MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007350	GCA	2	6	57	62	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007350	ATT	2	6	114	119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007350	GTT	3	9	276	284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007350	TAA	2	6	342	347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007350	TGT	2	6	458	463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007350	TTA	2	6	504	509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661310
7	NC_007350	TGA	2	6	640	645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661310
8	NC_007350	TTG	2	6	651	656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73661310
9	NC_007350	ATT	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661310
10	NC_007350	GCT	2	6	695	700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73661310
11	NC_007350	GAA	2	6	746	751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661310
12	NC_007350	AGA	2	6	784	789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661310
13	NC_007350	AAC	2	6	801	806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73661310
14	NC_007350	TGA	2	6	832	837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661310
15	NC_007350	ATA	2	6	870	875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73661310
16	NC_007350	TGC	2	6	919	924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73661310
17	NC_007350	ATT	2	6	967	972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661310
18	NC_007350	TGG	2	6	979	984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73661310
19	NC_007350	TTA	2	6	1095	1100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661310
20	NC_007350	ATA	2	6	1113	1118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73661310
21	NC_007350	TGA	2	6	1168	1173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661310
22	NC_007350	AAG	2	6	1206	1211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661310
23	NC_007350	AGA	2	6	1300	1305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661310
24	NC_007350	CGC	2	6	1350	1355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73661310
25	NC_007350	AGA	2	6	1386	1391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661310
26	NC_007350	GAA	2	6	1400	1405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661310
27	NC_007350	ATT	2	6	1562	1567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661310
28	NC_007350	TTG	2	6	1614	1619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73661310
29	NC_007350	TAT	2	6	1625	1630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661310
30	NC_007350	AAG	2	6	1836	1841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661310
31	NC_007350	AAT	2	6	1897	1902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007350	CTA	3	9	2053	2061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007350	TAC	2	6	2063	2068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007350	TAA	2	6	2116	2121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007350	AAG	2	6	2138	2143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661311
36	NC_007350	ATT	2	6	2146	2151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661311
37	NC_007350	TTA	2	6	2152	2157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661311
38	NC_007350	AAC	2	6	2195	2200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73661311
39	NC_007350	AAC	2	6	2238	2243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73661311
40	NC_007350	ATT	2	6	2319	2324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661311
41	NC_007350	TTG	2	6	2329	2334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73661311
42	NC_007350	TTC	2	6	2364	2369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73661311
43	NC_007350	AAG	2	6	2398	2403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661311
44	NC_007350	TTA	2	6	2437	2442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661311
45	NC_007350	TGA	2	6	2516	2521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661311
46	NC_007350	AGA	2	6	2696	2701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661311
47	NC_007350	TCA	2	6	2722	2727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73661311
48	NC_007350	GAA	2	6	2775	2780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661311
49	NC_007350	TTA	2	6	2850	2855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661311
50	NC_007350	TTA	2	6	2958	2963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661311
51	NC_007350	GGC	2	6	2973	2978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73661311
52	NC_007350	AAT	2	6	2979	2984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73661311
53	NC_007350	AGA	2	6	3056	3061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661311
54	NC_007350	TGG	2	6	3083	3088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73661311
55	NC_007350	GAT	2	6	3210	3215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661311
56	NC_007350	TTA	2	6	3423	3428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007350	TAA	2	6	3507	3512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007350	ATT	2	6	3607	3612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007350	ATA	2	6	3649	3654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007350	AAC	2	6	3666	3671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007350	ATT	2	6	3694	3699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007350	TTG	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73661312
63	NC_007350	TAT	2	6	3877	3882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661312
64	NC_007350	ATG	2	6	3936	3941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661312
65	NC_007350	ATC	2	6	3972	3977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73661312
66	NC_007350	GAA	2	6	4031	4036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661312
67	NC_007350	TTA	2	6	4150	4155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661313
68	NC_007350	CGT	2	6	4371	4376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73661313
69	NC_007350	CAG	2	6	4463	4468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73661313
70	NC_007350	AAT	2	6	4516	4521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73661313
71	NC_007350	CAA	2	6	4582	4587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73661313
72	NC_007350	TTA	2	6	4631	4636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661313
73	NC_007350	GAT	2	6	4840	4845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661313
74	NC_007350	CAA	2	6	4897	4902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73661313
75	NC_007350	ACT	2	6	4906	4911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73661313
76	NC_007350	GAT	2	6	4984	4989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661313
77	NC_007350	GAT	2	6	5005	5010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661313
78	NC_007350	TAC	2	6	5064	5069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73661313
79	NC_007350	AAC	2	6	5185	5190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73661314
80	NC_007350	TGG	2	6	5484	5489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73661314
81	NC_007350	GGC	2	6	5500	5505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73661314
82	NC_007350	TGG	2	6	5520	5525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73661314
83	NC_007350	TCA	2	6	5542	5547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73661314
84	NC_007350	GTA	2	6	5548	5553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661314
85	NC_007350	AGA	2	6	5565	5570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661314
86	NC_007350	ATC	2	6	5606	5611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73661314
87	NC_007350	GAA	2	6	5656	5661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661314
88	NC_007350	GAT	3	9	5665	5673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661314
89	NC_007350	ACA	2	6	5728	5733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73661314
90	NC_007350	ACA	2	6	5751	5756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73661314
91	NC_007350	GTG	2	6	5816	5821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73661314
92	NC_007350	AAG	2	6	5822	5827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661314
93	NC_007350	GGT	2	6	5854	5859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73661314
94	NC_007350	GAA	2	6	5908	5913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661314
95	NC_007350	GAT	2	6	5938	5943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661314
96	NC_007350	CAA	2	6	5984	5989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73661314
97	NC_007350	TTG	2	6	5992	5997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73661314
98	NC_007350	AAT	2	6	6007	6012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73661314
99	NC_007350	GGT	2	6	6028	6033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73661314
100	NC_007350	GAA	2	6	6040	6045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661314
101	NC_007350	AGA	2	6	6108	6113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661314
102	NC_007350	TGC	2	6	6345	6350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73661314
103	NC_007350	TCG	2	6	6461	6466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73661314
104	NC_007350	ATA	2	6	6584	6589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73661314
105	NC_007350	TGG	2	6	6630	6635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73661314
106	NC_007350	TTA	2	6	6721	6726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661314
107	NC_007350	TTC	2	6	6730	6735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73661314
108	NC_007350	ATT	2	6	6753	6758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661314
109	NC_007350	ACC	2	6	6786	6791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73661314
110	NC_007350	ACT	2	6	6943	6948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73661314
111	NC_007350	GAT	2	6	6988	6993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661314
112	NC_007350	AGG	2	6	7120	7125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007350	TTG	2	6	7342	7347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73661315
114	NC_007350	TCA	2	6	7383	7388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73661315
115	NC_007350	ATG	2	6	7582	7587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661315
116	NC_007350	TTA	2	6	7632	7637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661315
117	NC_007350	TCA	2	6	7705	7710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73661315
118	NC_007350	TAT	2	6	7799	7804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661315
119	NC_007350	TCG	2	6	7823	7828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73661315
120	NC_007350	AGA	2	6	7880	7885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661315
121	NC_007350	GTG	2	6	7888	7893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73661315
122	NC_007350	GTC	2	6	7897	7902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73661315
123	NC_007350	TTG	2	6	7909	7914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73661315
124	NC_007350	GTA	2	6	8043	8048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661315
125	NC_007350	CAT	2	6	8119	8124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73661315
126	NC_007350	AAG	2	6	8222	8227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661315
127	NC_007350	TGA	2	6	8306	8311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661315
128	NC_007350	GAA	2	6	8490	8495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661315
129	NC_007350	GAA	2	6	8517	8522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661315
130	NC_007350	ATT	2	6	8525	8530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661315
131	NC_007350	TGA	2	6	8543	8548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661315
132	NC_007350	TGA	2	6	8576	8581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661315
133	NC_007350	TGG	2	6	8603	8608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73661315
134	NC_007350	AGA	2	6	8642	8647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661315
135	NC_007350	ATA	2	6	8671	8676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73661315
136	NC_007350	GTG	2	6	8722	8727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73661315
137	NC_007350	GTG	2	6	8731	8736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73661315
138	NC_007350	AGA	3	9	8756	8764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661315
139	NC_007350	AGT	2	6	8891	8896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661315
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142	NC_007350	ATT	2	6	8971	8976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661315
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147	NC_007350	GAT	2	6	9267	9272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661315
148	NC_007350	TCG	2	6	9280	9285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73661315
149	NC_007350	GTG	2	6	9343	9348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73661315
150	NC_007350	GAA	2	6	9420	9425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661315
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155	NC_007350	AAG	2	6	9748	9753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661315
156	NC_007350	GAA	2	6	9816	9821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661315
157	NC_007350	ATA	2	6	9837	9842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_007350	TGG	2	6	9940	9945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73661316
159	NC_007350	CTT	2	6	10014	10019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73661316
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169	NC_007350	TAG	2	6	11450	11455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661317
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249	NC_007350	GTT	3	9	16904	16912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_007350	AAT	2	6	17005	17010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_007350	ACC	2	6	17156	17161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73661322
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259	NC_007350	CGA	2	6	18117	18122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73661323
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261	NC_007350	GTA	2	6	18225	18230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661323
262	NC_007350	TTC	2	6	18464	18469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73661323
263	NC_007350	AAG	2	6	18480	18485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661323
264	NC_007350	ATC	2	6	18508	18513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73661323
265	NC_007350	ATT	2	6	18532	18537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661323
266	NC_007350	ATG	2	6	18549	18554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661323
267	NC_007350	TCA	2	6	18615	18620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73661323
268	NC_007350	ATA	2	6	18639	18644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73661323
269	NC_007350	GTG	2	6	18867	18872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73661323
270	NC_007350	TGG	2	6	18919	18924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73661323
271	NC_007350	GCA	2	6	19058	19063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73661323
272	NC_007350	GAT	2	6	19084	19089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661323
273	NC_007350	ACG	2	6	19144	19149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73661323
274	NC_007350	TCA	2	6	19194	19199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73661323
275	NC_007350	ACA	2	6	19235	19240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73661323
276	NC_007350	AGT	2	6	19312	19317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661323
277	NC_007350	CAT	2	6	19325	19330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73661323
278	NC_007350	GTG	2	6	19335	19340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73661323
279	NC_007350	CAG	2	6	19395	19400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73661323
280	NC_007350	CAT	2	6	19480	19485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73661323
281	NC_007350	CTT	2	6	19755	19760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73661323
282	NC_007350	AAG	2	6	19771	19776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661323
283	NC_007350	AGA	2	6	19777	19782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661323
284	NC_007350	TGG	3	9	19849	19857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73661323
285	NC_007350	GCA	2	6	19874	19879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73661323
286	NC_007350	TGA	2	6	19903	19908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661323
287	NC_007350	ACA	2	6	19924	19929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73661323
288	NC_007350	CTT	2	6	20049	20054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73661324
289	NC_007350	GAA	2	6	20058	20063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661324
290	NC_007350	GCT	2	6	20122	20127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73661324
291	NC_007350	CAA	2	6	20140	20145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73661324
292	NC_007350	ATT	2	6	20229	20234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661324
293	NC_007350	ACA	4	12	20271	20282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73661324
294	NC_007350	AAG	2	6	20369	20374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661324
295	NC_007350	AAT	2	6	20408	20413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73661324
296	NC_007350	ACT	2	6	20548	20553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73661325
297	NC_007350	ATG	2	6	20614	20619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661325
298	NC_007350	ATA	2	6	20633	20638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73661325
299	NC_007350	AAG	2	6	20678	20683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73661325
300	NC_007350	ATG	2	6	20843	20848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661325
301	NC_007350	CGT	2	6	20884	20889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73661325
302	NC_007350	ATC	2	6	20901	20906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73661325
303	NC_007350	AGC	2	6	21075	21080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73661325
304	NC_007350	ATG	2	6	21253	21258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661325
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311	NC_007350	GAT	2	6	21582	21587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661325
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313	NC_007350	TGA	2	6	21651	21656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661325
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317	NC_007350	ATT	2	6	21745	21750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661325
318	NC_007350	AAC	2	6	21755	21760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73661325
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320	NC_007350	AAT	2	6	21887	21892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
321	NC_007350	TCA	2	6	22151	22156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73661326
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326	NC_007350	TTA	2	6	22595	22600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73661326
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328	NC_007350	ATA	2	6	22632	22637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73661326
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330	NC_007350	GAT	2	6	22769	22774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661326
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342	NC_007350	TGA	2	6	23534	23539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73661327
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382	NC_007350	AGT	2	6	26197	26202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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