MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305 plasmid pSSP1

Total Repeats: 1026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007351	TCT	2	6	17867	17872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663774
502	NC_007351	GTT	2	6	17878	17883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663774
503	NC_007351	ACT	2	6	17888	17893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663774
504	NC_007351	GTT	2	6	17913	17918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663774
505	NC_007351	TTG	2	6	17926	17931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663774
506	NC_007351	AT	3	6	17947	17952	50 %	50 %	0 %	0 %	73663774
507	NC_007351	AGA	2	6	17953	17958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663774
508	NC_007351	CAT	2	6	17980	17985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663774
509	NC_007351	AAG	2	6	18072	18077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663774
510	NC_007351	AAT	2	6	18099	18104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663774
511	NC_007351	A	6	6	18206	18211	100 %	0 %	0 %	0 %	73663774
512	NC_007351	GCT	2	6	18230	18235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73663774
513	NC_007351	TCT	2	6	18287	18292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663774
514	NC_007351	GCA	3	9	18341	18349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663774
515	NC_007351	AG	3	6	18370	18375	50 %	0 %	50 %	0 %	73663774
516	NC_007351	TTA	2	6	18404	18409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663774
517	NC_007351	TACT	2	8	18456	18463	25 %	50 %	0 %	25 %	73663774
518	NC_007351	CTTT	2	8	18471	18478	0 %	75 %	0 %	25 %	73663774
519	NC_007351	TCG	2	6	18516	18521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73663774
520	NC_007351	A	6	6	18547	18552	100 %	0 %	0 %	0 %	73663774
521	NC_007351	ATTT	2	8	18588	18595	25 %	75 %	0 %	0 %	73663774
522	NC_007351	CATC	2	8	18609	18616	25 %	25 %	0 %	50 %	73663774
523	NC_007351	TCC	2	6	18629	18634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73663775
524	NC_007351	TAA	2	6	18655	18660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663775
525	NC_007351	CTT	3	9	18670	18678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663775
526	NC_007351	CTT	2	6	18769	18774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663775
527	NC_007351	TAA	2	6	18781	18786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663775
528	NC_007351	ATTC	2	8	18787	18794	25 %	50 %	0 %	25 %	73663775
529	NC_007351	TTA	2	6	18868	18873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663775
530	NC_007351	CTT	2	6	18922	18927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663775
531	NC_007351	ATTA	2	8	18962	18969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_007351	TAC	2	6	18973	18978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_007351	TA	3	6	18993	18998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_007351	TAA	2	6	19054	19059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_007351	GAA	2	6	19069	19074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_007351	T	6	6	19126	19131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_007351	AAT	2	6	19140	19145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_007351	TA	3	6	19147	19152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_007351	AT	3	6	19167	19172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_007351	A	7	7	19174	19180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_007351	AT	3	6	19185	19190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_007351	ATT	2	6	19204	19209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_007351	AGG	2	6	19219	19224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_007351	AAG	2	6	19322	19327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663776
545	NC_007351	AT	4	8	19333	19340	50 %	50 %	0 %	0 %	73663776
546	NC_007351	TCA	2	6	19368	19373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663776
547	NC_007351	ACAA	2	8	19400	19407	75 %	0 %	0 %	25 %	73663776
548	NC_007351	ATA	2	6	19431	19436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_007351	A	6	6	19458	19463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_007351	TTA	2	6	19485	19490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663777
551	NC_007351	ATGA	2	8	19505	19512	50 %	25 %	25 %	0 %	73663777
552	NC_007351	CAA	2	6	19517	19522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663777
553	NC_007351	TAA	2	6	19603	19608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663777
554	NC_007351	TTA	2	6	19637	19642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663777
555	NC_007351	A	7	7	19675	19681	100 %	0 %	0 %	0 %	73663777
556	NC_007351	ACT	2	6	19728	19733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663777
557	NC_007351	TCT	2	6	19805	19810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_007351	CAT	2	6	19815	19820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_007351	T	7	7	19831	19837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_007351	TA	3	6	19842	19847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_007351	A	7	7	19850	19856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_007351	TAAA	2	8	19863	19870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_007351	GGA	2	6	19874	19879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_007351	T	6	6	19934	19939	0 %	100 %	0 %	0 %	73663778
565	NC_007351	ATT	2	6	19942	19947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663778
566	NC_007351	TAG	2	6	19959	19964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663778
567	NC_007351	AGA	2	6	20002	20007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663778
568	NC_007351	TTA	2	6	20043	20048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663778
569	NC_007351	TGTTCT	2	12	20090	20101	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	73663778
570	NC_007351	TTA	2	6	20216	20221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663778
571	NC_007351	TGT	2	6	20236	20241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663778
572	NC_007351	TGT	2	6	20248	20253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663778
573	NC_007351	T	6	6	20286	20291	0 %	100 %	0 %	0 %	73663778
574	NC_007351	TAA	2	6	20353	20358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663778
575	NC_007351	AAGC	2	8	20375	20382	50 %	0 %	25 %	25 %	73663778
576	NC_007351	ATG	2	6	20388	20393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663778
577	NC_007351	ATT	2	6	20429	20434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663778
578	NC_007351	ATTT	2	8	20452	20459	25 %	75 %	0 %	0 %	73663778
579	NC_007351	TAT	2	6	20509	20514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663778
580	NC_007351	TTA	2	6	20520	20525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663778
581	NC_007351	ATTA	2	8	20629	20636	50 %	50 %	0 %	0 %	73663778
582	NC_007351	ATT	2	6	20683	20688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663778
583	NC_007351	AGG	2	6	20773	20778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73663778
584	NC_007351	A	7	7	20807	20813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_007351	TGT	2	6	20835	20840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_007351	A	6	6	20868	20873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_007351	AAT	2	6	20880	20885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_007351	A	6	6	20889	20894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_007351	TAA	2	6	20903	20908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_007351	TTG	2	6	20912	20917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_007351	A	6	6	20926	20931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_007351	TTA	2	6	20951	20956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_007351	GAT	2	6	20965	20970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_007351	A	6	6	20984	20989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_007351	TTA	2	6	21064	21069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663779
596	NC_007351	TTC	2	6	21081	21086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663779
597	NC_007351	ATT	2	6	21100	21105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663779
598	NC_007351	TTG	2	6	21176	21181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663779
599	NC_007351	TAT	2	6	21236	21241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663779
600	NC_007351	TCC	2	6	21267	21272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73663780
601	NC_007351	AATT	2	8	21275	21282	50 %	50 %	0 %	0 %	73663780
602	NC_007351	CTA	2	6	21288	21293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663780
603	NC_007351	TTC	2	6	21299	21304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663780
604	NC_007351	TTG	2	6	21312	21317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663780
605	NC_007351	T	6	6	21332	21337	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
606	NC_007351	ATCTTT	2	12	21347	21358	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	73663780
607	NC_007351	CAG	2	6	21367	21372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663780
608	NC_007351	T	6	6	21378	21383	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
609	NC_007351	TTCT	2	8	21385	21392	0 %	75 %	0 %	25 %	73663780
610	NC_007351	AT	3	6	21398	21403	50 %	50 %	0 %	0 %	73663780
611	NC_007351	AAT	2	6	21414	21419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663780
612	NC_007351	T	9	9	21474	21482	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
613	NC_007351	T	7	7	21530	21536	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
614	NC_007351	AAAG	2	8	21558	21565	75 %	0 %	25 %	0 %	73663780
615	NC_007351	TTG	2	6	21584	21589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663780
616	NC_007351	ATT	2	6	21632	21637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663780
617	NC_007351	TAG	2	6	21655	21660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663780
618	NC_007351	T	6	6	21697	21702	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
619	NC_007351	T	6	6	21706	21711	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
620	NC_007351	T	6	6	21720	21725	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
621	NC_007351	AT	3	6	21729	21734	50 %	50 %	0 %	0 %	73663780
622	NC_007351	T	7	7	21736	21742	0 %	100 %	0 %	0 %	73663780
623	NC_007351	ATA	2	6	21762	21767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663780
624	NC_007351	AAT	2	6	21801	21806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663780
625	NC_007351	ATGA	2	8	21867	21874	50 %	25 %	25 %	0 %	73663780
626	NC_007351	TTA	2	6	22045	22050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663780
627	NC_007351	CCT	2	6	22064	22069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_007351	ATTC	2	8	22090	22097	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
629	NC_007351	TA	3	6	22099	22104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_007351	TGT	2	6	22112	22117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_007351	TTTC	2	8	22151	22158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
632	NC_007351	GTT	2	6	22176	22181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_007351	ATTC	2	8	22186	22193	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
634	NC_007351	TA	3	6	22195	22200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_007351	TGT	2	6	22208	22213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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637	NC_007351	ATTC	2	8	22282	22289	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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771	NC_007351	ATTTA	2	10	27043	27052	40 %	60 %	0 %	0 %	73663785
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