MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 chromosome

Total Repeats: 1840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007181	AAGGG	2	10	1154	1163	40 %	0 %	60 %	0 %	70605854
2	NC_007181	AATAG	2	10	1561	1570	60 %	20 %	20 %	0 %	70605855
3	NC_007181	TAACT	2	10	3346	3355	40 %	40 %	0 %	20 %	70605858
4	NC_007181	TATTT	2	10	7874	7883	20 %	80 %	0 %	0 %	70605864
5	NC_007181	CAAGC	2	10	8050	8059	40 %	0 %	20 %	40 %	70605864
6	NC_007181	ATAGA	2	10	8458	8467	60 %	20 %	20 %	0 %	70605865
7	NC_007181	CTAAA	2	10	8572	8581	60 %	20 %	0 %	20 %	70605865
8	NC_007181	TGCTT	2	10	9546	9555	0 %	60 %	20 %	20 %	70605867
9	NC_007181	TGAAT	2	10	11851	11860	40 %	40 %	20 %	0 %	70605870
10	NC_007181	CTTTT	2	10	13691	13700	0 %	80 %	0 %	20 %	70605874
11	NC_007181	ATTTG	2	10	14471	14480	20 %	60 %	20 %	0 %	70605875
12	NC_007181	GTTTT	2	10	16332	16341	0 %	80 %	20 %	0 %	70605877
13	NC_007181	CTTAC	2	10	16896	16905	20 %	40 %	0 %	40 %	70605878
14	NC_007181	TATCA	2	10	17066	17075	40 %	40 %	0 %	20 %	70605878
15	NC_007181	GGAAC	2	10	17290	17299	40 %	0 %	40 %	20 %	70605878
16	NC_007181	TTAAA	2	10	23335	23344	60 %	40 %	0 %	0 %	70605887
17	NC_007181	CAAAT	2	10	25619	25628	60 %	20 %	0 %	20 %	70605891
18	NC_007181	TAGAA	2	10	25671	25680	60 %	20 %	20 %	0 %	70605891
19	NC_007181	TATTG	2	10	29514	29523	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007181	CATAA	2	10	29592	29601	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007181	ATTTT	2	10	29630	29639	20 %	80 %	0 %	0 %	70605897
22	NC_007181	ACAGT	2	10	29807	29816	40 %	20 %	20 %	20 %	70605897
23	NC_007181	TACTT	2	10	31287	31296	20 %	60 %	0 %	20 %	70605899
24	NC_007181	CTATT	2	10	31574	31583	20 %	60 %	0 %	20 %	70605899
25	NC_007181	TTCTT	2	10	31912	31921	0 %	80 %	0 %	20 %	70605899
26	NC_007181	AAAAG	2	10	32392	32401	80 %	0 %	20 %	0 %	70605900
27	NC_007181	GAATG	2	10	32634	32643	40 %	20 %	40 %	0 %	70605900
28	NC_007181	TTACT	2	10	34515	34524	20 %	60 %	0 %	20 %	70605902
29	NC_007181	TCTTT	2	10	34815	34824	0 %	80 %	0 %	20 %	70605903
30	NC_007181	ATCTA	2	10	34973	34982	40 %	40 %	0 %	20 %	70605903
31	NC_007181	TTTTC	2	10	35083	35092	0 %	80 %	0 %	20 %	70605903
32	NC_007181	TGTAT	2	10	35712	35721	20 %	60 %	20 %	0 %	70605903
33	NC_007181	TTCTT	2	10	35925	35934	0 %	80 %	0 %	20 %	70605904
34	NC_007181	CTCTT	2	10	36984	36993	0 %	60 %	0 %	40 %	70605904
35	NC_007181	CTTTC	2	10	38235	38244	0 %	60 %	0 %	40 %	70605904
36	NC_007181	AGATC	2	10	44900	44909	40 %	20 %	20 %	20 %	70605911
37	NC_007181	AGGTA	2	10	45370	45379	40 %	20 %	40 %	0 %	70605911
38	NC_007181	TCGTT	2	10	45538	45547	0 %	60 %	20 %	20 %	70605911
39	NC_007181	CTAAA	2	10	47328	47337	60 %	20 %	0 %	20 %	70605913
40	NC_007181	ACTTA	2	10	48342	48351	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_007181	AAATA	2	10	48596	48605	80 %	20 %	0 %	0 %	70605915
42	NC_007181	TTATG	2	10	48713	48722	20 %	60 %	20 %	0 %	70605916
43	NC_007181	AAACT	2	10	49143	49152	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_007181	CTATA	2	10	49743	49752	40 %	40 %	0 %	20 %	70605917
45	NC_007181	AAAAT	2	10	50278	50287	80 %	20 %	0 %	0 %	70605917
46	NC_007181	TGGAA	2	10	50613	50622	40 %	20 %	40 %	0 %	70605917
47	NC_007181	ACTGA	2	10	50638	50647	40 %	20 %	20 %	20 %	70605917
48	NC_007181	TAAGA	2	10	50935	50944	60 %	20 %	20 %	0 %	70605918
49	NC_007181	CCTTA	2	10	51521	51530	20 %	40 %	0 %	40 %	70605918
50	NC_007181	AGAGA	2	10	52022	52031	60 %	0 %	40 %	0 %	70605919
51	NC_007181	TCATT	2	10	52264	52273	20 %	60 %	0 %	20 %	70605919
52	NC_007181	TTTTA	2	10	52753	52762	20 %	80 %	0 %	0 %	70605920
53	NC_007181	GCAGT	2	10	53600	53609	20 %	20 %	40 %	20 %	70605921
54	NC_007181	AGAGA	2	10	56888	56897	60 %	0 %	40 %	0 %	70605924
55	NC_007181	ATATA	2	10	57007	57016	60 %	40 %	0 %	0 %	70605924
56	NC_007181	GGGAA	2	10	57307	57316	40 %	0 %	60 %	0 %	70605924
57	NC_007181	ATATT	2	10	57916	57925	40 %	60 %	0 %	0 %	70605924
58	NC_007181	TTTAG	2	10	59581	59590	20 %	60 %	20 %	0 %	70605926
59	NC_007181	TTGCA	2	10	59859	59868	20 %	40 %	20 %	20 %	70605926
60	NC_007181	GAAAG	2	10	66817	66826	60 %	0 %	40 %	0 %	70605938
61	NC_007181	TATAT	2	10	68109	68118	40 %	60 %	0 %	0 %	70605940
62	NC_007181	GGTAA	2	10	70893	70902	40 %	20 %	40 %	0 %	70605943
63	NC_007181	TTATA	2	10	70919	70928	40 %	60 %	0 %	0 %	70605943
64	NC_007181	GTATC	2	10	71074	71083	20 %	40 %	20 %	20 %	70605943
65	NC_007181	TTATT	2	10	71165	71174	20 %	80 %	0 %	0 %	70605943
66	NC_007181	ATATC	2	10	71387	71396	40 %	40 %	0 %	20 %	70605943
67	NC_007181	CCTAT	2	10	74793	74802	20 %	40 %	0 %	40 %	70605946
68	NC_007181	ATTAC	2	10	76105	76114	40 %	40 %	0 %	20 %	70605948
69	NC_007181	GGAAG	2	10	80855	80864	40 %	0 %	60 %	0 %	70605955
70	NC_007181	ATCCA	2	10	81881	81890	40 %	20 %	0 %	40 %	70605957
71	NC_007181	GAATA	2	10	81915	81924	60 %	20 %	20 %	0 %	70605957
72	NC_007181	GCCAT	2	10	82233	82242	20 %	20 %	20 %	40 %	70605957
73	NC_007181	TAACA	2	10	82731	82740	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_007181	ATGTT	2	10	83355	83364	20 %	60 %	20 %	0 %	70605960
75	NC_007181	ATTTA	2	10	88109	88118	40 %	60 %	0 %	0 %	70605966
76	NC_007181	TATTT	2	10	88880	88889	20 %	80 %	0 %	0 %	70605966
77	NC_007181	ATTTT	2	10	92817	92826	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007181	ACAGA	2	10	93764	93773	60 %	0 %	20 %	20 %	70605971
79	NC_007181	TAAAC	2	10	95078	95087	60 %	20 %	0 %	20 %	70605972
80	NC_007181	CCACT	2	10	95214	95223	20 %	20 %	0 %	60 %	70605972
81	NC_007181	TCTGG	2	10	95958	95967	0 %	40 %	40 %	20 %	70605972
82	NC_007181	AGTGT	2	10	96243	96252	20 %	40 %	40 %	0 %	70605972
83	NC_007181	ATCTC	2	10	96696	96705	20 %	40 %	0 %	40 %	70605972
84	NC_007181	CTAGA	2	10	100603	100612	40 %	20 %	20 %	20 %	70605974
85	NC_007181	ATCCT	2	10	100696	100705	20 %	40 %	0 %	40 %	70605975
86	NC_007181	GATAC	2	10	100717	100726	40 %	20 %	20 %	20 %	70605975
87	NC_007181	TATTT	2	10	100782	100791	20 %	80 %	0 %	0 %	70605975
88	NC_007181	GATCA	2	10	102808	102817	40 %	20 %	20 %	20 %	70605977
89	NC_007181	TTTCT	2	10	103238	103247	0 %	80 %	0 %	20 %	70605978
90	NC_007181	ATTAC	2	10	103467	103476	40 %	40 %	0 %	20 %	70605978
91	NC_007181	AGGAA	2	10	103954	103963	60 %	0 %	40 %	0 %	70605979
92	NC_007181	ATTTG	2	10	105555	105564	20 %	60 %	20 %	0 %	70605981
93	NC_007181	AGGTA	2	10	106850	106859	40 %	20 %	40 %	0 %	70605982
94	NC_007181	TCCTA	2	10	111028	111037	20 %	40 %	0 %	40 %	70605986
95	NC_007181	TATTT	2	10	111956	111965	20 %	80 %	0 %	0 %	70605987
96	NC_007181	AATAA	2	10	112950	112959	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007181	TTTTG	2	10	112978	112987	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007181	ATTAT	2	10	114418	114427	40 %	60 %	0 %	0 %	70605988
99	NC_007181	TTTCT	2	10	114861	114870	0 %	80 %	0 %	20 %	70605989
100	NC_007181	CCTAA	2	10	115063	115072	40 %	20 %	0 %	40 %	70605989
101	NC_007181	TATTC	2	10	115892	115901	20 %	60 %	0 %	20 %	70605990
102	NC_007181	CCTTT	2	10	116518	116527	0 %	60 %	0 %	40 %	70605991
103	NC_007181	TAAAA	2	10	116928	116937	80 %	20 %	0 %	0 %	70605991
104	NC_007181	GAAAA	2	10	123502	123511	80 %	0 %	20 %	0 %	70605996
105	NC_007181	CTTAC	2	10	124347	124356	20 %	40 %	0 %	40 %	70605998
106	NC_007181	GTATA	2	10	124662	124671	40 %	40 %	20 %	0 %	70605998
107	NC_007181	ACTAT	2	10	124755	124764	40 %	40 %	0 %	20 %	70605998
108	NC_007181	GTGGA	2	10	124902	124911	20 %	20 %	60 %	0 %	70605998
109	NC_007181	TACAG	2	10	125968	125977	40 %	20 %	20 %	20 %	70605999
110	NC_007181	TTGTA	2	10	128094	128103	20 %	60 %	20 %	0 %	70606001
111	NC_007181	ATGGA	2	10	129525	129534	40 %	20 %	40 %	0 %	70606003
112	NC_007181	CCTTG	2	10	134381	134390	0 %	40 %	20 %	40 %	70606008
113	NC_007181	CATTT	2	10	134814	134823	20 %	60 %	0 %	20 %	70606008
114	NC_007181	AGGAA	2	10	135454	135463	60 %	0 %	40 %	0 %	70606009
115	NC_007181	CTTTT	2	10	139241	139250	0 %	80 %	0 %	20 %	70606014
116	NC_007181	TATCA	2	10	140154	140163	40 %	40 %	0 %	20 %	70606016
117	NC_007181	TCTTT	2	10	140873	140882	0 %	80 %	0 %	20 %	70606017
118	NC_007181	TTCAA	2	10	141007	141016	40 %	40 %	0 %	20 %	70606017
119	NC_007181	TTATC	2	10	141272	141281	20 %	60 %	0 %	20 %	70606017
120	NC_007181	GATCA	2	10	142482	142491	40 %	20 %	20 %	20 %	70606019
121	NC_007181	TAGGA	2	10	143063	143072	40 %	20 %	40 %	0 %	70606019
122	NC_007181	TAAGA	2	10	143344	143353	60 %	20 %	20 %	0 %	70606020
123	NC_007181	GTATA	2	10	143744	143753	40 %	40 %	20 %	0 %	70606020
124	NC_007181	TTTAT	2	10	145134	145143	20 %	80 %	0 %	0 %	70606022
125	NC_007181	ACTGG	2	10	147132	147141	20 %	20 %	40 %	20 %	70606024
126	NC_007181	TGGAC	2	10	147174	147183	20 %	20 %	40 %	20 %	70606024
127	NC_007181	TTTGG	2	10	150489	150498	0 %	60 %	40 %	0 %	70606027
128	NC_007181	AATTC	2	10	151825	151834	40 %	40 %	0 %	20 %	70606029
129	NC_007181	GGTAA	2	10	152393	152402	40 %	20 %	40 %	0 %	70606029
130	NC_007181	TTGAT	2	10	153014	153023	20 %	60 %	20 %	0 %	70606030
131	NC_007181	GAATT	2	10	153729	153738	40 %	40 %	20 %	0 %	70606031
132	NC_007181	GTAAA	2	10	154507	154516	60 %	20 %	20 %	0 %	70606032
133	NC_007181	ATATA	2	10	154717	154726	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007181	TAATG	2	10	155034	155043	40 %	40 %	20 %	0 %	70606033
135	NC_007181	TTTTC	2	10	155272	155281	0 %	80 %	0 %	20 %	70606034
136	NC_007181	GCAAG	2	10	155832	155841	40 %	0 %	40 %	20 %	70606034
137	NC_007181	TATGA	2	10	156148	156157	40 %	40 %	20 %	0 %	70606034
138	NC_007181	AGGAT	2	10	157630	157639	40 %	20 %	40 %	0 %	70606036
139	NC_007181	ACTCT	2	10	158621	158630	20 %	40 %	0 %	40 %	70606038
140	NC_007181	CTTCA	2	10	160792	160801	20 %	40 %	0 %	40 %	70606040
141	NC_007181	AGAGA	2	10	161484	161493	60 %	0 %	40 %	0 %	70606040
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152	NC_007181	TGTTA	2	10	174869	174878	20 %	60 %	20 %	0 %	70606054
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165	NC_007181	ATTGC	2	10	195353	195362	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
166	NC_007181	TAGCC	2	10	195541	195550	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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178	NC_007181	ATGGG	2	10	209811	209820	20 %	20 %	60 %	0 %	70606089
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187	NC_007181	ATTTA	2	10	226292	226301	40 %	60 %	0 %	0 %	70606107
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205	NC_007181	ATTAT	2	10	253427	253436	40 %	60 %	0 %	0 %	70606136
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211	NC_007181	ATAAA	2	10	260580	260589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
212	NC_007181	TCTGC	2	10	261059	261068	0 %	40 %	20 %	40 %	70606145
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232	NC_007181	CTCTA	2	10	294146	294155	20 %	40 %	0 %	40 %	70606184
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234	NC_007181	TTTAG	2	10	295092	295101	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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236	NC_007181	ATTTT	2	10	295785	295794	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
237	NC_007181	AGGTG	2	10	296579	296588	20 %	20 %	60 %	0 %	70606188
238	NC_007181	TTTAG	2	10	296797	296806	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
239	NC_007181	TAAAT	2	10	298657	298666	60 %	40 %	0 %	0 %	70606191
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241	NC_007181	TCAAA	2	10	299945	299954	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
242	NC_007181	CTATC	2	10	300565	300574	20 %	40 %	0 %	40 %	70606194
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248	NC_007181	CTATC	2	10	306975	306984	20 %	40 %	0 %	40 %	70606202
249	NC_007181	TGTGA	2	10	308073	308082	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
250	NC_007181	ATCTC	2	10	308608	308617	20 %	40 %	0 %	40 %	70606203
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252	NC_007181	ATGTT	2	10	310572	310581	20 %	60 %	20 %	0 %	70606205
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255	NC_007181	TCTGT	2	10	315056	315065	0 %	60 %	20 %	20 %	70606208
256	NC_007181	AAATA	2	10	317609	317618	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_007181	AATCA	2	10	317994	318003	60 %	20 %	0 %	20 %	70606211
258	NC_007181	CCTTA	2	10	319048	319057	20 %	40 %	0 %	40 %	70606211
259	NC_007181	AATGC	2	10	319679	319688	40 %	20 %	20 %	20 %	70606211
260	NC_007181	TATCT	2	10	320201	320210	20 %	60 %	0 %	20 %	70606212
261	NC_007181	AGGAT	2	10	323187	323196	40 %	20 %	40 %	0 %	70606213
262	NC_007181	TCTCT	2	10	323601	323610	0 %	60 %	0 %	40 %	70606213
263	NC_007181	TACTT	2	10	323828	323837	20 %	60 %	0 %	20 %	70606213
264	NC_007181	AGGGA	2	10	324325	324334	40 %	0 %	60 %	0 %	70606214
265	NC_007181	TAAAT	2	10	325221	325230	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_007181	TTCCA	2	10	326060	326069	20 %	40 %	0 %	40 %	70606216
267	NC_007181	TCTTG	2	10	326290	326299	0 %	60 %	20 %	20 %	70606217
268	NC_007181	TCTCC	2	10	328521	328530	0 %	40 %	0 %	60 %	162139953
269	NC_007181	AAAAT	2	10	329296	329305	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_007181	AAATT	2	10	329493	329502	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_007181	AATAT	2	10	333459	333468	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_007181	TTACC	2	10	499602	499611	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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