	2	8	23819	23826	50 %	25 %	25 %	0 %	73663781
83	NC_007351	CGTT	2	8	24020	24027	0 %	50 %	25 %	25 %	73663781
84	NC_007351	ATCA	2	8	24555	24562	50 %	25 %	0 %	25 %	73663782
85	NC_007351	AAAG	2	8	24866	24873	75 %	0 %	25 %	0 %	73663782
86	NC_007351	CTTT	2	8	24981	24988	0 %	75 %	0 %	25 %	73663783
87	NC_007351	TACG	2	8	25057	25064	25 %	25 %	25 %	25 %	73663783
88	NC_007351	TCAT	2	8	25167	25174	25 %	50 %	0 %	25 %	73663783
89	NC_007351	AGTG	2	8	25296	25303	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007351	CATA	2	8	25313	25320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_007351	ATAA	2	8	25559	25566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007351	TAAA	2	8	25610	25617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007351	ACAT	2	8	26181	26188	50 %	25 %	0 %	25 %	73663784
94	NC_007351	ACCA	2	8	26896	26903	50 %	0 %	0 %	50 %	73663785
95	NC_007351	AATG	2	8	27446	27453	50 %	25 %	25 %	0 %	73663787
96	NC_007351	CAAG	2	8	27525	27532	50 %	0 %	25 %	25 %	73663787
97	NC_007351	CATC	2	8	27925	27932	25 %	25 %	0 %	50 %	73663788
98	NC_007351	ATTA	2	8	28208	28215	50 %	50 %	0 %	0 %	73663788
99	NC_007351	TATT	2	8	28336	28343	25 %	75 %	0 %	0 %	73663788
100	NC_007351	TTAA	2	8	29457	29464	50 %	50 %	0 %	0 %	73663790
101	NC_007351	TCTA	2	8	30171	30178	25 %	50 %	0 %	25 %	73663791
102	NC_007351	ATGC	2	8	30566	30573	25 %	25 %	25 %	25 %	73663791
103	NC_007351	TCTA	2	8	30588	30595	25 %	50 %	0 %	25 %	73663791
104	NC_007351	GACT	2	8	30616	30623	25 %	25 %	25 %	25 %	73663791
105	NC_007351	CTTC	2	8	30696	30703	0 %	50 %	0 %	50 %	73663792
106	NC_007351	TTTC	2	8	30717	30724	0 %	75 %	0 %	25 %	73663792
107	NC_007351	TCTA	2	8	31436	31443	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_007351	TTAC	2	8	31474	31481	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_007351	TAGC	2	8	31757	31764	25 %	25 %	25 %	25 %	73663793
110	NC_007351	TGTA	2	8	31980	31987	25 %	50 %	25 %	0 %	73663793
111	NC_007351	ATTT	2	8	32559	32566	25 %	75 %	0 %	0 %	73663793
112	NC_007351	TTCA	2	8	33054	33061	25 %	50 %	0 %	25 %	73663793
113	NC_007351	CTTT	2	8	33075	33082	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007351	ACAT	2	8	33519	33526	50 %	25 %	0 %	25 %	73663794
115	NC_007351	AAGA	2	8	33753	33760	75 %	0 %	25 %	0 %	73663794
116	NC_007351	GATA	2	8	33970	33977	50 %	25 %	25 %	0 %	73663795
117	NC_007351	ATTT	2	8	34294	34301	25 %	75 %	0 %	0 %	73663795
118	NC_007351	TATG	2	8	34844	34851	25 %	50 %	25 %	0 %	73663796
119	NC_007351	AAAT	2	8	36185	36192	75 %	25 %	0 %	0 %	73663799
120	NC_007351	TAAA	2	8	36501	36508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007351	ATAA	2	8	36680	36687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007351	AATT	2	8	36902	36909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007351	GAAA	2	8	36999	37006	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007351	AATA	2	8	37007	37014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007351	GAAA	2	8	37023	37030	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007351	AAAT	2	8	37175	37182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007351	ACAT	2	8	37953	37960	50 %	25 %	0 %	25 %	73663801
128	NC_007351	AAGA	2	8	38187	38194	75 %	0 %	25 %	0 %	73663801

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.