MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 chromosome

Total Repeats: 47491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007181	CTA	2	6	161276	161281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606040
3502	NC_007181	AAG	2	6	161368	161373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606040
3503	NC_007181	AAG	2	6	161393	161398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606040
3504	NC_007181	ATG	2	6	161455	161460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606040
3505	NC_007181	AGAGA	2	10	161484	161493	60 %	0 %	40 %	0 %	70606040
3506	NC_007181	GAA	2	6	161494	161499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606040
3507	NC_007181	TA	3	6	161524	161529	50 %	50 %	0 %	0 %	70606040
3508	NC_007181	AGA	2	6	161640	161645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606040
3509	NC_007181	G	6	6	161651	161656	0 %	0 %	100 %	0 %	70606040
3510	NC_007181	TTA	2	6	161700	161705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606040
3511	NC_007181	TAGGA	2	10	161753	161762	40 %	20 %	40 %	0 %	70606040
3512	NC_007181	CTG	2	6	161841	161846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70606040
3513	NC_007181	AT	3	6	162024	162029	50 %	50 %	0 %	0 %	70606040
3514	NC_007181	GTGA	2	8	162054	162061	25 %	25 %	50 %	0 %	70606040
3515	NC_007181	TG	3	6	162134	162139	0 %	50 %	50 %	0 %	70606040
3516	NC_007181	AGA	2	6	162178	162183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606040
3517	NC_007181	ATT	3	9	162188	162196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606040
3518	NC_007181	GGT	2	6	162198	162203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70606040
3519	NC_007181	GAA	2	6	162222	162227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606041
3520	NC_007181	A	6	6	162326	162331	100 %	0 %	0 %	0 %	70606041
3521	NC_007181	TGT	2	6	162373	162378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70606041
3522	NC_007181	C	6	6	162393	162398	0 %	0 %	0 %	100 %	70606041
3523	NC_007181	TAGT	2	8	162414	162421	25 %	50 %	25 %	0 %	70606041
3524	NC_007181	ATC	2	6	162592	162597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606041
3525	NC_007181	TA	3	6	162609	162614	50 %	50 %	0 %	0 %	70606041
3526	NC_007181	GTT	2	6	162713	162718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70606041
3527	NC_007181	AGT	2	6	162868	162873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606041
3528	NC_007181	TTC	2	6	162920	162925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_007181	TC	3	6	162924	162929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_007181	AT	4	8	162938	162945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_007181	T	6	6	162949	162954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_007181	AGG	2	6	162998	163003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606042
3533	NC_007181	CAGG	2	8	163073	163080	25 %	0 %	50 %	25 %	70606042
3534	NC_007181	CT	4	8	163095	163102	0 %	50 %	0 %	50 %	70606042
3535	NC_007181	CTA	2	6	163154	163159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606042
3536	NC_007181	AG	3	6	163162	163167	50 %	0 %	50 %	0 %	70606042
3537	NC_007181	AG	3	6	163212	163217	50 %	0 %	50 %	0 %	70606042
3538	NC_007181	CAC	2	6	163276	163281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	70606042
3539	NC_007181	CTA	2	6	163287	163292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606042
3540	NC_007181	TTCT	2	8	163324	163331	0 %	75 %	0 %	25 %	70606042
3541	NC_007181	AG	3	6	163339	163344	50 %	0 %	50 %	0 %	70606042
3542	NC_007181	GTT	2	6	163474	163479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70606042
3543	NC_007181	GCTTC	2	10	163501	163510	0 %	40 %	20 %	40 %	70606042
3544	NC_007181	TA	3	6	163526	163531	50 %	50 %	0 %	0 %	70606042
3545	NC_007181	TA	3	6	163534	163539	50 %	50 %	0 %	0 %	70606042
3546	NC_007181	GA	3	6	163559	163564	50 %	0 %	50 %	0 %	70606042
3547	NC_007181	ATTA	2	8	163687	163694	50 %	50 %	0 %	0 %	70606042
3548	NC_007181	AG	3	6	163709	163714	50 %	0 %	50 %	0 %	70606042
3549	NC_007181	AG	3	6	163727	163732	50 %	0 %	50 %	0 %	70606043
3550	NC_007181	GCTTC	2	10	163752	163761	0 %	40 %	20 %	40 %	70606043
3551	NC_007181	ATT	2	6	163766	163771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606043
3552	NC_007181	ATT	2	6	163830	163835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606043
3553	NC_007181	GTT	2	6	163913	163918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70606043
3554	NC_007181	GTAA	2	8	163919	163926	50 %	25 %	25 %	0 %	70606043
3555	NC_007181	AAAT	2	8	163953	163960	75 %	25 %	0 %	0 %	70606043
3556	NC_007181	ATA	2	6	163997	164002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606043
3557	NC_007181	CAA	2	6	164079	164084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70606043
3558	NC_007181	TAATA	2	10	164125	164134	60 %	40 %	0 %	0 %	70606043
3559	NC_007181	TTC	2	6	164222	164227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606043
3560	NC_007181	GTG	2	6	164260	164265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70606043
3561	NC_007181	GAT	2	6	164267	164272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606043
3562	NC_007181	AAAG	2	8	164294	164301	75 %	0 %	25 %	0 %	70606043
3563	NC_007181	ACG	2	6	164346	164351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70606043
3564	NC_007181	TAA	2	6	164385	164390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606043
3565	NC_007181	AGG	2	6	164408	164413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606043
3566	NC_007181	TCT	2	6	164460	164465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606043
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3568	NC_007181	TTA	3	9	164704	164712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606044
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3570	NC_007181	TTTAGT	2	12	164802	164813	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	70606044
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3572	NC_007181	CGC	2	6	164829	164834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	70606044
3573	NC_007181	TAA	2	6	164841	164846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606044
3574	NC_007181	CCA	2	6	164938	164943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	70606044
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3576	NC_007181	TAA	2	6	164981	164986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606044
3577	NC_007181	TAG	2	6	164993	164998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606044
3578	NC_007181	TA	3	6	165014	165019	50 %	50 %	0 %	0 %	70606044
3579	NC_007181	ATT	2	6	165059	165064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_007181	CT	3	6	165136	165141	0 %	50 %	0 %	50 %	70606045
3581	NC_007181	CCT	2	6	165149	165154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606045
3582	NC_007181	AT	3	6	165177	165182	50 %	50 %	0 %	0 %	70606045
3583	NC_007181	CT	3	6	165183	165188	0 %	50 %	0 %	50 %	70606045
3584	NC_007181	CTAT	2	8	165307	165314	25 %	50 %	0 %	25 %	70606045
3585	NC_007181	ATT	2	6	165325	165330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606045
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3589	NC_007181	ACTC	2	8	165569	165576	25 %	25 %	0 %	50 %	70606045
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3592	NC_007181	AG	3	6	165963	165968	50 %	0 %	50 %	0 %	70606046
3593	NC_007181	AT	3	6	166045	166050	50 %	50 %	0 %	0 %	70606046
3594	NC_007181	TCC	2	6	166061	166066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606046
3595	NC_007181	T	6	6	166081	166086	0 %	100 %	0 %	0 %	70606046
3596	NC_007181	TATTTT	2	12	166147	166158	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	70606046
3597	NC_007181	AG	3	6	166172	166177	50 %	0 %	50 %	0 %	70606046
3598	NC_007181	CCT	2	6	166206	166211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606046
3599	NC_007181	TGAT	2	8	166215	166222	25 %	50 %	25 %	0 %	70606046
3600	NC_007181	AT	3	6	166236	166241	50 %	50 %	0 %	0 %	70606046
3601	NC_007181	TTC	2	6	166273	166278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_007181	ATA	2	6	166281	166286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_007181	TTG	2	6	166378	166383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70606047
3604	NC_007181	CTT	2	6	166421	166426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606047
3605	NC_007181	TGTT	2	8	166452	166459	0 %	75 %	25 %	0 %	70606047
3606	NC_007181	CAC	2	6	166483	166488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	70606047
3607	NC_007181	ATT	2	6	166515	166520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606047
3608	NC_007181	TA	3	6	166550	166555	50 %	50 %	0 %	0 %	70606047
3609	NC_007181	GGA	2	6	166703	166708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606047
3610	NC_007181	CTC	2	6	166736	166741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606047
3611	NC_007181	CT	3	6	166768	166773	0 %	50 %	0 %	50 %	70606047
3612	NC_007181	TGAG	2	8	166790	166797	25 %	25 %	50 %	0 %	70606047
3613	NC_007181	ACT	2	6	166871	166876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606047
3614	NC_007181	ATT	2	6	166911	166916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606047
3615	NC_007181	ATG	2	6	166993	166998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606047
3616	NC_007181	CAG	2	6	167158	167163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70606047
3617	NC_007181	ACA	2	6	167202	167207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70606047
3618	NC_007181	ACC	2	6	167311	167316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	70606048
3619	NC_007181	T	7	7	167367	167373	0 %	100 %	0 %	0 %	70606048
3620	NC_007181	TCA	2	6	167393	167398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606048
3621	NC_007181	ACC	2	6	167458	167463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	70606048
3622	NC_007181	TCA	2	6	167489	167494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606048
3623	NC_007181	AT	3	6	167678	167683	50 %	50 %	0 %	0 %	70606048
3624	NC_007181	CTT	2	6	167720	167725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606048
3625	NC_007181	ATTA	2	8	167755	167762	50 %	50 %	0 %	0 %	70606048
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