MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305 plasmid pSSP1

Total Repeats: 639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007351	AGC	2	6	116	121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663757
2	NC_007351	TCA	2	6	132	137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663757
3	NC_007351	GCC	2	6	149	154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73663757
4	NC_007351	CAA	2	6	157	162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663757
5	NC_007351	CAA	2	6	184	189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663757
6	NC_007351	ACC	2	6	215	220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73663757
7	NC_007351	ATC	2	6	341	346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663757
8	NC_007351	CTA	2	6	370	375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007351	TAA	2	6	447	452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007351	AGT	2	6	505	510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007351	TTC	2	6	568	573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007351	TAA	2	6	616	621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007351	TTA	2	6	647	652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007351	ATT	2	6	656	661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007351	TTA	2	6	670	675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007351	TAG	2	6	792	797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663758
17	NC_007351	TCT	2	6	855	860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663758
18	NC_007351	TAA	2	6	923	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663758
19	NC_007351	AAT	2	6	954	959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663758
20	NC_007351	CTT	2	6	1013	1018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663758
21	NC_007351	TTA	2	6	1176	1181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663758
22	NC_007351	CAT	2	6	1195	1200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663758
23	NC_007351	ATT	3	9	1212	1220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663758
24	NC_007351	CAT	2	6	1281	1286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007351	TTA	2	6	1312	1317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007351	ATA	2	6	1323	1328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007351	TTC	2	6	1350	1355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663759
28	NC_007351	TCA	2	6	1376	1381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663759
29	NC_007351	TAA	2	6	1416	1421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
30	NC_007351	AAT	2	6	1435	1440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
31	NC_007351	TCC	2	6	1482	1487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73663759
32	NC_007351	GAA	2	6	1548	1553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663759
33	NC_007351	TCC	2	6	1581	1586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73663759
34	NC_007351	ACC	2	6	1587	1592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73663759
35	NC_007351	GTA	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663759
36	NC_007351	GAT	2	6	1614	1619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663759
37	NC_007351	TGA	2	6	1686	1691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663759
38	NC_007351	ACA	2	6	1717	1722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663759
39	NC_007351	ATA	2	6	1780	1785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
40	NC_007351	AAC	2	6	1798	1803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663759
41	NC_007351	TAT	2	6	1862	1867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663759
42	NC_007351	TAA	2	6	1875	1880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
43	NC_007351	TAA	2	6	1890	1895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
44	NC_007351	TCG	2	6	2059	2064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73663759
45	NC_007351	TGT	2	6	2250	2255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663759
46	NC_007351	TGT	2	6	2266	2271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663759
47	NC_007351	ATG	2	6	2300	2305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663759
48	NC_007351	ATA	2	6	2337	2342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
49	NC_007351	AGT	2	6	2427	2432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663759
50	NC_007351	TAA	2	6	2517	2522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
51	NC_007351	TAA	2	6	2547	2552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
52	NC_007351	ATC	2	6	2589	2594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663759
53	NC_007351	CTA	2	6	2599	2604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663759
54	NC_007351	CTT	3	9	2639	2647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663759
55	NC_007351	ATT	2	6	2703	2708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663759
56	NC_007351	TAT	2	6	2714	2719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663759
57	NC_007351	TCA	2	6	2743	2748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663759
58	NC_007351	ATA	2	6	2783	2788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
59	NC_007351	ATA	2	6	2884	2889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
60	NC_007351	TCT	2	6	2920	2925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663759
61	NC_007351	ACT	2	6	2928	2933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663759
62	NC_007351	ATA	2	6	2966	2971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
63	NC_007351	ACT	2	6	3012	3017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663759
64	NC_007351	ATT	2	6	3036	3041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663759
65	NC_007351	TGC	2	6	3118	3123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73663759
66	NC_007351	ATT	2	6	3150	3155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663759
67	NC_007351	CTT	2	6	3170	3175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663759
68	NC_007351	CTT	2	6	3191	3196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663759
69	NC_007351	CAT	2	6	3326	3331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663759
70	NC_007351	GCA	2	6	3448	3453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663759
71	NC_007351	TCA	2	6	3493	3498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663759
72	NC_007351	TTC	2	6	3624	3629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663759
73	NC_007351	TAA	2	6	3663	3668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
74	NC_007351	TAA	2	6	3862	3867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
75	NC_007351	ATC	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663759
76	NC_007351	ACA	2	6	4009	4014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663759
77	NC_007351	CCT	2	6	4102	4107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73663759
78	NC_007351	CAG	2	6	4121	4126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663759
79	NC_007351	AAT	2	6	4159	4164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663759
80	NC_007351	TTC	2	6	4174	4179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663759
81	NC_007351	ATA	2	6	4371	4376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007351	CAA	2	6	4406	4411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663760
83	NC_007351	ATT	2	6	4414	4419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663760
84	NC_007351	CTT	2	6	4437	4442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663760
85	NC_007351	CAT	2	6	4452	4457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663760
86	NC_007351	GAG	2	6	4541	4546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73663760
87	NC_007351	TCA	2	6	4565	4570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663760
88	NC_007351	ATG	2	6	4581	4586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663760
89	NC_007351	TGA	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663760
90	NC_007351	AGA	2	6	4666	4671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663760
91	NC_007351	TAA	3	9	4675	4683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663760
92	NC_007351	ATA	2	6	4701	4706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663760
93	NC_007351	ATC	2	6	4708	4713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663760
94	NC_007351	ATT	2	6	4828	4833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663760
95	NC_007351	TAA	3	9	4849	4857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663760
96	NC_007351	CTA	2	6	4872	4877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663760
97	NC_007351	GAA	2	6	4903	4908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663760
98	NC_007351	ATA	2	6	4923	4928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663760
99	NC_007351	GAT	2	6	4967	4972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663760
100	NC_007351	TGA	2	6	5038	5043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663760
101	NC_007351	GAT	2	6	5072	5077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663760
102	NC_007351	ATA	2	6	5082	5087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663760
103	NC_007351	GAT	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663760
104	NC_007351	TCC	2	6	5153	5158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73663760
105	NC_007351	CAA	2	6	5159	5164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663760
106	NC_007351	GAA	2	6	5177	5182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663760
107	NC_007351	ATG	2	6	5190	5195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663760
108	NC_007351	ACA	2	6	5208	5213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663760
109	NC_007351	ATA	2	6	5346	5351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663760
110	NC_007351	ATG	2	6	5361	5366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663760
111	NC_007351	GAT	2	6	5375	5380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663760
112	NC_007351	AAT	2	6	5411	5416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663760
113	NC_007351	CAA	2	6	5552	5557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663760
114	NC_007351	GAT	2	6	5573	5578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663760
115	NC_007351	TTA	2	6	5631	5636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663760
116	NC_007351	CAA	2	6	5985	5990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663760
117	NC_007351	TAT	2	6	6046	6051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663760
118	NC_007351	ATA	2	6	6078	6083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663760
119	NC_007351	GAT	2	6	6122	6127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663760
120	NC_007351	ACA	2	6	6158	6163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663760
121	NC_007351	GTG	2	6	6240	6245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73663760
122	NC_007351	AAT	2	6	6269	6274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663760
123	NC_007351	TTC	2	6	6301	6306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663760
124	NC_007351	CAA	2	6	6347	6352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663760
125	NC_007351	GAT	2	6	6401	6406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663760
126	NC_007351	TGC	2	6	6478	6483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73663760
127	NC_007351	TAA	2	6	6508	6513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663760
128	NC_007351	TTA	2	6	6545	6550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007351	TGA	2	6	6715	6720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663761
130	NC_007351	CCA	2	6	6732	6737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73663761
131	NC_007351	TTG	2	6	6769	6774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663761
132	NC_007351	ACT	2	6	6783	6788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663761
133	NC_007351	ATT	2	6	6818	6823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663761
134	NC_007351	TTA	2	6	7029	7034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663761
135	NC_007351	ATC	2	6	7079	7084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663761
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389	NC_007351	AAT	2	6	20880	20885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
390	NC_007351	TAA	2	6	20903	20908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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392	NC_007351	TTA	2	6	20951	20956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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