MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 chromosome

Total Repeats: 47491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007181	TTA	2	6	138043	138048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606011
3002	NC_007181	CTT	2	6	138130	138135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606011
3003	NC_007181	ATT	2	6	138166	138171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_007181	AAT	2	6	138187	138192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_007181	TAT	2	6	138215	138220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_007181	AAAGTA	2	12	138227	138238	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_007181	GAT	2	6	138243	138248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_007181	AAT	2	6	138309	138314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606012
3009	NC_007181	ATT	2	6	138384	138389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606012
3010	NC_007181	TCC	2	6	138420	138425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606012
3011	NC_007181	GAAA	2	8	138484	138491	75 %	0 %	25 %	0 %	70606012
3012	NC_007181	T	6	6	138582	138587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_007181	CTT	2	6	138625	138630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_007181	TTA	2	6	138636	138641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_007181	TGG	2	6	138701	138706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_007181	CCG	2	6	138718	138723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_007181	ACC	2	6	138739	138744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_007181	TC	3	6	138846	138851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3019	NC_007181	ATT	2	6	138855	138860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606013
3020	NC_007181	TCA	2	6	138917	138922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606013
3021	NC_007181	TTGT	2	8	138930	138937	0 %	75 %	25 %	0 %	70606013
3022	NC_007181	TCA	2	6	138956	138961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606013
3023	NC_007181	AAG	2	6	138969	138974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606013
3024	NC_007181	GTT	2	6	139067	139072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70606013
3025	NC_007181	CTT	2	6	139080	139085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606013
3026	NC_007181	TA	3	6	139102	139107	50 %	50 %	0 %	0 %	70606013
3027	NC_007181	CAT	3	9	139156	139164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606013
3028	NC_007181	ATA	3	9	139207	139215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_007181	TTTA	2	8	139233	139240	25 %	75 %	0 %	0 %	70606014
3030	NC_007181	CTTTT	2	10	139241	139250	0 %	80 %	0 %	20 %	70606014
3031	NC_007181	CT	3	6	139342	139347	0 %	50 %	0 %	50 %	70606014
3032	NC_007181	CTT	2	6	139353	139358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606014
3033	NC_007181	ATT	2	6	139375	139380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606014
3034	NC_007181	T	6	6	139379	139384	0 %	100 %	0 %	0 %	70606014
3035	NC_007181	T	6	6	139458	139463	0 %	100 %	0 %	0 %	70606014
3036	NC_007181	T	7	7	139468	139474	0 %	100 %	0 %	0 %	70606015
3037	NC_007181	TAAT	2	8	139525	139532	50 %	50 %	0 %	0 %	70606015
3038	NC_007181	GCA	2	6	139611	139616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70606015
3039	NC_007181	TAAG	2	8	139651	139658	50 %	25 %	25 %	0 %	70606015
3040	NC_007181	TG	3	6	139667	139672	0 %	50 %	50 %	0 %	70606015
3041	NC_007181	AAT	2	6	139699	139704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606015
3042	NC_007181	TTA	2	6	139717	139722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606015
3043	NC_007181	TTC	2	6	139738	139743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606016
3044	NC_007181	TTC	2	6	139800	139805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606016
3045	NC_007181	TC	3	6	139864	139869	0 %	50 %	0 %	50 %	70606016
3046	NC_007181	AAT	2	6	139893	139898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606016
3047	NC_007181	TGTA	2	8	139987	139994	25 %	50 %	25 %	0 %	70606016
3048	NC_007181	CTT	2	6	140097	140102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606016
3049	NC_007181	T	6	6	140121	140126	0 %	100 %	0 %	0 %	70606016
3050	NC_007181	TATCA	2	10	140154	140163	40 %	40 %	0 %	20 %	70606016
3051	NC_007181	CTC	2	6	140235	140240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606016
3052	NC_007181	TTC	2	6	140284	140289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_007181	CAC	2	6	140299	140304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	70606017
3054	NC_007181	AT	3	6	140309	140314	50 %	50 %	0 %	0 %	70606017
3055	NC_007181	ATC	2	6	140388	140393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606017
3056	NC_007181	AGG	2	6	140411	140416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606017
3057	NC_007181	CTAT	2	8	140428	140435	25 %	50 %	0 %	25 %	70606017
3058	NC_007181	TTA	2	6	140486	140491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606017
3059	NC_007181	TCC	2	6	140512	140517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606017
3060	NC_007181	TAT	2	6	140577	140582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606017
3061	NC_007181	ATT	2	6	140611	140616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606017
3062	NC_007181	GTC	2	6	140710	140715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70606017
3063	NC_007181	ACT	2	6	140782	140787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606017
3064	NC_007181	AAT	2	6	140847	140852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606017
3065	NC_007181	TCTTT	2	10	140873	140882	0 %	80 %	0 %	20 %	70606017
3066	NC_007181	CGA	2	6	140916	140921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70606017
3067	NC_007181	CTC	3	9	140982	140990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606017
3068	NC_007181	ACTT	2	8	140999	141006	25 %	50 %	0 %	25 %	70606017
3069	NC_007181	TTCAA	2	10	141007	141016	40 %	40 %	0 %	20 %	70606017
3070	NC_007181	GAG	2	6	141142	141147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	70606017
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3072	NC_007181	CTT	2	6	141250	141255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606017
3073	NC_007181	TTATC	2	10	141272	141281	20 %	60 %	0 %	20 %	70606017
3074	NC_007181	GCT	2	6	141306	141311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70606018
3075	NC_007181	CTT	2	6	141382	141387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606018
3076	NC_007181	TTCT	2	8	141404	141411	0 %	75 %	0 %	25 %	70606018
3077	NC_007181	TACA	2	8	141419	141426	50 %	25 %	0 %	25 %	70606018
3078	NC_007181	GCA	2	6	141456	141461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70606018
3079	NC_007181	ATCT	2	8	141505	141512	25 %	50 %	0 %	25 %	70606018
3080	NC_007181	CAT	2	6	141527	141532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606018
3081	NC_007181	TTA	2	6	141544	141549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606018
3082	NC_007181	ATG	2	6	141551	141556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606018
3083	NC_007181	TTC	2	6	141603	141608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70606018
3084	NC_007181	AGT	2	6	141674	141679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606018
3085	NC_007181	TCATAA	2	12	141693	141704	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	70606018
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3089	NC_007181	TCT	2	6	141892	141897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_007181	TGT	2	6	141912	141917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_007181	CT	3	6	141996	142001	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3092	NC_007181	TGAA	2	8	142007	142014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_007181	ATTT	2	8	142016	142023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_007181	ATT	2	6	142174	142179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606019
3095	NC_007181	ACA	2	6	142195	142200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70606019
3096	NC_007181	TTG	2	6	142224	142229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70606019
3097	NC_007181	ATA	2	6	142237	142242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606019
3098	NC_007181	GCAA	2	8	142246	142253	50 %	0 %	25 %	25 %	70606019
3099	NC_007181	ATA	2	6	142281	142286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606019
3100	NC_007181	CTA	2	6	142288	142293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70606019
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3102	NC_007181	TC	3	6	142581	142586	0 %	50 %	0 %	50 %	70606019
3103	NC_007181	TA	3	6	142653	142658	50 %	50 %	0 %	0 %	70606019
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3106	NC_007181	GAC	2	6	142810	142815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70606019
3107	NC_007181	AAGT	2	8	142836	142843	50 %	25 %	25 %	0 %	70606019
3108	NC_007181	AGA	2	6	142848	142853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70606019
3109	NC_007181	TTA	2	6	142913	142918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606019
3110	NC_007181	GAT	2	6	143041	143046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70606019
3111	NC_007181	TAGGA	2	10	143063	143072	40 %	20 %	40 %	0 %	70606019
3112	NC_007181	TAT	2	6	143073	143078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606019
3113	NC_007181	ACTA	2	8	143082	143089	50 %	25 %	0 %	25 %	70606019
3114	NC_007181	TCC	2	6	143101	143106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70606019
3115	NC_007181	CTTC	2	8	143137	143144	0 %	50 %	0 %	50 %	70606020
3116	NC_007181	TC	3	6	143149	143154	0 %	50 %	0 %	50 %	70606020
3117	NC_007181	GGGA	2	8	143243	143250	25 %	0 %	75 %	0 %	70606020
3118	NC_007181	CTG	2	6	143281	143286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70606020
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3121	NC_007181	TAT	3	9	143330	143338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70606020
3122	NC_007181	TAAGA	2	10	143344	143353	60 %	20 %	20 %	0 %	70606020
3123	NC_007181	AT	3	6	143386	143391	50 %	50 %	0 %	0 %	70606020
3124	NC_007181	TAA	2	6	143452	143457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70606020
3125	NC_007181	TAAG	2	8	143471	143478	50 %	25 %	25 %	0 %	70606020
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3127	NC_007181	AACGAA	2	12	143603	143614	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	70606020
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3260	NC_007181	TA	3	6	150169	150174	50 %	50 %	0 %	0 %	70606027
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